; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10012810 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10012810
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionC2H2-type domain-containing protein
Genome locationChr01:24423087..24423818
RNA-Seq ExpressionHG10012810
SyntenyHG10012810
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0049241.1 hypothetical protein E6C27_scaffold171G004810 [Cucumis melo var. makuwa]2.0e-9779.42Show/hide
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KAG6582389.1 hypothetical protein SDJN03_22391, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.8e-2138.87Show/hide
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          R  L +    +   W +        S+ P  TL  +       +     A+DMAH LPLHPLLAQ    PPP  +T N + +                
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KAG6597359.1 hypothetical protein SDJN03_10539, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.0e-8270.56Show/hide
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        L L   L  LFFLTAFSPSL+FPW+SS  +KSGWNPS EELL  SGE+S RP RRK+TIFGAPCGLCGQVIFGSEALNHHYNYHFLQN+LAS+G R    
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        S SSQRP +WT+ FHGQASASREPQ+TLN+ LTM P     SLRSY    +DMAHLLPLHPLLAQ  PPPP R  TANG+    N+ A  QR QGNQ + 
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KGN56847.1 hypothetical protein Csa_010766 [Cucumis sativus]1.4e-10181.48Show/hide
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          SG SQRP LW+N FHGQASASREPQMTLNDYLTM PSLRSYSGAAIDMAH LPLHPLLAQ  PPP PRT TAN +N QQNQA    RRQGNQV+WNNG
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        GVR VGG+ A+E+QPPQDVIDLNSEENDCSSD SEGLDLTLSL
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L892 C2H2-type domain-containing protein6.6e-10281.48Show/hide
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A0A5A7U6I9 C2H2-type domain-containing protein9.8e-9879.42Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCCTCCTCCTTCAAGCTCCTCTGTTTTATCTGTTTTTCCTCACAGCCTTCTCTCCTTCTCTGTCTTTCCCATGGAATTCCTCCTCAATTGATAAATCTGGCTGGAA
CCCATCATTCGAGGAGCTGTTGTTGACCTCCGGCGAGTCTTCCGGTCGACCGTCTCGCCGGAAAAACACAATTTTCGGTGCTCCTTGTGGGCTCTGTGGCCAAGTGATTT
TTGGCTCTGAAGCTCTTAATCACCATTATAATTATCATTTCTTGCAGAATGAGCTTGCTTCTTTTGGAGGCCGCTCAAATCTTTGCTCCGGAAGCTCTCAGCGGCCGTCG
TTATGGACCAATAATTTCCATGGCCAAGCCTCTGCTTCTCGAGAACCCCAAATGACGCTTAACGATTATTTGACGATGCAGCCGTCATTGAGAAGCTATTCCGGCGCCGC
CATCGACATGGCTCATTTGCTTCCGCTTCATCCGTTGTTGGCCCAACCGCCGCCACCGCCACCGCCGCGGACCGTCACTGCCAACGGTTTGAACGTTCAACAGAATCAGG
CTGCGACGCGGCAGAGGAGGCAGGGGAATCAAGTCCGATGGAATAACGGCGGCGTGAGGGCGGTTGGTGGCCGGCATGCGGCGGAGCAGCAGCCACCCCAAGATGTGATT
GATCTGAATAGCGAGGAGAATGATTGTAGCTCTGATGGTTCAGAAGGCTTGGATTTGACCTTGAGTCTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CATCGACATGGCTCATTTGCTTCCGCTTCATCCGTTGTTGGCCCAACCGCCGCCACCGCCACCGCCGCGGACCGTCACTGCCAACGGTTTGAACGTTCAACAGAATCAGG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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