; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10008532 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10008532
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Descriptionribonucleoside-diphosphate reductase small chain
Genome locationChr10:23974285..23975274
RNA-Seq ExpressionHG10008532
SyntenyHG10008532
Gene Ontology termsGO:0009263 - deoxyribonucleotide biosynthetic process (biological process)
GO:0004748 - ribonucleoside-diphosphate reductase activity, thioredoxin disulfide as acceptor (molecular function)
InterPro domainsIPR000358 - Ribonucleotide reductase small subunit family
IPR009078 - Ferritin-like superfamily
IPR012348 - Ribonucleotide reductase-like
IPR030475 - Ribonucleotide reductase small subunit, acitve site
IPR033909 - Ribonucleotide reductase small subunit


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581100.1 hypothetical protein SDJN03_21102, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.2e-18295.44Show/hide
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XP_022935447.1 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain [Cucurbita moschata]1.1e-18195.44Show/hide
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XP_022984134.1 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain [Cucurbita maxima]9.8e-18094.83Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L8R8 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain4.8e-18094.53Show/hide
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A0A1S3BNB8 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain5.3e-17993.92Show/hide
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A0A6J1F5K5 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain5.1e-18295.44Show/hide
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A0A6J1J9K8 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain4.8e-18094.83Show/hide
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A0A6P4AGQ7 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain4.3e-17389.67Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P0DKH3 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain B6.5e-15880.78Show/hide
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P49730 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain4.0e-16886.02Show/hide
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P50651 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain A1.1e-14175.08Show/hide
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        +ENIHSEMYSLLLET+IKDS EK RLF AIET+PC+ KKA W L WI S  SFA R++AFACVEGIFFSGSFC+IFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGL
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Query:  HCDFACLLYSLLRKKLSENRVNEIVTEAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYGKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGE
        HCDFACLLYSLL+K+L   +V +IV EAV+IE EFVC ALP  L+GMN +LMSQYI+FVADRL+  LG  + Y  +NPFDWME ISLQGKTNFFEKRVGE
Subjt:  HCDFACLLYSLLRKKLSENRVNEIVTEAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYGKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGE

Query:  YQKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF
        YQKASVMSNL      +EF  +EDF
Subjt:  YQKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF

Q60561 Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M27.7e-13571.73Show/hide
Query:  PSTSDEPLLSPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDLRHWESLTPDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVSEARAFYGF
        PS  DEPLL  NP RF +FPI+Y  IW+MYKKAEASFWTAEEVDLS+D++HWE+L PDE+HFI+HVLAFFAASDGIV ENL  RF +EVQV+EAR FYGF
Subjt:  PSTSDEPLLSPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDLRHWESLTPDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVSEARAFYGF

Query:  QIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKSRLFRAIETVPCVKKKADWALKWI-DSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISR
        QIA+ENIHSEMYSLL++TYIKDS E+  LF AIET+PCVKKKADWAL+WI D   ++ ER++AFA VEGIFFSGSF SIFWLKKRGLMPGLTFSNELISR
Subjt:  QIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKSRLFRAIETVPCVKKKADWALKWI-DSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISR

Query:  DEGLHCDFACLLYSLLRKKLSENRVNEIVTEAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYGKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEK
        DEGLHCDFACL++  L  K SE RV EI+T AV IE+EF+ +ALPV L+GMN  LM QYIEFVADRL+  LG+ KI+ V+NPFD+ME ISL+GKTNFFEK
Subjt:  DEGLHCDFACLLYSLLRKKLSENRVNEIVTEAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYGKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEK

Query:  RVGEYQKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF
        RVGEYQ+  VMSN         F +D DF
Subjt:  RVGEYQKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF

Q9LSD0 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain C8.1e-16182.83Show/hide
Query:  MPSTSDEPLLSPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDLRHWE-SLTPDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVSEARAFY
        MPS  +EPLL+P PDRFCMFPI YPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQD R WE SL   E+HFI HVLAFFAASDGIVLENLA RFM +VQVSEARAFY
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Query:  GFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKSRLFRAIETVPCVKKKADWALKWIDSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
        GFQIAIENIHSEMYSLLL+TYIKD+ E+  LFRAIET+PCV KKA WA+KWID +++FAERI+AFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
Subjt:  GFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKSRLFRAIETVPCVKKKADWALKWIDSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS

Query:  RDEGLHCDFACLLYSLLRKKLSENRVNEIVTEAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYGKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFE
        RDEGLHCDFACLLY+LL+ KLSE RV  IV +AV+IEREFVCDALP ALVGMN DLMSQYIEFVADRL+GALGYGK+Y V NPFDWMELISLQGKTNFFE
Subjt:  RDEGLHCDFACLLYSLLRKKLSENRVNEIVTEAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYGKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFE

Query:  KRVGEYQKASVMSNLNGNGGI--HEFKMDEDF
        KRVG+YQKASVMS++NGNG    H F +DEDF
Subjt:  KRVGEYQKASVMSNLNGNGGI--HEFKMDEDF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G23580.1 ribonucleotide reductase 2A7.9e-14375.08Show/hide
Query:  SDEPLLSPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDLRHWESLTPDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVSEARAFYGFQIA
        S+EPLL     RF MFPI+Y  IWEMYKKAEASFWTAEEVDLS D++ WE+LT  EKHFI+H+LAFFAASDGIVLENLA RF+ +VQV EARAFYGFQIA
Subjt:  SDEPLLSPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDLRHWESLTPDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVSEARAFYGFQIA

