CuGenDBv2

Gene ID	HG10011395
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	protein SIEVE ELEMENT OCCLUSION B
Genome location	Chr01:5582032..5582553
RNA-Seq Expression	HG10011395
Synteny	HG10011395
Gene Ontology terms	GO:0010088 - phloem development (biological process)
InterPro domains	IPR027944 - Sieve element occlusion, C-terminal IPR039299 - Protein SIEVE ELEMENT OCCLUSION

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAA0037841.1 protein SIEVE ELEMENT OCCLUSION B [Cucumis melo var. makuwa]

2.7e-96

95.95

Show/hide

Query:  MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPTLG
        MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESML+SKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGS VILNGHSTTVLPTLG
Subjt:  MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPTLG

Query:  SYDSWKQQAAEKGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENSDE
        S+DSWKQ+AA+KGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHT+GRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENS+E
Subjt:  SYDSWKQQAAEKGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENSDE

XP_004145690.1 protein SIEVE ELEMENT OCCLUSION B [Cucumis sativus]

1.1e-94

94.22

Show/hide

Query:  MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPTLG
        MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESML+SKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGS VILNGHSTT+LPTLG
Subjt:  MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPTLG

Query:  SYDSWKQQAAEKGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENSDE
        S+DSWKQ+A +KGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHT+GRIPENFKCP CDRQMEKLTTFLCCHDENS+E
Subjt:  SYDSWKQQAAEKGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENSDE

XP_008449999.1 PREDICTED: protein SIEVE ELEMENT OCCLUSION B [Cucumis melo]

2.7e-96

95.95

Show/hide

Query:  MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPTLG
        MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESML+SKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGS VILNGHSTTVLPTLG
Subjt:  MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPTLG

Query:  SYDSWKQQAAEKGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENSDE
        S+DSWKQ+AA+KGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHT+GRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENS+E
Subjt:  SYDSWKQQAAEKGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENSDE

XP_022154134.1 protein SIEVE ELEMENT OCCLUSION B [Momordica charantia]

1.9e-94

95.95

Show/hide

Query:  MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPTLG
        MVYVGKSSKRERVK+IITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADD DPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPTLG
Subjt:  MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPTLG

Query:  SYDSWKQQAAEKGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENSDE
        S+DSWKQQAA+KGFD AFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDE S E
Subjt:  SYDSWKQQAAEKGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENSDE

XP_038903849.1 protein SIEVE ELEMENT OCCLUSION B [Benincasa hispida]

5.5e-97

97.11

Show/hide

Query:  MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPTLG
        MVYVGKSSKRERVKKIITTI TEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESML+SKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPTLG
Subjt:  MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPTLG

Query:  SYDSWKQQAAEKGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENSDE
        S+DSWKQQAA+KGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENS+E
Subjt:  SYDSWKQQAAEKGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENSDE

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LBZ8 Uncharacterized protein

5.5e-95

94.22

Show/hide

Query:  MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPTLG
        MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESML+SKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGS VILNGHSTT+LPTLG
Subjt:  MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPTLG

Query:  SYDSWKQQAAEKGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENSDE
        S+DSWKQ+A +KGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHT+GRIPENFKCP CDRQMEKLTTFLCCHDENS+E
Subjt:  SYDSWKQQAAEKGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENSDE

A0A1S3BNA0 protein SIEVE ELEMENT OCCLUSION B

1.3e-96

95.95

Show/hide

Query:  MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPTLG
        MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESML+SKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGS VILNGHSTTVLPTLG
Subjt:  MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPTLG

Query:  SYDSWKQQAAEKGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENSDE
        S+DSWKQ+AA+KGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHT+GRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENS+E
Subjt:  SYDSWKQQAAEKGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENSDE

A0A5D3DVA0 Protein SIEVE ELEMENT OCCLUSION B

1.3e-96

95.95

Show/hide

Query:  MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPTLG
        MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESML+SKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGS VILNGHSTTVLPTLG
Subjt:  MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPTLG

Query:  SYDSWKQQAAEKGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENSDE
        S+DSWKQ+AA+KGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHT+GRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENS+E
Subjt:  SYDSWKQQAAEKGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENSDE

A0A6J1DL59 protein SIEVE ELEMENT OCCLUSION B

9.4e-95

95.95

Show/hide

Query:  MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPTLG
        MVYVGKSSKRERVK+IITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADD DPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPTLG
Subjt:  MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPTLG

Query:  SYDSWKQQAAEKGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENSDE
        S+DSWKQQAA+KGFD AFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDE S E
Subjt:  SYDSWKQQAAEKGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENSDE

A0A6J1JPN3 protein SIEVE ELEMENT OCCLUSION B

1.7e-91

91.33

Show/hide

Query:  MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPTLG
        MVYVGKSSKRERV++IITTITT+KLGYCW DLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADD DPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVI+NGHSTTVLPTL 
Subjt:  MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPTLG

Query:  SYDSWKQQAAEKGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENSDE
        ++DSWKQQAA++GFD+AFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDR MEKLTTFLCCHDE  DE
Subjt:  SYDSWKQQAAEKGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENSDE

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q93XX2 Protein SIEVE ELEMENT OCCLUSION A

2.0e-25

37.08

Show/hide

Query:  MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKA-----------DDCDPLMQEIKKLLSYDKEG-GWAVLSKGSTVIL
        MVYVGK + +  ++ II TI  E L +   DL  IWFFWTR+ESM  SK ++ KA           ++ D ++QE+  +L Y  EG GW ++SK S +++
Subjt:  MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKA-----------DDCDPLMQEIKKLLSYDKEG-GWAVLSKGSTVIL

Query:  NGHSTTVLPTLGSYDSWKQQAAEKGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCC
                  L  ++ W+     KGF  A  N H  ++   H C RF  P T G IP   +C EC R MEK   + CC
Subjt:  NGHSTTVLPTLGSYDSWKQQAAEKGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCC

Q9SS87 Protein SIEVE ELEMENT OCCLUSION B

8.9e-42

48.89

Show/hide

Query:  MVYVGK--SSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPT
        M YVGK   S RE++++I   I +E L + W +  ++WFFWTR+ESML+SKIQLGKADD D +MQ IKK+LSYDK GGWA+LSKG  +++  H   +  T
Subjt:  MVYVGK--SSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPT

Query:  LGSYD-SWKQQAAEKGFDIAFKNHHDE--LQGITHPCCRFEFPHT--TGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENSDE
        +  YD +WK     KG+  A  +HH +  L+    PC  F+F  T  +GRIPE   C EC R MEK  +F CCHDE   E
Subjt:  LGSYD-SWKQQAAEKGFDIAFKNHHDE--LQGITHPCCRFEFPHT--TGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENSDE

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G01670.1 unknown protein

1.4e-26

37.08

Show/hide

Query:  MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKA-----------DDCDPLMQEIKKLLSYDKEG-GWAVLSKGSTVIL
        MVYVGK + +  ++ II TI  E L +   DL  IWFFWTR+ESM  SK ++ KA           ++ D ++QE+  +L Y  EG GW ++SK S +++
Subjt:  MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKA-----------DDCDPLMQEIKKLLSYDKEG-GWAVLSKGSTVIL

Query:  NGHSTTVLPTLGSYDSWKQQAAEKGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCC
                  L  ++ W+     KGF  A  N H  ++   H C RF  P T G IP   +C EC R MEK   + CC
Subjt:  NGHSTTVLPTLGSYDSWKQQAAEKGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCC

AT3G01680.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mediator complex subunit Med28 (InterPro:IPR021640)

6.3e-43

48.89

Show/hide

Query:  MVYVGK--SSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPT
        M YVGK   S RE++++I   I +E L + W +  ++WFFWTR+ESML+SKIQLGKADD D +MQ IKK+LSYDK GGWA+LSKG  +++  H   +  T
Subjt:  MVYVGK--SSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPT

Query:  LGSYD-SWKQQAAEKGFDIAFKNHHDE--LQGITHPCCRFEFPHT--TGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENSDE
        +  YD +WK     KG+  A  +HH +  L+    PC  F+F  T  +GRIPE   C EC R MEK  +F CCHDE   E
Subjt:  LGSYD-SWKQQAAEKGFDIAFKNHHDE--LQGITHPCCRFEFPHT--TGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENSDE

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGTGTACGTAGGAAAAAGCAGCAAAAGAGAACGCGTCAAGAAAATCATTACAACAATCACAACAGAAAAACTTGGCTATTGCTGGCAAGATCTTACCATGATTTGGTT
CTTCTGGACTCGAATCGAGAGCATGCTTTTCTCCAAGATTCAATTAGGAAAAGCCGACGATTGCGATCCTCTGATGCAAGAAATCAAAAAGCTCCTCAGCTACGACAAAG
AAGGAGGATGGGCGGTTCTGAGCAAAGGATCAACCGTGATCCTCAACGGCCACAGCACCACTGTCTTGCCCACCCTCGGGAGTTACGATTCATGGAAGCAACAGGCCGCC
GAAAAGGGTTTCGACATAGCTTTCAAGAATCACCACGACGAACTTCAAGGCATTACTCATCCTTGTTGCCGCTTCGAATTTCCTCACACCACTGGGAGAATTCCGGAGAA
TTTCAAGTGCCCTGAATGCGATCGGCAAATGGAGAAACTCACCACGTTCCTCTGCTGCCATGACGAAAATTCAGATGAATGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MVYVGKSSKRERVKKIITTITTEKLGYCWQDLTMIWFFWTRIESMLFSKIQLGKADDCDPLMQEIKKLLSYDKEGGWAVLSKGSTVILNGHSTTVLPTLGSYDSWKQQAA
EKGFDIAFKNHHDELQGITHPCCRFEFPHTTGRIPENFKCPECDRQMEKLTTFLCCHDENSDE

HG10011395 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome