CuGenDBv2

Gene ID	HG10017568
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	Auxin efflux carrier component
Genome location	Chr03:15891638..15893897
RNA-Seq Expression	HG10017568
Synteny	HG10017568
Gene Ontology terms	GO:0009926 - auxin polar transport (biological process) GO:0010252 - auxin homeostasis (biological process) GO:0010315 - auxin efflux (biological process) GO:0055085 - transmembrane transport (biological process) GO:0005783 - endoplasmic reticulum (cellular component) GO:0005886 - plasma membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0010329 - auxin efflux transmembrane transporter activity (molecular function)
InterPro domains	IPR004776 - Membrane transport protein IPR014024 - Auxin efflux carrier, plant type

Homology

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GenBank top hits

e value

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KAA0025909.1 putative auxin efflux carrier component 1b [Cucumis melo var. makuwa]

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XP_008455726.1 PREDICTED: probable auxin efflux carrier component 1b [Cucumis melo]

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XP_038880939.1 probable auxin efflux carrier component 1b isoform X1 [Benincasa hispida]

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XP_038880940.1 probable auxin efflux carrier component 1b isoform X2 [Benincasa hispida]

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TrEMBL top hits

e value

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A0A0A0KYF4 Auxin efflux carrier component

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A0A1S3C1I4 Auxin efflux carrier component

4.9e-286

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A0A5A7SKX8 Auxin efflux carrier component

7.4e-290

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Query:  KLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSHGGGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFFLGNASPRHSNFGNYGNFDEESGGLKGRGISGNVNGV
        KLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSHGGGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFFLGNASPRHSNFGN+GNFDEE+GGLK RGISGNVNG+
Subjt:  KLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSHGGGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFFLGNASPRHSNFGNYGNFDEESGGLKGRGISGNVNGV

Query:  FPSSNGYPAPASGGLFSPVTGPAAAAAKKRVNGGDGGKDLHMFVWSSSASPVSEGGINVFRSGDYDSAVAGGMNQKDFDEFGRDEFSFGNKSAVNGSGHD
        FPSSNGYPAPASGGLFSPVTGPAA    K+ NGGDGGKDLHMFVWSSSASPVSEGGINVFRSGDYD   AGGMNQKDF+E+G DEFSFGNKSAVNG GHD
Subjt:  FPSSNGYPAPASGGLFSPVTGPAAAAAKKRVNGGDGGKDLHMFVWSSSASPVSEGGINVFRSGDYDSAVAGGMNQKDFDEFGRDEFSFGNKSAVNGSGHD

Query:  GGPVLSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTAMPPASVMT-------------------------------RWNIVMPAIVARSIAILSDAGLGMAMFSLG
        GGPVLSKLGSSSTAELHPKNGDD AESKPT+MPPASVMT                               RWNI MPAIVARSIAILSDAGLGMAMFSLG
Subjt:  GGPVLSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTAMPPASVMT-------------------------------RWNIVMPAIVARSIAILSDAGLGMAMFSLG

Query:  LFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHPDILSTGFDLDLDPNS
        LFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHPDILSTGFDLD D NS
Subjt:  LFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHPDILSTGFDLDLDPNS

A0A6J1EVC1 Auxin efflux carrier component

5.3e-280

89.31

Show/hide

Query:  MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEW
        MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMN RFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEW
Subjt:  MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEW

Query:  SITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGDSTGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSLDGKEPLQTEAEIGEDG
        +ITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGDSTGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSLDGKEPLQTEAEIGEDG
Subjt:  SITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGDSTGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSLDGKEPLQTEAEIGEDG

Query:  KLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSH--GGGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFFLGNASPRHSNFGNYGNFDEESGGLKGRGISGNVN
        KLRVVVRKS SSRSEVFSRRSH  GGGGG SLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFFLGNASPRHSN+GN+GNFDEESGG KGR I+GNV 
Subjt:  KLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSH--GGGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFFLGNASPRHSNFGNYGNFDEESGGLKGRGISGNVN

Query:  GVFPSSNGYPAPASGGLFSPVTGPAAAAAKKRVNGGDGGKDLHMFVWSSSASPVSEGGINVFRSGDYDSAVAGGMNQKDFDEFGRDEFSFGNKSAVNGSG
              NGYPAPASGGLFSP+TGPAAAAAKKRV+GGDGGKDLHMFVWSSSASPVSEGG+NVFR GDYD A AGGMNQKDFDEFGRDEFSFGNKSAVNG G
Subjt:  GVFPSSNGYPAPASGGLFSPVTGPAAAAAKKRVNGGDGGKDLHMFVWSSSASPVSEGGINVFRSGDYDSAVAGGMNQKDFDEFGRDEFSFGNKSAVNGSG

