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HG10015484 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10015484
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionProtein TIC 214
Genome locationChr02:27069035..27069385
RNA-Seq ExpressionHG10015484
SyntenyHG10015484
Gene Ontology termsGO:0015031 - protein transport (biological process)
GO:0009706 - chloroplast inner membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008896 - Protein TIC214


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
PRQ36545.1 putative protein TIC214 [Rosa chinensis]6.8e-3588.76Show/hide
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RZC58808.1 hypothetical protein C5167_006125 [Papaver somniferum]1.2e-3486.96Show/hide
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VDD24536.1 unnamed protein product [Brassica rapa]1.2e-3470Show/hide
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VDD65314.1 unnamed protein product [Brassica oleracea]1.0e-3082.11Show/hide
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VDD65572.1 unnamed protein product [Brassica oleracea]8.6e-3080.85Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A251RRP8 Protein TIC 2145.1e-3688.76Show/hide
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A0A2P6QQT4 Uncharacterized protein3.3e-3588.76Show/hide
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A0A3P6DAS3 Uncharacterized protein5.6e-3570Show/hide
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A0A3P6H5A4 Uncharacterized protein4.9e-3182.11Show/hide
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A0A4Y7JG87 Uncharacterized protein5.6e-3586.96Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0A393 Protein TIC 2143.2e-2798.39Show/hide
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A6MM95 Protein TIC 2143.2e-2798.39Show/hide
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Q2MIC9 Protein TIC 2142.1e-2696.77Show/hide
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Q33BW4 Protein TIC 2142.1e-2696.77Show/hide
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Q3C1P6 Protein TIC 2142.1e-2696.77Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G07739.1 Ycf1 protein1.8e-2590.77Show/hide
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ATCG01000.1 Ycf1 protein3.6e-2692.31Show/hide
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ATCG01130.1 Ycf1 protein3.6e-2692.31Show/hide
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ATMG00370.1 Ycf1 protein3.6e-2692.31Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AGAAGGAACCGAGAAGAAAGTATCAGCAACAACAGGTTTTATTACGGGACAGCTCATGATGTTCATATCGATCTATTATGCGCCTCTGCATCTAGCATTGGGTAGACCTC
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GCATTCAATGTGTATTCCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCATGAAGATAATCAATTCGGTCGTTGTGGTCGGACTCTATTATGGATTTCTGACCACATTCTCCATAGGCCCTCTTATCTCTTCCTTCTCCGAGCTCGGGTTATGGA
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