; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10010697 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10010697
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionPollen Ole e 1 allergen and extensin family protein
Genome locationChr06:24918514..24919773
RNA-Seq ExpressionHG10010697
SyntenyHG10010697
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0039837.1 extensin [Cucumis melo var. makuwa]2.1e-15074.74Show/hide
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XP_004140544.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 3 [Cucumis sativus]1.8e-15475.38Show/hide
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                                                  NPP                     PSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP PPPPSS
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XP_008459888.1 PREDICTED: extensin [Cucumis melo]2.1e-15074.74Show/hide
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XP_023515622.1 formin-2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.5e-14469.4Show/hide
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                SPPP  PS PPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAF+PRDPRTWIPHIPPF+   PPAFDPRDPRTWIPHIPPFF PPPPAFDLRDPRTWIP
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        HFPPSPPQG QNQKP
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XP_038906532.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 5 [Benincasa hispida]1.4e-15477.32Show/hide
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        DPTIS LLLLFLTSFFTN FGLTA A  SVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVD
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                                                            +PPPPS PPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP PP PSSPPPFSLSDPR
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        TWIPH+PPFSPPPPPAF+PRDPRTWIPHIPPFSPS PPAFDPRDPRTWIP+IPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPH PPSPPQ PQNQKP
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAD5 Uncharacterized protein8.8e-15575.38Show/hide
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                                                  NPP                     PSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP PPPPSS
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A0A1S3CB81 extensin1.0e-15074.74Show/hide
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A0A5D3DMB9 Extensin1.0e-15074.74Show/hide
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                                                                +PP PS PPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP PPPPSSPPPFSL
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A0A6J1GPH0 formin-2-like7.0e-14469.4Show/hide
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        +FLMDPTIS  LLLFL SFF N FGLTAE  ASV RI+VVGAVYCDTCLSNS+SKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQM+FSVNRTTDKYGVYRLEI
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        PSVDG NCVDGMTMQSFCQA+LIG+SS VCNVPGLRT SEEIS+KSKQDNLCIFSLNALSYRP+KKN SLCG++KEK PDPLTS                
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Query:  -------------------------------------------------SNPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSP-------------------
                                                         S+PPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP                   
Subjt:  -------------------------------------------------SNPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSP-------------------

Query:  --------SPPP--PSSPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFNPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIP
                SPPP  PS PPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAF+PRDPRTWIPHIPPF+   PPAFDPRDPRTWIPHIPPFF PPPPAFDLRDPRTWIP
Subjt:  --------SPPP--PSSPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFNPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIP

Query:  HFPPSPPQGPQNQKP
        HFPPSPPQG QNQKP
Subjt:  HFPPSPPQGPQNQKP

A0A6J1JLM5 extensin-like5.0e-14269.01Show/hide
Query:  MFLMDPTISLLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEI
        +FLMDPTIS  LLLFL SFF N FGLTAE   SVTRI+VVGAVYCDTCLSNS+SKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQM+FSVNRTTDKYGVYRLEI
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Query:  PSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPDPLTS----------------
        PSVDG NCVDGMTMQSFCQA+LIG+S  VCNVPGLRT SEEIS+KSKQDNLCIFSLNALSYRP+KKN SLCG++KEK PDPLTS                
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Query:  -------------------------------------------------SNPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPP----PPSSPPPFSLSD
                                                         S+PPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYV PFSP PP     P  PPPFSLSD
Subjt:  -------------------------------------------------SNPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPP----PPSSPPPFSLSD

Query:  PRTWIPHVPPFSPPPPPAFNPRDPRTWIPHIPPFS----------------PSL-------PPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHF
        PRTWIPHVPPFSPPPPPAF+PRDPRTWIPHIPPF+                P +       PPAFDPRDPRTWIPHIPPFF PPPPAFDLRDPRTWIPHF
Subjt:  PRTWIPHVPPFSPPPPPAFNPRDPRTWIPHIPPFS----------------PSL-------PPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHF

Query:  PPSPPQGPQNQKP
        PPSPPQG QNQKP
Subjt:  PPSPPQGPQNQKP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P13983 Extensin2.5e-0537.91Show/hide
Query:  PLTSSNPPPPS---APPPPPPFS--LSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFNPRDPRTWIPHIPPFS--PSLPPAF
        P  S +PPPP+   +PPPPP +S  L  P T+ P  P +SP PP  + PPP     P T+ P  P +SPPPPP ++P  P T+ P  P ++  P  PP +
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Query:  DPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIP-----HFPPSPPQGPQNQKP
         P  P    P   P + PPPP      P    P     H PP P + P+   P
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Q9LK03 Proline-rich receptor-like protein kinase PERK28.6e-0641.77Show/hide
Query:  PDPLTSSNPPPPSA-----PPPPPPFSL------SDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPF-----SLSDPRTWIPHV--PPFSPPPPPAFNPRDPRTWIP
        P PL  + PPPP+A     PPPPPP +L        P T +P +PP +PSPPPP +P P      + S P T  P    PP +P PPPA  P  P T  P
Subjt:  PDPLTSSNPPPPSA-----PPPPPPFSL------SDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPF-----SLSDPRTWIPHV--PPFSPPPPPAFNPRDPRTWIP

Query:  HIPPFSPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLR--DPRTWIPHFPPSPPQGP
         +PP SP+ P    P  P   IP  PP  P PPP+  LR   P    P  P +PP+ P
Subjt:  HIPPFSPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLR--DPRTWIPHFPPSPPQGP

Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 36.6e-0639.16Show/hide
Query:  PDPLTSSNPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFNPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDP
        P P    +PPPP  PPPPPP     P    P  PP   SPPPPS PPP     P  + P  PP  PPPPP ++P  P  +    PP SP+  P +  R P
Subjt:  PDPLTSSNPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFNPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDP

Query:  RTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP
               PP   PPPP F    P  +    PP P   P    P
Subjt:  RTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G26960.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein3.1e-3547.52Show/hide
Query:  ITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGS---SSTVCNVP
        IT++G VYCD C  NS SKHSYF+ GV+V + C+F+A +    E + FS NRTT+++G+Y++ I S+D   C D  ++ S CQASLIG    S + CN+P
Subjt:  ITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGS---SSTVCNVP

Query:  GLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNK
        G RTT++++  KS+Q N C++  NAL++RP K++ +LCG K
Subjt:  GLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNK

AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein4.7e-0739.16Show/hide
Query:  PDPLTSSNPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFNPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDP
        P P    +PPPP  PPPPPP     P    P  PP   SPPPPS PPP     P  + P  PP  PPPPP ++P  P  +    PP SP+  P +  R P
Subjt:  PDPLTSSNPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFNPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDP

Query:  RTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP
               PP   PPPP F    P  +    PP P   P    P
Subjt:  RTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGPQNQKP

AT4G22505.1 Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein1.0e-0641.36Show/hide
Query:  PLTSSNPPP--PSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFNPRDPRTWIPHIPPFS---------PSL
        P T S PPP  P  PPPPPP     PRT  P  PP +P  PPP  PPP +   P T  P  PP SP  PP   P+ P T  P  PP S         P  
Subjt:  PLTSSNPPP--PSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFNPRDPRTWIPHIPPFS---------PSL

Query:  PPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPP---------PPPAFDLRDPRTWIPHFPP-SPPQGPQNQKP
        PP   PR P T  P +PP  PP          PP    R P T  P  PP SPP+ P    P
Subjt:  PPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPP---------PPPAFDLRDPRTWIPHFPP-SPPQGPQNQKP

AT5G13140.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein8.2e-4441.55Show/hide
Query:  ISLLLLLFLTSFFTNFF-------GLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEI
        + LL LLFL S  T+              +L   +RITVVG VYCDTC  N+ S+ SYFL GV+VH+ C+F+A +PK AE++  SVNRTT++ GVY+LEI
Subjt:  ISLLLLLFLTSFFTNFF-------GLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEI

Query:  PSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGSSST---VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGN--KKEKIPDPLTSSNPPPPSAPPP
        P VDGI+CVDG+ + S C A ++ +SS     C++P  +T + E+S+KSKQD +CI+SL+ALSY+P  KN SLCGN  KK    D               
Subjt:  PSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGSSST---VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGN--KKEKIPDPLTSSNPPPPSAPPP

Query:  PPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFNPRDPRTWIPHIPPFSPSLP-PAFDPRDPRTWIPHIPPFFP
               D + + PY+ P+    P P  PP          +P +PPF     P+F         P +P  +P+L  PAFD ++P TWIP++P F P
Subjt:  PPPFSLSDPRTWIPYVPPFSPSPPPPSSPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFNPRDPRTWIPHIPPFSPSLP-PAFDPRDPRTWIPHIPPFFP

AT5G41050.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein7.4e-3744.58Show/hide
Query:  LLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCV
        ++LLL L     N   L   +     +ITV+G VYCD C +NS S HSYF+PGV+V + C+F + + +  E + FS NRTT++ G+Y+L+I S++G+ C 
Subjt:  LLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCV

Query:  DGM---TMQSFCQASLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG
              ++ + CQASLIG S   CNVPG RTT+E++  KSK  NLC++   AL++RP++KN  LCG
Subjt:  DGM---TMQSFCQASLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTTCTTATGGATCCCACCATTTCTCTCCTTCTTCTCCTTTTTTTAACATCTTTCTTCACTAACTTCTTTGGCCTAACAGCTGAAGCCCTAGCATCGGTCACT
CGGATCACGGTAGTGGGTGCAGTTTATTGTGACACATGTTTGAGCAACAGTGTCTCCAAACACAGCTATTTCTTGCCTGGTGTGGATGTCCATTTACAGTGCAAA
TTCAGAGCAGTTGCTCCCAAAATGGCTGAGCAAATGGCCTTCTCTGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGTATATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGA
ATCAATTGTGTTGATGGTATGACAATGCAGTCATTTTGCCAGGCAAGCTTAATTGGAAGCTCATCTACAGTTTGCAATGTCCCAGGTTTAAGAACTACTTCGGAA
GAGATATCGGTCAAGTCTAAGCAAGATAATCTCTGTATATTCAGCTTAAATGCTTTGAGTTACAGGCCAATGAAGAAGAATGAAAGCTTATGTGGGAATAAGAAA
GAGAAAATTCCAGATCCATTGACCTCCTCAAATCCACCTCCGCCATCTGCACCACCTCCGCCGCCCCCATTTAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCTAT
GTTCCTCCATTTTCTCCTTCCCCGCCTCCACCATCGTCGCCACCTCCATTCAGTCTCAGCGATCCAAGAACCTGGATACCCCATGTTCCTCCATTTTCCCCTCCC
CCACCTCCTGCTTTCAATCCCCGAGACCCGAGAACCTGGATTCCCCATATCCCTCCATTTTCTCCCTCCCTACCTCCTGCATTTGATCCTAGAGACCCCAGAACA
TGGATTCCCCATATTCCTCCATTTTTCCCTCCCCCACCTCCTGCATTCGACCTTAGAGACCCCAGAACATGGATACCTCATTTCCCCCCATCCCCTCCACAGGGC
CCTCAAAATCAAAAGCCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTTCTTATGGATCCCACCATTTCTCTCCTTCTTCTCCTTTTTTTAACATCTTTCTTCACTAACTTCTTTGGCCTAACAGCTGAAGCCCTAGCATCGGTCACT
CGGATCACGGTAGTGGGTGCAGTTTATTGTGACACATGTTTGAGCAACAGTGTCTCCAAACACAGCTATTTCTTGCCTGGTGTGGATGTCCATTTACAGTGCAAA
TTCAGAGCAGTTGCTCCCAAAATGGCTGAGCAAATGGCCTTCTCTGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGTATATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGA
ATCAATTGTGTTGATGGTATGACAATGCAGTCATTTTGCCAGGCAAGCTTAATTGGAAGCTCATCTACAGTTTGCAATGTCCCAGGTTTAAGAACTACTTCGGAA
GAGATATCGGTCAAGTCTAAGCAAGATAATCTCTGTATATTCAGCTTAAATGCTTTGAGTTACAGGCCAATGAAGAAGAATGAAAGCTTATGTGGGAATAAGAAA
GAGAAAATTCCAGATCCATTGACCTCCTCAAATCCACCTCCGCCATCTGCACCACCTCCGCCGCCCCCATTTAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCTAT
GTTCCTCCATTTTCTCCTTCCCCGCCTCCACCATCGTCGCCACCTCCATTCAGTCTCAGCGATCCAAGAACCTGGATACCCCATGTTCCTCCATTTTCCCCTCCC
CCACCTCCTGCTTTCAATCCCCGAGACCCGAGAACCTGGATTCCCCATATCCCTCCATTTTCTCCCTCCCTACCTCCTGCATTTGATCCTAGAGACCCCAGAACA
TGGATTCCCCATATTCCTCCATTTTTCCCTCCCCCACCTCCTGCATTCGACCTTAGAGACCCCAGAACATGGATACCTCATTTCCCCCCATCCCCTCCACAGGGC
CCTCAAAATCAAAAGCCCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFLMDPTISLLLLLFLTSFFTNFFGLTAEALASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMAFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDG
INCVDGMTMQSFCQASLIGSSSTVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPMKKNESLCGNKKEKIPDPLTSSNPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPY
VPPFSPSPPPPSSPPPFSLSDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFNPRDPRTWIPHIPPFSPSLPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQG
PQNQKP