; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10014733 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10014733
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionBasic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein
Genome locationChr02:18844904..18850172
RNA-Seq ExpressionHG10014733
SyntenyHG10014733
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR004827 - Basic-leucine zipper domain
IPR044759 - RF2-like transcription factor, bZIP domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ADN33710.1 b-zip DNA binding protein [Cucumis melo subsp. melo]5.8e-11494.12Show/hide
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XP_004146436.1 bZIP transcription factor 18 [Cucumis sativus]2.2e-11394.12Show/hide
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XP_008456950.1 PREDICTED: transcription factor RF2b [Cucumis melo]5.8e-11494.12Show/hide
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XP_022146775.1 transcription factor RF2b [Momordica charantia]2.0e-10689.87Show/hide
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XP_038893228.1 transcription factor RF2b [Benincasa hispida]6.9e-11594.51Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KMA2 BZIP domain-containing protein1.1e-11394.12Show/hide
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A0A1S3C4G5 transcription factor RF2b2.8e-11494.12Show/hide
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A0A5A7VHZ8 B-zip DNA binding protein2.8e-11494.12Show/hide
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A0A6J1CY75 transcription factor RF2b9.7e-10789.87Show/hide
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E5GB68 B-zip DNA binding protein2.8e-11494.12Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22873 bZIP transcription factor 181.2e-6462.45Show/hide
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        HRHS S DGSS +ESIEAKKAM PDKLAELW +DPKRAKRI+ANRQSAARSKERKARYI+ELERKVQ+LQTEATTLSAQL+L+QRDTTGLS+EN+ELKLR
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        LQ MEQQA LRDALNE LKKEVERLKFATGEV  A D+YN GM  + Y   PQ  F    HQ Q    N Q+       H FH          SS  NP 
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              H A   A  Q H+ +E   +D + +LQGLDISS  RG+     G S +VSESSST
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Q04088 Probable transcription factor PosF212.6e-4048.54Show/hide
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        H+HS S DGS  +            +I+AKK+M   KLAEL  IDPKRAKRI ANRQSAARSKERK RYI ELERKVQ+LQTEATTLSAQLTL QRDT G
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Query:  LSTENSELKLRLQAMEQQAHLRDALNEALKKEVERLKFATGEVMTATDSY-NFGMPQVPYPQSCFSHQPQPGRHNPQRTMQGPQVHPFHSSLPNPHQALF
        L+ EN+ELKLRLQ MEQQ HL+D LNEALK+E++ LK  TG+V  +  +Y +FG  Q    Q  +S+          +  Q  Q+H          Q   
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Query:  VASHQPHTLTEIFQQDPIRQLQGLDISSR----GTEIKP
            Q       FQQ  ++QL    +  +    G  +KP
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Q69IL4 Transcription factor RF2a2.6e-4052.27Show/hide
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        ++ G+  M S EAKKA+   KLAEL  +DPKRAKRI ANRQSAARSKERK RYI ELERKVQ+LQTEATTLSAQL L QRDT+GL+TENSELKLRLQ ME
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Query:  QQAHLRDALNEALKKEVERLKFATGEVMTATD-SYNF-GMP-QVPYPQSCFSHQPQPGRHNPQRTMQGPQVHPFHSSLPNPHQALFVASHQPHTLTEIFQ
