; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10009476 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10009476
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionProtein TIC 214
Genome locationChr06:6396130..6404641
RNA-Seq ExpressionHG10009476
SyntenyHG10009476
Gene Ontology termsGO:0015031 - protein transport (biological process)
GO:0015979 - photosynthesis (biological process)
GO:0009706 - chloroplast inner membrane (cellular component)
GO:0031361 - integral component of thylakoid membrane (cellular component)
GO:0005506 - iron ion binding (molecular function)
GO:0009055 - electron transfer activity (molecular function)
GO:0020037 - heme binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002325 - Cytochrome f
IPR008896 - Protein TIC214
IPR024094 - Cytochrome f large domain
IPR036826 - Cytochrome f large domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
QJD26342.1 Ycf1 [Trichosanthes kirilowii]1.0e-10099.48Show/hide
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YP_009430686.1 photosystem I assembly protein Ycf1 [Gynostemma cardiospermum]1.0e-10099.48Show/hide
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YP_009440204.1 hypothetical chloroplast RF19-like protein [Gynostemma longipes]1.0e-10099.48Show/hide
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YP_009738261.1 Ycf1 [Siraitia siamensis]1.0e-10099.48Show/hide
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YP_009753666.1 Ycf1 protein [Trichosanthes wallichiana]1.0e-10099.48Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1P8LE53 Ycf15.1e-10199.48Show/hide
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A0A6M3RU58 Protein TIC 2145.1e-10199.48Show/hide
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A0A6M3RWE9 Protein TIC 2145.1e-10199.48Show/hide
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A0A6M3S424 Protein TIC 2145.1e-10199.48Show/hide
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A0A6M3S6W7 Protein TIC 2145.1e-10199.48Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A4GYX4 Protein TIC 2143.2e-10095.88Show/hide
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A6MM95 Protein TIC 2142.7e-9994.76Show/hide
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P56785 Protein TIC 2144.6e-9994.85Show/hide
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Q09WW0 Protein TIC 2141.4e-10096.39Show/hide
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Q14FA0 Protein TIC 2143.2e-10095.88Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G07739.1 Ycf1 protein1.6e-7886.11Show/hide
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ATCG00540.1 photosynthetic electron transfer A1.1e-3490.79Show/hide
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ATCG01000.1 Ycf1 protein3.2e-10094.85Show/hide
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ATCG01130.1 Ycf1 protein3.2e-10094.85Show/hide
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ATMG00370.1 Ycf1 protein3.2e-7986.67Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GGGCTGTTCTTATTTTACCCGAAGGACAGCTCAGGAGGAGTAGAAAGTTGCCACAACCTAGGATGGGGTTTGCTTTCGAGTCAGCCAAAGTCCGCCTTTTTACAAACTTA
TTAAAGGGGGAGAGCGCCAGGACGGACGGCGTCAAGGAGAACGTCGAGACGCCATCAGTTTGGAGCGCGAGGCCTGCAGAGCTTCCTGCAAAGGAGATAAGAAAAGGCTC
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GTAATCTAGTATCCTTATGCATGAAGATAATCAATTCGGTCGTTGTGGTCGGACTCTATTATGGATTTCTGACCACATTCTCCATAGGGCCCTCTTATCTCTTCCTTCTC
CGAGCTCGGGTTATGGAAGAAGGAACCGAGAAGAAAGTATCAGCAACAACAGGTTTTATTACGGGACAGCTCATGATGTTCATATCGATCTATTATGCGCCTCTGCATCT
AGCATTGGGTAGACCTCATACAATAACTGTCCTAGCTCTACTGTATCTTTTGTTTCATTTCTTCTGGAACAATCACAAACACTTTTTTGATTATGGATCTACTACCAGAA
ACTCAATGCGTAATCTTAGCATTCAATGTGTATTCCTGAATAATCTCATTTTTCAATTATTCAACCATTTCATTTTACCAAGTTCAATGTTAGTCAGATTAGTCAACATT
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ACAGCAAAATAATTCTATTAGATTCGCCCTCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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AGCATTGGGTAGACCTCATACAATAACTGTCCTAGCTCTACTGTATCTTTTGTTTCATTTCTTCTGGAACAATCACAAACACTTTTTTGATTATGGATCTACTACCAGAA
ACTCAATGCGTAATCTTAGCATTCAATGTGTATTCCTGAATAATCTCATTTTTCAATTATTCAACCATTTCATTTTACCAAGTTCAATGTTAGTCAGATTAGTCAACATT
TCTATGTTTCGATGCAACAACAAGATGTTATTTGTAACAAGTAGTTTTGTTGGTTGGTTAATTGGTCACATTTTATTCATGAAATGGGTTGGATTGATATTAGTCTGGAT
ACAGCAAAATAATTCTATTAGATTCGCCCTCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SMFRCNNKMLFVTSSFVGWLIGHILFMKWVGLILVWIQQNNSIRFAL