; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10009982 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10009982
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionHigh molecular weight glutenin subunit
Genome locationChr06:16070390..16070827
RNA-Seq ExpressionHG10009982
SyntenyHG10009982
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CAA2108424.1 hypothetical protein VVAX_04934 [Variovorax paradoxus]6.4e-1442.96Show/hide
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        G+ G+LG + GG+   G G L DG+ GN+G+VG +L  DG++
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SDY71664.1 hypothetical protein SAMN05518669_11544 [Variovorax sp. YR634]2.4e-1341.94Show/hide
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        + GG+    G L  GI G++G++G
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WP_093057540.1 hypothetical protein [Variovorax sp. YR634]2.4e-1341.94Show/hide
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        + GG+    G L  GI G++G++G
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WP_125949639.1 MULTISPECIES: hypothetical protein [unclassified Variovorax]1.3e-1445.11Show/hide
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        +VG L  G+ G G G L DG+ G++G++  L GG+ G G G L DG+ G++G++G L GG+ G G G L DG+ G++G++G L GG+ G G G L DG+ 
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WP_125966597.1 hypothetical protein [Variovorax beijingensis]3.7e-1446.43Show/hide
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        +VG L  G +LG   +GG L  G+ G +G++D L GG L +GG L DG+ G +G++G L GG +LG   +GG L DG+ G +G++G L GG +LG   +G
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        G L DG+ G +G+LG L GG L +GG L DG+ G +G+VG
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1H7EDJ9 Uncharacterized protein2.6e-1343.08Show/hide
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        G L  G+LG  G L  G+ G++G+L  + GG+ G G G L DG+ G+ G+LG + GG+  G  G L DG+ G++G+LG + GG+ G G G L DG+ G+ 
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        G+LG + GG+ + G G L DG+ G++G++G
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A0A286AQL9 Uncharacterized protein1.2e-1341.94Show/hide
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        L  G+LG  G L  G+ G++G+L  + GG+ G  G L  GI G++G+LG + GG+ G  G L  GI G++G+LG + GG+ G  G L  GI G++G+LG 
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        + GG+    G L  GI G++G++G
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A0A2W7GYA3 Uncharacterized protein3.9e-1745.77Show/hide
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        +VG L  G+ G G G L DG+ GN+G++  L GG+ G G G L +G+ G++G++G L GG+ G G G L DG+ GN+G++G L GG+ G G G L DG+ 
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A0A3S0HAP9 Uncharacterized protein6.2e-1545.11Show/hide
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A0A679JQE2 Uncharacterized protein3.1e-1442.96Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTAGGGATACTAACAAGTGGGATATTAGGGATGGGAGGCAAACTAGCAGATGGAATAGAAGGCAATGAAGGAATGTTAGACATACTAACGGGTGGGATATTAGGGAT
GGGAGGCAAACTAGCGGATGGAATAGAAGGCAATGAAGGAATGTTAGGCATACTAACGGGTGGGATATTAGGGATGGGAGGCAAACTAGCGGATGGAATAGAAGGCAATG
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GAGATGGGAGGCAAATTAACAGATGGAATAGAAGGTAATGAAGGAATGGTCGGGATATTAACAATGGATGGAATATTATTGGAGGAGGATGGTTTTTGTTGGAGATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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