; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10009139 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10009139
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionTubulin beta chain
Genome locationChr06:2891941..2892229
RNA-Seq ExpressionHG10009139
SyntenyHG10009139
Gene Ontology termsGO:0000226 - microtubule cytoskeleton organization (biological process)
GO:0000278 - mitotic cell cycle (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0005874 - microtubule (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005200 - structural constituent of cytoskeleton (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000217 - Tubulin
IPR008280 - Tubulin/FtsZ, C-terminal
IPR023123 - Tubulin, C-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004143909.2 tubulin beta chain [Cucumis sativus]2.8e-3093.9Show/hide
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XP_008437269.1 PREDICTED: tubulin beta chain-like [Cucumis melo]2.8e-3093.9Show/hide
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XP_022159568.1 tubulin beta chain-like [Momordica charantia]4.3e-3195.12Show/hide
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XP_022958255.1 tubulin beta chain-like [Cucurbita moschata]3.1e-2992.77Show/hide
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XP_038875501.1 tubulin beta chain-like [Benincasa hispida]1.3e-3095.24Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
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A0A1S3ATL6 Tubulin beta chain1.4e-3093.9Show/hide
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A0A5A7THJ1 Tubulin beta chain1.4e-3093.9Show/hide
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A0A6J1DZ61 Tubulin beta chain2.1e-3195.12Show/hide
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A0A6J1K569 Tubulin beta chain1.5e-2992.77Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q39445 Tubulin beta chain1.1e-2986.25Show/hide
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Q41784 Tubulin beta-7 chain3.8e-3088.75Show/hide
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Q6VAF5 Tubulin beta-7 chain1.0e-3090Show/hide
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Q9ZPP0 Tubulin beta-1 chain1.1e-2985.71Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G75780.1 tubulin beta-1 chain8.7e-3083.75Show/hide
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AT2G29550.1 tubulin beta-7 chain8.7e-3083.13Show/hide
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AT5G12250.1 beta-6 tubulin1.3e-3087.5Show/hide
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AT5G23860.1 tubulin beta 88.7e-3083.53Show/hide
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AT5G23860.2 tubulin beta 88.7e-3083.53Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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