; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10011401 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10011401
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2
Genome locationChr01:5701992..5704202
RNA-Seq ExpressionHG10011401
SyntenyHG10011401
Gene Ontology termsGO:0033615 - mitochondrial proton-transporting ATP synthase complex assembly (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
InterPro domainsIPR011419 - ATP12, ATP synthase F1-assembly protein
IPR023335 - ATP12 orthogonal Bundle domain superfamily
IPR042272 - ATP12, ATP synthase F1-assembly protein, N-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022934998.1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2 [Cucurbita moschata]1.5e-16492.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BNE3 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2 isoform X13.9e-15889.26Show/hide
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A0A6J1DKX6 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 24.6e-15991.16Show/hide
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A0A6J1F9A4 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 27.3e-16592.33Show/hide
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A0A6J1J577 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 23.3e-16592.02Show/hide
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E5GCD8 ATP12-like protein3.9e-15889.26Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P22135 Protein ATP12, mitochondrial1.5e-0521.43Show/hide
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        + K   N D               LVF    E +  L +   E  +  +  + +++R   SE   +  +  +      G +Q D +  A +  +      
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Query:  ELASIDAIASAAHSLIIAIGIFRG-----------KLQIEEAIELIRLEEDLQVDKWGLVEGGHDVDIADLRVQISSATV
        +LA ++       S I  + +              K  ++  +    LE   QV+KWG VE  HDVD  D+R +I +A +
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Q1LZ96 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 23.2e-2431.22Show/hide
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        KRFYQ V+  + +   G+ + LD+R L+TP  +   +P+  LA AVA EW+ Q+ D I+ +TM L  L C  S   P  R K  +I   +K  + D V  
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        R  E   L     E Q  + DP++ W    +G +    +S  G        + +   L   +   L  I+ + +   SL++ +G+   +L +E+A+ L R
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        LEE+ Q+ KWG +E  HD ++ +LR + ++ T+F+ L
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Q8N5M1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 27.6e-2631.22Show/hide
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        KRFYQ V+  + +   G+ + LD+R LKTP  +   +P+  LA AVA EW+ Q+ D I+ +TM L  L C  S   P  R K  +I   +K  + D +  
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        R  E   L     E Q  + DP+++W    +G +    +S  G        + +   L   +   L  I+ +A+   S+++ +G+   +L +E+A+ L R
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Q91YY4 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 23.8e-2530.8Show/hide
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        KRFYQ V+  + +   G+ + LD+R LKTP  +   +P+  LA AVA EW+ Q+ D I+ +TM L  L C  S   P  R K  +I   +K  + D +  
Subjt:  KRFYQQVTTREADDRNGWTVMLDYRTLKTPSKRPLKLPTLGLAKAVAAEWEYQETDGIRPFTMPLMKLACTASERVPLTRPK--IIEHLMKKFNQDLVFC

Query:  RAPEDNVLTSGVYERQVEKVDPLLDWVRSEFGFKPVVYSSFFGGKQEDGLIKAVEDLLRKTDDCELASIDAIASAAHSLIIAIGIFRGKLQIEEAIELIR
        R  E   L     E Q  + DP+++W    +G +    +S  G        + +   L   +   L  I+ + +   S+++ +G+   +L +E+A+ L R
Subjt:  RAPEDNVLTSGVYERQVEKVDPLLDWVRSEFGFKPVVYSSFFGGKQEDGLIKAVEDLLRKTDDCELASIDAIASAAHSLIIAIGIFRGKLQIEEAIELIR

Query:  LEEDLQVDKWGLVEGGHDVDIADLRVQISSATVFLAL
        LEE+ Q+ KWG +E  HD ++ +LR + ++ T+F+ L
Subjt:  LEEDLQVDKWGLVEGGHDVDIADLRVQISSATVFLAL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G40660.1 ATP12 protein-related6.0e-11971.11Show/hide
Query:  SFRCRMLSTSVATAAEQAQSD------AASFTFSEDNAREDPIFVKAPVSNSRADSSSPSSSSVTMPTSFMTGSVVGKRFYQQVTTREADDRNGWTVMLD
        + R R L T+  +AA Q  SD      ++SFTF ++N  E PI VKAP  NSR  +    S SVTMPTSFMTGS+VGKRFY++VTTREADD NGWTVMLD
Subjt:  SFRCRMLSTSVATAAEQAQSD------AASFTFSEDNAREDPIFVKAPVSNSRADSSSPSSSSVTMPTSFMTGSVVGKRFYQQVTTREADDRNGWTVMLD

Query:  YRTLKTPSKRPLKLPTLGLAKAVAAEWEYQETDGIRPFTMPLMKLACTASERVPLTRPKIIEHLMKKFNQDLVFCRAPEDNVLTSGVYERQVEKVDPLLD
        YRTLKTPSKRPLKL +L LAKA+AAEWEYQ T+GIRPFTMPLM+LACTA ERVPLTR KIIEHL +K +QDLVF RAPEDN LTS V++ QVE +DPLL+
Subjt:  YRTLKTPSKRPLKLPTLGLAKAVAAEWEYQETDGIRPFTMPLMKLACTASERVPLTRPKIIEHLMKKFNQDLVFCRAPEDNVLTSGVYERQVEKVDPLLD

Query:  WVRSEFGFKPVVYSSFFGGKQEDGLIKAVEDLLRKTDDCELASIDAIASAAHSLIIAIGIFRGKLQIEEAIELIRLEEDLQVDKWGLVEGGHDVDIADLR
        W+ SEF  KP VYSS FGGKQ+D L+KAVE+LL+KT+D ELASIDA+ ++AHS++IA+GIF GKLQI++AI+LIRLEEDLQVDKWGLVEGGHD+D+ADL+
Subjt:  WVRSEFGFKPVVYSSFFGGKQEDGLIKAVEDLLRKTDDCELASIDAIASAAHSLIIAIGIFRGKLQIEEAIELIRLEEDLQVDKWGLVEGGHDVDIADLR

Query:  VQISSATVFLALSRK
        VQISSATVFLALSR+
Subjt:  VQISSATVFLALSRK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGAAATCAATCAGAATCACCAATCCCACGCTAATTCCATTTCATTCATTCCGCTGCCGTATGCTTTCTACCAGTGTCGCCACCGCTGCCGAACAAGCTCAATCCGA
CGCTGCCTCCTTCACCTTCTCCGAGGACAACGCTAGAGAAGATCCTATTTTCGTCAAGGCTCCAGTTTCGAATTCCAGAGCCGATTCTTCATCCCCTTCCAGCTCCTCGG
TGACGATGCCGACCTCGTTCATGACCGGTTCCGTCGTAGGCAAGCGATTTTACCAGCAAGTGACTACGAGGGAAGCGGATGATCGGAATGGATGGACGGTGATGCTTGAT
TACCGGACGCTGAAGACTCCTTCGAAGAGGCCGCTAAAGCTACCGACTCTCGGTCTCGCCAAGGCCGTTGCGGCTGAGTGGGAATATCAGGAAACAGATGGGATTAGACC
CTTCACAATGCCTCTAATGAAACTGGCCTGTACCGCATCGGAAAGAGTGCCTCTTACCCGGCCCAAGATTATCGAACATTTGATGAAGAAATTCAATCAGGATCTGGTTT
TCTGTCGTGCTCCGGAGGACAATGTTCTAACAAGTGGAGTTTATGAACGACAAGTGGAGAAAGTTGATCCTTTACTTGACTGGGTGCGCTCAGAATTTGGCTTTAAGCCT
GTTGTATATTCCAGTTTTTTTGGTGGGAAGCAGGAGGACGGTCTTATAAAAGCTGTTGAAGATCTTCTAAGAAAAACAGATGACTGTGAATTGGCATCAATCGATGCCAT
TGCGTCAGCTGCACACTCTTTAATAATTGCTATTGGAATTTTTCGTGGAAAGTTGCAGATCGAAGAAGCAATTGAGTTGATTAGACTCGAAGAAGATCTGCAGGTGGATA
AATGGGGTCTGGTTGAAGGTGGTCACGATGTCGATATTGCTGATCTACGGGTTCAGATCTCATCTGCCACGGTATTTCTCGCTCTTTCAAGGAAATTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGAAATCAATCAGAATCACCAATCCCACGCTAATTCCATTTCATTCATTCCGCTGCCGTATGCTTTCTACCAGTGTCGCCACCGCTGCCGAACAAGCTCAATCCGA
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TCTGTCGTGCTCCGGAGGACAATGTTCTAACAAGTGGAGTTTATGAACGACAAGTGGAGAAAGTTGATCCTTTACTTGACTGGGTGCGCTCAGAATTTGGCTTTAAGCCT
GTTGTATATTCCAGTTTTTTTGGTGGGAAGCAGGAGGACGGTCTTATAAAAGCTGTTGAAGATCTTCTAAGAAAAACAGATGACTGTGAATTGGCATCAATCGATGCCAT
TGCGTCAGCTGCACACTCTTTAATAATTGCTATTGGAATTTTTCGTGGAAAGTTGCAGATCGAAGAAGCAATTGAGTTGATTAGACTCGAAGAAGATCTGCAGGTGGATA
AATGGGGTCTGGTTGAAGGTGGTCACGATGTCGATATTGCTGATCTACGGGTTCAGATCTCATCTGCCACGGTATTTCTCGCTCTTTCAAGGAAATTTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAKSIRITNPTLIPFHSFRCRMLSTSVATAAEQAQSDAASFTFSEDNAREDPIFVKAPVSNSRADSSSPSSSSVTMPTSFMTGSVVGKRFYQQVTTREADDRNGWTVMLD
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VVYSSFFGGKQEDGLIKAVEDLLRKTDDCELASIDAIASAAHSLIIAIGIFRGKLQIEEAIELIRLEEDLQVDKWGLVEGGHDVDIADLRVQISSATVFLALSRKF