; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10018369 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10018369
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionRING-H2 finger protein ATL74-like
Genome locationChr04:3527042..3527650
RNA-Seq ExpressionHG10018369
SyntenyHG10018369
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0052006.1 RING-H2 finger protein ATL72 [Cucumis melo var. makuwa]6.4e-9794.03Show/hide
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KAG6578482.1 RING-H2 finger protein ATL72, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.2e-9288.18Show/hide
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KAG7016045.1 RING-H2 finger protein ATL72, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.6e-9288.67Show/hide
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XP_022938777.1 RING-H2 finger protein ATL74-like [Cucurbita moschata]4.7e-9288.18Show/hide
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XP_023550807.1 RING-H2 finger protein ATL74-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.6e-9288.67Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAH2 RING-type domain-containing protein2.2e-9590.59Show/hide
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A0A5D3BXT6 RING-H2 finger protein ATL723.1e-9794.03Show/hide
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A0A6J1BZW4 RING-H2 finger protein ATL743.8e-8789.12Show/hide
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A0A6J1FF16 RING-H2 finger protein ATL74-like2.3e-9288.18Show/hide
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A0A6J1JVF4 RING-H2 finger protein ATL74-like3.0e-9288.18Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P0C034 RING-H2 finger protein ATL107.0e-3047.73Show/hide
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        E N   N++++L+ L+C +IC LGL+ I+RCALR S RF       + S    +   G+KK ALR  PV  Y  E  L   + +C ICL DF +GE++++
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        LPKCNHGFHVRCID WL  H +CP CR  L+E
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Q6NQG7 RING-H2 finger protein ATL782.0e-3754.89Show/hide
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        Y  + NFD N+V++L+ LLCAL+C+LGLNSI+RCALRCS     E GG     RLT TG+K+ AL+      Y +E  L   +T+C ICL +F A E++K
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        +LP C+HGFHVRCID WL+SHSSCPTCR  L++
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Q9FLC6 RING-H2 finger protein ATL731.4e-4161.76Show/hide
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        A+ DT+MVIILAALLCALICALG+NS++RC LRC+RRF         +   A G+KK AL+ IPV  Y  E  L+++ T+C ICLGDF  GE ++VLPKC
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        NHGFHV+CIDTWL SHSSCPTCRQSLLE Q+ +  +
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Q9LZV8 RING-H2 finger protein ATL745.7e-4054.55Show/hide
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        HRLLL+          S   + Y+ + NFD NMVIILAALLCALI ALGLNSI+RCA+RC    +     GT +     GLKK  L++ PVA YGS   +
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Q9SG96 RING-H2 finger protein ATL721.7e-4458.9Show/hide
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        RLLL+    AP+N + + +   + +  FDTNMVIILAALLCALICAL LNS +RC LR +RRF  +     AS           ATGLKK AL+QIPV +
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        YGS   ++++ T+C ICLGDF  GEK++VLPKCNHGFHVRCIDTWL S SSCPTCRQSLL +Q
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G49220.1 RING/U-box superfamily protein5.0e-3147.73Show/hide
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        E N   N++++L+ L+C +IC LGL+ I+RCALR S RF       + S    +   G+KK ALR  PV  Y  E  L   + +C ICL DF +GE++++
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        LPKCNHGFHVRCID WL  H +CP CR  L+E
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AT1G49230.1 RING/U-box superfamily protein1.4e-3854.89Show/hide
Query:  YSTEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGT-ASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSESGLEIRETDCPICLGDFTAGEKIK
        Y  + NFD N+V++L+ LLCAL+C+LGLNSI+RCALRCS     E GG     RLT TG+K+ AL+      Y +E  L   +T+C ICL +F A E++K
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        +LP C+HGFHVRCID WL+SHSSCPTCR  L++
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AT3G10910.1 RING/U-box superfamily protein1.2e-4558.9Show/hide
Query:  RLLLDETTAAPSNGSSRTRNSYSTEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASR--------LTATGLKKSALRQIPVAV
        RLLL+    AP+N + + +   + +  FDTNMVIILAALLCALICAL LNS +RC LR +RRF  +     AS           ATGLKK AL+QIPV +
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Query:  YGSESGLEIRETDCPICLGDFTAGEKIKVLPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQ
        YGS   ++++ T+C ICLGDF  GEK++VLPKCNHGFHVRCIDTWL S SSCPTCRQSLL +Q
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AT5G01880.1 RING/U-box superfamily protein4.1e-4154.55Show/hide
Query:  HRLLLDETTAAPSNGSSRTRNSYSTEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSESGL
        HRLLL+          S   + Y+ + NFD NMVIILAALLCALI ALGLNSI+RCA+RC    +     GT +     GLKK  L++ PVA YGS   +
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Query:  EIRETDCPICLGDFTAGEKIKVLPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLE
        +I  T+C ICLG+F  GE+++VLP CNH FH+ CIDTWL SHSSCP CR SL+E
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AT5G05280.1 RING/U-box superfamily protein9.7e-4361.76Show/hide
Query:  ANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSESGLEIRETDCPICLGDFTAGEKIKVLPKC
        A+ DT+MVIILAALLCALICALG+NS++RC LRC+RRF         +   A G+KK AL+ IPV  Y  E  L+++ T+C ICLGDF  GE ++VLPKC
Subjt:  ANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSESGLEIRETDCPICLGDFTAGEKIKVLPKC

Query:  NHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSASESA
        NHGFHV+CIDTWL SHSSCPTCRQSLLE Q+ +  +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGATGGAGTCCAATCACCACCGTCCCCGTCCCCACCGCCTCCTCCTCGACGAGACGACGGCGGCACCGTCGAATGGAAGCAGCAGAACGCGAAATTCATATAGCAC
CGAAGCCAATTTTGACACGAACATGGTGATAATTCTTGCTGCCTTACTCTGCGCGTTGATTTGCGCTCTAGGACTAAACTCGATTGTCCGGTGCGCCCTCCGCTGCAGCC
GGCGGTTCGCCTTCGAGACAGGCGGCGGAACAGCCTCGCGCCTCACCGCTACAGGGTTAAAGAAAAGCGCATTACGCCAAATTCCAGTCGCCGTATACGGTTCGGAATCG
GGTCTAGAGATCCGAGAAACGGATTGCCCTATCTGCCTTGGAGATTTCACCGCCGGAGAGAAAATCAAAGTACTCCCTAAATGTAACCACGGATTTCACGTTCGATGTAT
CGATACCTGGTTAGCTTCCCACTCGTCATGTCCGACGTGTCGTCAATCACTGCTCGAACAACAGTCGGCTTCTGAATCAGCTGCAGCTGAAGCCGGAAATCGACCCGCCG
GAAATTCATCGGCTAGCGGCCAAGGTGAGATCTCGATAACTGTAGATGAAATTACCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGATGGAGTCCAATCACCACCGTCCCCGTCCCCACCGCCTCCTCCTCGACGAGACGACGGCGGCACCGTCGAATGGAAGCAGCAGAACGCGAAATTCATATAGCAC
CGAAGCCAATTTTGACACGAACATGGTGATAATTCTTGCTGCCTTACTCTGCGCGTTGATTTGCGCTCTAGGACTAAACTCGATTGTCCGGTGCGCCCTCCGCTGCAGCC
GGCGGTTCGCCTTCGAGACAGGCGGCGGAACAGCCTCGCGCCTCACCGCTACAGGGTTAAAGAAAAGCGCATTACGCCAAATTCCAGTCGCCGTATACGGTTCGGAATCG
GGTCTAGAGATCCGAGAAACGGATTGCCCTATCTGCCTTGGAGATTTCACCGCCGGAGAGAAAATCAAAGTACTCCCTAAATGTAACCACGGATTTCACGTTCGATGTAT
CGATACCTGGTTAGCTTCCCACTCGTCATGTCCGACGTGTCGTCAATCACTGCTCGAACAACAGTCGGCTTCTGAATCAGCTGCAGCTGAAGCCGGAAATCGACCCGCCG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAMESNHHRPRPHRLLLDETTAAPSNGSSRTRNSYSTEANFDTNMVIILAALLCALICALGLNSIVRCALRCSRRFAFETGGGTASRLTATGLKKSALRQIPVAVYGSES
GLEIRETDCPICLGDFTAGEKIKVLPKCNHGFHVRCIDTWLASHSSCPTCRQSLLEQQSASESAAAEAGNRPAGNSSASGQGEISITVDEIT