; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10012242 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10012242
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionAuxin responsive SAUR protein
Genome locationChr01:19242498..19242902
RNA-Seq ExpressionHG10012242
SyntenyHG10012242
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0038583.1 Auxin responsive SAUR protein [Cucumis melo var. makuwa]1.5e-5483.7Show/hide
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XP_008465964.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103503536 [Cucumis melo]1.5e-5483.7Show/hide
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XP_011652654.1 auxin-responsive protein SAUR78 [Cucumis sativus]1.3e-5384.78Show/hide
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XP_022931160.1 uncharacterized protein LOC111437423 [Cucurbita moschata]1.8e-3161.15Show/hide
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XP_038888374.1 uncharacterized protein LOC120078224 [Benincasa hispida]5.3e-5586.57Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LK59 Uncharacterized protein6.3e-5484.78Show/hide
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A0A1S3CQ48 uncharacterized protein LOC1035035367.4e-5583.7Show/hide
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A0A5D3E5S1 Auxin responsive SAUR protein7.4e-5583.7Show/hide
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A0A6J1EYP5 uncharacterized protein LOC1114374238.8e-3261.15Show/hide
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A0A7N2N146 Uncharacterized protein4.4e-3158.52Show/hide
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        D+ILFEH+LWLMYNDCSSLFKLN++EI+DFY+QD+
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G72430.1 SAUR-like auxin-responsive protein family7.7e-0426.42Show/hide
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        +H    S    +  + ++NL  V  G+ RR +++ P ++    F+ L+ +      ++D+E         I V  + +LFEHLLW++    S     +VE
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        E+ +FY
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AT2G35290.1 unknown protein1.1e-2147.76Show/hide
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        MGCL+ P  VMK RR  S+ SR    R    +L  N    E  +++VV GKE++EF+V+P+VLEE PFR+LIG     D  +++    G   RV+++D V
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        D+ILFEHLLWL+ ND S+   L+V EI++FYAQD
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TGGAGCCGCGGAGAGTAATCTAGTGAAGGTTGTGGCGGGAAAAGAGAGGAGAGAATTCTTAGTAGACCCTTTTGTGTTGGAAGAAACTCCGTTTCGGATTTTGATCGGAA
AAGGAGGAGATGACGATGAAGATGAAGATAAAGAAGAAGAAGATGGTAAAAGGAAAAGGGTTATTTTTGTTGATGTTGATGCTATTCTGTTCGAGCACTTGCTATGGCTC
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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