; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10015579 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10015579
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionDNA repair REX1-B protein
Genome locationChr02:27845706..27847907
RNA-Seq ExpressionHG10015579
SyntenyHG10015579
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR039491 - Required for excision 1-B domain-containing protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004135056.1 uncharacterized protein LOC101210078 [Cucumis sativus]1.2e-9390.29Show/hide
Query:  MEDFEKKLSLDEQMEEDQRTDVTDSSNTLSLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVSYQQLCSEITMEFSNCSKQVIAIESNFRSPDHNRLDL
        MEDFEKKLSLDEQMEED++   TDSSNTLSLLR+FLEIQQRRAEAY+KLKRGFDEYMTSGRE+SYQQLCSEIT EFSNCSKQVI IESNFRS DHNRL+L
Subjt:  MEDFEKKLSLDEQMEEDQRTDVTDSSNTLSLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVSYQQLCSEITMEFSNCSKQVIAIESNFRSPDHNRLDL

Query:  ANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAGHPSERLVSHENCKFNAPREHECMHVHEITEASGTEEAEADADYDNALKESIKGVQDAVTTIIEHMEEVRYEI
        AN LRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAG PSERLVSHENC+FNAPREHEC+HVHEITEASGTEEAEADA+YDNALKE+IKGVQDAVTTI EHMEEVRYEI
Subjt:  ANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAGHPSERLVSHENCKFNAPREHECMHVHEITEASGTEEAEADADYDNALKESIKGVQDAVTTIIEHMEEVRYEI

Query:  AALEDK
         ALEDK
Subjt:  AALEDK

XP_008446706.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103489347 [Cucumis melo]1.7e-9289.32Show/hide
Query:  MEDFEKKLSLDEQMEEDQRTDVTDSSNTLSLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVSYQQLCSEITMEFSNCSKQVIAIESNFRSPDHNRLDL
        MEDFEKKLSLDEQMEED+    TDSSNTLSLLR+FLEIQQRRAEAY+KLKRGFDEYMTSGRE+SYQQLCSEIT EFSNCSKQVI IESNFR+ DHNRL+L
Subjt:  MEDFEKKLSLDEQMEEDQRTDVTDSSNTLSLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVSYQQLCSEITMEFSNCSKQVIAIESNFRSPDHNRLDL

Query:  ANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAGHPSERLVSHENCKFNAPREHECMHVHEITEASGTEEAEADADYDNALKESIKGVQDAVTTIIEHMEEVRYEI
        ANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAG PSERLVSHENC+ NAPREHEC+HVHEITEASGTEEAEADA+YDNALKE+IKGVQDAVTTI +HMEEVRYEI
Subjt:  ANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAGHPSERLVSHENCKFNAPREHECMHVHEITEASGTEEAEADADYDNALKESIKGVQDAVTTIIEHMEEVRYEI

Query:  AALEDK
         ALEDK
Subjt:  AALEDK

XP_022945518.1 uncharacterized protein C19orf60 homolog [Cucurbita moschata]3.5e-9086.54Show/hide
Query:  MEDFEKKLSLDEQMEEDQRT--DVTDSSNTLSLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVSYQQLCSEITMEFSNCSKQVIAIESNFRSPDHNRL
        MEDF+KKLSL EQMEED RT  D + SSNTL+LLRKFLEIQQRRAEAYA+LKRGFDEYMTSGRE+SYQQLC EIT EFSNCSKQVI IESNF SPDH+R+
Subjt:  MEDFEKKLSLDEQMEEDQRT--DVTDSSNTLSLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVSYQQLCSEITMEFSNCSKQVIAIESNFRSPDHNRL

Query:  DLANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAGHPSERLVSHENCKFNAPREHECMHVHEITEASGTEEAEADADYDNALKESIKGVQDAVTTIIEHMEEVRY
        +LA+LLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAG PSERLVSHENC+F  PREHEC+HVHEITEASGTEEAEADA+YDNALKE+IKGVQ+AVTTI EHMEEVRY
Subjt:  DLANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAGHPSERLVSHENCKFNAPREHECMHVHEITEASGTEEAEADADYDNALKESIKGVQDAVTTIIEHMEEVRY

Query:  EIAALEDK
        EIAALEDK
Subjt:  EIAALEDK

XP_023541138.1 uncharacterized protein C19orf60 homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.1e-9187.02Show/hide
Query:  MEDFEKKLSLDEQMEEDQRT--DVTDSSNTLSLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVSYQQLCSEITMEFSNCSKQVIAIESNFRSPDHNRL
        MEDF+KKLSL EQMEED RT  D + SSNTL+LLRKFLEIQQRRAEAYA+LKRGFDEYMTSGRE+SYQQLC EIT EFSNCSKQVI IESNF SPDH+R+
Subjt:  MEDFEKKLSLDEQMEEDQRT--DVTDSSNTLSLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVSYQQLCSEITMEFSNCSKQVIAIESNFRSPDHNRL

Query:  DLANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAGHPSERLVSHENCKFNAPREHECMHVHEITEASGTEEAEADADYDNALKESIKGVQDAVTTIIEHMEEVRY
        +LA+LLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAG PSERLVSHENC+F  PREHEC+HVHEITEASGTEEAEADA+YDNALKE+IKGVQDAVTTI EHMEEVRY
Subjt:  DLANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAGHPSERLVSHENCKFNAPREHECMHVHEITEASGTEEAEADADYDNALKESIKGVQDAVTTIIEHMEEVRY

Query:  EIAALEDK
        EIAALEDK
Subjt:  EIAALEDK

XP_038892275.1 uncharacterized protein LOC120081463 [Benincasa hispida]3.0e-9488.83Show/hide
Query:  MEDFEKKLSLDEQMEEDQRTDVTDSSNTLSLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVSYQQLCSEITMEFSNCSKQVIAIESNFRSPDHNRLDL
        MEDFEKKLSLDEQMEEDQRTD +DSSNTLSLLR+FLEIQQRRAEAYA+LKRGFDEYMTSGRE+SYQQLCS+IT EFSNCSKQVI IESNFRS DHNRL+L
Subjt:  MEDFEKKLSLDEQMEEDQRTDVTDSSNTLSLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVSYQQLCSEITMEFSNCSKQVIAIESNFRSPDHNRLDL

Query:  ANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAGHPSERLVSHENCKFNAPREHECMHVHEITEASGTEEAEADADYDNALKESIKGVQDAVTTIIEHMEEVRYEI
        ANLLRSVQE+EKQKLHLTAQIQLLKKAG PSER+VSHENC+FNAPREHEC+HVHE+T ASGTEEAEA+A+YDNALKE+IKGVQD VTTI E+MEEVRYEI
Subjt:  ANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAGHPSERLVSHENCKFNAPREHECMHVHEITEASGTEEAEADADYDNALKESIKGVQDAVTTIIEHMEEVRYEI

Query:  AALEDK
        AALEDK
Subjt:  AALEDK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KUN3 Uncharacterized protein5.6e-9490.29Show/hide
Query:  MEDFEKKLSLDEQMEEDQRTDVTDSSNTLSLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVSYQQLCSEITMEFSNCSKQVIAIESNFRSPDHNRLDL
        MEDFEKKLSLDEQMEED++   TDSSNTLSLLR+FLEIQQRRAEAY+KLKRGFDEYMTSGRE+SYQQLCSEIT EFSNCSKQVI IESNFRS DHNRL+L
Subjt:  MEDFEKKLSLDEQMEEDQRTDVTDSSNTLSLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVSYQQLCSEITMEFSNCSKQVIAIESNFRSPDHNRLDL

Query:  ANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAGHPSERLVSHENCKFNAPREHECMHVHEITEASGTEEAEADADYDNALKESIKGVQDAVTTIIEHMEEVRYEI
        AN LRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAG PSERLVSHENC+FNAPREHEC+HVHEITEASGTEEAEADA+YDNALKE+IKGVQDAVTTI EHMEEVRYEI
Subjt:  ANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAGHPSERLVSHENCKFNAPREHECMHVHEITEASGTEEAEADADYDNALKESIKGVQDAVTTIIEHMEEVRYEI

Query:  AALEDK
         ALEDK
Subjt:  AALEDK

A0A1S3BGI9 uncharacterized protein LOC1034893478.1e-9389.32Show/hide
Query:  MEDFEKKLSLDEQMEEDQRTDVTDSSNTLSLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVSYQQLCSEITMEFSNCSKQVIAIESNFRSPDHNRLDL
        MEDFEKKLSLDEQMEED+    TDSSNTLSLLR+FLEIQQRRAEAY+KLKRGFDEYMTSGRE+SYQQLCSEIT EFSNCSKQVI IESNFR+ DHNRL+L
Subjt:  MEDFEKKLSLDEQMEEDQRTDVTDSSNTLSLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVSYQQLCSEITMEFSNCSKQVIAIESNFRSPDHNRLDL

Query:  ANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAGHPSERLVSHENCKFNAPREHECMHVHEITEASGTEEAEADADYDNALKESIKGVQDAVTTIIEHMEEVRYEI
        ANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAG PSERLVSHENC+ NAPREHEC+HVHEITEASGTEEAEADA+YDNALKE+IKGVQDAVTTI +HMEEVRYEI
Subjt:  ANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAGHPSERLVSHENCKFNAPREHECMHVHEITEASGTEEAEADADYDNALKESIKGVQDAVTTIIEHMEEVRYEI

Query:  AALEDK
         ALEDK
Subjt:  AALEDK

A0A5D3CFT2 Uncharacterized protein8.1e-9389.32Show/hide
Query:  MEDFEKKLSLDEQMEEDQRTDVTDSSNTLSLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVSYQQLCSEITMEFSNCSKQVIAIESNFRSPDHNRLDL
        MEDFEKKLSLDEQMEED+    TDSSNTLSLLR+FLEIQQRRAEAY+KLKRGFDEYMTSGRE+SYQQLCSEIT EFSNCSKQVI IESNFR+ DHNRL+L
Subjt:  MEDFEKKLSLDEQMEEDQRTDVTDSSNTLSLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVSYQQLCSEITMEFSNCSKQVIAIESNFRSPDHNRLDL

Query:  ANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAGHPSERLVSHENCKFNAPREHECMHVHEITEASGTEEAEADADYDNALKESIKGVQDAVTTIIEHMEEVRYEI
        ANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAG PSERLVSHENC+ NAPREHEC+HVHEITEASGTEEAEADA+YDNALKE+IKGVQDAVTTI +HMEEVRYEI
Subjt:  ANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAGHPSERLVSHENCKFNAPREHECMHVHEITEASGTEEAEADADYDNALKESIKGVQDAVTTIIEHMEEVRYEI

Query:  AALEDK
         ALEDK
Subjt:  AALEDK

A0A6J1G147 uncharacterized protein C19orf60 homolog1.7e-9086.54Show/hide
Query:  MEDFEKKLSLDEQMEEDQRT--DVTDSSNTLSLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVSYQQLCSEITMEFSNCSKQVIAIESNFRSPDHNRL
        MEDF+KKLSL EQMEED RT  D + SSNTL+LLRKFLEIQQRRAEAYA+LKRGFDEYMTSGRE+SYQQLC EIT EFSNCSKQVI IESNF SPDH+R+
Subjt:  MEDFEKKLSLDEQMEEDQRT--DVTDSSNTLSLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVSYQQLCSEITMEFSNCSKQVIAIESNFRSPDHNRL

Query:  DLANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAGHPSERLVSHENCKFNAPREHECMHVHEITEASGTEEAEADADYDNALKESIKGVQDAVTTIIEHMEEVRY
        +LA+LLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAG PSERLVSHENC+F  PREHEC+HVHEITEASGTEEAEADA+YDNALKE+IKGVQ+AVTTI EHMEEVRY
Subjt:  DLANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAGHPSERLVSHENCKFNAPREHECMHVHEITEASGTEEAEADADYDNALKESIKGVQDAVTTIIEHMEEVRY

Query:  EIAALEDK
        EIAALEDK
Subjt:  EIAALEDK

A0A6J1HYI6 uncharacterized protein C19orf60 homolog1.7e-9086.54Show/hide
Query:  MEDFEKKLSLDEQMEEDQRT--DVTDSSNTLSLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVSYQQLCSEITMEFSNCSKQVIAIESNFRSPDHNRL
        MEDF+KKLSL EQMEED RT  D + SSNTL+LLRKFLEIQQRRAEAYA+LKRGFDEYMTSGRE+SYQQLC EIT EFSNCSKQVI IESNF SPDH+R+
Subjt:  MEDFEKKLSLDEQMEEDQRT--DVTDSSNTLSLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVSYQQLCSEITMEFSNCSKQVIAIESNFRSPDHNRL

Query:  DLANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAGHPSERLVSHENCKFNAPREHECMHVHEITEASGTEEAEADADYDNALKESIKGVQDAVTTIIEHMEEVRY
        +LA+LLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAG PSERLVSHENC+F  PREHEC+HVHEITEASGTEEAEADA+YDNALKE+IKGVQ+AVTTI EHMEEVRY
Subjt:  DLANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAGHPSERLVSHENCKFNAPREHECMHVHEITEASGTEEAEADADYDNALKESIKGVQDAVTTIIEHMEEVRY

Query:  EIAALEDK
        EIAALEDK
Subjt:  EIAALEDK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q17Q97 Required for excision 1-B domain-containing protein2.7e-0530.93Show/hide
Query:  LLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVS---YQQLCSEITMEFSNCSKQVIAIESNFRSPDHNRLDLANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLL
        L+++  ++Q  RA+A+ +L+ G  +Y++SG       Y+    E+T  F+  S++V+A+E+    P    L LA+ +RS+Q+ E+ +L   A +QL+
Subjt:  LLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVS---YQQLCSEITMEFSNCSKQVIAIESNFRSPDHNRLDLANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G04910.1 unknown protein5.4e-6560.83Show/hide
Query:  EDFEKKLSLDEQMEEDQRTDVTDS--------------SNTLSLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVSYQQLCSEITMEFSNCSKQVIAIE
        EDF+KK+SL + +  D   +   S              S TL LLR  LEIQQRRA+AYA LK GF EY+ SG E  YQ+LCSEIT EFS CSKQV  +E
Subjt:  EDFEKKLSLDEQMEEDQRTDVTDS--------------SNTLSLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVSYQQLCSEITMEFSNCSKQVIAIE

Query:  SNFRSPDHNRLDLANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAGHPSERLVSHENCKFNAPREHECMHVHEITEASGTEEAEADADYDNALKESIKGVQDAVT
        S F +P+  R DLA LL  +Q QEKQKLHLT  IQ+LKKAG PSER+++HENCKF  P +HEC+H+HEITEA+GTEEAEADA++DNALKE+I+GVQDAVT
Subjt:  SNFRSPDHNRLDLANLLRSVQEQEKQKLHLTAQIQLLKKAGHPSERLVSHENCKFNAPREHECMHVHEITEASGTEEAEADADYDNALKESIKGVQDAVT

Query:  TIIEHMEEVRYEIAALE
        +I E++E++RYEI ALE
Subjt:  TIIEHMEEVRYEIAALE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGATTTTGAGAAGAAGCTCTCTCTGGATGAACAAATGGAGGAAGACCAAAGAACCGATGTCACCGATTCCTCCAACACTCTCAGTTTGCTCCGCAAGTTTCTTGA
AATCCAGCAGCGTAGAGCGGAAGCTTATGCCAAGCTTAAAAGGGGGTTCGATGAGTATATGACTTCAGGAAGGGAGGTATCTTATCAACAGCTTTGCAGTGAGATCACTA
TGGAATTCAGTAATTGCTCCAAACAAGTCATTGCCATTGAATCGAACTTCCGGAGTCCAGATCATAACAGGCTCGACTTAGCCAACCTGCTTAGATCTGTTCAAGAACAA
GAAAAGCAGAAATTGCACCTGACAGCTCAAATTCAGTTATTGAAGAAGGCTGGCCACCCATCAGAGCGCTTGGTGAGCCACGAGAATTGCAAATTCAATGCACCTCGAGA
GCACGAGTGTATGCATGTCCATGAGATAACTGAGGCTTCTGGTACTGAGGAAGCAGAAGCGGATGCCGATTATGACAATGCTCTAAAGGAATCAATCAAAGGTGTGCAGG
ATGCTGTGACGACCATAATTGAGCACATGGAGGAAGTGAGATATGAGATTGCAGCTCTTGAAGATAAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAGATTTTGAGAAGAAGCTCTCTCTGGATGAACAAATGGAGGAAGACCAAAGAACCGATGTCACCGATTCCTCCAACACTCTCAGTTTGCTCCGCAAGTTTCTTGA
AATCCAGCAGCGTAGAGCGGAAGCTTATGCCAAGCTTAAAAGGGGGTTCGATGAGTATATGACTTCAGGAAGGGAGGTATCTTATCAACAGCTTTGCAGTGAGATCACTA
TGGAATTCAGTAATTGCTCCAAACAAGTCATTGCCATTGAATCGAACTTCCGGAGTCCAGATCATAACAGGCTCGACTTAGCCAACCTGCTTAGATCTGTTCAAGAACAA
GAAAAGCAGAAATTGCACCTGACAGCTCAAATTCAGTTATTGAAGAAGGCTGGCCACCCATCAGAGCGCTTGGTGAGCCACGAGAATTGCAAATTCAATGCACCTCGAGA
GCACGAGTGTATGCATGTCCATGAGATAACTGAGGCTTCTGGTACTGAGGAAGCAGAAGCGGATGCCGATTATGACAATGCTCTAAAGGAATCAATCAAAGGTGTGCAGG
ATGCTGTGACGACCATAATTGAGCACATGGAGGAAGTGAGATATGAGATTGCAGCTCTTGAAGATAAGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEDFEKKLSLDEQMEEDQRTDVTDSSNTLSLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREVSYQQLCSEITMEFSNCSKQVIAIESNFRSPDHNRLDLANLLRSVQEQ
EKQKLHLTAQIQLLKKAGHPSERLVSHENCKFNAPREHECMHVHEITEASGTEEAEADADYDNALKESIKGVQDAVTTIIEHMEEVRYEIAALEDK