CuGenDBv2

Gene ID	HG10014812
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	Microsomal signal peptidase 25 kDa subunit (SPC25)
Genome location	Chr02:20388063..20390283
RNA-Seq Expression	HG10014812
Synteny	HG10014812
Gene Ontology terms	GO:0006465 - signal peptide processing (biological process) GO:0045047 - protein targeting to ER (biological process) GO:0005787 - signal peptidase complex (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR009582 - Signal peptidase complex subunit Spc2/SPCS2

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAA0037360.1 putative signal peptidase complex subunit 2 [Cucumis melo var. makuwa]

3.8e-65

70.56

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XP_008463218.1 PREDICTED: probable signal peptidase complex subunit 2 [Cucumis melo]

2.0e-61

73.91

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        MATKNAKKANLLDHHSLKHLLDESVSE++ S          N   I+G    +I     F   K              YVVFNGILQFIVYTKEKNAILF
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XP_011654984.1 probable signal peptidase complex subunit 2 [Cucumis sativus]

2.2e-60

72.83

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        MA+KNAKKANLLDHHSLKHLLDESVSE++        V  + +K+I     +I      F   K              YVVFNGILQFIVYTKEKNAILF
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XP_022996614.1 probable signal peptidase complex subunit 2 [Cucurbita maxima]

2.8e-60

72.83

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        MATKNAKKANLLDHHSLKHLLDESVSE++ S          N   I+G    +I     F   K              YVVFNGILQFIVYTKEKNAILF
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XP_038891545.1 probable signal peptidase complex subunit 2 [Benincasa hispida]

1.5e-61

73.91

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        MATKN KKANLLDHHSLKHLLDESVSE++ S         + +K+I     +I      F   K              YVVFNGILQFIVYTKEKNAILF
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        TYPPAGSFTSTGLV+SSKLPRFSDLYTLTISSSDPKSISANEPVQFTKSVTRWFTKDGVLVEGLFWKDVEALIDDY REPKKSK
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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KSD0 Uncharacterized protein

1.3e-66

73.06

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        MA+KNAKKANLLDHHSLKHLLDESVSE+                           L+ F+           M+I+G  S+VIFNSGKYVVFNGILQFIVY
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        TKEKNAILFTYPPAGSFTSTGL++SSKLPRFSDLYTLTISSSDPKSISANE VQFTKSVTRWFTKDGVLVEGLFWKDVEALID+YAREPKKSK
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A0A1S3CIQ9 probable signal peptidase complex subunit 2

9.5e-62

73.91

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        MATKNAKKANLLDHHSLKHLLDESVSE++ S          N   I+G    +I     F   K              YVVFNGILQFIVYTKEKNAILF
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        TYPPAGSFTSTGL++SSKLPRFSDLYTL+ISSSDPKSISANEPVQFTKSVTRWFTKDGVLVEGLFWKDVEALID+YAREPKKSK
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A0A5A7T1V9 Putative signal peptidase complex subunit 2

1.8e-65

70.56

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Query:  FIVYTKEKNAILFTYPPAGSFTSTGLVISSKLPRFSDLYTLTISSSDPKSISANEPVQFTKSVTRWFTKDGVLVEGLFWKDVEALIDDYAREPKKSK
        FIVYTKEKNAILFTYPPAGSFTSTGL++SSKLPRFSDLYTL+ISSSDPKSISANEPVQFTKSVTRWFTKDGVLVEGLFWKDVEALID+YAREPKKSK
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A0A6J1FVT7 probable signal peptidase complex subunit 2

1.8e-60

72.83

Show/hide

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        MATKNAKKANLLDHHSLKHLLDESVSE++ S          N   I+G    +I     F   K              YVVFNGILQFIVYTKEKNAILF
Subjt:  MATKNAKKANLLDHHSLKHLLDESVSEVLVS---------FNEMKIIGWCSHVI-----FNSGK--------------YVVFNGILQFIVYTKEKNAILF

Query:  TYPPAGSFTSTGLVISSKLPRFSDLYTLTISSSDPKSISANEPVQFTKSVTRWFTKDGVLVEGLFWKDVEALIDDYAREPKKSK
        TYPPAGSFTSTGLV+SSKLPRFSDLYTL+ISSSDP+SISAN+PV+FTKSVTRWFTKDGVLVEGLFWKDVEALIDDYA EPKKSK
Subjt:  TYPPAGSFTSTGLVISSKLPRFSDLYTLTISSSDPKSISANEPVQFTKSVTRWFTKDGVLVEGLFWKDVEALIDDYAREPKKSK

A0A6J1K981 probable signal peptidase complex subunit 2

1.4e-60

72.83

Show/hide

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        MATKNAKKANLLDHHSLKHLLDESVSE++ S          N   I+G    +I     F   K              YVVFNGILQFIVYTKEKNAILF
Subjt:  MATKNAKKANLLDHHSLKHLLDESVSEVLVS---------FNEMKIIGWCSHVI-----FNSGK--------------YVVFNGILQFIVYTKEKNAILF

Query:  TYPPAGSFTSTGLVISSKLPRFSDLYTLTISSSDPKSISANEPVQFTKSVTRWFTKDGVLVEGLFWKDVEALIDDYAREPKKSK
        TYPPAGSFTSTGLV+SSKLPRFSDLYTL+ISSSDP+SISAN PV+FTKSVTRWFTKDGVLVEGLFWKDVEALIDDYA+EPKKSK
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SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

P58684 Probable signal peptidase complex subunit 2

9.5e-51

62.64

Show/hide

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        KN KKANLLDHHS+KH+LDESVS+++ S          N   I+G    V+     F + K              YVV N +LQ I+YTKEKNAILFTYP
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Query:  PAGSFTSTGLVISSKLPRFSDLYTLTISSSDPKSISANEPVQFTKSVTRWFTKDGVLVEGLFWKDVEALIDDYA-REPKKSK
        P GSFTSTGLV+SSKLPRFSD YTLTI S+DPKSISA + VQ TKSVT+WFTKDGVLVEGLFWKDVEALI +YA  EPKK K
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Q5BJI9 Probable signal peptidase complex subunit 2

1.3e-07

39.05

Show/hide

Query:  YVVFNGILQFIVYTKEKNAILFTY--PPAGSFTSTGLVISSKLPRFSDLYTLTISSSDPKSISANEPVQFTKSVTRWFTKDGVLVEGLFWKDVEALIDDY
        Y +  GIL      KEKN  L      PAG        +SS L RF D YTL +S +D K+  + E  +FTKSV+ +F ++G LV   + K V  L D  
Subjt:  YVVFNGILQFIVYTKEKNAILFTY--PPAGSFTSTGLVISSKLPRFSDLYTLTISSSDPKSISANEPVQFTKSVTRWFTKDGVLVEGLFWKDVEALIDDY

Query:  AREPK
        A E K
Subjt:  AREPK

Q5M8Y1 Probable signal peptidase complex subunit 2

6.4e-07

37.14

Show/hide

Query:  YVVFNGILQFIVYTKEKNAILFTY--PPAGSFTSTGLVISSKLPRFSDLYTLTISSSDPKSISANEPVQFTKSVTRWFTKDGVLVEGLFWKDVEALIDDY
        Y +  GIL      KEK+  L  +   PAG        +SS L RF D YTL ++    K+  A    +FTKS+ R+F  +G LV  LF  +V  L D  
Subjt:  YVVFNGILQFIVYTKEKNAILFTY--PPAGSFTSTGLVISSKLPRFSDLYTLTISSSDPKSISANEPVQFTKSVTRWFTKDGVLVEGLFWKDVEALIDDY

Query:  AREPK
        A E K
Subjt:  AREPK

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G39960.1 Microsomal signal peptidase 25 kDa subunit (SPC25)

6.7e-52

62.64

Show/hide

Query:  KNAKKANLLDHHSLKHLLDESVSEVLVS---------FNEMKIIGWCSHVI-----FNSGK--------------YVVFNGILQFIVYTKEKNAILFTYP
        KN KKANLLDHHS+KH+LDESVS+++ S          N   I+G    V+     F + K              YVV N +LQ I+YTKEKNAILFTYP
Subjt:  KNAKKANLLDHHSLKHLLDESVSEVLVS---------FNEMKIIGWCSHVI-----FNSGK--------------YVVFNGILQFIVYTKEKNAILFTYP

Query:  PAGSFTSTGLVISSKLPRFSDLYTLTISSSDPKSISANEPVQFTKSVTRWFTKDGVLVEGLFWKDVEALIDDYA-REPKKSK
        P GSFTSTGLV+SSKLPRFSD YTLTI S+DPKSISA + VQ TKSVT+WFTKDGVLVEGLFWKDVEALI +YA  EPKK K
Subjt:  PAGSFTSTGLVISSKLPRFSDLYTLTISSSDPKSISANEPVQFTKSVTRWFTKDGVLVEGLFWKDVEALIDDYA-REPKKSK

AT4G04200.1 Microsomal signal peptidase 25 kDa subunit (SPC25)

5.3e-49

57.61

Show/hide

Query:  ATKNAKKANLLDHHSLKHLLDESVSEVLVS--------FNEMKII-------------------GWCSHVIFNSGKYVVFNGILQFIVYTKEKNAILFTY
        ATKN KK NLLDH ++KHLLDESVS+++ S         + +K +                   G C  ++ + GKYVV   ++Q I+Y KEKNAILFTY
Subjt:  ATKNAKKANLLDHHSLKHLLDESVSEVLVS--------FNEMKII-------------------GWCSHVIFNSGKYVVFNGILQFIVYTKEKNAILFTY

Query:  PPAGSFTSTGLVISSKLPRFSDLYTLTISSSDPKSISANEPVQFTKSVTRWFTKDGVLVEGLFWKDVEALIDDY--AREPKKSK
        P  GSFTSTGLV+SSKLPRFSD YTLTI S+DP+SISA + VQFTKSVT+W TKDGVLVEGLFWKDVEAL+ +Y  A EPKK +
Subjt:  PPAGSFTSTGLVISSKLPRFSDLYTLTISSSDPKSISANEPVQFTKSVTRWFTKDGVLVEGLFWKDVEALIDDY--AREPKKSK

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCGACCAAAAATGCCAAAAAGGCCAATCTCTTGGATCACCACTCCCTCAAACACCTACTCGATGAATCTGTTTCTGAGGTTTTGGTTTCGTTTAATGAAATGAAAAT
CATTGGATGGTGCTCTCATGTGATCTTTAACTCTGGCAAGTATGTAGTTTTTAATGGGATCTTGCAGTTCATCGTTTACACCAAGGAGAAGAACGCAATTTTGTTCACAT
ATCCTCCTGCAGGATCCTTCACCAGCACTGGACTGGTAATCTCTTCAAAATTACCCAGATTCTCAGATCTGTATACACTGACCATATCTAGTTCAGATCCCAAATCAATC
TCCGCTAATGAACCGGTTCAATTTACCAAGAGTGTCACACGCTGGTTTACTAAGGATGGAGTTTTAGTTGAGGGGCTTTTCTGGAAAGATGTTGAAGCACTGATCGATGA
TTATGCTAGAGAACCAAAGAAGAGCAAGTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MATKNAKKANLLDHHSLKHLLDESVSEVLVSFNEMKIIGWCSHVIFNSGKYVVFNGILQFIVYTKEKNAILFTYPPAGSFTSTGLVISSKLPRFSDLYTLTISSSDPKSI
SANEPVQFTKSVTRWFTKDGVLVEGLFWKDVEALIDDYAREPKKSK

HG10014812 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome