; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10014954 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10014954
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Descriptionserine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X2
Genome locationChr02:22221256..22223462
RNA-Seq ExpressionHG10014954
SyntenyHG10014954
Gene Ontology termsGO:0003723 - RNA binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR001878 - Zinc finger, CCHC-type
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily
IPR036875 - Zinc finger, CCHC-type superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0034024.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-13681.07Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYG----------------------------RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGS
        MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYG                            RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGS
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYG----------------------------RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGS

Query:  RIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL---------------------------
        RIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL                           
Subjt:  RIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL---------------------------

Query:  NRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNY
        +RSRSPVKR+RSLERSDKRSRSPRGR SPKRHSLSPPP KAMKRSPTPDERSPEE ARRSLSP NRD  SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDF+GGGSRNY
Subjt:  NRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNY

Query:  RREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA
        RREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA
Subjt:  RREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA

XP_004143594.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32 isoform X2 [Cucumis sativus]1.3e-14088.35Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
        MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT

Query:  GRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL---------------------------NRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPS
        GRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL                           +RSRSPVKR+RSLERSDKRSRSPRGR S
Subjt:  GRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL---------------------------NRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPS

Query:  PKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNN
        PKRHSLSPPP KAMKRSPTPDERSPEE ARRSLSP NRD  SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDF+GGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNN
Subjt:  PKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNN

Query:  GSPRGGSES
        GSPRGGSES
Subjt:  GSPRGGSES

XP_008445806.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X2 [Cucumis melo]3.4e-14188.39Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
        MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT

Query:  GRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL---------------------------NRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPS
        GRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL                           +RSRSPVKR+RSLERSDKRSRSPRGR S
Subjt:  GRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL---------------------------NRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPS

Query:  PKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNN
        PKRHSLSPPP KAMKRSPTPDERSPEE ARRSLSP NRD  SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDF+GGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNN
Subjt:  PKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNN

Query:  GSPRGGSESA
        GSPRGGSESA
Subjt:  GSPRGGSESA

XP_022139066.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X1 [Momordica charantia]8.8e-13781.52Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
        MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT

Query:  GRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL-----------------------------NRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGR
        GRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL                             +RSRSP+KRERSLERS+KRSRSPRGR
Subjt:  GRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL-----------------------------NRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGR

Query:  PSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRD---------------------SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYS
        PSPKRHSLSPPP KAMKRSPTPDERSPEEARRS SP NRD                     SPRGRSRSPRGRSRSPMDE EDF  GGSRNYRREENGYS
Subjt:  PSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRD---------------------SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYS

Query:  RSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA
        RSPSPLPREERSP+NDEDNNG+PRGGSESA
Subjt:  RSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA

XP_038892927.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X1 [Benincasa hispida]1.3e-14389.25Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
        MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT

Query:  GRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL---------------------------NRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPS
        GRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL                           +RSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGR S
Subjt:  GRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL---------------------------NRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPS

Query:  PKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSP
        PKRHSLSPPP K MKRSPTPDERSPEEARRSLSP NRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDED NGSP
Subjt:  PKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSP

Query:  RGGSESA
        RGGSESA
Subjt:  RGGSESA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KS31 Uncharacterized protein6.3e-14188.35Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
        MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT

Query:  GRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL---------------------------NRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPS
        GRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL                           +RSRSPVKR+RSLERSDKRSRSPRGR S
Subjt:  GRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL---------------------------NRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPS

Query:  PKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNN
        PKRHSLSPPP KAMKRSPTPDERSPEE ARRSLSP NRD  SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDF+GGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNN
Subjt:  PKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNN

Query:  GSPRGGSES
        GSPRGGSES
Subjt:  GSPRGGSES

A0A1S3BD24 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X15.5e-13781.07Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYG----------------------------RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGS
        MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYG                            RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGS
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYG----------------------------RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGS

Query:  RIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL---------------------------
        RIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL                           
Subjt:  RIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL---------------------------

Query:  NRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNY
        +RSRSPVKR+RSLERSDKRSRSPRGR SPKRHSLSPPP KAMKRSPTPDERSPEE ARRSLSP NRD  SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDF+GGGSRNY
Subjt:  NRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNY

Query:  RREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA
        RREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA
Subjt:  RREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA

A0A1S3BDJ7 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X21.7e-14188.39Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
        MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT

Query:  GRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL---------------------------NRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPS
        GRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL                           +RSRSPVKR+RSLERSDKRSRSPRGR S
Subjt:  GRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL---------------------------NRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPS

Query:  PKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNN
        PKRHSLSPPP KAMKRSPTPDERSPEE ARRSLSP NRD  SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDF+GGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNN
Subjt:  PKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNN

Query:  GSPRGGSESA
        GSPRGGSESA
Subjt:  GSPRGGSESA

A0A5A7SS39 Serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X15.5e-13781.07Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYG----------------------------RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGS
        MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYG                            RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGS
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYG----------------------------RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGS

Query:  RIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL---------------------------
        RIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL                           
Subjt:  RIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL---------------------------

Query:  NRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNY
        +RSRSPVKR+RSLERSDKRSRSPRGR SPKRHSLSPPP KAMKRSPTPDERSPEE ARRSLSP NRD  SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDF+GGGSRNY
Subjt:  NRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNY

Query:  RREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA
        RREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA
Subjt:  RREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA

A0A6J1CET7 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X14.2e-13781.52Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
        MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT

Query:  GRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL-----------------------------NRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGR
        GRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL                             +RSRSP+KRERSLERS+KRSRSPRGR
Subjt:  GRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL-----------------------------NRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGR

Query:  PSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRD---------------------SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYS
        PSPKRHSLSPPP KAMKRSPTPDERSPEEARRS SP NRD                     SPRGRSRSPRGRSRSPMDE EDF  GGSRNYRREENGYS
Subjt:  PSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRD---------------------SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYS

Query:  RSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA
        RSPSPLPREERSP+NDEDNNG+PRGGSESA
Subjt:  RSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q16629 Serine/arginine-rich splicing factor 77.2e-1736.99Show/hide
Query:  MPRYDDRYGG-TRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRD---YAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG
        M RY  RYGG T++YVG L +     +L+  FS YG +R V + R+   +AFVEF DPRDA+DA   L+G+ + GSR+ VE++ G+PR     R    R 
Subjt:  MPRYDDRYGG-TRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRD---YAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG

Query:  PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLNRSRSPVKRERSLERSDKRSRS---PRGRPSPKRHSLS---------PPPS
             RC+ CG  GH+A DC     + +      R     + ++  ++ +RSRS  +  RS   S +RSRS    R R +  R S S           PS
Subjt:  PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLNRSRSPVKRERSLERSDKRSRS---PRGRPSPKRHSLS---------PPPS

Query:  KAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRG---RSRSP
        ++  RS     RS    R S S     SP+ RSRSP G   RS SP
Subjt:  KAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRG---RSRSP

Q3T106 Serine/arginine-rich splicing factor 77.2e-1734.53Show/hide
Query:  MPRYDDRYGG-TRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRD---YAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG
        M RY  RYGG T++YVG L +     +L+  FS YG +R V + R+   +AFVEF DPRDA+DA   L+G+ + GSR+ VE++ G+PR     R    R 
Subjt:  MPRYDDRYGG-TRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRD---YAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG

Query:  PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLNRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMK-RSPTPDE
        P               AR  +  D  ++CY CGE+GH   +C    ++        +R RS  RS  RSR        +R+S S   S+  + RS +P  
Subjt:  PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLNRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMK-RSPTPDE

Query:  RSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSP
              RRS S   R S  G  +  R RSR         S   SR+  R  +  S+S SP P+  RSP      + SP
Subjt:  RSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSP

Q8BL97 Serine/arginine-rich splicing factor 71.3e-1333.33Show/hide
Query:  TRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRD---YAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCG
        T++YVG L +     +L+  FS YG +R V + R+   +AFVEF DPRDA+DA   L+G+ + GSR+ VE++ G+PR     R    R P          
Subjt:  TRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRD---YAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCG

Query:  IDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLNRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMK-RSPTPDERSPEEARRSLS
             AR  +  D  ++CY CGE+GH   +C    ++        +R RS  RS  RSR        +R+S S   S+  + RS +P        RRS S
Subjt:  IDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLNRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMK-RSPTPDERSPEEARRSLS

Query:  PENRDSPRGR---SRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSP
           R S  G    SR  + RSR         S   SR+  R  +  S+S SP P+  RSP      + SP
Subjt:  PENRDSPRGR---SRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSP

Q8VYA5 Serine/arginine-rich splicing factor RS2Z333.5e-7259.93Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPG
        MPRYDDRYG TRLYVGRLSSRTR+RDL+ LFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEF DPRDADDAR+ L+GRD  GSRI VE ++G PR   GSR++  RG PPG
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPG

Query:  TGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLNRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPT-PDERSP
         GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+NSPKKL RS        S  RS  RSRSPR R SP R SLS   S +  RSP    ERS 
Subjt:  TGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLNRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPT-PDERSP

Query:  EEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPM--DEGE----DFSGGGSRNYRRE-----------ENGYSRSPSPL-------PREERSPVND--EDNNGS
        EE  RS SP+  D     S SPR R RSP+  DEG     D S   S   ++E           +NG +   SP+        +E+RSPV+D  E N  S
Subjt:  EEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPM--DEGE----DFSGGGSRNYRRE-----------ENGYSRSPSPL-------PREERSPVND--EDNNGS

Query:  PRGGSES
        PR GSES
Subjt:  PRGGSES

Q9FYB7 Serine/arginine-rich splicing factor RS2Z328.1e-6957.88Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPG
        MPRYDDRYG TRLYVGRLSSRTR+RDL+ LFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARY L+GRD  GSRI VE ++G PR   GSR+   RG PPG
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPG

Query:  TGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLNRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKR-HSLSPPPSKAMKRSPTPDERSP
        +GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+NSP     S    ++  S  RS  +SRSPR R SP R  S S   S +  RSP   E+S 
Subjt:  TGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLNRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKR-HSLSPPPSKAMKRSPTPDERSP

Query:  EEARRSLSPENRD-SPRGRSRSPRGRSRSPMD----EGEDFSG-----GGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPR-GGSES
        E+  RS     R  SP+GR +S     R  +D     G D+ G     G  RN      G   SP  L  ++RSP++DE     P   GSES
Subjt:  EEARRSLSPENRD-SPRGRSRSPRGRSRSPMD----EGEDFSG-----GGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPR-GGSES

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37340.1 arginine/serine-rich zinc knuckle-containing protein 332.5e-7359.93Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPG
        MPRYDDRYG TRLYVGRLSSRTR+RDL+ LFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEF DPRDADDAR+ L+GRD  GSRI VE ++G PR   GSR++  RG PPG
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPG

Query:  TGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLNRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPT-PDERSP
         GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+NSPKKL RS        S  RS  RSRSPR R SP R SLS   S +  RSP    ERS 
Subjt:  TGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLNRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPT-PDERSP

Query:  EEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPM--DEGE----DFSGGGSRNYRRE-----------ENGYSRSPSPL-------PREERSPVND--EDNNGS
        EE  RS SP+  D     S SPR R RSP+  DEG     D S   S   ++E           +NG +   SP+        +E+RSPV+D  E N  S
Subjt:  EEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPM--DEGE----DFSGGGSRNYRRE-----------ENGYSRSPSPL-------PREERSPVND--EDNNGS

Query:  PRGGSES
        PR GSES
Subjt:  PRGGSES

AT2G37340.2 arginine/serine-rich zinc knuckle-containing protein 335.8e-4653.88Show/hide
Query:  EFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLNRS
        EF DPRDADDAR+ L+GRD  GSRI VE ++G PR   GSR++  RG PPG GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+NSPKKL RS
Subjt:  EFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLNRS

Query:  RSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPT-PDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPM--DEGE----DFSGGGSRN
                S  RS  RSRSPR R SP R SLS   S +  RSP    ERS EE  RS SP+  D     S SPR R RSP+  DEG     D S   S  
Subjt:  RSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPT-PDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPM--DEGE----DFSGGGSRN

Query:  YRRE-----------ENGYSRSPSPL-------PREERSPVND--EDNNGSPRGGSES
         ++E           +NG +   SP+        +E+RSPV+D  E N  SPR GSES
Subjt:  YRRE-----------ENGYSRSPSPL-------PREERSPVND--EDNNGSPRGGSES

AT2G37340.3 arginine/serine-rich zinc knuckle-containing protein 337.8e-5155.26Show/hide
Query:  MKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQN
        MKRDYAFVEF DPRDADDAR+ L+GRD  GSRI VE ++G PR   GSR++  RG PPG GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+N
Subjt:  MKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQN

Query:  SPKKLNRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPT-PDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPM--DEGE----D
        SPKKL RS        S  RS  RSRSPR R SP R SLS   S +  RSP    ERS EE  RS SP+  D     S SPR R RSP+  DEG     D
Subjt:  SPKKLNRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPT-PDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPM--DEGE----D

Query:  FSGGGSRNYRRE-----------ENGYSRSPSPL-------PREERSPVND--EDNNGSPRGGSES
         S   S   ++E           +NG +   SP+        +E+RSPV+D  E N  SPR GSES
Subjt:  FSGGGSRNYRRE-----------ENGYSRSPSPL-------PREERSPVND--EDNNGSPRGGSES

AT3G53500.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein with retrovirus zinc finger-like domain1.4e-4752.59Show/hide
Query:  MKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQN
        MKRDYAFVEFSDPRDADDARY L+GRD  GSRI VE ++G PR   GSR+   RG PPG+GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+N
Subjt:  MKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQN

Query:  SPKKLNRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKR-HSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRD-SPRGRSRSPRGRSRSPMD----EGEDF
        SP     S    ++  S  RS  +SRSPR R SP R  S S   S +  RSP   E+S E+  RS     R  SP+GR +S     R  +D     G D+
Subjt:  SPKKLNRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKR-HSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRD-SPRGRSRSPRGRSRSPMD----EGEDF

Query:  SG-----GGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPR-GGSES
         G     G  RN      G   SP  L  ++RSP++DE     P   GSES
Subjt:  SG-----GGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPR-GGSES

AT3G53500.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein with retrovirus zinc finger-like domain5.8e-7057.88Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPG
        MPRYDDRYG TRLYVGRLSSRTR+RDL+ LFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARY L+GRD  GSRI VE ++G PR   GSR+   RG PPG
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPG

Query:  TGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLNRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKR-HSLSPPPSKAMKRSPTPDERSP
        +GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+NSP     S    ++  S  RS  +SRSPR R SP R  S S   S +  RSP   E+S 
Subjt:  TGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLNRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKR-HSLSPPPSKAMKRSPTPDERSP

Query:  EEARRSLSPENRD-SPRGRSRSPRGRSRSPMD----EGEDFSG-----GGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPR-GGSES
        E+  RS     R  SP+GR +S     R  +D     G D+ G     G  RN      G   SP  L  ++RSP++DE     P   GSES
Subjt:  EEARRSLSPENRD-SPRGRSRSPRGRSRSPMD----EGEDFSG-----GGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPR-GGSES


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCTCGCTATGACGATCGTTACGGTGGTACTCGGCTCTATGTTGGGCGCCTGTCTTCACGGACGAGGTCCCGTGATCTGGATGACCTGTTCAGTCGTTATGGAAGAGT
ACGCGATGTGGATATGAAGCGAGACTATGCATTCGTTGAATTTAGTGATCCCCGTGATGCGGATGATGCAAGATATAGTTTAAATGGGAGAGATGTTCATGGAAGTCGAA
TCATTGTGGAAATAGCTAAAGGGGTACCCCGTGGTCCTGGTGGATCTCGTGAATATCTTGGTCGAGGCCCTCCAGGAACTGGCCGTTGCTTCAATTGTGGGATTGATGGC
CACTGGGCTAGAGATTGCAAGGCTGGAGACTGGAAAAATAAATGTTATCGATGTGGCGAACGTGGACATATAGAGAAGAATTGCCAAAACAGTCCTAAGAAATTGAATCG
ATCTAGATCGCCTGTAAAAAGAGAAAGAAGCCTTGAACGATCAGATAAAAGATCAAGGAGCCCGAGAGGCAGACCAAGCCCAAAGAGGCACAGTTTGTCACCTCCTCCTT
CAAAAGCTATGAAACGTAGCCCCACTCCTGATGAGAGGAGTCCCGAAGAAGCAAGACGTAGTCTGTCCCCTGAAAATCGCGACAGTCCTAGAGGTAGAAGCAGAAGCCCA
AGGGGAAGGAGCAGGAGTCCAATGGACGAAGGCGAGGACTTCAGCGGTGGTGGAAGTAGAAATTACAGGAGGGAAGAAAATGGCTACAGTCGCAGCCCCAGTCCGTTGCC
TAGAGAAGAAAGAAGTCCTGTAAACGACGAAGATAACAACGGTTCTCCAAGGGGTGGCAGCGAGTCTGCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCCTCGCTATGACGATCGTTACGGTGGTACTCGGCTCTATGTTGGGCGCCTGTCTTCACGGACGAGGTCCCGTGATCTGGATGACCTGTTCAGTCGTTATGGAAGAGT
ACGCGATGTGGATATGAAGCGAGACTATGCATTCGTTGAATTTAGTGATCCCCGTGATGCGGATGATGCAAGATATAGTTTAAATGGGAGAGATGTTCATGGAAGTCGAA
TCATTGTGGAAATAGCTAAAGGGGTACCCCGTGGTCCTGGTGGATCTCGTGAATATCTTGGTCGAGGCCCTCCAGGAACTGGCCGTTGCTTCAATTGTGGGATTGATGGC
CACTGGGCTAGAGATTGCAAGGCTGGAGACTGGAAAAATAAATGTTATCGATGTGGCGAACGTGGACATATAGAGAAGAATTGCCAAAACAGTCCTAAGAAATTGAATCG
ATCTAGATCGCCTGTAAAAAGAGAAAGAAGCCTTGAACGATCAGATAAAAGATCAAGGAGCCCGAGAGGCAGACCAAGCCCAAAGAGGCACAGTTTGTCACCTCCTCCTT
CAAAAGCTATGAAACGTAGCCCCACTCCTGATGAGAGGAGTCCCGAAGAAGCAAGACGTAGTCTGTCCCCTGAAAATCGCGACAGTCCTAGAGGTAGAAGCAGAAGCCCA
AGGGGAAGGAGCAGGAGTCCAATGGACGAAGGCGAGGACTTCAGCGGTGGTGGAAGTAGAAATTACAGGAGGGAAGAAAATGGCTACAGTCGCAGCCCCAGTCCGTTGCC
TAGAGAAGAAAGAAGTCCTGTAAACGACGAAGATAACAACGGTTCTCCAAGGGGTGGCAGCGAGTCTGCATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDG
HWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLNRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSP
RGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA