; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10015971 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10015971
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionAgamous-like putative transcription factor
Genome locationChr03:1841300..1846615
RNA-Seq ExpressionHG10015971
SyntenyHG10015971
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR002487 - Transcription factor, K-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
NP_001292633.1 floral homeotic protein AGAMOUS [Cucumis sativus]2.4e-11697.82Show/hide
Query:  MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ
        MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ
Subjt:  MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ

Query:  EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP
        EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSL+ KDLK LE+KLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQ+LRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP
Subjt:  EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP

Query:  YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
        YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
Subjt:  YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV

XP_008439701.1 PREDICTED: floral homeotic protein AGAMOUS isoform X2 [Cucumis melo]5.3e-11697.38Show/hide
Query:  MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ
        MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ
Subjt:  MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ

Query:  EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP
        EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSL+ KDLK LE+KLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMR+REIDLHNNNQ+LRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP
Subjt:  EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP

Query:  YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
        YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
Subjt:  YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV

XP_011658265.1 floral homeotic protein AGAMOUS isoform X3 [Cucumis sativus]2.4e-11697.82Show/hide
Query:  MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ
        MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ
Subjt:  MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ

Query:  EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP
        EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSL+ KDLK LE+KLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQ+LRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP
Subjt:  EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP

Query:  YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
        YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
Subjt:  YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV

XP_022925702.1 floral homeotic protein AGAMOUS [Cucurbita moschata]9.7e-11899.56Show/hide
Query:  MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ
        MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ
Subjt:  MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ

Query:  EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP
        EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERN NMMGGEFELMQSHP
Subjt:  EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP

Query:  YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
        YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
Subjt:  YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV

XP_022978760.1 floral homeotic protein AGAMOUS [Cucurbita maxima]8.2e-11798.69Show/hide
Query:  MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ
        MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ
Subjt:  MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ

Query:  EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP
        EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLG+SLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERN NMMGGEFELMQSHP
Subjt:  EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP

Query:  YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
        YDPRDFFQVNGLQH+HQYPRQDNMALQLV
Subjt:  YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KID6 Uncharacterized protein1.2e-11697.82Show/hide
Query:  MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ
        MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ
Subjt:  MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ

Query:  EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP
        EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSL+ KDLK LE+KLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQ+LRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP
Subjt:  EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP

Query:  YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
        YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
Subjt:  YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV

A0A6J1ECE2 floral homeotic protein AGAMOUS4.7e-11899.56Show/hide
Query:  MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ
        MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ
Subjt:  MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ

Query:  EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP
        EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERN NMMGGEFELMQSHP
Subjt:  EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP

Query:  YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
        YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
Subjt:  YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV

A0A6J1IR53 floral homeotic protein AGAMOUS4.0e-11798.69Show/hide
Query:  MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ
        MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ
Subjt:  MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ

Query:  EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP
        EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLG+SLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERN NMMGGEFELMQSHP
Subjt:  EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP

Query:  YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
        YDPRDFFQVNGLQH+HQYPRQDNMALQLV
Subjt:  YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV

O64958 CUM11.2e-11697.82Show/hide
Query:  MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ
        MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ
Subjt:  MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ

Query:  EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP
        EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSL+ KDLK LE+KLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQ+LRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP
Subjt:  EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP

Query:  YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
        YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
Subjt:  YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV

Q9SBK1 Agamous-like putative transcription factor1.2e-11697.82Show/hide
Query:  MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ
        MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ
Subjt:  MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQ

Query:  EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP
        EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSL+ KDLK LE+KLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQ+LRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP
Subjt:  EAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHP

Query:  YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
        YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
Subjt:  YDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q40168 Floral homeotic protein AGAMOUS1.1e-8773.42Show/hide
Query:  SPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQEAA
        SPQRK+GRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVAL+VFS+RGRLYEYANNSVKATI+RYKKA SDSSNTGS SEAN Q+YQQEA+
Subjt:  SPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQEAA

Query:  KLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESER------NVNMMGGE----F
        KLR QIGNL N NRNM+GE+L+ + +K+LK+LE ++EKGIS+IRSKKNELLFAEIEYM+KRE+DLHNNNQ LRAKIAE+ER       +N+M G      
Subjt:  KLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESER------NVNMMGGE----F

Query:  ELM-QSHPYDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
        EL+     +D R++ QVNGLQ N+ YPRQD   +QLV
Subjt:  ELM-QSHPYDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV

Q40872 Floral homeotic protein AGAMOUS2.9e-8875.76Show/hide
Query:  SPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQEAA
        SPQRK+GRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFS+RGRLYEYANNSVK TI+RYKKA +DS NT S SEAN QFYQQEA+
Subjt:  SPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQEAA

Query:  KLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESER---NVNMMGG--EFELMQS
        KLR +I ++Q +NRNM+GESL SL+V+DLK LE+KLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYM+K+EIDLHNNNQ LRAKIAE+ER   ++N+M G  ++EL   
Subjt:  KLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESER---NVNMMGG--EFELMQS

Query:  HPYDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
          +D R++ Q+NGLQ N+ Y RQD  ALQLV
Subjt:  HPYDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV

Q40885 Floral homeotic protein AGAMOUS6.8e-9077.06Show/hide
Query:  SPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQEAA
        SPQRK+GRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATI+RYKKA SDSSNTGS +EAN Q+YQQEA+
Subjt:  SPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQEAA

Query:  KLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERN--VNMMGG--EFELM-QS
        KLR QIGNLQN NRN LGESL++L+++DL++LE K+EKGIS+IR+KKNELLFAEIEYM+KREIDLHNNNQ LRAKIAE+ER+  +N+M G   ++L+   
Subjt:  KLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERN--VNMMGG--EFELM-QS

Query:  HPYDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
          +D R++ QVNGLQ N+ YPRQD   LQLV
Subjt:  HPYDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV

Q43585 Floral homeotic protein AGAMOUS1.6e-9177.64Show/hide
Query:  SPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQEAA
        SPQRK+GRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATI+RYKKA SDSSNTGS SEAN Q+YQQEA+
Subjt:  SPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQEAA

Query:  KLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESER--------NVNMMGG--EF
        KLR QIGNLQN NRNMLGESL++LS++DLK+LE K+EKGIS+IRSKKNELLFAEIEYM+KREIDLHNNNQ LRAKIAE+ER         +N+M G   +
Subjt:  KLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESER--------NVNMMGG--EF

Query:  ELM-QSHPYDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
        EL+   H +D R++ QVNGLQ N+ Y RQD  +LQLV
Subjt:  ELM-QSHPYDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV

Q93XH4 Agamous-like MADS-box protein MADS11.2e-8173.78Show/hide
Query:  MGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQEAAKLRVQ
        MGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSV+ TI+RYKK  SDSSNTGS SEAN QFYQQEA+KLR Q
Subjt:  MGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQEAAKLRVQ

Query:  IGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESER---NVNMM-GGEFELMQSHPYDPR
        I ++QN NR++LGE+LSSL+ K+LK+LE++LEKGISRIRSKKNELLFAEIEYM+KREI+L N+N  LRA+IAE+ER    +N+M G ++E +   PYD +
Subjt:  IGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESER---NVNMM-GGEFELMQSHPYDPR

Query:  DFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
        +   VN L  NH Y R D  ALQLV
Subjt:  DFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42830.1 K-box region and MADS-box transcription factor family protein4.7e-7064.1Show/hide
Query:  RKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQEAAKLR
        +K+GRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVAL++FS+RGRLYEYANNSV+ TI+RYKKA SD+ N  + +EANTQ+YQQEA+KLR
Subjt:  RKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQEAAKLR

Query:  VQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAE------SERNVNMMGGEFE-----L
         QI ++QN NR++LGESL SL+ K+LK+LES+LEKGISR+RSKK+E+L AEIEYM+KREI+L N+N  LR+KI E       E +V   G  +E      
Subjt:  VQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAE------SERNVNMMGGEFE-----L

Query:  MQSHPYDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
         QS  Y+ R++  VN L+ N     QD   LQLV
Subjt:  MQSHPYDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV

AT2G42830.2 K-box region and MADS-box transcription factor family protein1.5e-6863.56Show/hide
Query:  RKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQEAAKLR
        +K+GRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVAL++FS+RGRLYEYANNSV+ TI+RYKKA SD+ N  + +EANTQ+YQQEA+KLR
Subjt:  RKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQEAAKLR

Query:  VQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKR--EIDLHNNNQLLRAKIAE------SERNVNMMGGEFE----
         QI ++QN NR++LGESL SL+ K+LK+LES+LEKGISR+RSKK+E+L AEIEYM+KR  EI+L N+N  LR+KI E       E +V   G  +E    
Subjt:  VQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKR--EIDLHNNNQLLRAKIAE------SERNVNMMGGEFE----

Query:  -LMQSHPYDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
           QS  Y+ R++  VN L+ N     QD   LQLV
Subjt:  -LMQSHPYDPRDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV

AT3G58780.1 K-box region and MADS-box transcription factor family protein3.0e-7264.83Show/hide
Query:  RKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQEAAKLR
        +K+GRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVAL++FS+RGRLYEYANNSV+ TI+RYKKA SD+ N  S +EANTQ+YQQEA+KLR
Subjt:  RKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQEAAKLR

Query:  VQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERNVNMMGGEFELMQ---------
         QI ++QNSNR+++GESL SL+ K+LK+LE +LEKGISR+RSKKNELL AEIEYM+KRE++L +NN  LRAKIAE  R +N    E  ++Q         
Subjt:  VQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERNVNMMGGEFELMQ---------

Query:  -SHPYDP---RDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
         SH       R++  VN L+ N Q+  QD   LQLV
Subjt:  -SHPYDP---RDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV

AT3G58780.3 K-box region and MADS-box transcription factor family protein4.4e-6858.62Show/hide
Query:  RKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNS-------------------------VKATIDRYKKAS
        +K+GRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVAL++FS+RGRLYEYANNS                         V+ TI+RYKKA 
Subjt:  RKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNS-------------------------VKATIDRYKKAS

Query:  SDSSNTGSTSEANTQFYQQEAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAE
        SD+ N  S +EANTQ+YQQEA+KLR QI ++QNSNR+++GESL SL+ K+LK+LE +LEKGISR+RSKKNELL AEIEYM+KRE++L +NN  LRAKIAE
Subjt:  SDSSNTGSTSEANTQFYQQEAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAE

Query:  SERNVNMMGGEFELMQ----------SHPYDP---RDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV
          R +N    E  ++Q          SH       R++  VN L+ N Q+  QD   LQLV
Subjt:  SERNVNMMGGEFELMQ----------SHPYDP---RDFFQVNGLQHNHQYPRQDNMALQLV

AT4G18960.1 K-box region and MADS-box transcription factor family protein9.2e-8268.88Show/hide
Query:  SPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQEAA
        SP RK GRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEY+NNSVK TI+RYKKA SD+SNTGS +E N Q+YQQE+A
Subjt:  SPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQEAA

Query:  KLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERN---VNMM--GGEFELM--
        KLR QI ++QNSNR ++GE++ S+S K+L++LE +LE+ I+RIRSKKNELLF+EI+YM+KRE+DLHN+NQ+LRAKIAE+ERN   +++M  G  +E +  
Subjt:  KLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERN---VNMM--GGEFELM--

Query:  ----QSHPYDPRDFFQVNGLQ-HNHQYP---RQDNMALQLV
            QS P+D R++FQV  LQ +NH Y    RQD  ALQLV
Subjt:  ----QSHPYDPRDFFQVNGLQ-HNHQYP---RQDNMALQLV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCAGACTCACCTCAGAGGAAGATGGGAAGAGGAAAGATTGAGATTAAGAGGATCGAAAATACAACAAATCGTCAAGTCACTTTCTGTAAGAGAAGAAATGGTTTGCT
CAAAAAAGCTTATGAACTTTCTGTTCTATGTGATGCTGAAGTTGCTCTCATCGTTTTCTCAAGCCGTGGCCGCCTCTATGAGTATGCTAACAACAGTGTGAAGGCAACAA
TTGATAGATACAAGAAGGCATCCTCAGATTCCTCTAACACTGGATCTACTTCTGAAGCTAACACTCAGTTTTACCAACAAGAAGCTGCCAAACTCCGAGTTCAGATTGGT
AACTTACAGAACTCAAACAGGAACATGCTGGGCGAGTCTCTAAGTTCTTTGAGTGTAAAAGATCTCAAAAGCCTTGAGAGCAAACTTGAGAAAGGAATTAGCAGAATTAG
ATCCAAAAAGAATGAACTCCTCTTTGCTGAAATTGAGTATATGCGGAAAAGGGAAATTGATTTGCACAACAACAATCAGCTGCTTCGAGCAAAGATAGCCGAGAGTGAAC
GAAATGTGAACATGATGGGAGGAGAATTTGAGCTGATGCAATCTCATCCGTACGATCCAAGAGACTTCTTCCAAGTGAACGGCTTACAACATAATCATCAGTATCCACGC
CAAGACAACATGGCTCTTCAATTAGTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCAGACTCACCTCAGAGGAAGATGGGAAGAGGAAAGATTGAGATTAAGAGGATCGAAAATACAACAAATCGTCAAGTCACTTTCTGTAAGAGAAGAAATGGTTTGCT
CAAAAAAGCTTATGAACTTTCTGTTCTATGTGATGCTGAAGTTGCTCTCATCGTTTTCTCAAGCCGTGGCCGCCTCTATGAGTATGCTAACAACAGTGTGAAGGCAACAA
TTGATAGATACAAGAAGGCATCCTCAGATTCCTCTAACACTGGATCTACTTCTGAAGCTAACACTCAGTTTTACCAACAAGAAGCTGCCAAACTCCGAGTTCAGATTGGT
AACTTACAGAACTCAAACAGGAACATGCTGGGCGAGTCTCTAAGTTCTTTGAGTGTAAAAGATCTCAAAAGCCTTGAGAGCAAACTTGAGAAAGGAATTAGCAGAATTAG
ATCCAAAAAGAATGAACTCCTCTTTGCTGAAATTGAGTATATGCGGAAAAGGGAAATTGATTTGCACAACAACAATCAGCTGCTTCGAGCAAAGATAGCCGAGAGTGAAC
GAAATGTGAACATGATGGGAGGAGAATTTGAGCTGATGCAATCTCATCCGTACGATCCAAGAGACTTCTTCCAAGTGAACGGCTTACAACATAATCATCAGTATCCACGC
CAAGACAACATGGCTCTTCAATTAGTTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSDSPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQEAAKLRVQIG
NLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLKSLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEIEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERNVNMMGGEFELMQSHPYDPRDFFQVNGLQHNHQYPR
QDNMALQLV