; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10012205 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10012205
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Descriptionprotein SAMBA isoform X2
Genome locationChr01:18789283..18792339
RNA-Seq ExpressionHG10012205
SyntenyHG10012205
Gene Ontology termsGO:0046621 - negative regulation of organ growth (biological process)
GO:0010997 - anaphase-promoting complex binding (molecular function)
InterPro domainsIPR037547 - Protein SAMBA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004136197.1 protein SAMBA isoform X1 [Cucumis sativus]6.4e-3689.01Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISSAAVAGRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINVMSRQGLKHH
        MNT SPANSS+S+ AVAGRCSTNAA+SLDDFRFP+NLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRIN+MSRQG   H
Subjt:  MNTSSPANSSISSAAVAGRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINVMSRQGLKHH

XP_004136198.1 protein SAMBA isoform X2 [Cucumis sativus]1.9e-3591.95Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISSAAVAGRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINVMSRQG
        MNT SPANSS+S+ AVAGRCSTNAA+SLDDFRFP+NLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRIN+MSRQG
Subjt:  MNTSSPANSSISSAAVAGRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINVMSRQG

XP_008466002.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103503566 isoform X1 [Cucumis melo]1.9e-3589.01Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISSAAVAGRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINVMSRQGLKHH
        MNT SPANSS S+ AVAGRCSTNAA+SLDDFRFP+NLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRIN+MSRQG   H
Subjt:  MNTSSPANSSISSAAVAGRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINVMSRQGLKHH

XP_038888367.1 protein SAMBA isoform X1 [Benincasa hispida]7.6e-3792.31Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISSAAVAGRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINVMSRQGLKHH
        MNTSSPANSSIS+ AVAGRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRIN+MS+QG   H
Subjt:  MNTSSPANSSISSAAVAGRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINVMSRQGLKHH

XP_038888368.1 protein SAMBA isoform X2 [Benincasa hispida]2.2e-3695.4Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISSAAVAGRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINVMSRQG
        MNTSSPANSSIS+ AVAGRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRIN+MS+QG
Subjt:  MNTSSPANSSISSAAVAGRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINVMSRQG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LK11 Uncharacterized protein9.1e-3691.95Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISSAAVAGRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINVMSRQG
        MNT SPANSS+S+ AVAGRCSTNAA+SLDDFRFP+NLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRIN+MSRQG
Subjt:  MNTSSPANSSISSAAVAGRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINVMSRQG

A0A1S3CQ76 uncharacterized protein LOC103503566 isoform X22.6e-3591.95Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISSAAVAGRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINVMSRQG
        MNT SPANSS S+ AVAGRCSTNAA+SLDDFRFP+NLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRIN+MSRQG
Subjt:  MNTSSPANSSISSAAVAGRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINVMSRQG

A0A1S3CQ80 uncharacterized protein LOC103503566 isoform X19.1e-3689.01Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISSAAVAGRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINVMSRQGLKHH
        MNT SPANSS S+ AVAGRCSTNAA+SLDDFRFP+NLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRIN+MSRQG   H
Subjt:  MNTSSPANSSISSAAVAGRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINVMSRQGLKHH

A0A5A7TB46 Uncharacterized protein2.6e-3591.95Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISSAAVAGRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINVMSRQG
        MNT SPANSS S+ AVAGRCSTNAA+SLDDFRFP+NLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRIN+MSRQG
Subjt:  MNTSSPANSSISSAAVAGRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINVMSRQG

A0A6J1BST3 protein SAMBA isoform X23.4e-3590.8Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISSAAVAGRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINVMSRQG
        MN+SSPANSSIS+ AVAGRCSTNAAMS+DDFRFPANLIS+PERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRSRIN+MSRQG
Subjt:  MNTSSPANSSISSAAVAGRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINVMSRQG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9C613 Protein SAMBA3.0e-2059.09Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISSAAVA-GRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINVMSRQG
        MN +SPA+S +S+ AVA G  S+ AA  LDDF FP ++ S+ ERKDEAM  LK+++M  L+KEVKSL++D+WMFEGPRSRI+++SR+G
Subjt:  MNTSSPANSSISSAAVA-GRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINVMSRQG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32310.1 unknown protein2.1e-2159.09Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISSAAVA-GRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINVMSRQG
        MN +SPA+S +S+ AVA G  S+ AA  LDDF FP ++ S+ ERKDEAM  LK+++M  L+KEVKSL++D+WMFEGPRSRI+++SR+G
Subjt:  MNTSSPANSSISSAAVA-GRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINVMSRQG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATACCTCTTCCCCAGCCAATTCTTCCATTTCCTCCGCTGCGGTTGCCGGAAGATGTAGCACTAACGCCGCAATGTCACTTGACGATTTTCGCTTCCCCGCCAATTT
AATTTCCGTACCAGAGCGCAAGGACGAGGCCATGACCGCTCTTAAATCTAATATAATGGCTGCACTGAACAAGGAGGTCAAATCCCTGGATGATGATAACTGGATGTTTG
AAGGTCCTCGCTCTCGTATCAATGTTATGTCACGACAAGGTCTAAAGCATCACCTAAGGACCAAAATGGGTCTAGAGGAAGGTGTTTGGCCTCGGCCAAGGTCGAGGCCA
GTCCTGGCCAAATGCGAAATGAGGCACACCCCTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAATACCTCTTCCCCAGCCAATTCTTCCATTTCCTCCGCTGCGGTTGCCGGAAGATGTAGCACTAACGCCGCAATGTCACTTGACGATTTTCGCTTCCCCGCCAATTT
AATTTCCGTACCAGAGCGCAAGGACGAGGCCATGACCGCTCTTAAATCTAATATAATGGCTGCACTGAACAAGGAGGTCAAATCCCTGGATGATGATAACTGGATGTTTG
AAGGTCCTCGCTCTCGTATCAATGTTATGTCACGACAAGGTCTAAAGCATCACCTAAGGACCAAAATGGGTCTAGAGGAAGGTGTTTGGCCTCGGCCAAGGTCGAGGCCA
GTCCTGGCCAAATGCGAAATGAGGCACACCCCTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNTSSPANSSISSAAVAGRCSTNAAMSLDDFRFPANLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINVMSRQGLKHHLRTKMGLEEGVWPRPRSRP
VLAKCEMRHTP