| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0025634.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Cucumis melo var. makuwa] | 6.6e-113 | 87.01 | Show/hide |
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L+++ L +IS GTLDLLPPGELLQD DLDHD GPGPGPDHGQGQDPQVVE ASSR+HA+NPGNTLYVTGLSTRVTERDLE+HFSKEGKVA
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SCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQS+LEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRS
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PYRGAREYSPRHSPP GGRSRRDHSRS PPP PPYGGSPDRRYPRGSR
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|
|
| KAE8647621.1 hypothetical protein Csa_003197 [Cucumis sativus] | 8.6e-89 | 93.26 | Show/hide |
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LKSTRDSGYR GDRG SRYR GGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPP GGRSRRDHSRS PPP PPYGGSPDRRYPRGSR
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|
|
| XP_016899368.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Cucumis melo] | 3.7e-92 | 93.16 | Show/hide |
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R+HA+NPGNTLYVTGLSTRVTERDLE+HFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQS+LEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLG
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LKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPP GGRSRRDHSRS PPP PPYGGSPDRRYPRGSR
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|
| XP_031743118.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Cucumis sativus] | 8.6e-89 | 93.26 | Show/hide |
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REHA+NPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLG
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LKSTRDSGYR GDRG SRYR GGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPP GGRSRRDHSRS PPP PPYGGSPDRRYPRGSR
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|
| XP_038881911.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Benincasa hispida] | 1.2e-93 | 93.16 | Show/hide |
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R+HAHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLG
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LKSTRD+GYRGDRGSRYRGGGSFR+DYGYRRSPRRSPYRGAREYSP PPYGGRSRRDHSRSPPY+ PPPYGGSPDRRYPRGSR
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|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0KMM4 RRM domain-containing protein | 4.2e-89 | 93.26 | Show/hide |
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LKSTRDSGYR GDRG SRYR GGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPP GGRSRRDHSRS PPP PPYGGSPDRRYPRGSR
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|
|
| A0A1S4DTT1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 1.8e-92 | 93.16 | Show/hide |
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R+HA+NPGNTLYVTGLSTRVTERDLE+HFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQS+LEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLG
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LKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPP GGRSRRDHSRS PPP PPYGGSPDRRYPRGSR
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|
|
| A0A5A7SJ12 Serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 3.2e-113 | 87.01 | Show/hide |
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L+++ L +IS GTLDLLPPGELLQD DLDHD GPGPGPDHGQGQDPQVVE ASSR+HA+NPGNTLYVTGLSTRVTERDLE+HFSKEGKVA
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SCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQS+LEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRS
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PYRGAREYSPRHSPP GGRSRRDHSRS PPP PPYGGSPDRRYPRGSR
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|
|
| A0A6J1GFF0 serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 6.0e-88 | 91.58 | Show/hide |
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E+ +NPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKV+SCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGL
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KSTRDSGYRG+RGSRYR GGSFREDYG+RRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPY GGRSRRDHSRSPPYSP GGSPDRRYPRGSR
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|
|
| A0A6J1INV2 serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 6.0e-88 | 91.58 | Show/hide |
Query: EHAHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGL
E+ +NPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKV+SCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGL
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Query: KSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPY-GGRSRRDHSRSPPYSPPPPPPPPYGGSPDRRYPRGSR
KSTRDSGYRG+RGSRYR GGSFREDYG+RRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPY GGRSRRDHSRSPPYSP GGSPDRRYPRGSR
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|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P62995 Transformer-2 protein homolog beta | 2.7e-16 | 40.61 | Show/hide |
Query: HGQGQDPQVVEASSREHAHN-----PGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYIT
H P ++ R H N P L V GLS TERDL E FSK G +A +V + ++R SRGFAFV +NVDDA + N L+GR I
Subjt: HGQGQDPQVVEASSREHAHN-----PGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYIT
Query: VEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPR-----RSPYRGAREYSP---RHSPPPYGGR-SRRDHSRSPPYSP
V+ S KRP TPTPG Y+G + T S R D R G DY Y RS R +R A++ R SP PY R R SRS YSP
Subjt: VEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPR-----RSPYRGAREYSP---RHSPPPYGGR-SRRDHSRSPPYSP
|
|
| Q10422 Uncharacterized RNA-binding protein C25G10.01 | 8.3e-18 | 34.38 | Show/hide |
Query: SDTGTL-----DLLPPGELLQDLDLDHDLGPGPGPDHGQGQDPQVVEASSREHAHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISR
SD G++ L GE LQ ++ D ++ P ++PQ S+ E + N GN L+V+G+++R+ E +L++ FSK G V ++ EP T+ SR
Subjt: SDTGTL-----DLLPPGELLQDLDLDHDLGPGPGPDHGQGQDPQVVEASSREHAHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISR
Query: GFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPR-RSPYRGA---REYSP
GF F++ V++A + +LN GR + V+K++R RP +PTPG Y+G R+S D S + GG R +Y R S R R+ YR + RE+SP
Subjt: GFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPR-RSPYRGA---REYSP
Query: ------RHSPPPYGGRSRRDHSRS
R++ R R H RS
Subjt: ------RHSPPPYGGRSRRDHSRS
|
|
| Q13595 Transformer-2 protein homolog alpha | 7.0e-17 | 41.92 | Show/hide |
Query: NPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTR
+P L V GLS TERDL E FS+ G ++ +V + RT SRGFAFV + +DD+ ++ N L+GR I V+ S KR TPTPG Y+G + T
Subjt: NPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTR
Query: DSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRH---SPPPYGGRSRRDHSRSPPYSP
G G G GGG R D Y R R Y +Y R+ SP PY R R SRS YSP
Subjt: DSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRH---SPPPYGGRSRRDHSRSPPYSP
|
|
| Q3ZBT6 Transformer-2 protein homolog beta | 2.7e-16 | 40.61 | Show/hide |
Query: HGQGQDPQVVEASSREHAHN-----PGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYIT
H P ++ R H N P L V GLS TERDL E FSK G +A +V + ++R SRGFAFV +NVDDA + N L+GR I
Subjt: HGQGQDPQVVEASSREHAHN-----PGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYIT
Query: VEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPR-----RSPYRGAREYSP---RHSPPPYGGR-SRRDHSRSPPYSP
V+ S KRP TPTPG Y+G + T S R D R G DY Y RS R +R A++ R SP PY R R SRS YSP
Subjt: VEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPR-----RSPYRGAREYSP---RHSPPPYGGR-SRRDHSRSPPYSP
|
|
| Q84TH4 Serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 1.5e-35 | 54.14 | Show/hide |
Query: AHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKS
A NPGN+LYVTGLS RVTERDLE+HF+KEGKV LV++P TR SRGF F++M +V DANRC++ L+ S+L+GR ITVEK+RR+R RTPTPG YLGL++
Subjt: AHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKS
Query: TRD-------SGYRGDRGSRYRG-------GGSFREDYGYR-RSPRRSP-YRGAREYSPRHSPPPYGG-RSRRDHSRSPPY
R S R SR R G S+ YG R RS SP YR R YSP SP P RRD S SP Y
Subjt: TRD-------SGYRGDRGSRYRG-------GGSFREDYGYR-RSPRRSP-YRGAREYSPRHSPPPYGG-RSRRDHSRSPPY
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G07350.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.1e-36 | 54.14 | Show/hide |
Query: AHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKS
A NPGN+LYVTGLS RVTERDLE+HF+KEGKV LV++P TR SRGF F++M +V DANRC++ L+ S+L+GR ITVEK+RR+R RTPTPG YLGL++
Subjt: AHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKS
Query: TRD-------SGYRGDRGSRYRG-------GGSFREDYGYR-RSPRRSP-YRGAREYSPRHSPPPYGG-RSRRDHSRSPPY
R S R SR R G S+ YG R RS SP YR R YSP SP P RRD S SP Y
Subjt: TRD-------SGYRGDRGSRYRG-------GGSFREDYGYR-RSPRRSP-YRGAREYSPRHSPPPYGG-RSRRDHSRSPPY
|
|
| AT4G35785.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.8e-50 | 62.69 | Show/hide |
Query: SSREHAHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHY
S NPG TLYVTGLSTRVT++DLE HF+KEGKVASCFLV+EPRTR+SRGFAFVTM ++ DA RC+K+LNQS+LEGRYITVE+SRRKRPRTPTPGHY
Subjt: SSREHAHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHY
Query: LGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGRSRRDHSRSPPYSPPPPPPPPYGGSPDRRY-PRGSR
LGLKS+RDS G R S RG R+DY RRSPR R+YSPR RSRRD S SP P +RRY PRGSR
Subjt: LGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGRSRRDHSRSPPYSPPPPPPPPYGGSPDRRY-PRGSR
|
|
| AT4G35785.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.3e-50 | 63.35 | Show/hide |
Query: REHAHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLG
R NPG TLYVTGLSTRVT++DLE HF+KEGKVASCFLV+EPRTR+SRGFAFVTM ++ DA RC+K+LNQS+LEGRYITVE+SRRKRPRTPTPGHYLG
Subjt: REHAHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLG
Query: LKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGRSRRDHSRSPPYSPPPPPPPPYGGSPDRRY-PRGSR
LKS+RDS G R S RG R+DY RRSPR R+YSPR RSRRD S SP P +RRY PRGSR
Subjt: LKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGRSRRDHSRSPPYSPPPPPPPPYGGSPDRRY-PRGSR
|
|
| AT4G35785.3 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 8.5e-34 | 76.19 | Show/hide |
Query: REHAHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEK
R NPG TLYVTGLSTRVT++DLE HF+KEGKVASCFLV+EPRTR+SRGFAFVTM ++ DA RC+K+LNQS+LEGRYITVE+
Subjt: REHAHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEK
|
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| AT4G35785.4 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.2e-33 | 74.42 | Show/hide |
Query: SSREHAHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEK
S NPG TLYVTGLSTRVT++DLE HF+KEGKVASCFLV+EPRTR+SRGFAFVTM ++ DA RC+K+LNQS+LEGRYITVE+
Subjt: SSREHAHNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEEHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSILEGRYITVEK
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