CuGenDBv2

Gene ID	HG10017421
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	Protein TIC 214
Genome location	Chr03:14121128..14121874
RNA-Seq Expression	HG10017421
Synteny	HG10017421
Gene Ontology terms	GO:0015031 - protein transport (biological process) GO:0009706 - chloroplast inner membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR008896 - Protein TIC214

Homology

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QJD26342.1 Ycf1 [Trichosanthes kirilowii]

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A0A6M3RWE9 Protein TIC 214

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A0A6M3S424 Protein TIC 214

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A6MMG9 Protein TIC 214

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Q06GT8 Protein TIC 214

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AT2G07739.1 Ycf1 protein

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ATCG01000.1 Ycf1 protein

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94.21

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ATCG01130.1 Ycf1 protein

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94.21

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        MKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVM   EEGTEKKVSATTGFI GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFD
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Query:  YGSTTRNSMRNLSIQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKMLFVTSSFVGWLIGHILFMKWVGLILVWIQQNNSIRSNVLIRSNKY--L
        YGSTTRN MRNL IQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSML RLVNI MFRCNNKMLFVTSSFVGWLIGHILFMKWVGL+LVWIQQNNSIRSNV+IRSNKY  L
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        VSELRNSMARIFSILLFITCVYYLGRIPSPI TKKLK TSET
Subjt:  VSELRNSMARIFSILLFITCVYYLGRIPSPIVTKKLKETSET

ATMG00370.1 Ycf1 protein

4.3e-77

87.28

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        MKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVM   EEGTEKKVSATTGFI GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFH FFWNNHKHFF
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Query:  DYGSTTRNSMRNLSIQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKMLFVTSSFVGWLIGHILFMKW
        DYGSTTRN MRNL IQCVF NNLIF+LFNH ILPSSML RLVNI MFRCNNKMLFVTSSFV  +   +L ++W
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Sequences

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CDS sequence

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ATGAAGATAATCAATTCGGTCGTTGTGGTCGGACTCTATTATGGATTTCTGACCACATTCTCCATAGGGCCCTCTTATCTCTTCCTTCTCCGAGCTCGGGTTATGGAAGA
AGGAACCGAGAAGAAAGTATCAGCAACAACAGGTTTTATTACGGGACAGCTCATGATGTTCATATCGATCTATTATGCGCCTCTGCATCTAGCATTGGGTAGACCTCATA
CAATAACTGTCCTAGCTCTACCGTATCTTTTGTTTCATTTCTTCTGGAACAATCACAAACACTTTTTTGATTATGGATCTACTACCAGAAACTCAATGCGTAATCTTAGC
ATTCAATGTGTATTCCTGAATAATCTCATTTTTCAATTATTCAACCATTTCATTTTACCAAGTTCAATGTTAGTCAGATTAGTCAACATTTCTATGTTTCGATGCAACAA
CAAGATGTTATTTGTAACAAGTAGTTTTGTTGGTTGGTTAATTGGTCACATTTTATTCATGAAATGGGTTGGATTGATATTAGTCTGGATACAGCAAAATAATTCTATTA
GATCTAATGTACTTATTAGATCTAATAAGTACCTTGTGTCAGAATTGAGAAATTCTATGGCTCGAATCTTTAGTATTCTCTTATTTATTACCTGTGTCTACTATTTAGGC
AGAATACCGTCACCCATTGTTACTAAGAAACTGAAAGAAACCTCAGAAACGGAGGAAAGGGGGAAAGCGAGGAAGAAACAGATGTAG

mRNA sequence

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Protein sequence

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IQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKMLFVTSSFVGWLIGHILFMKWVGLILVWIQQNNSIRSNVLIRSNKYLVSELRNSMARIFSILLFITCVYYLG
RIPSPIVTKKLKETSETEERGKARKKQM

HG10017421 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome