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HG10012517 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10012517
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionAcetate/butyrate--CoA ligase AAE7, peroxisomal
Genome locationChr01:22035798..22036533
RNA-Seq ExpressionHG10012517
SyntenyHG10012517
Gene Ontology termsGO:0016874 - ligase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0049534.1 acetate/butyrate--CoA ligase AAE7, peroxisomal [Cucumis melo var. makuwa]1.3e-3292.31Show/hide
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KAG7029009.1 Acetate/butyrate--CoA ligase AAE7, peroxisomal, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.5e-3195.83Show/hide
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XP_008438938.1 PREDICTED: acetate/butyrate--CoA ligase AAE7, peroxisomal [Cucumis melo]2.3e-3297.22Show/hide
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XP_022972177.1 acetate/butyrate--CoA ligase AAE7, peroxisomal-like [Cucurbita maxima]1.5e-3195.83Show/hide
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XP_038892631.1 acetate/butyrate--CoA ligase AAE7, peroxisomal isoform X1 [Benincasa hispida]8.7e-3294.44Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3AXM3 acetate/butyrate--CoA ligase AAE7, peroxisomal1.1e-3297.22Show/hide
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A0A5D3CXH1 Acetate/butyrate--CoA ligase AAE7, peroxisomal6.5e-3392.31Show/hide
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A0A6J1F872 acetate/butyrate--CoA ligase AAE7, peroxisomal-like7.2e-3295.83Show/hide
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A0A6J1GX22 acetate/butyrate--CoA ligase AAE7, peroxisomal-like9.3e-3294.44Show/hide
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A0A6J1IG41 acetate/butyrate--CoA ligase AAE7, peroxisomal-like7.2e-3295.83Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4HUK6 Butanoate--CoA ligase AAE16.1e-1253.33Show/hide
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        K+ ANY  LTP+ F++R+A+V+  R+S+V+GS +YTW QT  RC R+ASALS   I  GD
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I3PB36 Trans-cinnamate:CoA ligase, peroxisomal1.1e-1047.69Show/hide
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        +D+LPK  ANY  LTPL F+ RA   + +R S+++   R+TW QTY+RC RLAS+L + +I   D
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M4IS88 Acetate--CoA ligase CCL38.7e-2779.41Show/hide
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        RDIDDLPKN ANYTALTPLWF+ERAA VHP+R SV+HGSR YTWLQTY RCR+ ASAL+N SIG G T
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Q8VZF1 Acetate/butyrate--CoA ligase AAE7, peroxisomal7.4e-2677.94Show/hide
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        RDIDDLPK  ANYTALTPLWF++RAA+VHP+R SV+HGSR YTW QTY RCRRLASAL++RSIG G T
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Q9SEY5 Isovalerate--CoA ligase AAE24.2e-1352.24Show/hide
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        R I+ L ++ AN++ L+P+ F+ER+A V+  R S+V GS ++TW QTYQRC RLASAL+N  I  GD
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G20560.1 acyl activating enzyme 14.3e-1353.33Show/hide
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        K+ ANY  LTP+ F++R+A+V+  R+S+V+GS +YTW QT  RC R+ASALS   I  GD
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AT1G65880.1 benzoyloxyglucosinolate 11.8e-1144.62Show/hide
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        +DDL   +AN   LTP+ F++RA+  +P+R S+++G  R+TW QTY RC RLA++L + +I   D
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AT1G65890.1 acyl activating enzyme 121.4e-1144.62Show/hide
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        +D+L   +AN   LTP+ F++RA+  +P+R S+++G  R+TW QTY RC RLA++L + +IG  D
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AT2G17650.1 AMP-dependent synthetase and ligase family protein3.0e-1452.24Show/hide
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        R I+ L ++ AN++ L+P+ F+ER+A V+  R S+V GS ++TW QTYQRC RLASAL+N  I  GD
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AT3G16910.1 acyl-activating enzyme 75.2e-2777.94Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGGAGCCAGAGACATCGACGATCTGCCGAAGAACGACGCCAACTACACCGCCTTGACACCGCTGTGGTTCATGGAGAGAGCCGCGTTGGTTCATCCTTCCAGATT
ATCGGTCGTTCATGGATCTCGCCGCTACACCTGGCTTCAGACTTACCAACGCTGCCGCCGTTTGGCTTCTGCTCTTTCGAACCGCTCCATCGGCGCTGGAGACACGTCTG
TGGATGTAATCTTGGGCTACAAATCAAATAGTCGACATCGTTTGAAATTACGAGAATCCAGAGGGTTCTGTAATATGTGTGATATGTTATCTTTGAAGTTATTAGTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCGGAGCCAGAGACATCGACGATCTGCCGAAGAACGACGCCAACTACACCGCCTTGACACCGCTGTGGTTCATGGAGAGAGCCGCGTTGGTTCATCCTTCCAGATT
ATCGGTCGTTCATGGATCTCGCCGCTACACCTGGCTTCAGACTTACCAACGCTGCCGCCGTTTGGCTTCTGCTCTTTCGAACCGCTCCATCGGCGCTGGAGACACGTCTG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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