CuGenDBv2

Gene ID	HG10010003
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	Protein Ycf2
Genome location	Chr06:16664072..16664596
RNA-Seq Expression	HG10010003
Synteny	HG10010003
Gene Ontology terms	GO:0009570 - chloroplast stroma (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0005524 - ATP binding (molecular function) GO:0016887 - ATPase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR003959 - ATPase, AAA-type, core IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

QIT04093.1 Ycf2 protein [Luffa aegyptiaca]

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QJR53001.1 hypothetical protein RF2 [Herpetospermum pedunculosum]

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YP_009751528.1 Ycf2 protein [Thladiantha dubia]

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YP_009751696.1 Ycf2 protein [Hodgsonia heteroclita]

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YP_009752370.1 Ycf2 protein [Bryonia marmorata]

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A0A410HFC5 Protein Ycf2

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A0A6H0ERQ9 Protein Ycf2

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A0A6H0ET42 Protein Ycf2

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A0A6M3RUH1 Protein Ycf2

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A0A7G9IT80 Protein Ycf2

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SwissProt top hits

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A4GYV4 Protein Ycf2

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Q09WV7 Protein Ycf2

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Q0ZIV6 Protein Ycf2

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Q14F97 Protein Ycf2

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Q49KT6 Protein Ycf2

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Arabidopsis top hits

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ATCG01280.1 Chloroplast Ycf2;ATPase, AAA type, core

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

TTCCTGGATAACAAGCCTAAGGGTTTTCTTATTGATGATAGTGACGATATTGATGATAGTGGCGATATTGATGATAGTGACGATATCGACCGTGACCTTGATACGGAGCT
GGAGCTTCTAACTATGATGAATGCGCTAACTATGGATATGATGCCGGAAATAGACCGATTTTATATCACCCTTCAATTCGAATTAGCAAAAGCAATGTCTCCTTGCATAA
TATGGATTCCAAACATTCATGATCTGGATGTGAATGAGTCGAATTACTTATCCCTTGGTCTATTAGTGAACTATCTCTCCAGGGATTGTGAAAGATGTTCCACTAGAAAT
ATTCTTGTTATTGCTTCGACCCATATTCCCCAAAAAGTGGATCCCGCTCTAATAGCTCCGAATAAATTAAATACATGCATTAAAATACGAAGGCTTCTTATTCCACAACA
ACGAAAGCACTTTTTCACTCTTTCATATACTAGGGATTTCACTTGGAAAAGAAAATGTTCCATACTAATGGATTCGGTTCCATAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

FLDNKPKGFLIDDSDDIDDSGDIDDSDDIDRDLDTELELLTMMNALTMDMMPEIDRFYITLQFELAKAMSPCIIWIPNIHDLDVNESNYLSLGLLVNYLSRDCERCSTRN
ILVIASTHIPQKVDPALIAPNKLNTCIKIRRLLIPQQRKHFFTLSYTRDFTWKRKCSILMDSVP

HG10010003 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome