; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10018378 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10018378
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionTPRXL protein
Genome locationChr04:3605730..3606443
RNA-Seq ExpressionHG10018378
SyntenyHG10018378
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8646577.1 hypothetical protein Csa_005771 [Cucumis sativus]8.9e-9888.99Show/hide
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XP_011656432.1 putative protein TPRXL [Cucumis sativus]1.6e-9989.13Show/hide
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XP_016901982.1 PREDICTED: putative uncharacterized protein DDB_G0277255 [Cucumis melo]7.5e-9788.31Show/hide
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XP_022134140.1 putative protein TPRXL [Momordica charantia]2.8e-7574.46Show/hide
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XP_038885974.1 putative protein TPRXL [Benincasa hispida]1.4e-9889.57Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K7T8 Uncharacterized protein7.8e-10089.13Show/hide
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A0A1S4E178 Uncharacterized protein3.6e-9788.31Show/hide
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A0A5A7UC51 Putative serine-rich protein3.6e-9788.31Show/hide
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A0A6J1BX95 Uncharacterized protein1.3e-7574.46Show/hide
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A0A6J1K022 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like2.7e-6880.2Show/hide
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        KEANS+ NSSFRVYYGGATGAIPFRWESRPGTPKHT+S+TSIPPLTPPPSYYSSSHSTSK S K T  +SIF     RKSRT S SFS  S SSSSSSS 
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         SWSSSR    SSPSAFVRPKFFK RR FS+SPSLPFE SFDDN+GDE  VGS P+SPTSTLCFGG +SS RASLF GCYQLVSVKNALLSIVGHGSA+R
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        GT
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06930.1 unknown protein2.9e-0635.76Show/hide
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        YYGG++ A+PF+WES+PGTP+           ++ S+ + P   PLTPPPSY+ +S S++K               +P+K+ T   S  S + S  SS +
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Query:  LASWSSSRSSSSSSPSAFVRPKFFKRRRRFSDSPSLPFEYSFDDNDGDEVGVGSRPNSPTSTLCF
            SSS SSSSS PS+ +R      RRR     S+ FE       G  +  GS  NS  S+ C+
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AT2G40475.1 unknown protein3.7e-1741.41Show/hide
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        +S +NSS R+YY G   ++PF WE+RPGTPKH  FSE+  +PPLTPPPSYYSSS S+    SKA  +       T      + PSFS  S SSSSSSS  
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                SSSSP + V     + R+ +S S S    Y  +D++ + V      +SPTSTLC+    SS          + S+K AL S++ HGS+ +
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AT3G56260.2 unknown protein7.4e-1040.62Show/hide
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        E + +I+     YYGGA  +IPF WESRPGTPK H  S++S+P PLTPPPSYYSS   ST +  SK     S F  F+       S    S  GS  ++S
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Query:  SLASWSSSRSSSSSSPSAFVRPKFFKRRRRFSDSPSLPFEYSFDDNDGDEVGVGSRPNSPTSTLCFGGSTSSRASLFGGCYQLVSVKNALLS
        S  SWSS+ SSSS S S    P   K  +R S     P  Y+  + D          +SPTSTLC      S     G    + SV  AL S
Subjt:  SLASWSSSRSSSSSSPSAFVRPKFFKRRRRFSDSPSLPFEYSFDDNDGDEVGVGSRPNSPTSTLCFGGSTSSRASLFGGCYQLVSVKNALLS

AT5G01790.1 unknown protein5.1e-1144.33Show/hide
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        PN       S    K +   F+  L  +K+  SS+++   SFR+ YY GA GA+PF WES PGTPKH  SE  ++PPLTPPPS++S S    +  SK
Subjt:  PNYDQISQKSFQTTKHEDRFFTRAL--SKEANSSINS---SFRV-YYGGATGAIPFRWESRPGTPKHTFSE-TSIPPLTPPPSYYSSSHSTSKASSK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAACTACTCCAAACTATGACCAAATTTCTCAAAAATCTTTCCAAACTACCAAACATGAAGATAGATTCTTCACTAGAGCTCTATCTAAAGAGGCTAATTCCTCCAT
CAACTCCTCTTTTCGAGTCTATTACGGCGGTGCTACCGGTGCGATTCCGTTCCGATGGGAGTCTCGACCCGGAACTCCAAAGCATACTTTTTCAGAAACTTCAATCCCTC
CTCTTACTCCTCCTCCTTCTTACTATTCCTCTTCACATTCTACTTCAAAGGCTTCTTCCAAAGCAACCCTTTTGAGCTCGATTTTTCCTCGGTTCACGCCGAGGAAATCT
CGAACAACTTCCCCATCTTTTTCTTCCTTCTCTGGCTCCTCCTCCTCGTCATCTTCCTTAGCATCCTGGTCATCCTCTCGCTCATCGTCCTCCTCGTCTCCCTCAGCTTT
CGTTAGACCTAAATTCTTCAAACGTCGTCGTCGCTTCTCGGATTCTCCAAGCTTACCGTTCGAGTATAGCTTCGACGACAACGACGGGGACGAGGTGGGGGTTGGGAGTC
GTCCCAATTCTCCTACATCAACTTTGTGCTTTGGTGGTTCTACTTCAAGTAGAGCTTCATTGTTTGGTGGTTGTTATCAGTTAGTGAGTGTGAAGAATGCTTTGTTGTCC
ATTGTTGGCCATGGATCTGCAACCAGAGGTACTCTTAATTATTTAGTTGTGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAAACTACTCCAAACTATGACCAAATTTCTCAAAAATCTTTCCAAACTACCAAACATGAAGATAGATTCTTCACTAGAGCTCTATCTAAAGAGGCTAATTCCTCCAT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQTTPNYDQISQKSFQTTKHEDRFFTRALSKEANSSINSSFRVYYGGATGAIPFRWESRPGTPKHTFSETSIPPLTPPPSYYSSSHSTSKASSKATLLSSIFPRFTPRKS
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IVGHGSATRGTLNYLVV