CuGenDBv2

Gene ID	HG10012364
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	RAB6-interacting golgin
Genome location	Chr01:20428756..20430999
RNA-Seq Expression	HG10012364
Synteny	HG10012364
Gene Ontology terms	GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAA0033596.1 hypothetical protein E6C27_scaffold239G00290 [Cucumis melo var. makuwa]

1.7e-123

95.31

Show/hide

Query:  MGSDPSLLPEFGPDGLAREAPVIAYTERIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
        MGSDPSLLPE GPDGLAREAPVIAYTE+IIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
Subjt:  MGSDPSLLPEFGPDGLAREAPVIAYTERIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV

Query:  WEAASKVVQDEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVKTMGGAQNSRVADSSGVATSTEAGAKANENVPNQTASDGA
        WEAASKVVQDEEA KQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVK MGGAQNSRV+DSS VAT+TE GAK NENVPNQT SD A
Subjt:  WEAASKVVQDEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVKTMGGAQNSRVADSSGVATSTEAGAKANENVPNQTASDGA

Query:  PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGTVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA
        PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIG VPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA
Subjt:  PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGTVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA

KAG6574142.1 hypothetical protein SDJN03_28029, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

2.8e-105

85.71

Show/hide

Query:  MGSDPSLLPEFGPDGLAREAPVIAYTERIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
        MGSDP LLPE GPDGLAREAPVIAYTE+IIEEG LQLRK IDEN SKIRDVERELA LTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTER+ AAKLKEEQAKK 
Subjt:  MGSDPSLLPEFGPDGLAREAPVIAYTERIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV

Query:  WEAASKVVQDEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVS---HDVKTMGGAQNSRVADSSGVATSTE-AGAKANENVPNQTA
        WEAASKVVQDEEA KQKLC+DLNHLVQES+N QLTRLEELKRRMEALNS+RVSTSVS    + +TMG AQNSRVADSSGVATSTE  GAKANE+   Q  
Subjt:  WEAASKVVQDEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVS---HDVKTMGGAQNSRVADSSGVATSTE-AGAKANENVPNQTA

Query:  SDGAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGTVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
        S  APV+NGQNQKP SETE RGKKKNQFHGRGKGIG VPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
Subjt:  SDGAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGTVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR

XP_011651127.1 uncharacterized protein LOC101210795 [Cucumis sativus]

3.9e-123

95.31

Show/hide

Query:  MGSDPSLLPEFGPDGLAREAPVIAYTERIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
        MGSDPSLLP  GPDGLAREAPVIAYTE+IIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
Subjt:  MGSDPSLLPEFGPDGLAREAPVIAYTERIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV

Query:  WEAASKVVQDEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVKTMGGAQNSRVADSSGVATSTEAGAKANENVPNQTASDGA
        WEAASKVVQ+EEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDV TMGGAQNSRV+DSSGVAT+TE GAK NENVPNQT SD A
Subjt:  WEAASKVVQDEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVKTMGGAQNSRVADSSGVATSTEAGAKANENVPNQTASDGA

Query:  PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGTVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA
        PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIG VPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA
Subjt:  PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGTVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA

XP_022945967.1 uncharacterized protein LOC111450054 [Cucurbita moschata]

2.8e-105

85.71

Show/hide

Query:  MGSDPSLLPEFGPDGLAREAPVIAYTERIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
        MGSDP LLPE GPDGLAREAPVIAYTE+IIEEG LQLRK IDEN SKIRDVERELA LTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTER+ AAKLKEEQAKK 
Subjt:  MGSDPSLLPEFGPDGLAREAPVIAYTERIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV

Query:  WEAASKVVQDEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVS---HDVKTMGGAQNSRVADSSGVATSTE-AGAKANENVPNQTA
        WEAASKVVQDEEA KQKLC+DLNHLVQES+N QLTRLEELKRRMEALNS+RVSTSVS    + +TMG AQNSRVADSSGVATSTE  GAKANE+   Q  
Subjt:  WEAASKVVQDEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVS---HDVKTMGGAQNSRVADSSGVATSTE-AGAKANENVPNQTA

Query:  SDGAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGTVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
        S  APV+NGQNQKP SETE RGKKKNQFHGRGKGIG VPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
Subjt:  SDGAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGTVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR

XP_038898541.1 uncharacterized protein LOC120086143 [Benincasa hispida]

2.3e-123

95.31

Show/hide

Query:  MGSDPSLLPEFGPDGLAREAPVIAYTERIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
        MGSDPSLLPE GPDGLAREAPVIAYTE+IIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIE+STERVRAAKLKEEQAKKV
Subjt:  MGSDPSLLPEFGPDGLAREAPVIAYTERIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV

Query:  WEAASKVVQDEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVKTMGGAQNSRVADSSGVATSTEAGAKANENVPNQTASDGA
        WEAASKVVQDEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNS+RVSTS+SHDVKTMGGAQNSR ADSSGVATSTE GAKA+ENVPN  A DGA
Subjt:  WEAASKVVQDEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVKTMGGAQNSRVADSSGVATSTEAGAKANENVPNQTASDGA

Query:  PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGTVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA
        PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIG VPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA
Subjt:  PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGTVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0L8J1 RAB6-interacting golgin

4.0e-110

89.06

Show/hide

Query:  MGSDPSLLPEFGPDGLAREAPVIAYTERIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
        MGSDPSLLP                   IIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
Subjt:  MGSDPSLLPEFGPDGLAREAPVIAYTERIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV

Query:  WEAASKVVQDEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVKTMGGAQNSRVADSSGVATSTEAGAKANENVPNQTASDGA
        WEAASKVVQ+EEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDV TMGGAQNSRV+DSSGVAT+TE GAK NENVPNQT SD A
Subjt:  WEAASKVVQDEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVKTMGGAQNSRVADSSGVATSTEAGAKANENVPNQTASDGA

Query:  PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGTVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA
        PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIG VPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA
Subjt:  PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGTVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA

A0A5D3DFA0 RAB6-interacting golgin

8.4e-124

95.31

Show/hide

Query:  MGSDPSLLPEFGPDGLAREAPVIAYTERIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
        MGSDPSLLPE GPDGLAREAPVIAYTE+IIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
Subjt:  MGSDPSLLPEFGPDGLAREAPVIAYTERIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV

Query:  WEAASKVVQDEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVKTMGGAQNSRVADSSGVATSTEAGAKANENVPNQTASDGA
        WEAASKVVQDEEA KQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVK MGGAQNSRV+DSS VAT+TE GAK NENVPNQT SD A
Subjt:  WEAASKVVQDEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVKTMGGAQNSRVADSSGVATSTEAGAKANENVPNQTASDGA

Query:  PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGTVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA
        PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIG VPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA
Subjt:  PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGTVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA

A0A6J1CI49 uncharacterized protein LOC111011714

7.4e-104

84.17

Show/hide

Query:  MGSDPSLLPEFGPDGLAREAPVIAYTERIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
        M S+PSLLPE GPDGLA E+PVIAYTE+IIEE  LQLRK I+EN SKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEM+TER+RAAKLKEEQAK+ 
Subjt:  MGSDPSLLPEFGPDGLAREAPVIAYTERIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV

Query:  WEAASKVVQDEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVKTMGGAQNSRVADSSGVATSTEAG--AKANENVPNQ-TAS
        WEAASKVVQDEE  KQKLCEDLNHLVQESSN QLTRLEELKRRMEALN  RVSTSVS+D KT+GGAQNSRV+DSSG  TSTE G  A+ANE+ PNQ T S
Subjt:  WEAASKVVQDEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVKTMGGAQNSRVADSSGVATSTEAG--AKANENVPNQ-TAS

Query:  DGA-PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGTVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
         GA PV+NGQNQKPPSE EGRGKKKNQ HGRGKGIG VPKGRSS DSGWTGSGFDVDGR
Subjt:  DGA-PVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGTVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR

A0A6J1G2D4 uncharacterized protein LOC111450054

1.3e-105

85.71

Show/hide

Query:  MGSDPSLLPEFGPDGLAREAPVIAYTERIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
        MGSDP LLPE GPDGLAREAPVIAYTE+IIEEG LQLRK IDEN SKIRDVERELA LTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTER+ AAKLKEEQAKK 
Subjt:  MGSDPSLLPEFGPDGLAREAPVIAYTERIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV

Query:  WEAASKVVQDEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVS---HDVKTMGGAQNSRVADSSGVATSTE-AGAKANENVPNQTA
        WEAASKVVQDEEA KQKLC+DLNHLVQES+N QLTRLEELKRRMEALNS+RVSTSVS    + +TMG AQNSRVADSSGVATSTE  GAKANE+   Q  
Subjt:  WEAASKVVQDEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVS---HDVKTMGGAQNSRVADSSGVATSTE-AGAKANENVPNQTA

Query:  SDGAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGTVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
        S  APV+NGQNQKP SETE RGKKKNQFHGRGKGIG VPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
Subjt:  SDGAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGTVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR

A0A6J1HV58 uncharacterized protein LOC111467736

1.1e-104

85.33

Show/hide

Query:  MGSDPSLLPEFGPDGLAREAPVIAYTERIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
        MGSDP LLPE GPDGLAREAPVIAYTE+IIEEG LQLRK IDEN SKIRDVERELA LTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTER+ AAKLKEEQAKK 
Subjt:  MGSDPSLLPEFGPDGLAREAPVIAYTERIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV

Query:  WEAASKVVQDEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVS---HDVKTMGGAQNSRVADSSGVATSTE-AGAKANENVPNQTA
        WEAASKVVQDEEA KQKLC+DLNHLVQES+N QLTRLEELKRRMEALNS+RVSTSVS    + +TM  AQNSRVADSSGVATSTE  GAKANE+   Q  
Subjt:  WEAASKVVQDEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVS---HDVKTMGGAQNSRVADSSGVATSTE-AGAKANENVPNQTA

Query:  SDGAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGTVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
        S  APV+NGQNQKP SETE RGKKKNQFHGRGKGIG VPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
Subjt:  SDGAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGTVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G51840.1 unknown protein

4.3e-64

58.91

Show/hide

Query:  MGSDPSLLPEFGPDGLAREAPVIAYTERIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV
        M SDP L  E G DGLAREAPVIAYTE+IIEE  +QLRK I+EN +KIRDVERE  NL+ME+KLT+GPKKAA+E LRKKIE+STER+ AAKLKEE+A+K 
Subjt:  MGSDPSLLPEFGPDGLAREAPVIAYTERIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKV

Query:  WEAASKVVQDEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVKTMGGAQNSRVADSSGVATSTEAGAKANENVPNQTASDGA
        +EAASKVV+DEEA KQ LCEDLN LVQ+SSN Q  RLEELKRR+EALN +R STS+          Q  +  ++  V  S  A A AN+  P +  ++  
Subjt:  WEAASKVVQDEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVKTMGGAQNSRVADSSGVATSTEAGAKANENVPNQTASDGA

Query:  PVINGQ--NQKP-PSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGTVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
            G+   Q+P  +E E + KKK Q  GRG+GIG + KGR     GWTG+GFDVDGR
Subjt:  PVINGQ--NQKP-PSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGTVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGGTTCTGATCCTTCTCTTTTGCCTGAGTTTGGTCCCGATGGCCTTGCCAGGGAAGCTCCTGTAATTGCCTACACTGAAAGGATAATCGAGGAAGGGAGTCTTCAATT
GAGAAAATGTATTGATGAAAATTTATCTAAAATTCGGGATGTTGAACGGGAATTGGCAAATCTTACAATGGAGATGAAACTCACATCTGGGCCGAAAAAAGCAGCACTTG
AACTTTTGCGGAAGAAAATAGAAATGTCAACAGAGAGAGTACGTGCAGCTAAGTTGAAGGAAGAACAAGCAAAGAAGGTTTGGGAAGCAGCATCAAAGGTAGTGCAGGAC
GAGGAAGCTGCAAAGCAAAAACTGTGTGAAGATTTGAATCATCTGGTTCAAGAAAGCAGTAACTTCCAGTTGACTAGACTAGAAGAACTAAAGCGGCGCATGGAAGCTTT
GAATTCAAGTCGAGTATCGACCTCTGTTTCTCATGATGTCAAGACAATGGGAGGTGCTCAGAATAGCAGAGTTGCAGATTCTTCAGGAGTTGCTACATCAACAGAAGCAG
GTGCAAAAGCAAATGAAAATGTCCCCAATCAAACAGCCAGTGATGGAGCTCCAGTGATAAATGGGCAAAATCAAAAGCCCCCTTCTGAGACAGAAGGAAGAGGGAAAAAG
AAAAACCAGTTTCATGGAAGAGGGAAGGGAATTGGAACAGTGCCTAAAGGAAGAAGCTCTGCAGACTCTGGCTGGACTGGCTCTGGCTTTGATGTGGATGGTAGGGCGTG
A

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MGSDPSLLPEFGPDGLAREAPVIAYTERIIEEGSLQLRKCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQD
EEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVKTMGGAQNSRVADSSGVATSTEAGAKANENVPNQTASDGAPVINGQNQKPPSETEGRGKK
KNQFHGRGKGIGTVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGRA

HG10012364 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome