; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10018116 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10018116
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionProtein of unknown function, DUF584
Genome locationChr04:536481..537203
RNA-Seq ExpressionHG10018116
SyntenyHG10018116
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR007608 - Senescence regulator S40


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KGN64943.1 hypothetical protein Csa_022813 [Cucumis sativus]2.5e-11692.12Show/hide
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XP_022967102.1 uncharacterized protein LOC111466606 [Cucurbita maxima]4.6e-11089.3Show/hide
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XP_038894579.1 uncharacterized protein LOC120083099 [Benincasa hispida]1.7e-12095.85Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LT40 Uncharacterized protein1.2e-11692.12Show/hide
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A0A1S4E4F1 uncharacterized protein LOC1034998845.1e-11591.7Show/hide
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A0A5A7SY45 Senescence regulator5.1e-11591.7Show/hide
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A0A6J1G2B0 uncharacterized protein LOC1114500332.9e-11088.93Show/hide
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A0A6J1HPU4 uncharacterized protein LOC1114666062.2e-11089.3Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G11700.1 Protein of unknown function, DUF5842.1e-1248.24Show/hide
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        SAPVNVP  SK  +      + + DEE+    G M+PPHE +A+S  +    S    SV EG GRTLKGR+LR+VR+A+W +TGF
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AT3G15040.1 Protein of unknown function, DUF5841.3e-3850.84Show/hide
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        ++PSS   I D  D ELNEDD+F      A   A HS    S +   TP   +   +   G    E  GILAALPE+  SSS   S  F+HK        
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Query:  --ASVSSSSSS-------SPSSSRMIPTIPKPPLERLPLPIS--SSLKY-QSAPVNVPIMSKAVQRQQ-------EIDVDDVDEEDGEMLPPHEIVARSL
          ++ SSSSSS       S SS+R IPT PKPP ERLP   S     KY QSAPV VP++S A+  +        ++  DD +EE+GEMLPPHEIVARSL
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        AQ+ +LSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAV+RRTGF+D
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AT3G45210.1 Protein of unknown function, DUF5841.5e-1034.06Show/hide
Query:  LPENEASSSLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLERLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSKAVQRQQEIDVDDVDEEDGEMLPPHEIVARSL
        LP +   +   +S   + ++ + S+ S SP   R + T  +   +  P  ++++    S P+NV   SK + ++    +++ D+     LPPHE     L
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Query:  AQAPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRTGFLD
        A+  M S SV EG GRTLKGRD+ +VRNA+  +TGFLD
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AT4G04630.1 Protein of unknown function, DUF5842.7e-1542.21Show/hide
Query:  ILAALPENEASSSLRN--SSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLERLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSKAV------QRQQEIDV----DDVDE
        + + L E E SS       SHF    S SSSSSSSP + R    +             S +K  SAP+NVP  SK        +R   +      DD ++
Subjt:  ILAALPENEASSSLRN--SSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLERLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSKAV------QRQQEIDV----DDVDE

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        +DG M+PPHE VAR LA+  + S S+ EG GRTLKGRDL +VRNAV  +TGFL+
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AT4G21970.1 Protein of unknown function, DUF5845.0e-1439.73Show/hide
Query:  ENEASSSLRNSSHFYHKASVSSS----SSSSPSSSRMIPTIPKPPLERLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSKAVQRQQEIDVDDV------DEEDGEMLPP
        E E  S LR S     +  +S S    S+SS SS+R IP   +         +S   K  SAP+N+P  SK     ++     +      D+++G M+PP
Subjt:  ENEASSSLRNSSHFYHKASVSSS----SSSSPSSSRMIPTIPKPPLERLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSKAVQRQQEIDVDDV------DEEDGEMLPP

Query:  HEIVARSLAQAPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRTGFLD
        HE+VA+ LA+  + S S+ EG GRTLKGRDL + RNAV  RTGFL+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACCTTAACCTTCCTTCCTCCCGCTTCCGCCATCGCAAGTCTCCCTCCTCCGAACGCTTTCTCGCTTCCTTCTCTTACCCCCCTGCTCGTACTGCAAACCCTAGCTC
CACCAACGGCATAGACGACGATAACGAGCTCAACGAAGACGACGTCTTCTGGACTGGCGATTTTGCTGCCGATTCCGCCCACCATAGCCACTCCACTCCCTCCTCCTCCT
CCTCTTCCACTCCTCGTCACCATATTCATCACCTCCAGCATCACAAGGGTTTTCCCCTGCCGGAGACCTTCGGAATCCTTGCTGCTCTCCCCGAGAACGAGGCCTCCTCC
AGCCTTCGCAACTCTTCACATTTCTATCACAAGGCGTCCGTTTCGTCCTCGTCCTCGTCCTCCCCTTCGTCTTCTCGGATGATTCCGACGATCCCTAAACCTCCTCTGGA
GCGATTGCCTCTTCCGATTTCGTCCTCGTTGAAGTACCAGTCCGCCCCTGTCAATGTGCCCATAATGTCGAAGGCGGTTCAGAGACAGCAGGAGATTGACGTGGATGATG
TTGATGAAGAAGATGGGGAAATGTTGCCGCCCCATGAGATTGTGGCTAGAAGTCTGGCTCAGGCGCCGATGTTGTCTTGCTCAGTGCTCGAGGGTGCAGGAAGGACGTTA
AAGGGCAGGGATCTTCGCCAGGTTCGCAACGCGGTTTGGAGACGAACAGGTTTTCTTGATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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