Query:  HDGGPVLSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTAMPPASVMT-------------------------------RWNIVMPAIVARSIAILSDAGLGMAMFS
        HDGGPVLSKLGSSSTAELHPK+GDD AESKPT MPPASVMT                               RWNI+MPAIVARSIAILSDAGLGMAMFS
Subjt:  HDGGPVLSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTAMPPASVMT-------------------------------RWNIVMPAIVARSIAILSDAGLGMAMFS

Query:  LGLFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHPDILSTG
        LGLFMALQPKIIACGNTIA+FAMAVRFITGPAVMAAASIAVGL+GVLLHIAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHPDILSTG
Subjt:  LGLFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHPDILSTG

D7URM4 Auxin efflux carrier component

4.6e-284

90.31

Show/hide

Query:  MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEW
        MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVL ALAVWSHLSSKGSLEW
Subjt:  MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEW

Query:  SITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGDSTGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSLDGKEPLQTEAEIGEDG
        SITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGDSTGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSLDGKEPLQTEAEIGEDG
Subjt:  SITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGDSTGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSLDGKEPLQTEAEIGEDG

Query:  KLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSHGGGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFFLGNASPRHSNFGNYGNFDEESGGLKGRGISGNVNGV
        KLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSHGGGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFFLGNASPRHSNFGN+GNFDEE+GG+KGRGISGNVNG+
Subjt:  KLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSHGGGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFFLGNASPRHSNFGNYGNFDEESGGLKGRGISGNVNGV

Query:  FPSSNGYPAPASGGLFSPVTGPAAAAAKKRVNGGDGGKDLHMFVWSSSASPVSEGGINVFRSGDYDSAVAGGMNQKDFDEFGRDEFSFGNKSAVNGSGHD
        FPS+NGYPAPASGGLFSP TGPAA    K+ NGGDGGKDLHMFVWSSSASPVSEGGINVFRSGDYD+  AGGMN KDF+E+G DEFSFGNKSAVNG GHD
Subjt:  FPSSNGYPAPASGGLFSPVTGPAAAAAKKRVNGGDGGKDLHMFVWSSSASPVSEGGINVFRSGDYDSAVAGGMNQKDFDEFGRDEFSFGNKSAVNGSGHD

Query:  GGPVLSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTAMPPASVMT-------------------------------RWNIVMPAIVARSIAILSDAGLGMAMFSLG
        GGPVLSKLGSSSTAELHPK+GDD AESKPT+MPPASVMT                               RWNI MPAIVARSIAILSDAGLGMAMFSLG
Subjt:  GGPVLSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTAMPPASVMT-------------------------------RWNIVMPAIVARSIAILSDAGLGMAMFSLG

Query:  LFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHPDILSTG
        LFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHPDILSTG
Subjt:  LFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHPDILSTG

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

P0C0X5 Probable auxin efflux carrier component 1b

3.8e-174

63.07

Show/hide

Query:  MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEW
        MI+V DLYHVLTAVVPLYVAM LAY SV+WW+IFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFIS+NNPF+MNLRF+AADTLQKLIVLA LA+W  LS++GSL+W
Subjt:  MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEW

Query:  SITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGDS----TGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSL----DGKEPLQT
         ITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMY  +    +G+LMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLL+ EQFPDTA  IVSFRVDSD++SL     G   LQ 
Subjt:  SITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGDS----TGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSL----DGKEPLQT

Query:  EAEIGEDGKLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSHG-GGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFFLGNASPRHSNFGNYGNFDEESGGLKGR
        EAE+G+DG++RV VRKSTSSRSE  +  SHG      S+ PR SNL+  EIYSLQSSRNPTPRGSSFNH++FF        +  GN    DEE G   G 
Subjt:  EAEIGEDGKLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSHG-GGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFFLGNASPRHSNFGNYGNFDEESGGLKGR

Query:  GISGNVNGVFPSSNGYPAPASGGLFSPVTGPAAAAAKKRVNGGDGGKDLHMFVWSSSASPVSE-------GGINVFRSGDYDSAVAGGMNQKDFDEFGRD
        G S             P P  G               KR       KDLHMFVWSSSASPVSE       G ++VF  G  D   A G           D
Subjt:  GISGNVNGVFPSSNGYPAPASGGLFSPVTGPAAAAAKKRVNGGDGGKDLHMFVWSSSASPVSE-------GGINVFRSGDYDSAVAGGMNQKDFDEFGRD

Query:  EFSFGNKSAVNGSGHDGGPVLSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTAMPPASVMT-------------------------------RWNIVMPAIVARSI
        E+SFGNK+         GP LSKLGS+STA+L PK   D  E    AMPPASVMT                               RW I MPAI+ARSI
Subjt:  EFSFGNKSAVNGSGHDGGPVLSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTAMPPASVMT-------------------------------RWNIVMPAIVARSI

Query:  AILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHPDILST
        +ILSDAGLGMAMFSLGLFMALQP+IIACGN++AS+AMAVRF+ GPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHP+ILST
Subjt:  AILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHPDILST

Q0IQA5 Probable auxin efflux carrier component 1d

4.4e-175

62.98

Show/hide

Query:  MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEW
        MI+V DLYHVLTAVVPLYVAM LAY SV+WW+IFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFIS+NNPF+MNLRF+AADTLQKLIVLA LA+W  LS++GSL+W
Subjt:  MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEW

Query:  SITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMY-------GDSTGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSL----DGKEP
         ITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMY       G  +G+LMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLL+ EQFPDTA  IVSFRVDSD++SL     G   
Subjt:  SITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMY-------GDSTGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSL----DGKEP

Query:  LQTEAEIGEDGKLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSHG-GGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFFLGNASPRHSNFGNYGNFDEESGGL
        LQ EAE+G+DGK+RV VRKSTSSRSE  +  SHG      S+ PR SNL+  EIYSLQSSRNPTPRGSSFNH++FF        +  GN  + DEE G  
Subjt:  LQTEAEIGEDGKLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSHG-GGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFFLGNASPRHSNFGNYGNFDEESGGL

Query:  KGRGISGNVNGVFPSSNGYPAPASGGLFSPVTGPAAAAAKKRVNGGDGGKDLHMFVWSSSASPVSE--------GGINVFRSGDYDSAVAGGMNQKDFDE
         G G S             P P  G               KR       KDLHMFVWSSSASPVSE        G ++VF  G  D   A G        
Subjt:  KGRGISGNVNGVFPSSNGYPAPASGGLFSPVTGPAAAAAKKRVNGGDGGKDLHMFVWSSSASPVSE--------GGINVFRSGDYDSAVAGGMNQKDFDE

Query:  FGRDEFSFGNKSAVNGSGHDGGPVLSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTAMPPASVMT-------------------------------RWNIVMPAIV
           DE+SFGNK+         GP LSKLGS+STA+L PK   D  E +  AMPPASVMT                               RW I MPAI+
Subjt:  FGRDEFSFGNKSAVNGSGHDGGPVLSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTAMPPASVMT-------------------------------RWNIVMPAIV

Query:  ARSIAILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHPDILST
        ARSI+ILSDAGLGMAMFSLGLFMALQP+IIACGN++AS+AMAVRF+ GPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHP+ILST
Subjt:  ARSIAILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHPDILST

Q5SMQ9 Auxin efflux carrier component 1a

1.4e-173

60.54

Show/hide

Query:  MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEW
        MI+ +D YHV+TA+VPLYVAMILAYGSVKWW+IF+PDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFIS+NNP++MNLRFIAADTLQKL+VLA L  WSHLS +GSLEW
Subjt:  MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEW

Query:  SITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGDSTGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSLDG-KEPLQTEAEIGED
        +ITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYG+ +G+LMVQIVVLQCIIWYTLMLF+FEYRGAR+LI EQFPDTA  I S  VD D++SLDG ++ ++TE E+ ED
Subjt:  SITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGDSTGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSLDG-KEPLQTEAEIGED

Query:  GKLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSHGGGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFFLGNASPRHSNFGNYGNFDEESGGL----KGRGISG
        G++ V VR+S +SRS+++SRRS G     S TPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNH+DF+  +   R SNFG    F   +G           + 
Subjt:  GKLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSHGGGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFFLGNASPRHSNFGNYGNFDEESGGL----KGRGISG

Query:  NVNGVFPSSNGYPAPASGGLFSPVTGPAAAAAKK-RVNGGDGGKDLHMFVWSSSASPVSEGGINVFRSG--DYDSAVA--------GGMNQKDFDEFGRD
              P+SN  P        +P    A   AKK   NG   G+DLHMFVWSSSASPVS+    VF  G  DY+ A A        G  +++D+ E  RD
Subjt:  NVNGVFPSSNGYPAPASGGLFSPVTGPAAAAAKK-RVNGGDGGKDLHMFVWSSSASPVSEGGINVFRSG--DYDSAVA--------GGMNQKDFDEFGRD

Query:  EFSFGNKSAVNGSGHDGGPVLSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTAMPPASVMT-------------------------------RWNIVMPAIVARSI
        +FSFGN+  ++     G     K  +++ A+         A + PTAMPP SVMT                               RWN  MPAIV +SI
Subjt:  EFSFGNKSAVNGSGHDGGPVLSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTAMPPASVMT-------------------------------RWNIVMPAIVARSI

Query:  AILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHPDILST
        +ILSDAGLGMAMFSLGLFMALQP IIACGN +A++AMAVRF+ GPAVMAAAS AVGLRG LLH+AIVQAALPQGIVPFVFAKEY+VHP ILST
Subjt:  AILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHPDILST

Q67UL3 Probable auxin efflux carrier component 1c

6.2e-177

61.91

Show/hide

Query:  MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEW
        MI+ +D YHV+TA+VPLYVAMILAYGSVKWW+IF+PDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFIS+NNP++MNLRFIAADTLQKLIVLA L +WSHLS +GSLEW
Subjt:  MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEW

Query:  SITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGDSTGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSLDG-KEPLQTEAEIGED
        +ITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYG+ +G+LMVQIVVLQCIIWYTLMLF+FEYRGAR+LI EQFPDTAG I S  VD+D++SLDG ++ ++TEAE+ ED
Subjt:  SITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGDSTGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSLDG-KEPLQTEAEIGED

Query:  GKLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSHGGGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFFLGNASPRHSNFGNYGNFDEESGGLKGRGISGNVNG
        GK+ V VR+S +SRS+V+SRRS G     S TPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNH+DF+  +   R SNF     F   +G    R  +   + 
Subjt:  GKLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSHGGGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFFLGNASPRHSNFGNYGNFDEESGGLKGRGISGNVNG

Query:  VFPSSNG-----YPAPASGGLFSPVTGPAAAA---AKKRVNG---GDGGKDLHMFVWSSSASPVSEGGINVFRSG-DYDSAVA------GGMNQKDFDEF
          P+  G     YPAP           PA AA    KK  NG   G+ GKDLHMFVWSSSASPVS+    VF +G +Y+ A A         + +  D  
Subjt:  VFPSSNG-----YPAPASGGLFSPVTGPAAAA---AKKRVNG---GDGGKDLHMFVWSSSASPVSEGGINVFRSG-DYDSAVA------GGMNQKDFDEF

Query:  GRDEFSFGNKSAVNGSGHDGGPVLSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTAMPPASVMT-------------------------------RWNIVMPAIVA
         RD+FSFGN+         G         S  A +  ++G       PTAMPP SVMT                               RWN  MPAI+ 
Subjt:  GRDEFSFGNKSAVNGSGHDGGPVLSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTAMPPASVMT-------------------------------RWNIVMPAIVA

Query:  RSIAILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHPDILST
        +SI+ILSDAGLGMAMFSLGLFMALQP+IIACGN +A+FAMAVRF+TGPAVMAAASIAVGLRG LLH+AIVQAALPQGIVPFVFAKEY+VHPDILST
Subjt:  RSIAILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHPDILST

Q9C6B8 Auxin efflux carrier component 1

2.6e-175

59.23

Show/hide

Query:  MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEW
        MI+ +D YHV+TA+VPLYVAMILAYGSVKWWKIF+PDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFI++NNP++MNLRF+AAD+LQK+IVL+ L +W  LS  GSL+W
Subjt:  MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEW

Query:  SITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGDSTGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSLDGKEPLQTEAEIGEDG
        +ITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYG+ +G LMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGA+LLI+EQFPDTAG IVS  VDSDI+SLDG++PL+TEAEI EDG
Subjt:  SITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGDSTGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSLDGKEPLQTEAEIGEDG

Query:  KLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSHGGGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFF--LGNASPRHSNFG-------------NYGNFDEES
        KL V VR+S +SRS+++SRRS     G+S TPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNH+DF+  + +   R+SNFG                N++E+ 
Subjt:  KLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSHGGGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFF--LGNASPRHSNFG-------------NYGNFDEES

Query:  GGLK--GRGISGNVNGVFPSSNG--------YPAPASGGLFSPVTGPAAAAAKK---RVNGG---DG-GKDLHMFVWSSSASPVSE--GGINVFRSGDYD
        G  K    G +         S G        YPAP + G+FSP TG     A K    V GG   DG G+DLHMFVWSSSASPVS+  GG       DY 
Subjt:  GGLK--GRGISGNVNGVFPSSNG--------YPAPASGGLFSPVTGPAAAAAKK---RVNGG---DG-GKDLHMFVWSSSASPVSE--GGINVFRSGDYD

Query:  SAV------------AGGMNQKDFDEFGRDEFSFGNKSAVNGSGHDGGPVLSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTAMPPASVMTR--------------
        +A              G  N   + E  R+EFSFGNK        D   VL+  G ++ +            ++   MPP SVMTR              
Subjt:  SAV------------AGGMNQKDFDEFGRDEFSFGNKSAVNGSGHDGGPVLSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTAMPPASVMTR--------------

Query:  -----------------WNIVMPAIVARSIAILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAA
                         WNI MPA++A+SI+ILSDAGLGMAMFSLGLFMAL P+IIACGN  A+FA A+RF+ GPAVM  AS AVGLRGVLLH+AI+QAA
Subjt:  -----------------WNIVMPAIVARSIAILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAA

Query:  LPQGIVPFVFAKEYNVHPDILST
        LPQGIVPFVFAKEYNVHPDILST
Subjt:  LPQGIVPFVFAKEYNVHPDILST

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G23080.1 Auxin efflux carrier family protein

1.4e-160

56.63

Show/hide

Query:  MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEW
        MI+  DLY VLTAV+PLYVAMILAYGSV+WWKIFSPDQCSGINRFVA+FAVPLLSFHFISSNNP++MNLRFIAADTLQKLI+L  L +W++ +  GSLEW
Subjt:  MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEW

Query:  SITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGDSTGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSLDGKEPLQTEAEIGEDG
        SIT+FSLSTLPNTLVMGIPLL  MYG+ +G+LMVQIVVLQCIIWYTL+LFLFEYRGA++LI EQFP+T   IVSF+V+SD++SLDG + L+T+A+IG+DG
Subjt:  SITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGDSTGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSLDGKEPLQTEAEIGEDG

Query:  KLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSHGGGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFF--LGNASPRHSNFG---------------NYGNFDE
        KL V VRKS +      SRRS  GGGG ++TPRPSNLT AEIYSL    N TPRGS+FNHSDF+  +G    R SNFG                  NF E
Subjt:  KLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSHGGGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFF--LGNASPRHSNFG---------------NYGNFDE

Query:  ESGGLKGRGISGNVNGVFPSSNGYPAPASGGLFSPVTGPAAAAAKKRVNG---GDGGKDLHMFVWSSSASPVSE-GGINVFRSGDYDSAVAGGMNQKDFD
        ES  +      G   G  P S  YPAP         TG  A        G    +  K+LHMFVW S+ SPVS+  G+ V    +     +     K+  
Subjt:  ESGGLKGRGISGNVNGVFPSSNGYPAPASGGLFSPVTGPAAAAAKKRVNG---GDGGKDLHMFVWSSSASPVSE-GGINVFRSGDYDSAVAGGMNQKDFD

Query:  EFGRDEFSFGNKSAVNGSGHDGGPV-----------LSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTA-MPPASVMT----------------------------
            D    G   A   +G  GG             L KL  +STAEL+PK   +  E+ P   MPPASVMT                            
Subjt:  EFGRDEFSFGNKSAVNGSGHDGGPV-----------LSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTA-MPPASVMT----------------------------

Query:  ---RWNIVMPAIVARSIAILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAALPQGIVPFVFAKE
           RW++ MP I+ +SI+ILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPK+IACGN+ A+FAMAVRF TGPAVMA A++A+GLRG LL +AIVQAALPQGIVPFVFAKE
Subjt:  ---RWNIVMPAIVARSIAILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAALPQGIVPFVFAKE

Query:  YNVHPDILSTG
        YNVHP ILSTG
Subjt:  YNVHPDILSTG

AT1G23080.3 Auxin efflux carrier family protein

1.4e-160

56.7

Show/hide

Query:  MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEW
        MI+  DLY VLTAV+PLYVAMILAYGSV+WWKIFSPDQCSGINRFVA+FAVPLLSFHFISSNNP++MNLRFIAADTLQKLI+L  L +W++ +  GSLEW
Subjt:  MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEW

Query:  SITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGDSTGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSLDGKEPLQTEAEIGEDG
        SIT+FSLSTLPNTLVMGIPLL  MYG+ +G+LMVQIVVLQCIIWYTL+LFLFEYRGA++LI EQFP+T   IVSF+V+SD++SLDG + L+T+A+IG+DG
Subjt:  SITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGDSTGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSLDGKEPLQTEAEIGEDG

Query:  KLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSHGGGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFF--LGNASPRHSNFG---------------NYGNFDE
        KL V VRKS +      SRRS  GGGG ++TPRPSNLT AEIYSL    N TPRGS+FNHSDF+  +G    R SNFG                  NF E
Subjt:  KLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSHGGGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFF--LGNASPRHSNFG---------------NYGNFDE

Query:  ESGGLKGRGISGNVNGVFPSSNGYPAPASGGLFSPVTGPAAAAAKKRVNG---GDGGKDLHMFVWSSSASPVS-------------------EGGINVFR
        ES  +      G   G  P S  YPAP         TG  A        G    +  K+LHMFVW S+ SPVS                   +GG    R
Subjt:  ESGGLKGRGISGNVNGVFPSSNGYPAPASGGLFSPVTGPAAAAAKKRVNG---GDGGKDLHMFVWSSSASPVS-------------------EGGINVFR

Query:  SGDYD-SAVAGGMNQKDFDEFGRDEFSFGNKSAVNGSGHDGGPVLSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTA-MPPASVMT--------------------
            D +  AG MN     ++G +E S   K   NG        L KL  +STAEL+PK   +  E+ P   MPPASVMT                    
Subjt:  SGDYD-SAVAGGMNQKDFDEFGRDEFSFGNKSAVNGSGHDGGPVLSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTA-MPPASVMT--------------------

Query:  -----------RWNIVMPAIVARSIAILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAALPQGI
                   RW++ MP I+ +SI+ILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPK+IACGN+ A+FAMAVRF TGPAVMA A++A+GLRG LL +AIVQAALPQGI
Subjt:  -----------RWNIVMPAIVARSIAILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAALPQGI

Query:  VPFVFAKEYNVHPDILSTG
        VPFVFAKEYNVHP ILSTG
Subjt:  VPFVFAKEYNVHPDILSTG

AT1G73590.1 Auxin efflux carrier family protein

1.9e-176

59.23

Show/hide

Query:  MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEW
        MI+ +D YHV+TA+VPLYVAMILAYGSVKWWKIF+PDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFI++NNP++MNLRF+AAD+LQK+IVL+ L +W  LS  GSL+W
Subjt:  MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEW

Query:  SITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGDSTGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSLDGKEPLQTEAEIGEDG
        +ITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYG+ +G LMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGA+LLI+EQFPDTAG IVS  VDSDI+SLDG++PL+TEAEI EDG
Subjt:  SITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGDSTGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSLDGKEPLQTEAEIGEDG

Query:  KLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSHGGGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFF--LGNASPRHSNFG-------------NYGNFDEES
        KL V VR+S +SRS+++SRRS     G+S TPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNH+DF+  + +   R+SNFG                N++E+ 
Subjt:  KLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSHGGGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFF--LGNASPRHSNFG-------------NYGNFDEES

Query:  GGLK--GRGISGNVNGVFPSSNG--------YPAPASGGLFSPVTGPAAAAAKK---RVNGG---DG-GKDLHMFVWSSSASPVSE--GGINVFRSGDYD
        G  K    G +         S G        YPAP + G+FSP TG     A K    V GG   DG G+DLHMFVWSSSASPVS+  GG       DY 
Subjt:  GGLK--GRGISGNVNGVFPSSNG--------YPAPASGGLFSPVTGPAAAAAKK---RVNGG---DG-GKDLHMFVWSSSASPVSE--GGINVFRSGDYD

Query:  SAV------------AGGMNQKDFDEFGRDEFSFGNKSAVNGSGHDGGPVLSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTAMPPASVMTR--------------
        +A              G  N   + E  R+EFSFGNK        D   VL+  G ++ +            ++   MPP SVMTR              
Subjt:  SAV------------AGGMNQKDFDEFGRDEFSFGNKSAVNGSGHDGGPVLSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTAMPPASVMTR--------------

Query:  -----------------WNIVMPAIVARSIAILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAA
                         WNI MPA++A+SI+ILSDAGLGMAMFSLGLFMAL P+IIACGN  A+FA A+RF+ GPAVM  AS AVGLRGVLLH+AI+QAA
Subjt:  -----------------WNIVMPAIVARSIAILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAA

Query:  LPQGIVPFVFAKEYNVHPDILST
        LPQGIVPFVFAKEYNVHPDILST
Subjt:  LPQGIVPFVFAKEYNVHPDILST

AT2G01420.2 Auxin efflux carrier family protein

7.1e-160

56.04

Show/hide

Query:  MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEW
        MI+  DLY VLTAVVPLYVAMILAYGSV+WWKIFSPDQCSGINRFVA+FAVPLLSFHFIS+N+P++MN RF+AADTLQK+I+L  LA+W++L+  GSLEW
Subjt:  MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEW

Query:  SITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGDSTGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSLDGKEPLQTEAEIGEDG
         IT+FSLSTLPNTLVMGIPLL  MYG   G+LMVQ+VVLQCIIWYTL+LFLFEYRGA+LLI EQFP+T   IVSF+V+SD++SLDG + L+T+AEIG DG
Subjt:  SITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGDSTGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSLDGKEPLQTEAEIGEDG

Query:  KLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSHGGGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFF--LGNASPRHSNFG---------------NYGNFDE
        KL V VRKS +SR  +             +TPRPSNLT AEIYSL S    TPRGS+FNHSDF+  +G    R SNFG                  NF E
Subjt:  KLRVVVRKSTSSRSEVFSRRSHGGGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFF--LGNASPRHSNFG---------------NYGNFDE

Query:  ESGGLKGRGISGNVNGVFPSSNGYPAPASGGLFSPVTGPAAAAAK-----------KRVNGGDGGKDLHMFVWSSSASPVSEGGINVFRSGDYDSAVAGG
        E+  +K  G   N N   P++  YPAP     FS  TG +    K           K        K+LHMFVWSSSASPVS+    VF  G  D+ VA  
Subjt:  ESGGLKGRGISGNVNGVFPSSNGYPAPASGGLFSPVTGPAAAAAK-----------KRVNGGDGGKDLHMFVWSSSASPVSEGGINVFRSGDYDSAVAGG

Query:  MNQKDFDEFGRDEFSFGNKSAVNGSGHDGGPV---------------LSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTAMPPASVMT------------------
         +++   E          KS   G G D G +               L+K+GS+STAEL    GD    +  T MPP SVMT                  
Subjt:  MNQKDFDEFGRDEFSFGNKSAVNGSGHDGGPV---------------LSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTAMPPASVMT------------------

Query:  -------------RWNIVMPAIVARSIAILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAALPQ
                     RW++ MP I+ +SI+ILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPKIIACGN++A+FAMAVRFITGPA+MA A IA+GL G LL IAIVQAALPQ
Subjt:  -------------RWNIVMPAIVARSIAILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAALPQ

Query:  GIVPFVFAKEYNVHPDILSTG
        GIVPFVFAKEYNVHP ILSTG
Subjt:  GIVPFVFAKEYNVHPDILSTG

AT5G57090.1 Auxin efflux carrier family protein

3.7e-161

55.33

Show/hide

Query:  MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEW
        MI+  D+Y VL A+VPLYVAMILAYGSV+WW IF+PDQCSGINRFVA+FAVPLLSFHFISSN+P++MN  F+AAD+LQK+++LAAL +W   S +GSLEW
Subjt:  MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEW

Query:  SITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGDSTGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSLDGKEPLQTEAEIGEDG
         ITLFSLSTLPNTLVMGIPLL+ MYGD +G LMVQIVVLQ IIWYTLMLFLFE+RGA+LLI+EQFP+TAG I SFRVDSD++SL+G+EPLQT+AEIG+DG
Subjt:  SITLFSLSTLPNTLVMGIPLLKGMYGDSTGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSLDGKEPLQTEAEIGEDG

Query:  KLRVVVRKSTSSRSEVFS-RRSHGGGGGVS-LTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFF-LGNA----SPRHSNFGNYG--------------
        KL VVVR+S+++ S + S  +SHGGG   S +TPR SNLT  EIYS+QSSR PTPR SSFN +DF+ + NA    SPRH    +YG              
Subjt:  KLRVVVRKSTSSRSEVFS-RRSHGGGGGVS-LTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFF-LGNA----SPRHSNFGNYG--------------

Query:  ----------NFDEE------SGGLKGRGISGNV--NGVFPSSNGYPAPASGGLFSPVTGPAAAAAKKRVNGGDGG---------KDLHMFVWSSSASPV
                  NFDEE        G  GR +SG +  N   PS   YP P    +F+  T  A+   KK   GG  G         K+++MFVWSSSASPV
Subjt:  ----------NFDEE------SGGLKGRGISGNV--NGVFPSSNGYPAPASGGLFSPVTGPAAAAAKKRVNGGDGG---------KDLHMFVWSSSASPV

Query:  SEGGIN--VFRSGDYDSAVAGGMNQKDFDEFGR-------DEFSFGNKSAV--NGSGHDGG--PVLSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTAMPPASVMT
        SE      + R    D +    ++    D           +  S G K  V  +  G++GG  P + K GS           D     +   MPPASVMT
Subjt:  SEGGIN--VFRSGDYDSAVAGGMNQKDFDEFGR-------DEFSFGNKSAV--NGSGHDGG--PVLSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTAMPPASVMT

Query:  R-------------------------------WNIVMPAIVARSIAILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAV
        R                               WNI MP I++ SI+ILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPKIIACG ++A FAMAVRF+TGPAV+AA SIA+
Subjt:  R-------------------------------WNIVMPAIVARSIAILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAV

Query:  GLRGVLLHIAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHPDILST
        G+RG LLHIAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHPDILST
Subjt:  GLRGVLLHIAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHPDILST

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGATCTCTGTTTCTGATCTCTACCATGTCCTCACCGCCGTCGTCCCGCTCTACGTCGCCATGATCCTAGCTTACGGCTCCGTCAAATGGTGGAAAATCTTCTCCCCGGA
CCAATGCTCCGGCATCAACCGTTTCGTCGCCCTCTTCGCCGTCCCCCTCCTCTCCTTCCATTTCATTTCCTCCAACAACCCTTTCTCTATGAACTTACGGTTCATCGCCG
CCGATACTCTTCAAAAGCTTATCGTTCTCGCCGCCCTCGCTGTATGGTCTCATCTCTCCTCTAAAGGCTCTCTAGAATGGTCAATTACTCTGTTTTCCCTCTCTACTCTG
CCCAATACTCTGGTAATGGGAATTCCTCTGTTGAAGGGAATGTATGGCGACTCCACCGGTACTTTAATGGTCCAAATCGTTGTACTTCAGTGTATCATTTGGTATACTTT
GATGCTGTTTTTGTTCGAGTACAGGGGAGCTAGATTGTTGATTGCAGAGCAGTTTCCGGATACTGCAGGGGAGATTGTTTCGTTTAGAGTTGATTCGGATATTCTGTCTT
TAGATGGGAAAGAGCCGCTGCAGACGGAGGCGGAGATTGGGGAAGATGGGAAGTTGAGAGTGGTGGTGAGGAAGTCGACGAGTTCTCGATCGGAGGTTTTTTCTCGGCGG
TCGCACGGCGGTGGAGGTGGGGTTTCGTTGACGCCTCGGCCATCGAATTTGACGAATGCAGAGATATATTCTTTGCAGTCGTCGAGGAATCCGACGCCGAGAGGGTCGAG
TTTTAATCATTCGGATTTCTTCTTGGGGAATGCGAGTCCAAGGCATTCTAATTTTGGGAATTATGGGAATTTTGATGAAGAAAGTGGAGGGCTGAAAGGCAGAGGAATTA
GTGGTAATGTTAATGGGGTTTTCCCGAGCTCTAATGGGTATCCGGCGCCGGCGAGCGGTGGCCTTTTTTCTCCGGTGACCGGACCGGCAGCGGCGGCAGCGAAGAAGAGG
GTCAATGGCGGAGATGGAGGAAAGGATTTGCATATGTTTGTTTGGAGTTCGAGTGCGTCGCCGGTTTCCGAGGGTGGAATCAACGTTTTCCGGAGTGGGGATTACGACAG
CGCCGTCGCCGGCGGGATGAACCAGAAAGATTTCGATGAGTTTGGTCGGGATGAGTTTAGCTTTGGGAACAAATCCGCCGTGAATGGAAGCGGACACGACGGTGGGCCGG
TACTATCCAAGCTTGGGTCAAGCTCCACCGCTGAACTCCATCCGAAAAATGGCGACGACATGGCCGAGTCTAAGCCGACCGCGATGCCACCAGCGAGTGTGATGACAAGG
TGGAACATTGTAATGCCAGCCATTGTTGCTCGATCGATCGCTATTTTATCCGATGCCGGGCTCGGGATGGCAATGTTTAGTCTCGGGTTGTTCATGGCATTGCAGCCTAA
AATCATTGCTTGTGGAAACACCATTGCTTCCTTTGCCATGGCGGTTCGGTTCATCACCGGGCCAGCCGTTATGGCAGCTGCCTCCATTGCTGTTGGGCTTAGAGGAGTTC
TCTTGCACATTGCCATAGTTCAGGCCGCTCTACCTCAAGGGATTGTCCCATTTGTGTTTGCTAAGGAATACAACGTTCATCCCGACATTTTGAGCACCGGGTTCGATCTC
GATCTCGACCCTAATAGTCCTGATCTTGATTCTTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MISVSDLYHVLTAVVPLYVAMILAYGSVKWWKIFSPDQCSGINRFVALFAVPLLSFHFISSNNPFSMNLRFIAADTLQKLIVLAALAVWSHLSSKGSLEWSITLFSLSTL
PNTLVMGIPLLKGMYGDSTGTLMVQIVVLQCIIWYTLMLFLFEYRGARLLIAEQFPDTAGEIVSFRVDSDILSLDGKEPLQTEAEIGEDGKLRVVVRKSTSSRSEVFSRR
SHGGGGGVSLTPRPSNLTNAEIYSLQSSRNPTPRGSSFNHSDFFLGNASPRHSNFGNYGNFDEESGGLKGRGISGNVNGVFPSSNGYPAPASGGLFSPVTGPAAAAAKKR
VNGGDGGKDLHMFVWSSSASPVSEGGINVFRSGDYDSAVAGGMNQKDFDEFGRDEFSFGNKSAVNGSGHDGGPVLSKLGSSSTAELHPKNGDDMAESKPTAMPPASVMTR
WNIVMPAIVARSIAILSDAGLGMAMFSLGLFMALQPKIIACGNTIASFAMAVRFITGPAVMAAASIAVGLRGVLLHIAIVQAALPQGIVPFVFAKEYNVHPDILSTGFDL
DLDPNSPDLDS

HG10017568 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome