; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10015084 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10015084
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionNuclear proteasome inhibitor UBLCP1
Genome locationChr02:23720588..23723774
RNA-Seq ExpressionHG10015084
SyntenyHG10015084
Gene Ontology termsGO:0006470 - protein dephosphorylation (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0004722 - protein serine/threonine phosphatase activity (molecular function)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000626 - Ubiquitin-like domain
IPR004274 - FCP1 homology domain
IPR011943 - HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIID
IPR023214 - HAD superfamily
IPR029071 - Ubiquitin-like domain superfamily
IPR036412 - HAD-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004135342.2 ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase [Cucumis sativus]2.4e-17896.08Show/hide
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XP_022998279.1 ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase [Cucurbita maxima]2.2e-17997.29Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KRY1 Nuclear proteasome inhibitor UBLCP11.2e-17896.08Show/hide
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A0A1S3BE06 Nuclear proteasome inhibitor UBLCP15.3e-17996.69Show/hide
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A0A5D3CXT3 Nuclear proteasome inhibitor UBLCP13.2e-17693.04Show/hide
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A0A6J1GYI7 Nuclear proteasome inhibitor UBLCP11.7e-18097.59Show/hide
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A0A6J1KDX1 Nuclear proteasome inhibitor UBLCP11.1e-17997.29Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2KJD7 Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 12.3e-9455.16Show/hide
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Q5FWT7 Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 11.7e-9455.48Show/hide
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Q5ZJJ8 Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 16.0e-9554.84Show/hide
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        N NYKIT +LD   MITV +  RG  D KPLG+IW +F E+Y+ +NTIMFDD+ RNF+MNPQNGL I+PF KAH NRD D+EL+KLTQYL  IA+LDD  
Subjt:  NPNYKITALLDHLGMITVQSDYRGTFDCKPLGLIWAQFPEFYNSRNTIMFDDLRRNFVMNPQNGLVIKPFRKAHANRDSDQELMKLTQYLLAIAELDDLS

Query:  PLDHNNWELY
         L+H +WE Y
Subjt:  PLDHNNWELY

Q8W3M6 Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase9.7e-15480.85Show/hide
Query:  AASASTSSPSEEEITLTVKWSGKEYTVRVCGDDSVAELKRRICELTNVLPKRQKLLYPKVGSKLADDSLLLSQLPLKSSLKMTMIGTVEDDIIVDQVDSP
        +A+A+ S  +EEE+TLTVKW+GKEYTVR+C DDSVAELKRRIC LT VLPKRQKLLYPK+G+KL+DDSLLLS +  K SLKMTMIGTVEDDIIVDQ +SP
Subjt:  AASASTSSPSEEEITLTVKWSGKEYTVRVCGDDSVAELKRRICELTNVLPKRQKLLYPKVGSKLADDSLLLSQLPLKSSLKMTMIGTVEDDIIVDQVDSP

Query:  EIIDDFELGKDEVIDIKDKDVNKQKLRRRISQYKIELRNPCREGKKLLVLDIDYTLFDHRSPAENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATSLKWVEL
        EI+DDFELGK+E +D+KDK+VNKQKLRRRI QYKI LR PCR+GKKLLVLDIDYTLFDHRS AENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATS+KWVEL
Subjt:  EIIDDFELGKDEVIDIKDKDVNKQKLRRRISQYKIELRNPCREGKKLLVLDIDYTLFDHRSPAENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATSLKWVEL

Query:  KMGQLGVLSNPNYKITALLDHLGMITVQSDYRGTFDCKPLGLIWAQFPEFYNSRNTIMFDDLRRNFVMNPQNGLVIKPFRKAHANRDSDQELMKLTQYLL
        KM +LGVL+NPNYK+TALLDHL MITVQSD RG FDCKPLGLIWA  PEFYN  NTIMFDDLRRNFVMNPQNGL IKPFRKAHANRD+DQEL+KLTQYLL
Subjt:  KMGQLGVLSNPNYKITALLDHLGMITVQSDYRGTFDCKPLGLIWAQFPEFYNSRNTIMFDDLRRNFVMNPQNGLVIKPFRKAHANRDSDQELMKLTQYLL

Query:  AIAELDDLSPLDHNNWELYSEDDGPKRRR
         IAEL DLS L H+ WE +S+D+  +RR+
Subjt:  AIAELDDLSPLDHNNWELYSEDDGPKRRR

Q8WVY7 Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 12.3e-9455.16Show/hide
Query:  ITLTVKWSGKEYTVRVCG-DDSVAELKRRICELTNVLPKRQKLLYPKVGSKLADDSLLLSQLPLKSSLKMTMIGTVE---DDIIVDQVDSPEIIDDFELG
        + + VKW G+EY+V     DD+V +LK+ +  LT VLP+RQKLL  KV  K A++ + L  L LK + K+ M+GT E   +D++    D+ ++++DF++ 
Subjt:  ITLTVKWSGKEYTVRVCG-DDSVAELKRRICELTNVLPKRQKLLYPKVGSKLADDSLLLSQLPLKSSLKMTMIGTVE---DDIIVDQVDSPEIIDDFELG

Query:  KDEVIDIKDKDVNKQKLRRRISQYKIELRNPCREGKKLLVLDIDYTLFDHRSPAENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATSLKWVELKMGQLGVLS
        +DEV+++++++ N  K+ RR+ +YK+E+ NP REGKKLLVLD+DYTLFDHRS AE  ++LMRPYLHEFLT+AY +YDI+IWSAT++KW+E KM +LGV +
Subjt:  KDEVIDIKDKDVNKQKLRRRISQYKIELRNPCREGKKLLVLDIDYTLFDHRSPAENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATSLKWVELKMGQLGVLS

Query:  NPNYKITALLDHLGMITVQSDYRGTFDCKPLGLIWAQFPEFYNSRNTIMFDDLRRNFVMNPQNGLVIKPFRKAHANRDSDQELMKLTQYLLAIAELDDLS
        N NYKIT +LD   MITV +  RG  D KPLG+IW +F EFY+ +NTIMFDD+ RNF+MNPQNGL I+PF KAH NRD D+EL+KLTQYL  IA+LDD  
Subjt:  NPNYKITALLDHLGMITVQSDYRGTFDCKPLGLIWAQFPEFYNSRNTIMFDDLRRNFVMNPQNGLVIKPFRKAHANRDSDQELMKLTQYLLAIAELDDLS

Query:  PLDHNNWELY
         L+H  WE Y
Subjt:  PLDHNNWELY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G30105.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Leucine-rich repeat, typical subtype (InterPro:IPR003591), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Ubiquitin (InterPro:IPR000626), Ubiquitin supergroup (InterPro:IPR019955)6.5e-0432.05Show/hide
Query:  SEEEITLTVKWSGKEYTVRVCGDDSVAELKRRICELTNVLPKRQKLLYPKVGSKLADDSLLLSQLPLKSSLKMTMIGT
        ++  I LTVK+ GK   + V  D +V +LK ++  +TNVLP+ QKL++     K+  ++  L Q  + S  K+ ++ +
Subjt:  SEEEITLTVKWSGKEYTVRVCGDDSVAELKRRICELTNVLPKRQKLLYPKVGSKLADDSLLLSQLPLKSSLKMTMIGT

AT4G06599.1 ubiquitin family protein6.9e-15580.85Show/hide
Query:  AASASTSSPSEEEITLTVKWSGKEYTVRVCGDDSVAELKRRICELTNVLPKRQKLLYPKVGSKLADDSLLLSQLPLKSSLKMTMIGTVEDDIIVDQVDSP
        +A+A+ S  +EEE+TLTVKW+GKEYTVR+C DDSVAELKRRIC LT VLPKRQKLLYPK+G+KL+DDSLLLS +  K SLKMTMIGTVEDDIIVDQ +SP
Subjt:  AASASTSSPSEEEITLTVKWSGKEYTVRVCGDDSVAELKRRICELTNVLPKRQKLLYPKVGSKLADDSLLLSQLPLKSSLKMTMIGTVEDDIIVDQVDSP

Query:  EIIDDFELGKDEVIDIKDKDVNKQKLRRRISQYKIELRNPCREGKKLLVLDIDYTLFDHRSPAENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATSLKWVEL
        EI+DDFELGK+E +D+KDK+VNKQKLRRRI QYKI LR PCR+GKKLLVLDIDYTLFDHRS AENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATS+KWVEL
Subjt:  EIIDDFELGKDEVIDIKDKDVNKQKLRRRISQYKIELRNPCREGKKLLVLDIDYTLFDHRSPAENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATSLKWVEL

Query:  KMGQLGVLSNPNYKITALLDHLGMITVQSDYRGTFDCKPLGLIWAQFPEFYNSRNTIMFDDLRRNFVMNPQNGLVIKPFRKAHANRDSDQELMKLTQYLL
        KM +LGVL+NPNYK+TALLDHL MITVQSD RG FDCKPLGLIWA  PEFYN  NTIMFDDLRRNFVMNPQNGL IKPFRKAHANRD+DQEL+KLTQYLL
Subjt:  KMGQLGVLSNPNYKITALLDHLGMITVQSDYRGTFDCKPLGLIWAQFPEFYNSRNTIMFDDLRRNFVMNPQNGLVIKPFRKAHANRDSDQELMKLTQYLL

Query:  AIAELDDLSPLDHNNWELYSEDDGPKRRR
         IAEL DLS L H+ WE +S+D+  +RR+
Subjt:  AIAELDDLSPLDHNNWELYSEDDGPKRRR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGCCTCAGCGTCCACCTCGTCTCCTTCAGAGGAAGAGATAACATTGACGGTGAAATGGAGCGGAAAGGAATATACTGTACGAGTCTGCGGTGATGACTCTGTGGC
TGAGCTCAAGCGTCGAATCTGCGAGCTTACTAACGTCTTGCCCAAGCGCCAAAAGCTTCTTTATCCCAAAGTCGGATCCAAACTAGCCGATGATTCGCTTTTGCTGTCTC
AGCTTCCCCTCAAATCATCTCTCAAGATGACCATGATCGGAACTGTTGAAGATGATATAATCGTGGATCAAGTGGATTCCCCTGAAATTATTGACGATTTTGAACTTGGG
AAAGATGAAGTCATTGACATTAAGGACAAGGATGTCAATAAGCAGAAACTGAGAAGGCGTATTAGTCAATACAAGATAGAACTTCGCAATCCATGCCGTGAAGGAAAGAA
ATTGCTTGTTCTGGACATTGATTATACACTTTTTGATCATCGATCTCCTGCTGAAAATCCTCTTCAACTCATGCGGCCTTATCTTCATGAATTTCTGACAGCTGCTTATG
CTGAATATGATATCATGATATGGTCCGCAACCAGCCTTAAGTGGGTTGAATTAAAGATGGGCCAGCTTGGCGTTCTCAGTAATCCAAACTACAAAATCACTGCTCTTCTA
GACCATTTAGGTATGATCACAGTTCAGTCAGATTATCGTGGGACCTTTGATTGCAAGCCACTAGGCTTGATTTGGGCACAGTTTCCAGAGTTTTATAATTCGAGAAATAC
TATAATGTTTGATGATCTTCGGAGAAATTTTGTAATGAATCCACAAAATGGCTTGGTAATCAAGCCATTCAGGAAAGCTCATGCTAATCGTGATAGTGACCAGGAGCTAA
TGAAGCTCACTCAGTACTTGCTTGCCATTGCGGAACTCGATGACTTGAGTCCTCTTGATCATAACAATTGGGAGCTATACTCTGAAGATGATGGTCCCAAAAGACGGCGG
CATGCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGCCTCAGCGTCCACCTCGTCTCCTTCAGAGGAAGAGATAACATTGACGGTGAAATGGAGCGGAAAGGAATATACTGTACGAGTCTGCGGTGATGACTCTGTGGC
TGAGCTCAAGCGTCGAATCTGCGAGCTTACTAACGTCTTGCCCAAGCGCCAAAAGCTTCTTTATCCCAAAGTCGGATCCAAACTAGCCGATGATTCGCTTTTGCTGTCTC
AGCTTCCCCTCAAATCATCTCTCAAGATGACCATGATCGGAACTGTTGAAGATGATATAATCGTGGATCAAGTGGATTCCCCTGAAATTATTGACGATTTTGAACTTGGG
AAAGATGAAGTCATTGACATTAAGGACAAGGATGTCAATAAGCAGAAACTGAGAAGGCGTATTAGTCAATACAAGATAGAACTTCGCAATCCATGCCGTGAAGGAAAGAA
ATTGCTTGTTCTGGACATTGATTATACACTTTTTGATCATCGATCTCCTGCTGAAAATCCTCTTCAACTCATGCGGCCTTATCTTCATGAATTTCTGACAGCTGCTTATG
CTGAATATGATATCATGATATGGTCCGCAACCAGCCTTAAGTGGGTTGAATTAAAGATGGGCCAGCTTGGCGTTCTCAGTAATCCAAACTACAAAATCACTGCTCTTCTA
GACCATTTAGGTATGATCACAGTTCAGTCAGATTATCGTGGGACCTTTGATTGCAAGCCACTAGGCTTGATTTGGGCACAGTTTCCAGAGTTTTATAATTCGAGAAATAC
TATAATGTTTGATGATCTTCGGAGAAATTTTGTAATGAATCCACAAAATGGCTTGGTAATCAAGCCATTCAGGAAAGCTCATGCTAATCGTGATAGTGACCAGGAGCTAA
TGAAGCTCACTCAGTACTTGCTTGCCATTGCGGAACTCGATGACTTGAGTCCTCTTGATCATAACAATTGGGAGCTATACTCTGAAGATGATGGTCCCAAAAGACGGCGG
CATGCATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAASASTSSPSEEEITLTVKWSGKEYTVRVCGDDSVAELKRRICELTNVLPKRQKLLYPKVGSKLADDSLLLSQLPLKSSLKMTMIGTVEDDIIVDQVDSPEIIDDFELG
KDEVIDIKDKDVNKQKLRRRISQYKIELRNPCREGKKLLVLDIDYTLFDHRSPAENPLQLMRPYLHEFLTAAYAEYDIMIWSATSLKWVELKMGQLGVLSNPNYKITALL
DHLGMITVQSDYRGTFDCKPLGLIWAQFPEFYNSRNTIMFDDLRRNFVMNPQNGLVIKPFRKAHANRDSDQELMKLTQYLLAIAELDDLSPLDHNNWELYSEDDGPKRRR
HA