; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10014519 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10014519
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD4-like isoform X2
Genome locationChr02:13456690..13456905
RNA-Seq ExpressionHG10014519
SyntenyHG10014519
Gene Ontology termsGO:0050790 - regulation of catalytic activity (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0016020 - membrane (cellular component)
GO:0005096 - GTPase activator activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008454718.1 PREDICTED: ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD4-like isoform X2 [Cucumis melo]3.2e-1192.5Show/hide
Query:  INRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
        + RGA+PSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
Subjt:  INRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
XP_008454719.1 PREDICTED: ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD4-like isoform X4 [Cucumis melo]3.2e-1192.5Show/hide
Query:  INRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
        + RGA+PSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
Subjt:  INRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
XP_011654489.1 ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD4 isoform X1 [Cucumis sativus]3.2e-1192.5Show/hide
Query:  INRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
        + RGA+PSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
Subjt:  INRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
XP_031741046.1 ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD4 isoform X2 [Cucumis sativus]3.2e-1192.5Show/hide
Query:  INRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
        + RGA+PSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
Subjt:  INRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
XP_031741047.1 ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD4 isoform X4 [Cucumis sativus]3.2e-1192.5Show/hide
Query:  INRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
        + RGA+PSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
Subjt:  INRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KJC8 Uncharacterized protein1.6e-1192.5Show/hide
Query:  INRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
        + RGA+PSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
Subjt:  INRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
A0A1S3BYT7 ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD4-like isoform X41.6e-1192.5Show/hide
Query:  INRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
        + RGA+PSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
Subjt:  INRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
A0A1S3C009 ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD4-like isoform X11.6e-1192.5Show/hide
Query:  INRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
        + RGA+PSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
Subjt:  INRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
A0A1S3C0G9 ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD4-like isoform X21.6e-1192.5Show/hide
Query:  INRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
        + RGA+PSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
Subjt:  INRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
A0A1S4E0Y6 ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD4-like isoform X31.6e-1192.5Show/hide
Query:  INRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
        + RGA+PSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
Subjt:  INRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE
SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9C6C3 ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD28.2e-1078.05Show/hide
Query:  FSYNFINRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLL
        F+   + RGARPSI+D GGLS LERAMEMGAITDEELFLLL
Subjt:  FSYNFINRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLL
Q9SMX5 ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD48.2e-1078.05Show/hide
Query:  FSYNFINRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLL
        F+   + RGARPSI+D GGLS LERAMEMGAITDEELFLLL
Subjt:  FSYNFINRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLL
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G10870.1 ARF-GAP domain 45.9e-1178.05Show/hide
Query:  FSYNFINRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLL
        F+   + RGARPSI+D GGLS LERAMEMGAITDEELFLLL
Subjt:  FSYNFINRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLL
AT1G60860.1 ARF-GAP domain 25.9e-1178.05Show/hide
Query:  FSYNFINRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLL
        F+   + RGARPSI+D GGLS LERAMEMGAITDEELFLLL
Subjt:  FSYNFINRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLL

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTTAATCAAACTTATGTATATAAATGTCAATTACATTGATAGTGGTGTTCTTATACAATTTTATTACCTGTGTTTTTCTTATAACTTTATAAACAGAGGTGCACG
GCCATCAATCAAAGATTGTGGAGGATTAAGTGCGTTAGAAAGAGCAATGGAAATGGGAGCAATAACCGATGAGGAGCTATTTCTATTGCTTACAGGATCTGAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTTAATCAAACTTATGTATATAAATGTCAATTACATTGATAGTGGTGTTCTTATACAATTTTATTACCTGTGTTTTTCTTATAACTTTATAAACAGAGGTGCACG
GCCATCAATCAAAGATTGTGGAGGATTAAGTGCGTTAGAAAGAGCAATGGAAATGGGAGCAATAACCGATGAGGAGCTATTTCTATTGCTTACAGGATCTGAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MALIKLMYINVNYIDSGVLIQFYYLCFSYNFINRGARPSIKDCGGLSALERAMEMGAITDEELFLLLTGSE