Query:  IENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKSRLFRAIETVPCVKKKADWALKWIDSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGL
        +ENIHSEMYSLLLET+IKDS EK RLF AIET+PC+ KKA W L WI S  SFA R++AFACVEGIFFSGSFC+IFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGL
Subjt:  IENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKSRLFRAIETVPCVKKKADWALKWIDSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGL

Query:  HCDFACLLYSLLRKKLSENRVNEIVTEAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYGKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGE
        HCDFACLLYSLL+K+L   +V +IV EAV+IE EFVC ALP  L+GMN +LMSQYI+FVADRL+  LG  + Y  +NPFDWME ISLQGKTNFFEKRVGE
Subjt:  HCDFACLLYSLLRKKLSENRVNEIVTEAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYGKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGE

Query:  YQKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF
        YQKASVMSNL      +EF  +EDF
Subjt:  YQKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF

AT3G27060.1 Ferritin/ribonucleotide reductase-like family protein5.8e-16282.83Show/hide
Query:  MPSTSDEPLLSPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDLRHWE-SLTPDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVSEARAFY
        MPS  +EPLL+P PDRFCMFPI YPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQD R WE SL   E+HFI HVLAFFAASDGIVLENLA RFM +VQVSEARAFY
Subjt:  MPSTSDEPLLSPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDLRHWE-SLTPDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVSEARAFY

Query:  GFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKSRLFRAIETVPCVKKKADWALKWIDSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
        GFQIAIENIHSEMYSLLL+TYIKD+ E+  LFRAIET+PCV KKA WA+KWID +++FAERI+AFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
Subjt:  GFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKSRLFRAIETVPCVKKKADWALKWIDSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS

Query:  RDEGLHCDFACLLYSLLRKKLSENRVNEIVTEAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYGKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFE
        RDEGLHCDFACLLY+LL+ KLSE RV  IV +AV+IEREFVCDALP ALVGMN DLMSQYIEFVADRL+GALGYGK+Y V NPFDWMELISLQGKTNFFE
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Query:  KRVGEYQKASVMSNLNGNGGI--HEFKMDEDF
        KRVG+YQKASVMS++NGNG    H F +DEDF
Subjt:  KRVGEYQKASVMSNLNGNGGI--HEFKMDEDF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCTTCAACTTCCGACGAGCCACTCCTCTCCCCCAACCCTGATCGCTTCTGCATGTTTCCAATTCAGTACCCTCAAATTTGGGAGATGTACAAGAAGGCCGAAGCTTC
CTTCTGGACCGCCGAGGAAGTCGATCTCTCACAGGATCTTCGCCATTGGGAGTCCTTAACTCCCGACGAGAAGCACTTCATCACTCACGTGCTTGCCTTCTTTGCTGCAT
CTGATGGCATTGTTTTGGAGAATCTTGCTGGACGTTTCATGAAAGAAGTTCAAGTCTCTGAAGCCAGAGCCTTTTATGGATTTCAAATCGCCATTGAAAATATCCACTCT
GAGATGTACAGTCTTCTTCTCGAAACTTATATCAAAGATTCAAACGAGAAGAGTCGATTATTTCGTGCAATCGAGACGGTCCCCTGTGTCAAGAAGAAGGCTGATTGGGC
GTTAAAGTGGATCGACAGCACGGAATCGTTTGCCGAGCGTATTTTGGCATTTGCTTGTGTTGAAGGAATCTTCTTCTCAGGTAGCTTCTGCTCCATTTTCTGGTTGAAAA
AACGTGGATTAATGCCTGGACTCACATTCTCAAATGAGTTGATTTCACGAGACGAGGGTCTTCATTGCGATTTTGCTTGTTTGTTGTATTCATTGTTGAGGAAGAAACTG
AGTGAGAATCGAGTGAATGAGATTGTTACCGAAGCCGTAGATATAGAGAGGGAATTCGTGTGTGATGCCTTGCCTGTTGCTCTAGTTGGAATGAATGGCGATTTGATGAG
CCAATACATTGAATTTGTGGCCGATAGATTGGTTGGAGCTTTAGGGTATGGCAAAATCTATAATGTTCAAAATCCATTTGATTGGATGGAATTGATTTCATTGCAAGGGA
AGACCAATTTCTTTGAAAAAAGAGTTGGGGAATATCAAAAGGCATCTGTGATGTCTAATCTAAATGGTAATGGAGGAATCCATGAGTTTAAGATGGATGAAGATTTCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCCTTCAACTTCCGACGAGCCACTCCTCTCCCCCAACCCTGATCGCTTCTGCATGTTTCCAATTCAGTACCCTCAAATTTGGGAGATGTACAAGAAGGCCGAAGCTTC
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CCAATACATTGAATTTGTGGCCGATAGATTGGTTGGAGCTTTAGGGTATGGCAAAATCTATAATGTTCAAAATCCATTTGATTGGATGGAATTGATTTCATTGCAAGGGA
AGACCAATTTCTTTGAAAAAAGAGTTGGGGAATATCAAAAGGCATCTGTGATGTCTAATCTAAATGGTAATGGAGGAATCCATGAGTTTAAGATGGATGAAGATTTCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPSTSDEPLLSPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDLRHWESLTPDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVSEARAFYGFQIAIENIHS
EMYSLLLETYIKDSNEKSRLFRAIETVPCVKKKADWALKWIDSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLHCDFACLLYSLLRKKL
SENRVNEIVTEAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYGKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGEYQKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF