; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10015996 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10015996
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionDOG1 domain-containing protein
Genome locationChr03:2054680..2055480
RNA-Seq ExpressionHG10015996
SyntenyHG10015996
Gene Ontology termsGO:0006351 - transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0004386 - helicase activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR025422 - Transcription factor TGA like domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0052615.1 transcription factor TGA6 [Cucumis melo var. makuwa]2.6e-11483.33Show/hide
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KAG7026521.1 Protein DOG1-like 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-10175.29Show/hide
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XP_004134926.1 protein DELAY OF GERMINATION 1 [Cucumis sativus]3.0e-11885.98Show/hide
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XP_008439732.1 PREDICTED: transcription factor TGA6 [Cucumis melo]2.9e-11382.82Show/hide
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XP_038883466.1 protein DELAY OF GERMINATION 1-like [Benincasa hispida]1.6e-11985.71Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KNL1 DOG1 domain-containing protein1.4e-11885.98Show/hide
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A0A1S3B031 transcription factor TGA61.4e-11382.82Show/hide
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A0A5D3CMS6 Transcription factor TGA61.3e-11483.33Show/hide
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A0A6J1EET8 protein DELAY OF GERMINATION 1-like1.6e-10174.9Show/hide
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A0A6J1KW35 protein DELAY OF GERMINATION 1-like6.7e-10074.14Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0SVK0 Protein DELAY OF GERMINATION 12.1e-3434.62Show/hide
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        SS +   ++  +LEWM LQ     EL + L      A       E+ + +L KL  K I  F++Y  +R  LA    S ++AP W S  E +L+W+ GCR
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        PS F RL Y+L G   E ++T+FL+ +   E   G       +LS +Q+ +++ L ++ I EEE++T +++ +QE+ AD  +  +A         +  ++
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Query:  KALEKQDGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGRRSDR
        +AL+KQ+  M RL+ +AD LR+ TL ++  I  P+Q   FL   KKLHL + EWG   DR
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Q58FV0 Protein DOG1-like 34.0e-3333.46Show/hide
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        MA S SS       + C+ EWM +Q     +L EAL +  ++ +  L++          LV K ++ FQ Y ++R +L++   S++FAP W S  E  LL
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Query:  WIAGCRPSVFIRLAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEEL-----AGELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGAS
        W+ GCRPS FIR+ YSL G   E +L+++L  +    E+       +L+  Q+ +++ L ++ I++E+++T + A +QE +AD   + IA  +       
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Query:  EELEKALEKQDGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGR-RSDRMHGRLRT
          +E AL+K +  M  L+ +ADKLR  TL ++ ++  P+QA  FL   K+LH+ + EWGR R ++  G +RT
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Q84JC2 Protein DOG1-like 44.3e-1125.98Show/hide
Query:  ERQLTKLVDKSIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLLWIAGCRPSVFIRLAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEELAGELSPQQMKQLDS
        E +L  L+ K     + Y   +    + DV AFF  VW +  E +  W+ G +PS+  R+                   +  + +    L   Q+K+L+ 
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Query:  LQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGAS-EELEKALEKQDGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVRE
        L+++T  +E+++  E+ R Q  MAD+ +V +A       G S   +E A+      + ++++ AD +R++TL  + +I  P Q V FLA +    + +R 
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Query:  WGRR
        WG R
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Q9SN45 Protein DOG1-like 23.9e-2832.05Show/hide
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        M  S S       +RC+ EWM LQ     +L EAL    N            + +L  LV K ++ +  Y  +R +L+    + +FAP W +  E S+LW
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Query:  IAGCRPSVFIRLAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEEL-----AGELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGASE
        + GCRPS FIRL Y+L G   E +L+++L  +    ++       +L+  Q+ +L+ L +  IK+E+++T   A  Q+++AD  +  +         A  
Subjt:  IAGCRPSVFIRLAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEEL-----AGELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGASE

Query:  ELEKALEKQDGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGR
         +E AL+K +  M  L+ +ADKLR  TL ++ ++  PLQAV FL   K+L L + + GR
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Q9SN47 Protein DOG1-like 11.4e-3032.97Show/hide
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        E+ SS+     + C+ EWM LQ     EL EA++  E   N           +L  L+  +I  F DY  +R + ++   S +FAP W +  E +LLW+ 
Subjt:  ESGSSSDHAASERCFLEWMKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDKSIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLLWIA

Query:  GCRPSVFIRLAYSLTGHDLEKKLTEFL------------------QGMKSMEELAGELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIA
        GCRPS FIRL Y++ G   E +LT F                   +G     E   +L+ +Q+ +++ L ++T++ E +LT   A +QE+ AD  +   A
Subjt:  GCRPSVFIRLAYSLTGHDLEKKLTEFL------------------QGMKSMEELAGELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIA

Query:  IRSMKEEGASEELEKALEKQDGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGRRSDRMHGRL
                A   +E+AL+K + +M  L+ +ADKLR+ TL ++ +I   +QA  FL   KKLHL + EWG+   R H RL
Subjt:  IRSMKEEGASEELEKALEKQDGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGRRSDRMHGRL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G14880.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: transcription factor-related (TAIR:AT4G18650.1)3.4e-1925.59Show/hide
Query:  ASERCFLEWMKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDKSIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLLWIAGCRPSVFIR
        + E     + K Q+    +L   LN + +  N +       E +L + VD+ ++ F++Y   +      DV    A  W SA E SL W+ G RP+    
Subjt:  ASERCFLEWMKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDKSIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLLWIAGCRPSVFIR

Query:  LAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEELAGELSPQQM-------KQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGASEELEKALEKQ
        L Y+ +    E ++ + L+G ++ +    +LSP Q        + +  LQ  T+KEE  +T EL+  Q++ +D  +           G S + ++ + + 
Subjt:  LAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEELAGELSPQQM-------KQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGASEELEKALEKQ

Query:  DGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGRRSDR
           +  ++ + D LR+RT+  + E+  PLQ   FL  + +L   V  WG   DR
Subjt:  DGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGRRSDR

AT3G14880.2 FUNCTIONS IN: molecular_function unknown2.8e-2126.32Show/hide
Query:  ASERCFLEWMKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDKSIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLLWIAGCRPSVFIR
        + E     + K Q+    +L   LN + +  N +       E +L + VD+ ++ F++Y   +      DV    A  W SA E SL W+ G RP+    
Subjt:  ASERCFLEWMKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDKSIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLLWIAGCRPSVFIR

Query:  LAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEELAGELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGASEELEKALEKQDGEMLRL
        L Y+ +    E ++ + L+G ++ +    +LSP Q + +  LQ  T+KEE  +T EL+  Q++ +D  +           G S + ++ + +    +  +
Subjt:  LAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEELAGELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGASEELEKALEKQDGEMLRL

Query:  IQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGRRSDR
        + + D LR+RT+  + E+  PLQ   FL  + +L   V  WG   DR
Subjt:  IQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGRRSDR

AT4G18680.1 unknown protein1.8e-2531.8Show/hide
Query:  MKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDKSIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLLWIAGCRPSVFIRLAYSLTGHD
        M LQ     +L EAL    N            + +L  LV K ++ +  Y  +R +L+    + +FAP W +  E S+LW+ GCRPS FIRL Y+L G  
Subjt:  MKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDKSIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLLWIAGCRPSVFIRLAYSLTGHD

Query:  LEKKLTEFLQGMKSMEEL-----AGELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGASEELEKALEKQDGEMLRLIQQA
         E +L+++L  +    ++       +L+  Q+ +L+ L +  IK+E+++T   A  Q+++AD  +  +         A   +E AL+K +  M  L+ +A
Subjt:  LEKKLTEFLQGMKSMEEL-----AGELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGASEELEKALEKQDGEMLRLIQQA

Query:  DKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGR
        DKLR  TL ++ ++  PLQAV FL   K+L L + + GR
Subjt:  DKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGR

AT4G18690.1 unknown protein2.8e-3433.46Show/hide
Query:  MAESGSS-SDHAASERCFLEWMKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDKSIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLL
        MA S SS       + C+ EWM +Q     +L EAL +  ++ +  L++          LV K ++ FQ Y ++R +L++   S++FAP W S  E  LL
Subjt:  MAESGSS-SDHAASERCFLEWMKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDKSIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLL

Query:  WIAGCRPSVFIRLAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEEL-----AGELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGAS
        W+ GCRPS FIR+ YSL G   E +L+++L  +    E+       +L+  Q+ +++ L ++ I++E+++T + A +QE +AD   + IA  +       
Subjt:  WIAGCRPSVFIRLAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEEL-----AGELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGAS

Query:  EELEKALEKQDGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGR-RSDRMHGRLRT
          +E AL+K +  M  L+ +ADKLR  TL ++ ++  P+QA  FL   K+LH+ + EWGR R ++  G +RT
Subjt:  EELEKALEKQDGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGR-RSDRMHGRLRT

AT5G45830.1 delay of germination 11.5e-3534.62Show/hide
Query:  SSSDHAASERCFLEWMKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDKSIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLLWIAGCR
        SS +   ++  +LEWM LQ     EL + L      A       E+ + +L KL  K I  F++Y  +R  LA    S ++AP W S  E +L+W+ GCR
Subjt:  SSSDHAASERCFLEWMKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDKSIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLLWIAGCR

Query:  PSVFIRLAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEELAG-------ELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGASEELE
        PS F RL Y+L G   E ++T+FL+ +   E   G       +LS +Q+ +++ L ++ I EEE++T +++ +QE+ AD  +  +A         +  ++
Subjt:  PSVFIRLAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEELAG-------ELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGASEELE

Query:  KALEKQDGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGRRSDR
        +AL+KQ+  M RL+ +AD LR+ TL ++  I  P+Q   FL   KKLHL + EWG   DR
Subjt:  KALEKQDGEMLRLIQQADKLRIRTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGRRSDR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGAAAGCGGGAGCAGCAGCGACCATGCTGCATCGGAGCGATGTTTCCTGGAGTGGATGAAGCTTCAAGAGGACAGTCAGAGGGAGCTTTTCGAAGCCCTCAACGC
CGTTGAAAACAGAGCAAATTCCAACCTCCAAGACCCCGAAGAAATCGAACGTCAACTCACCAAGCTTGTAGACAAGAGCATCGACCAATTCCAAGACTACATTGACCGAC
GAATGCAGCTGGCCAAAAACGACGTGTCCGCATTCTTCGCCCCTGTCTGGTGCAGCGCCAGAGAAACCTCTCTCCTCTGGATCGCCGGTTGCCGGCCCTCCGTCTTCATC
CGCTTAGCCTACTCCCTCACCGGACACGACCTGGAAAAAAAACTCACGGAATTTCTGCAGGGGATGAAGTCGATGGAGGAATTAGCGGGAGAGCTGTCGCCGCAGCAAAT
GAAGCAGCTGGACAGTCTGCAGATGAGAACCATCAAGGAGGAGGAGAGACTGACGTCGGAGCTGGCGAGGGTGCAGGAGGAGATGGCGGACCAGACGGTGGTGGGGATTG
CGATAAGATCAATGAAAGAGGAAGGGGCGAGTGAGGAACTGGAGAAGGCTCTGGAAAAGCAGGATGGGGAAATGCTGAGACTCATCCAACAAGCCGACAAACTGAGGATC
CGTACGCTGAATGAGCTGACGGAGATTTTCAGACCGTTGCAGGCGGTGTGGTTCTTAGCGTTCAGTAAGAAGCTCCATCTCTGCGTCCGCGAATGGGGACGGCGAAGCGA
TCGAATGCACGGCAGACTTCGTACTCCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GAATGCAGCTGGCCAAAAACGACGTGTCCGCATTCTTCGCCCCTGTCTGGTGCAGCGCCAGAGAAACCTCTCTCCTCTGGATCGCCGGTTGCCGGCCCTCCGTCTTCATC
CGCTTAGCCTACTCCCTCACCGGACACGACCTGGAAAAAAAACTCACGGAATTTCTGCAGGGGATGAAGTCGATGGAGGAATTAGCGGGAGAGCTGTCGCCGCAGCAAAT
GAAGCAGCTGGACAGTCTGCAGATGAGAACCATCAAGGAGGAGGAGAGACTGACGTCGGAGCTGGCGAGGGTGCAGGAGGAGATGGCGGACCAGACGGTGGTGGGGATTG
CGATAAGATCAATGAAAGAGGAAGGGGCGAGTGAGGAACTGGAGAAGGCTCTGGAAAAGCAGGATGGGGAAATGCTGAGACTCATCCAACAAGCCGACAAACTGAGGATC
CGTACGCTGAATGAGCTGACGGAGATTTTCAGACCGTTGCAGGCGGTGTGGTTCTTAGCGTTCAGTAAGAAGCTCCATCTCTGCGTCCGCGAATGGGGACGGCGAAGCGA
TCGAATGCACGGCAGACTTCGTACTCCCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAESGSSSDHAASERCFLEWMKLQEDSQRELFEALNAVENRANSNLQDPEEIERQLTKLVDKSIDQFQDYIDRRMQLAKNDVSAFFAPVWCSARETSLLWIAGCRPSVFI
RLAYSLTGHDLEKKLTEFLQGMKSMEELAGELSPQQMKQLDSLQMRTIKEEERLTSELARVQEEMADQTVVGIAIRSMKEEGASEELEKALEKQDGEMLRLIQQADKLRI
RTLNELTEIFRPLQAVWFLAFSKKLHLCVREWGRRSDRMHGRLRTP