; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10013855 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10013855
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationChr02:5433738..5437056
RNA-Seq ExpressionHG10013855
SyntenyHG10013855
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7024718.1 hypothetical protein SDJN02_13536, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.9e-14181.95Show/hide
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XP_031740628.1 uncharacterized protein LOC101204571 isoform X1 [Cucumis sativus]9.3e-15786.11Show/hide
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XP_038898361.1 uncharacterized protein LOC120086031 isoform X1 [Benincasa hispida]4.3e-16288.2Show/hide
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        EFFTTIKNKPA DAV+LLSFNWF             ARLLAPP LR++EWF FSIS
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XP_038898364.1 uncharacterized protein LOC120086031 isoform X3 [Benincasa hispida]7.4e-13886.82Show/hide
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        R++EWF FSIS
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XP_038898366.1 uncharacterized protein LOC120086031 isoform X4 [Benincasa hispida]9.7e-13086.2Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWK5 Uncharacterized protein2.1e-12584.05Show/hide
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        S
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A0A1S3B9G5 uncharacterized protein LOC1034876331.6e-12585.52Show/hide
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        SLFS LLSLLVGVIIWEAEEPHLCLVVALMFVVSISLKSVVEFFTTIKNKPA DAVALLSFNWF             AR LAP A RV+EW GFS S
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A0A6J1F5N4 uncharacterized protein LOC111442593 isoform X11.5e-12877.3Show/hide
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        DL +SDALKD+                              DED+TEILDEQREVAV RSLFSTLLSLLVGVIIW+AEEPHLCLVVALMFVVSISLKSVV
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A0A6J1F6D4 uncharacterized protein LOC111442593 isoform X21.5e-12877.3Show/hide
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        DL +SDALKD+                              DED+TEILDEQREVAV RSLFSTLLSLLVGVIIW+AEEPHLCLVVALMFVVSISLKSVV
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        EFFTTIKNKPA DAVALLSFNWF             AR+LAP A RV+
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A0A6J1IHW7 uncharacterized protein LOC111477072 isoform X21.0e-12475.57Show/hide
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        KELQKQFQ AMKE KMMELMLDELEMI+EKATNKIALLES++QKLRNEN RLQEIKGKAYWSLKG  VKSEAQKT RV S+ITYGISSCSSSYS SS++Q
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        DL +S+A KD+                              DED+TEILDEQREVAV RSLFSTLLSLLVGVIIW+AEEPHLCLVVALMFVVSISLKSVV
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        EFFTTIKNKPA DAV+LLSFNWF             ARLLAP A RV+
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G45310.1 unknown protein6.7e-4436.09Show/hide
Query:  LSEFLNNTIFLVTRPFSFFMRTCSFILKTFVVVVQTWLELLKTSVSLHLNIFWTTL---MW-IIAIVSLPGRILAALQRERQLQQNLQFLEIEFDNVLWE
        +S  ++++++L+TRPF F +  C F L+T +V      +++ +++  +L++ W  +   +W  + + + P R  A++ RER L+Q++  L  E +++ W 
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Query:  RKELQKQFQAAMKEHKMMELMLDELEMIHEKATNKIALLESQMQKLRNENLRLQEIKGKAYWSLKGLGVKSEAQKTVRVDSDITYGISSCSSSYSGSSVI
        RKE++K  + A+KE+++ME  LDELE  H++A +KI  LE+++Q+L+ ENL+L E+ GK Y S KG    SE    +R                      
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                 K   I      K   + +KS ++  + + I  KDE++T  +L  ++ +AVSRS+FS +L+L+VG++++EA+E  LC  L+ AL  VV ISL
Subjt:  QDLCQSDALKDDGISEEKFIKILESGLKSGMFIHSHTEILSKDEDVT-EILDEQREVAVSRSLFSTLLSLLVGVIIWEAEEPHLC--LVVALMFVVSISL

Query:  KSVVEFFTTIKNKPAWDAVALLSFNWF
        KSVV+FF+T+KNKPA DAVAL+S NWF
Subjt:  KSVVEFFTTIKNKPAWDAVALLSFNWF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTTTCTTTCCGAGTTCCTGAATAATACAATATTCTTGGTCACGAGGCCTTTCTCGTTTTTCATGCGTACATGCTCATTTATCTTGAAAACCTTTGTTGTTGTTGT
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ATGGTATCTCATCATGCTCATCCAGCTATAGTGGCAGCAGTGTTATTCAAGACCTCTGTCAAAGTGATGCTTTGAAAGATGATGGTATATCTGAAGAAAAATTTATCAAA
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GCGTTGAGGGTTATGGAATGGTTCGGTTTCTCCATTTCCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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ALRVMEWFGFSIS