CuGenDBv2

Gene ID	HG10013671
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	ARM repeat superfamily protein
Genome location	Chr02:3634106..3642888
RNA-Seq Expression	HG10013671
Synteny	HG10013671
Gene Ontology terms	GO:0043248 - proteasome assembly (biological process)
InterPro domains	IPR011989 - Armadillo-like helical IPR016024 - Armadillo-type fold IPR019538 - 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5

Homology

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GenBank top hits

e value

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KAA0066810.1 Armadillo-like helical [Cucumis melo var. makuwa]

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XP_008463698.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501781 isoform X1 [Cucumis melo]

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XP_022940916.1 uncharacterized protein LOC111446360 [Cucurbita moschata]

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XP_038898234.1 uncharacterized protein LOC120085959 isoform X1 [Benincasa hispida]

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A0A0A0L246 Uncharacterized protein

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A0A1S3CKC0 uncharacterized protein LOC103501781 isoform X1

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A0A5D3DVV9 Armadillo-like helical

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A0A6J1FJQ7 uncharacterized protein LOC111446360

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A0A6J1IVZ7 uncharacterized protein LOC111480433

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Subjt:  MEEFTVDDPTQLLEAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEIPGLENTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLLADSQTVKGLAC

Query:  KTVIRLLQESDETALLAIQLIIDYGIYPLLLECLLNGNEQVANSSMDAIKTLAAFPQGMAIIFPTNKTEATHLGTVASTYSSLGRVRVMALVVKLFSVSS
        KTV RLL+E+D T  LA QLI+DY IYPLL+ECLLNGNEQVANSSMDA+K LAAFP+GM IIFPTNKTEATHLGTVAST SSLGRVRVMAL+VKLFSVSS
Subjt:  KTVIRLLQESDETALLAIQLIIDYGIYPLLLECLLNGNEQVANSSMDAIKTLAAFPQGMAIIFPTNKTEATHLGTVASTYSSLGRVRVMALVVKLFSVSS

Query:  SVASAVHNANLLSLLESEINNSNDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESILRSRAMVISGRLLSKENTFSLVDESCVRNLI
        SVASAV+N+NLL+LLESEI+NSNDTLVTLSVLELLYELVEIEHGT FLPRTSFLQLLSSIISN SAESILRSRAMVISGRLLSKEN FSLVDESCVR LI
Subjt:  SVASAVHNANLLSLLESEINNSNDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESILRSRAMVISGRLLSKENTFSLVDESCVRNLI

Query:  SATDGILGSSEGQDVNVCEAAFEALGQIGSSIWGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHSKQLAAMHALGNIFGETRSENDIILNDNAEENLRDLMYQIA
        S+ D ILGSSEGQDVNVCE+AFEALGQIGSS WGATLLLSS+PTCVK+VI AAFDRHEH KQLAAMHALGNIFGETRSENDI+LNDNAEENL DL+YQ A
Subjt:  SATDGILGSSEGQDVNVCEAAFEALGQIGSSIWGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHSKQLAAMHALGNIFGETRSENDIILNDNAEENLRDLMYQIA

Query:  SKSPKMMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQNILNIVTDASTETTKIGICAYF----ALHPYFEVNQRL
        S+SPK+ PSGL LAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQ+I+NIV+DASTETTKIG+ A +    A+H  F  + RL
Subjt:  SKSPKMMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQNILNIVTDASTETTKIGICAYF----ALHPYFEVNQRL

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G15180.1 ARM repeat superfamily protein

1.1e-145

56.22

Show/hide

Query:  VDDPTQLLEAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEIPGLENTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLLADSQTVKGLACKTVIR
        ++D  QL +AA  FA+YPG + + SVKEFLDRFPLP I NALQT  +IPG ENTLV CL+R+FKTKYGASLIP YMP +QVGL ADS  VK LACKTV+ 
Subjt:  VDDPTQLLEAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEIPGLENTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLLADSQTVKGLACKTVIR

Query:  LLQESDETALLAIQLIIDYGIYPLLLECLLNGNEQVANSSMDAIKTLAAFPQGMAIIFPTNKTEATHLGTVASTYSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASA
        LL++ D   + ++QL+++ GIYPLLL+ ++N +++VAN++ + IK+LA FP  M++IFP+   + THL  +A+  SSL RVRV++L+VKLFS+S  VAS 
Subjt:  LLQESDETALLAIQLIIDYGIYPLLLECLLNGNEQVANSSMDAIKTLAAFPQGMAIIFPTNKTEATHLGTVASTYSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASA

Query:  VHNANLLSLLESEINNSNDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESILRSRAMVISGRLLSKENTFSLVDESCVRNLISATDG
        V  + LL LLE+E+  + DTLV L+VLEL YEL+E+EH ++F+P+TS +QLL SIIS +S     + RAM+ISGRLLSKEN + +V+E+ V+ LISA DG
Subjt:  VHNANLLSLLESEINNSNDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESILRSRAMVISGRLLSKENTFSLVDESCVRNLISATDG

Query:  ILGSSEGQDVNVCEAAFEALGQIGSSIWGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHSKQLAAMHALGNIFGETRSENDIILNDNAEENLRDLMYQIASKSPK
         L S E  D +  EAA +ALGQ+GS+  GA L+LS+ P   +HV+ +AFDR+ H KQLAA+HAL NI GETR +++ I++  AEE+LR L+Y  A++S K
Subjt:  ILGSSEGQDVNVCEAAFEALGQIGSSIWGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHSKQLAAMHALGNIFGETRSENDIILNDNAEENLRDLMYQIASKSPK

Query:  MMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQNILNIVTDASTETTKIGICAYF----ALHPYFEVNQRLCS
        + PSGLFL+VLQQ SEIRLA YR +T LVARPWCL+EI +K+ I+NIVTDA+TET KI + A +    A+H  F     LCS
Subjt:  MMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQNILNIVTDASTETTKIGICAYF----ALHPYFEVNQRLCS

AT3G15180.2 ARM repeat superfamily protein

7.5e-142

52.92

Show/hide

Query:  VDDPTQLLEAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEIPGLENTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLLADSQTVKGLACKTVIR
        ++D  QL +AA  FA+YPG + + SVKEFLDRFPLP I NALQT  +IPG ENTLV CL+R+FKTKYGASLIP YMP +QVGL ADS  VK LACKTV+ 
Subjt:  VDDPTQLLEAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEIPGLENTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLLADSQTVKGLACKTVIR

Query:  LLQESDETALLAIQLIIDYGIYPLLLECLLNGNEQVANSSMDAIKTLAAFPQGMAIIFPTNKTEATHLGTVASTYSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASA
        LL++ D   + ++QL+++ GIYPLLL+ ++N +++VAN++ + IK+LA FP  M++IFP+   + THL  +A+  SSL RVRV++L+VKLFS+S  VAS 
Subjt:  LLQESDETALLAIQLIIDYGIYPLLLECLLNGNEQVANSSMDAIKTLAAFPQGMAIIFPTNKTEATHLGTVASTYSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASA

Query:  VHNANLLSLLESEINNSNDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESILRSRAMVISGRLLSKENTFSLVDES-----------
        V  + LL LLE+E+  + DTLV L+VLEL YEL+E+EH ++F+P+TS +QLL SIIS +S     + RAM+ISGRLLSKEN + +V+E+           
Subjt:  VHNANLLSLLESEINNSNDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESILRSRAMVISGRLLSKENTFSLVDES-----------

Query:  ---------------------CVRNLISATDGILGSSEGQDVNVCEAAFEALGQIGSSIWGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHSKQLAAMHALGNIF
                             CV+ LISA DG L S E  D +  EAA +ALGQ+GS+  GA L+LS+ P   +HV+ +AFDR+ H KQLAA+HAL NI 
Subjt:  ---------------------CVRNLISATDGILGSSEGQDVNVCEAAFEALGQIGSSIWGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHSKQLAAMHALGNIF

Query:  GETRSENDIILNDNAEENLRDLMYQIASKSPKMMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQNILNIVTDASTETTKIGICAYF----
        GETR +++ I++  AEE+LR L+Y  A++S K+ PSGLFL+VLQQ SEIRLA YR +T LVARPWCL+EI +K+ I+NIVTDA+TET KI + A +    
Subjt:  GETRSENDIILNDNAEENLRDLMYQIASKSPKMMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQNILNIVTDASTETTKIGICAYF----

Query:  ALHPYFEVNQRLCS
        A+H  F     LCS
Subjt:  ALHPYFEVNQRLCS

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAGGAATTTACAGTGGATGATCCGACTCAGCTACTCGAAGCAGCTGCAAACTTCGCAAATTATCCTGGTGTTCGGACTGATGCGTCGGTTAAGGAATTTCTCGACCG
CTTCCCCCTTCCCGCCATCATCAATGCTTTACAAACAAAAGCAGAAATTCCTGGTCTAGAGAACACCCTGGTTGCATGTCTTGACAGGATATTCAAAACCAAGTACGGAG
CATCTCTTATACCTCATTATATGCCTTTTGTACAGGTTGGACTACTGGCAGATTCTCAAACAGTTAAAGGCTTAGCTTGTAAAACGGTCATTCGCCTTTTGCAGGAGTCT
GATGAAACTGCTCTTTTGGCTATACAACTAATTATTGACTATGGCATCTATCCACTTTTGCTCGAGTGCCTTCTCAATGGTAACGAACAAGTTGCTAACTCATCAATGGA
TGCAATCAAGACATTGGCTGCATTTCCACAGGGGATGGCAATCATCTTCCCAACAAATAAAACAGAAGCTACACACCTAGGAACTGTAGCTTCAACATATTCGTCACTGG
GCAGAGTTCGAGTCATGGCTTTGGTAGTGAAACTATTTTCAGTTTCTAGCTCTGTGGCATCGGCAGTACACAATGCAAATTTACTAAGCCTACTGGAAAGTGAAATCAAC
AATTCAAATGATACACTTGTAACTTTAAGTGTGTTGGAACTCTTGTACGAGCTAGTGGAAATTGAACATGGTACAAAGTTCTTGCCAAGGACCAGCTTTCTCCAACTACT
AAGCTCTATAATCAGCAACTCATCAGCAGAGTCTATTCTACGATCAAGAGCTATGGTCATTAGTGGAAGACTTTTGTCCAAAGAGAACACTTTCTCGCTTGTAGATGAAT
CATGTGTACGGAACTTGATATCTGCTACAGATGGAATTCTTGGGTCATCTGAAGGACAGGATGTAAATGTATGTGAAGCTGCATTTGAAGCACTGGGTCAAATTGGGTCA
AGCATATGGGGAGCCACTTTACTGCTGTCAAGTTTTCCAACTTGTGTGAAGCACGTAATTTATGCAGCATTTGATCGGCATGAACACAGCAAACAGCTGGCAGCCATGCA
TGCTCTTGGTAATATCTTTGGAGAAACTCGATCTGAGAATGATATTATACTAAATGATAATGCAGAAGAAAATCTGCGGGATTTGATGTATCAAATTGCATCCAAAAGTC
CAAAAATGATGCCCTCGGGTCTTTTTCTAGCTGTCCTTCAACAGGACTCTGAGATTCGCTTGGCAAGTTACAGAATGATAACTGGGTTGGTCGCTCGACCTTGGTGCCTA
ATGGAAATCTGCTCGAAACAAAACATATTAAATATAGTTACTGATGCAAGTACTGAGACTACTAAAATAGGTATATGTGCTTACTTTGCCTTGCATCCATATTTTGAGGT
TAATCAGAGATTATGTTCATGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MEEFTVDDPTQLLEAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPAIINALQTKAEIPGLENTLVACLDRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLLADSQTVKGLACKTVIRLLQES
DETALLAIQLIIDYGIYPLLLECLLNGNEQVANSSMDAIKTLAAFPQGMAIIFPTNKTEATHLGTVASTYSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASAVHNANLLSLLESEIN
NSNDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESILRSRAMVISGRLLSKENTFSLVDESCVRNLISATDGILGSSEGQDVNVCEAAFEALGQIGS
SIWGATLLLSSFPTCVKHVIYAAFDRHEHSKQLAAMHALGNIFGETRSENDIILNDNAEENLRDLMYQIASKSPKMMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCL
MEICSKQNILNIVTDASTETTKIGICAYFALHPYFEVNQRLCS

HG10013671 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome