; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10010944 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10010944
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationChr01:683021..683677
RNA-Seq ExpressionHG10010944
SyntenyHG10010944
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
No hits found
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A210PEF8 Uncharacterized protein9.7e-0441.13Show/hide
Query:  GGRGGIWGSNEASEVVDNGGRWSAVDSVSVEG-GGIGVKSEKG--GGMSSMDSMGGMGSVEG-------EGMGSVEGRGRGSIEG----GGLGSVDSVGG
        GG G + G      +   GG  S   S S+ G GG+G  S  G  G M  M SMGGMGS+ G        GMGS+ G   GS+ G    GG+G + S+GG
Subjt:  GGRGGIWGSNEASEVVDNGGRWSAVDSVSVEG-GGIGVKSEKG--GGMSSMDSMGGMGSVEG-------EGMGSVEGRGRGSIEG----GGLGSVDSVGG

Query:  MGSVDSEGGMGSVHSVDG-GKMDLVDSVGGMSSMQSMEGGG
        MGS+   GGM S+  +   G M  + S+GGM  M SM G G
Subjt:  MGSVDSEGGMGSVHSVDG-GKMDLVDSVGGMSSMQSMEGGG
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTATTTATGTTTCTTCGTTAGAGGGGTGTACGGTTGTGTCGGCTTCCTCTTCCTACTTGCCCATCTCTGTTCCTTTTCAACGTCCACAAGCTCGCCCTTCACCTTAGG
ATCAGGATCGGCCATACGCTCGCCCTTCACCTTGGGCTCGCCCTTAATCCTCAACCTCTTCAACGGTTGCCAGAGAAGCAACTCGAGATGCAGTAGGGTCAATGGAGGAA
GAGGTGGTATATGGGGAAGCAACGAAGCAAGCGAAGTGGTGGATAATGGTGGAAGATGGAGTGCGGTGGACTCGGTGTCAGTGGAGGGTGGAGGGATAGGTGTAAAGTCA
GAGAAGGGTGGAGGGATGAGCTCGATGGACTCGATGGGAGGGATGGGATCAGTGGAAGGTGAAGGAATGGGCTCGGTGGAGGGTAGAGGAAGGGGCTCAATAGAGGGTGG
AGGGTTGGGCTCGGTTGACTCGGTGGGAGGAATGGGTTCGGTGGACTCAGAGGGAGGGATGGGCTCGGTGCACTCAGTGGATGGTGGAAAAATGGACTTGGTGGACTCGG
TGGGAGGGATGAGCTCGATGCAATCAATGGAGGGTGGGGGAATGGACTCGTGGATTCGGAGGAAAGGATGGGATCAACGGAGGGTGGAGGAATGGGCTCTATGTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTATTTATGTTTCTTCGTTAGAGGGGTGTACGGTTGTGTCGGCTTCCTCTTCCTACTTGCCCATCTCTGTTCCTTTTCAACGTCCACAAGCTCGCCCTTCACCTTAGG
ATCAGGATCGGCCATACGCTCGCCCTTCACCTTGGGCTCGCCCTTAATCCTCAACCTCTTCAACGGTTGCCAGAGAAGCAACTCGAGATGCAGTAGGGTCAATGGAGGAA
GAGGTGGTATATGGGGAAGCAACGAAGCAAGCGAAGTGGTGGATAATGGTGGAAGATGGAGTGCGGTGGACTCGGTGTCAGTGGAGGGTGGAGGGATAGGTGTAAAGTCA
GAGAAGGGTGGAGGGATGAGCTCGATGGACTCGATGGGAGGGATGGGATCAGTGGAAGGTGAAGGAATGGGCTCGGTGGAGGGTAGAGGAAGGGGCTCAATAGAGGGTGG
AGGGTTGGGCTCGGTTGACTCGGTGGGAGGAATGGGTTCGGTGGACTCAGAGGGAGGGATGGGCTCGGTGCACTCAGTGGATGGTGGAAAAATGGACTTGGTGGACTCGG
TGGGAGGGATGAGCTCGATGCAATCAATGGAGGGTGGGGGAATGGACTCGTGGATTCGGAGGAAAGGATGGGATCAACGGAGGGTGGAGGAATGGGCTCTATGTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MYLCFFVRGVYGCVGFLFLLAHLCSFSTSTSSPFTLGSGSAIRSPFTLGSPLILNLFNGCQRSNSRCSRVNGGRGGIWGSNEASEVVDNGGRWSAVDSVSVEGGGIGVKS
EKGGGMSSMDSMGGMGSVEGEGMGSVEGRGRGSIEGGGLGSVDSVGGMGSVDSEGGMGSVHSVDGGKMDLVDSVGGMSSMQSMEGGGMDSWIRRKGWDQRRVEEWALC