        QQ HL+DALN+ LK EV+RLK ATG++        NF GMP Q    Q  F +            +Q  Q+HP         Q +    HQ        Q
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Query:  QDPIRQLQGLDISSRGTEIK
        Q P+  LQ   +     ++K
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Q6S4P4 Transcription factor RF2b9.8e-6460.64Show/hide
Query:  HRHSNSADGS------------SIMESIEAKKAMDPDKLAELWTIDPKRAKRILANRQSAARSKERKARYIMELERKVQSLQTEATTLSAQLTLYQRDTT
        HRHS+S DGS            S+ E +EAKKAM P++L+EL  IDPKRAKRILANRQSAARSKERKARYI ELERKVQ+LQTEATTLSAQLTL+QRDTT
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Query:  GLSTENSELKLRLQAMEQQAHLRDALNEALKKEVERLKFATGEVMTATDSYNFGMPQVPYPQSCFSHQPQPGRHNPQRTMQGPQVHPFHSSLPNPHQALF
        GLS EN+ELK+RLQAMEQQA LRDALN+ALK+E+ERLK ATGE+  + ++Y+ G+  VPY    F       +HN  R   G Q+ P     P P+    
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Query:  VASHQPHTLTEIFQQDPIRQLQGLDISSRGTEIKPEGSSISVSESSSTF
        + SH P+ L +I QQDP+ +LQGLDIS     +K E SSIS SESSSTF
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Q8H1F0 bZIP transcription factor 298.7e-3666.91Show/hide
Query:  SNSADGSS-----------IMESIEAKKAMDPDKLAELWTIDPKRAKRILANRQSAARSKERKARYIMELERKVQSLQTEATTLSAQLTLYQRDTTGLST
        +NS DG+S              + E KK M  DKLAE+   DPKR KRILANRQSAARSKERK RYI+ELE KVQ+LQTEATTLSAQLTL QRD  GL+ 
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Query:  ENSELKLRLQAMEQQAHLRDALNEALKKEVERLKFATGE
        +N+ELK RLQAMEQQA LRDALNEAL  EV+RLK A GE
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06850.1 basic leucine-zipper 524.4e-5957.38Show/hide
Query:  HRHSNSADGSSIM---ESIEAKKAMDPDKLAELWTIDPKRAKRILANRQSAARSKERKARYIMELERKVQSLQTEATTLSAQLTLYQRDTTGLSTENSEL
        HRHSNS D    M   + ++AKKAM P+KL+ELW IDPKRAKRILANRQSAARSKERKARYI ELERKVQSLQTEATTLSAQLTLYQRDT GL+ EN+EL
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Query:  KLRLQAMEQQAHLRDALNEALKKEVERLKFATGEVMTATDSYNFGMPQVPYPQSCFSHQPQPGRHNPQRTMQGPQVHPFHSSLPNPHQALFVASHQPHTL
        KLRLQAMEQQA LR+ALNEAL+KEVER+K  TGE+   +DS++ GM Q+ Y  S F   P                 P+H S+ N H     +S  P  +
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Query:  TEIFQQDPIRQ---LQGLDISSRGTE-IKPEGSSISVSESSSTF
        +         Q   +QGL+ISS  +  +K EG S+S SESSS +
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AT1G06850.2 basic leucine-zipper 521.1e-4978.26Show/hide
Query:  HRHSNSADGSSIM---ESIEAKKAMDPDKLAELWTIDPKRAKRILANRQSAARSKERKARYIMELERKVQSLQTEATTLSAQLTLYQRDTTGLSTENSEL
        HRHSNS D    M   + ++AKKAM P+KL+ELW IDPKRAKRILANRQSAARSKERKARYI ELERKVQSLQTEATTLSAQLTLYQRDT GL+ EN+EL
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Query:  KLRLQAMEQQAHLRDALNEALKKEVERLKFATGEVMTA
        KLRLQAMEQQA LR+ALNEAL+KEVER+K  TGE+  A
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AT2G31370.3 Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein1.8e-4148.54Show/hide
Query:  HRHSNSADGSSIM-----------ESIEAKKAMDPDKLAELWTIDPKRAKRILANRQSAARSKERKARYIMELERKVQSLQTEATTLSAQLTLYQRDTTG
        H+HS S DGS  +            +I+AKK+M   KLAEL  IDPKRAKRI ANRQSAARSKERK RYI ELERKVQ+LQTEATTLSAQLTL QRDT G
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Query:  LSTENSELKLRLQAMEQQAHLRDALNEALKKEVERLKFATGEVMTATDSY-NFGMPQVPYPQSCFSHQPQPGRHNPQRTMQGPQVHPFHSSLPNPHQALF
        L+ EN+ELKLRLQ MEQQ HL+D LNEALK+E++ LK  TG+V  +  +Y +FG  Q    Q  +S+          +  Q  Q+H          Q   
Subjt:  LSTENSELKLRLQAMEQQAHLRDALNEALKKEVERLKFATGEVMTATDSY-NFGMPQVPYPQSCFSHQPQPGRHNPQRTMQGPQVHPFHSSLPNPHQALF

Query:  VASHQPHTLTEIFQQDPIRQLQGLDISSR----GTEIKP
            Q       FQQ  ++QL    +  +    G  +KP
Subjt:  VASHQPHTLTEIFQQDPIRQLQGLDISSR----GTEIKP

AT2G31370.5 Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein8.3e-4264.33Show/hide
Query:  HRHSNSADGSSIM-----------ESIEAKKAMDPDKLAELWTIDPKRAKRILANRQSAARSKERKARYIMELERKVQSLQTEATTLSAQLTLYQRDTTG
        H+HS S DGS  +            +I+AKK+M   KLAEL  IDPKRAKRI ANRQSAARSKERK RYI ELERKVQ+LQTEATTLSAQLTL QRDT G
Subjt:  HRHSNSADGSSIM-----------ESIEAKKAMDPDKLAELWTIDPKRAKRILANRQSAARSKERKARYIMELERKVQSLQTEATTLSAQLTLYQRDTTG

Query:  LSTENSELKLRLQAMEQQAHLRDALNEALKKEVERLKFATGEVMTATDSY-NFGMPQ
        L+ EN+ELKLRLQ MEQQ HL+D LNEALK+E++ LK  TG+V  +  +Y +FG  Q
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AT2G40620.1 Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein8.2e-6662.45Show/hide
Query:  HRHSNSADGSSIMESIEAKKAMDPDKLAELWTIDPKRAKRILANRQSAARSKERKARYIMELERKVQSLQTEATTLSAQLTLYQRDTTGLSTENSELKLR
        HRHS S DGSS +ESIEAKKAM PDKLAELW +DPKRAKRI+ANRQSAARSKERKARYI+ELERKVQ+LQTEATTLSAQL+L+QRDTTGLS+EN+ELKLR
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Query:  LQAMEQQAHLRDALNEALKKEVERLKFATGEVMTATDSYNFGMPQVPY---PQSCF---SHQPQPGRHNPQRTMQGPQVHPFH----------SSLPNP-
        LQ MEQQA LRDALNE LKKEVERLKFATGEV  A D+YN GM  + Y   PQ  F    HQ Q    N Q+       H FH          SS  NP 
Subjt:  LQAMEQQAHLRDALNEALKKEVERLKFATGEVMTATDSYNFGMPQVPY---PQSCF---SHQPQPGRHNPQRTMQGPQVHPFH----------SSLPNP-

Query:  ------HQALFVASHQPHTLTEIFQQDPIRQLQGLDISS--RGTEIKPEGSSISVSESSST
              H A   A  Q H+ +E   +D + +LQGLDISS  RG+     G S +VSESSST
Subjt:  ------HQALFVASHQPHTLTEIFQQDPIRQLQGLDISS--RGTEIKPEGSSISVSESSST


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACCCACTTTGATTTACCCAACAAGAACACGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAGAAGGAACAATTTAATCAACAGACTCTCTCTCTGCACCGTCATAGCAATTCTGC
AGATGGGTCTTCCATTATGGAGTCTATTGAGGCTAAGAAGGCCATGGATCCTGATAAGCTCGCCGAGTTGTGGACTATTGATCCTAAACGTGCCAAAAGGATTTTGGCGA
ATAGACAGTCTGCTGCTCGGTCAAAAGAGAGAAAAGCTCGCTACATAATGGAACTTGAGAGAAAAGTTCAAAGCCTTCAGACTGAAGCGACAACTCTCTCTGCACAGCTC
ACGTTGTACCAGAGAGATACCACAGGGCTTTCAACCGAAAACTCAGAGCTCAAACTACGTTTACAAGCTATGGAACAGCAAGCTCATTTACGCGATGCTCTAAATGAAGC
TTTGAAAAAGGAAGTCGAGCGGCTCAAGTTTGCGACTGGAGAAGTAATGACAGCTACAGATTCGTATAACTTTGGAATGCCTCAAGTTCCATATCCCCAATCTTGCTTTT
CACACCAACCACAACCTGGGCGACACAACCCACAGAGGACGATGCAAGGGCCCCAAGTTCATCCATTCCATTCTAGTTTACCGAACCCACATCAAGCTTTGTTTGTTGCA
TCGCACCAGCCTCACACCTTGACAGAAATATTTCAGCAGGATCCTATTAGACAATTGCAGGGTCTCGATATCAGTAGCAGAGGCACAGAAATAAAACCAGAAGGCTCCTC
CATATCCGTCAGTGAAAGTAGCAGCACATTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SHQPHTLTEIFQQDPIRQLQGLDISSRGTEIKPEGSSISVSESSSTF