; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10011694 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10011694
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionRas-related protein Rab-1A
Genome locationChr01:9412849..9419067
RNA-Seq ExpressionHG10011694
SyntenyHG10011694
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004133726.1 ras-related protein RABD1 [Cucumis sativus]1.8e-10598.51Show/hide
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XP_022136911.1 ras-related protein RABD1 [Momordica charantia]1.7e-10396.52Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L6Q4 Uncharacterized protein8.8e-10698.51Show/hide
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A0A1S3BTF1 ras-related protein RABD1 isoform X18.8e-10698.01Show/hide
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A0A6J1C4U5 ras-related protein RABD18.3e-10496.52Show/hide
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A0A6J1EMZ9 ras-related protein RABD1-like2.2e-10496.52Show/hide
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A0A6J1JCC5 ras-related protein RABD1-like2.2e-10496.52Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P16976 GTP-binding protein YPTM18.8e-8779.71Show/hide
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P40392 Ras-related protein RIC18.8e-8778.22Show/hide
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Q05737 GTP-binding protein YPTM22.0e-8678.71Show/hide
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Q9SEH3 Ras-related protein RABD2c1.0e-8778.61Show/hide
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Q9ZRE2 Ras-related protein RABD12.2e-9385.15Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02130.1 RAS 52.0e-8677.23Show/hide
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AT3G09900.1 RAB GTPase homolog E1E1.6e-6257.97Show/hide
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        +  I+++A+DSV K+LVGNK D+ E+K  V T   +  ADE GI F ETSAK + NVEQ FL++A +IK+++    T ++  G    K            
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        +KS CCS
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AT3G11730.1 Ras-related small GTP-binding family protein1.5e-9485.15Show/hide
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AT4G17530.1 RAB GTPase homolog 1C7.4e-8978.61Show/hide
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AT5G47200.1 RAB GTPase homolog 1A2.4e-8778.11Show/hide
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        M+ EYDYLFKLLLIGDS VGKSCLLLRFADDSY+DSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ YDVT++ESFNNVK
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        QWLNEIDRYA+++V KLLVGNK DL   KVV T+TAK FADELGIPFLETSAK++ NVE+AF+ M A IK +M SQP        VQ++GQP+ Q+SGCC
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Query:  S
        S
Subjt:  S


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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