; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10012730 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10012730
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionCalmodulin
Genome locationChr01:23774407..23777036
RNA-Seq ExpressionHG10012730
SyntenyHG10012730
Gene Ontology termsGO:0005509 - calcium ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002048 - EF-hand domain
IPR011992 - EF-hand domain pair
IPR018247 - EF-Hand 1, calcium-binding site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004134112.1 calmodulin-like protein 11 [Cucumis sativus]4.2e-5999.19Show/hide
Query:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
        CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVD DGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
Subjt:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI

Query:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG
        KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG
Subjt:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG

XP_022138077.1 calmodulin-like protein 11 [Momordica charantia]2.3e-5795.97Show/hide
Query:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
        CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEF EFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNG+ISATELRHVMINLGEKLTD+EVEQMI
Subjt:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI

Query:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG
        +EADLDGDGQVNFEEFVKMMM VG
Subjt:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG

XP_022979563.1 calmodulin-like protein 11 [Cucurbita maxima]1.6e-5898.39Show/hide
Query:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
        CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMI EVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
Subjt:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI

Query:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG
        KEADLDGDGQVNFEEFVKMMM VG
Subjt:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG

XP_023527202.1 calmodulin-like protein 11 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.9e-5897.58Show/hide
Query:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
        CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMI EVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIK TDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
Subjt:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI

Query:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG
        KEADLDGDGQVNFEEFVKMMM VG
Subjt:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG

XP_038902291.1 calmodulin-like protein 11 [Benincasa hispida]1.2e-5898.39Show/hide
Query:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
        CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVD DGNGTIEF EFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
Subjt:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI

Query:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG
        KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG
Subjt:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LA37 Uncharacterized protein2.0e-5999.19Show/hide
Query:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
        CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVD DGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
Subjt:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI

Query:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG
        KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG
Subjt:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG

A0A1S3AWW8 calmodulin-like protein 112.0e-5999.19Show/hide
Query:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
        CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVD DGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
Subjt:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI

Query:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG
        KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG
Subjt:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG

A0A5A7U6X6 Calmodulin-like protein 11 isoform X22.0e-5999.19Show/hide
Query:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
        CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVD DGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
Subjt:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI

Query:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG
        KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG
Subjt:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG

A0A6J1CA12 calmodulin-like protein 111.1e-5795.97Show/hide
Query:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
        CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEF EFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNG+ISATELRHVMINLGEKLTD+EVEQMI
Subjt:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI

Query:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG
        +EADLDGDGQVNFEEFVKMMM VG
Subjt:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG

A0A6J1IWM2 calmodulin-like protein 117.7e-5998.39Show/hide
Query:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
        CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMI EVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
Subjt:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI

Query:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG
        KEADLDGDGQVNFEEFVKMMM VG
Subjt:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23320 Calmodulin-like protein 81.2e-5384.55Show/hide
Query:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
        CIT+EELATVIRSLDQNPTE+EL D+I E+D+D NGTIEFAEFLNLMAKK++E+DAEEELKEAFKVFDKDQNGYISA+EL HVMINLGEKLTD+EVEQMI
Subjt:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI

Query:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAV
        KEADLDGDGQVN++EFVKMM+ +
Subjt:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAV

P0DH95 Calmodulin-15.7e-5181.15Show/hide
Query:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
        CIT +EL TV+RSL QNPTE ELQDMI EVDADGNGTI+F EFLNLMAKK+K+TD+EEELKEAF+VFDKDQNG+ISA ELRHVM NLGEKLTD+EVE+MI
Subjt:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI

Query:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMA
        +EAD+DGDGQ+N+EEFVK+MMA
Subjt:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMA

P0DH96 Calmodulin-45.7e-5181.15Show/hide
Query:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
        CIT +EL TV+RSL QNPTE ELQDMI EVDADGNGTI+F EFLNLMAKK+K+TD+EEELKEAF+VFDKDQNG+ISA ELRHVM NLGEKLTD+EVE+MI
Subjt:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI

Query:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMA
        +EAD+DGDGQ+N+EEFVK+MMA
Subjt:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMA

P0DH97 Calmodulin-21.3e-5080.33Show/hide
Query:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
        CIT +EL TV+RSL QNPTE ELQDMI EVDADGNGTI+F EFLNLMA+K+K+TD+EEELKEAF+VFDKDQNG+ISA ELRHVM NLGEKLTD+EV++MI
Subjt:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI

Query:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMA
        KEAD+DGDGQ+N+EEFVK+MMA
Subjt:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMA

Q9LIK5 Calmodulin-like protein 117.2e-5483.87Show/hide
Query:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
        CIT +ELATVIRSLDQNPTE+ELQDMI E+D+DGNGTIEF+EFLNLMA +++ETDA+EELKEAFKVFDKDQNGYISA+ELRHVMINLGEKLTD+EV+QMI
Subjt:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI

Query:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG
        KEADLDGDGQVN++EFV+MMM  G
Subjt:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G66410.1 calmodulin 44.0e-5281.15Show/hide
Query:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
        CIT +EL TV+RSL QNPTE ELQDMI EVDADGNGTI+F EFLNLMAKK+K+TD+EEELKEAF+VFDKDQNG+ISA ELRHVM NLGEKLTD+EVE+MI
Subjt:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI

Query:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMA
        +EAD+DGDGQ+N+EEFVK+MMA
Subjt:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMA

AT1G66410.2 calmodulin 44.0e-5281.15Show/hide
Query:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
        CIT +EL TV+RSL QNPTE ELQDMI EVDADGNGTI+F EFLNLMAKK+K+TD+EEELKEAF+VFDKDQNG+ISA ELRHVM NLGEKLTD+EVE+MI
Subjt:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI

Query:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMA
        +EAD+DGDGQ+N+EEFVK+MMA
Subjt:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMA

AT3G22930.1 calmodulin-like 115.1e-5583.87Show/hide
Query:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
        CIT +ELATVIRSLDQNPTE+ELQDMI E+D+DGNGTIEF+EFLNLMA +++ETDA+EELKEAFKVFDKDQNGYISA+ELRHVMINLGEKLTD+EV+QMI
Subjt:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI

Query:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG
        KEADLDGDGQVN++EFV+MMM  G
Subjt:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG

AT4G14640.1 calmodulin 88.7e-5584.55Show/hide
Query:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
        CIT+EELATVIRSLDQNPTE+EL D+I E+D+D NGTIEFAEFLNLMAKK++E+DAEEELKEAFKVFDKDQNGYISA+EL HVMINLGEKLTD+EVEQMI
Subjt:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI

Query:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAV
        KEADLDGDGQVN++EFVKMM+ +
Subjt:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAV

AT5G37780.1 calmodulin 14.0e-5281.15Show/hide
Query:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI
        CIT +EL TV+RSL QNPTE ELQDMI EVDADGNGTI+F EFLNLMAKK+K+TD+EEELKEAF+VFDKDQNG+ISA ELRHVM NLGEKLTD+EVE+MI
Subjt:  CITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYISATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMI

Query:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMA
        +EAD+DGDGQ+N+EEFVK+MMA
Subjt:  KEADLDGDGQVNFEEFVKMMMA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAATTAGATCCAAACACTACAATTTCATTTCAGGACTCGTCACCACACCTCTTCTAAGTCCGGCTTTCTATCAGTTTCTTTTAAAGATTTATACTCTAAGGTGCAT
TACTATTGAGGAATTGGCGACGGTGATCCGATCGTTGGATCAGAATCCGACGGAGGAGGAGCTTCAGGACATGATCAAGGAAGTCGACGCCGACGGCAATGGAACTATCG
AATTTGCTGAGTTTCTCAATTTGATGGCCAAAAAAATTAAGGAAACTGATGCGGAAGAAGAGCTGAAAGAGGCTTTCAAAGTGTTCGACAAAGATCAAAACGGATACATC
TCAGCTACTGAGCTGAGGCACGTGATGATCAACCTTGGGGAGAAGCTGACGGATGACGAAGTGGAGCAGATGATCAAAGAGGCCGATCTGGACGGTGATGGTCAAGTCAA
TTTTGAAGAATTCGTCAAGATGATGATGGCCGTTGGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAATTAGATCCAAACACTACAATTTCATTTCAGGACTCGTCACCACACCTCTTCTAAGTCCGGCTTTCTATCAGTTTCTTTTAAAGATTTATACTCTAAGGTGCAT
TACTATTGAGGAATTGGCGACGGTGATCCGATCGTTGGATCAGAATCCGACGGAGGAGGAGCTTCAGGACATGATCAAGGAAGTCGACGCCGACGGCAATGGAACTATCG
AATTTGCTGAGTTTCTCAATTTGATGGCCAAAAAAATTAAGGAAACTGATGCGGAAGAAGAGCTGAAAGAGGCTTTCAAAGTGTTCGACAAAGATCAAAACGGATACATC
TCAGCTACTGAGCTGAGGCACGTGATGATCAACCTTGGGGAGAAGCTGACGGATGACGAAGTGGAGCAGATGATCAAAGAGGCCGATCTGGACGGTGATGGTCAAGTCAA
TTTTGAAGAATTCGTCAAGATGATGATGGCCGTTGGATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEIRSKHYNFISGLVTTPLLSPAFYQFLLKIYTLRCITIEELATVIRSLDQNPTEEELQDMIKEVDADGNGTIEFAEFLNLMAKKIKETDAEEELKEAFKVFDKDQNGYI
SATELRHVMINLGEKLTDDEVEQMIKEADLDGDGQVNFEEFVKMMMAVG