; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10012245 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10012245
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionC2H2-type domain-containing protein
Genome locationChr01:19281221..19282543
RNA-Seq ExpressionHG10012245
SyntenyHG10012245
Gene Ontology termsGO:0019058 - viral life cycle (biological process)
GO:0022610 - biological adhesion (biological process)
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR036236 - Zinc finger C2H2 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004148508.1 transcriptional regulator SUPERMAN [Cucumis sativus]5.0e-9881.93Show/hide
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        ETST+S S +          NNGSQ+  LDLELRLGHG
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XP_008465962.1 PREDICTED: transcriptional regulator SUPERMAN-like [Cucumis melo]3.3e-9781.17Show/hide
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          P  SSNP+KPS +SSSNSNSFIIPTPDFNGGG LCLLYQFPNPNSIN GINT  STLNAYIHSPSSLFSM HHSFNT+PSST+LS  FP+ND+   RL
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        ETST+S S +          NNGS +   LDLELRLGHG
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XP_022963778.1 transcriptional regulator SUPERMAN [Cucurbita moschata]9.9e-7872.34Show/hide
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        HQ PL SN  KPS SSSS SNSFIIP PDFNGGGLCLLYQFPNPNS+N GIN P            SLFS+S+HSFN+F  S  +S  FPVNDHRL    
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         S FS S QQ    ++SME NG+QELDLELRLGHG
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XP_022967174.1 transcriptional regulator SUPERMAN [Cucurbita maxima]2.8e-8074.47Show/hide
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        HQ PL SNP KPS SSSS SNSFIIP PDFNGGGLCLLYQFPNPNSIN GIN P            SLFSMS+HSFN+F  ST +S  FPVNDHR   L 
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         S FS S QQ    ++SME NG+QELDLELRLGHG
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XP_038888762.1 transcriptional regulator SUPERMAN-like [Benincasa hispida]1.1e-10891.03Show/hide
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        MAAELELGFQY SSLPHLAE TRDGQ+PN LNPMQ PDVVVDDDDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQ
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         PP SSNP+KP   SSSNSNSFIIPTPDFNGGG LCLLYQFPNPNSIN GINTP STLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNTF PSST+LSP FPVN DHRLET
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        STFS+S+QQHFSSTS+MENNGSQELDLELRLGHG
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LF36 C2H2-type domain-containing protein2.4e-9881.93Show/hide
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          P  SSNP+KPS +SSSNSNSFIIPTPDFNGGG LCLLYQFPNPNSIN GINT SSTLNAYIHSPSSLFSM HHSFNT+PSST++S  FP+ND    RL
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        ETST+S S +          NNGSQ+  LDLELRLGHG
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A0A1S3CRJ1 transcriptional regulator SUPERMAN-like1.6e-9781.17Show/hide
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          P  SSNP+KPS +SSSNSNSFIIPTPDFNGGG LCLLYQFPNPNSIN GINT  STLNAYIHSPSSLFSM HHSFNT+PSST+LS  FP+ND+   RL
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        ETST+S S +          NNGS +   LDLELRLGHG
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A0A5D3E693 Transcriptional regulator SUPERMAN-like1.6e-9781.17Show/hide
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          P  SSNP+KPS +SSSNSNSFIIPTPDFNGGG LCLLYQFPNPNSIN GINT  STLNAYIHSPSSLFSM HHSFNT+PSST+LS  FP+ND+   RL
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        ETST+S S +          NNGS +   LDLELRLGHG
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A0A6J1HIW9 transcriptional regulator SUPERMAN4.8e-7872.34Show/hide
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        HQ PL SN  KPS SSSS SNSFIIP PDFNGGGLCLLYQFPNPNS+N GIN P            SLFS+S+HSFN+F  S  +S  FPVNDHRL    
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         S FS S QQ    ++SME NG+QELDLELRLGHG
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A0A6J1HW10 transcriptional regulator SUPERMAN1.3e-8074.47Show/hide
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        HQ PL SNP KPS SSSS SNSFIIP PDFNGGGLCLLYQFPNPNSIN GIN P            SLFSMS+HSFN+F  ST +S  FPVNDHR   L 
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         S FS S QQ    ++SME NG+QELDLELRLGHG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80942 Zinc finger protein 104.9e-1958.06Show/hide
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        + SWE  AFAED A   G+ WPPRSYTC++CRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL Q       P  SS+P  PS   S N +     T  FN
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Q38895 Transcriptional regulator SUPERMAN6.8e-1335.59Show/hide
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        +D   ++G +WPPRSYTC++C+REFRSAQALGGHMNVHRRDRA  RL Q P SS+   P   + + S S +  +P  +   L L      P+S       
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Query:  PSSTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNTFPSSTTLSPTFPVNDHRLETSTFSESNQQHFSSTSSMENNGSQELDLELRLG
          S      H+P +       S        T    F   D                     + N   Q+LDLELRLG
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Q9LHS9 Probable transcriptional regulator RABBIT EARS7.5e-1233.85Show/hide
Query:  EVRAF--AEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQPPLSSNPIKPSPSSSSNSNSFIIPTPDFNGGGLCLLYQFPNPNSI
        E RAF  AE+     G  WPPRSY+C++C REF+SAQALGGHMNVHRRDRARL Q  LS +    +     +    ++      G  + +  +   PN  
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Query:  N------CGINTPSSTLNAYIHSPSSL---FSMSHHSFNTFPSSTTLSPTFPVNDHRLETSTFSESNQQHFSSTSSMENNGSQELDLELRLG
               C  N   S++  Y H    +    S+   S    P    L      +  R +T               S  N   +ELDLELRLG
Subjt:  N------CGINTPSSTLNAYIHSPSSL---FSMSHHSFNTFPSSTTLSPTFPVNDHRLETSTFSESNQQHFSSTSSMENNGSQELDLELRLG

Q9SLB8 Zinc finger protein 111.0e-1362.5Show/hide
Query:  WPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQ------PPLSSNPI-KPSPSSSSNSNS
        WPP++YTC++CRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA+L Q       P    PI  P+P+ SS+S+S
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Q9SR34 Transcriptional regulator TAC11.5e-0762.5Show/hide
Query:  RSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQPPLSSN
        RSY C++C R F +AQALGGHMN+HRRDRA+L Q  +  N
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37740.1 zinc-finger protein 103.4e-2058.06Show/hide
Query:  DDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQ-------PPLSSNPIKPSPSSSSNSNSFIIPTPDFN
        + SWE  AFAED A   G+ WPPRSYTC++CRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL Q       P  SS+P  PS   S N +     T  FN
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AT2G42410.1 zinc finger protein 117.4e-1562.5Show/hide
Query:  WPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQ------PPLSSNPI-KPSPSSSSNSNS
        WPP++YTC++CRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA+L Q       P    PI  P+P+ SS+S+S
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AT3G23130.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein4.8e-1435.59Show/hide
Query:  EDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA--RLHQPPLSSNPIKPSPSSSSNSNSFIIPTPDFNGGGLCLLYQFPNPNSINCGINT
        +D   ++G +WPPRSYTC++C+REFRSAQALGGHMNVHRRDRA  RL Q P SS+   P   + + S S +  +P  +   L L      P+S       
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Query:  PSSTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNTFPSSTTLSPTFPVNDHRLETSTFSESNQQHFSSTSSMENNGSQELDLELRLG
          S      H+P +       S        T    F   D                     + N   Q+LDLELRLG
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AT4G17810.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein5.1e-2439.7Show/hide
Query:  DDDDSWEVRAFAEDT-ANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA--RLHQPPLSSNPIKP--------SPSSSSNSNSFIIPTPDFNG
        DDD+SWEV+AF +DT  N+ GTTWPPRSYTC +CRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA  R HQ    +   +         S +    + + II +   N 
Subjt:  DDDDSWEVRAFAEDT-ANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA--RLHQPPLSSNPIKP--------SPSSSSNSNSFIIPTPDFNG

Query:  GGLCLLYQFPNPNSINCGINTPSSTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNTFPSSTTLSPTFPVNDHRLETSTFSESNQQHFSSTSSMENNGSQELDLELRLGH
         GL   YQ  NP+ I          +N Y    ++ F  S+  F+   S   + P             +S  + +   S          ELDLELRLGH
Subjt:  GGLCLLYQFPNPNSINCGINTPSSTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNTFPSSTTLSPTFPVNDHRLETSTFSESNQQHFSSTSSMENNGSQELDLELRLGH

AT5G06070.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein5.3e-1333.85Show/hide
Query:  EVRAF--AEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQPPLSSNPIKPSPSSSSNSNSFIIPTPDFNGGGLCLLYQFPNPNSI
        E RAF  AE+     G  WPPRSY+C++C REF+SAQALGGHMNVHRRDRARL Q  LS +    +     +    ++      G  + +  +   PN  
Subjt:  EVRAF--AEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQPPLSSNPIKPSPSSSSNSNSFIIPTPDFNGGGLCLLYQFPNPNSI

Query:  N------CGINTPSSTLNAYIHSPSSL---FSMSHHSFNTFPSSTTLSPTFPVNDHRLETSTFSESNQQHFSSTSSMENNGSQELDLELRLG
               C  N   S++  Y H    +    S+   S    P    L      +  R +T               S  N   +ELDLELRLG
Subjt:  N------CGINTPSSTLNAYIHSPSSL---FSMSHHSFNTFPSSTTLSPTFPVNDHRLETSTFSESNQQHFSSTSSMENNGSQELDLELRLG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGCTGAGCTTGAGCTTGGATTCCAATACTCTTCTTCTTTGCCTCATCTTGCCGAAACGACTCGAGACGGACAAAGTCCGAACGGTTTAAACCCTATGCAAACGCC
CGACGTTGTTGTCGACGACGATGACTCGTGGGAAGTCCGAGCTTTCGCCGAGGACACAGCTAATGTTATGGGAACTACTTGGCCTCCTAGGTCTTACACTTGCACTTATT
GTAGAAGAGAGTTTAGGTCAGCTCAAGCCCTAGGCGGTCATATGAATGTTCACCGTCGCGACCGTGCTCGCCTCCACCAGCCTCCTCTGTCCTCAAACCCTATAAAACCC
TCTCCCTCTTCTTCCTCTAATTCCAATTCTTTTATCATCCCAACTCCTGATTTTAATGGTGGAGGCTTGTGCCTTCTTTACCAATTCCCAAACCCTAATAGTATTAATTG
TGGAATCAATACTCCTTCTTCCACATTAAATGCTTACATTCACTCACCCTCATCTCTTTTCTCCATGTCCCATCATTCCTTCAACACCTTCCCGTCCTCGACCACGTTGT
CCCCGACTTTTCCGGTGAACGACCACCGTCTCGAAACGAGTACTTTCTCTGAATCAAATCAACAACACTTCTCATCAACATCCTCCATGGAAAATAATGGTAGCCAAGAA
CTTGATCTTGAGCTTAGACTTGGACATGGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGCTGAGCTTGAGCTTGGATTCCAATACTCTTCTTCTTTGCCTCATCTTGCCGAAACGACTCGAGACGGACAAAGTCCGAACGGTTTAAACCCTATGCAAACGCC
CGACGTTGTTGTCGACGACGATGACTCGTGGGAAGTCCGAGCTTTCGCCGAGGACACAGCTAATGTTATGGGAACTACTTGGCCTCCTAGGTCTTACACTTGCACTTATT
GTAGAAGAGAGTTTAGGTCAGCTCAAGCCCTAGGCGGTCATATGAATGTTCACCGTCGCGACCGTGCTCGCCTCCACCAGCCTCCTCTGTCCTCAAACCCTATAAAACCC
TCTCCCTCTTCTTCCTCTAATTCCAATTCTTTTATCATCCCAACTCCTGATTTTAATGGTGGAGGCTTGTGCCTTCTTTACCAATTCCCAAACCCTAATAGTATTAATTG
TGGAATCAATACTCCTTCTTCCACATTAAATGCTTACATTCACTCACCCTCATCTCTTTTCTCCATGTCCCATCATTCCTTCAACACCTTCCCGTCCTCGACCACGTTGT
CCCCGACTTTTCCGGTGAACGACCACCGTCTCGAAACGAGTACTTTCTCTGAATCAAATCAACAACACTTCTCATCAACATCCTCCATGGAAAATAATGGTAGCCAAGAA
CTTGATCTTGAGCTTAGACTTGGACATGGATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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LDLELRLGHG