CuGenDBv2

Gene ID	HG10018384
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	Vitellogenin-2 isoform X1
Genome location	Chr04:3637433..3639783
RNA-Seq Expression	HG10018384
Synteny	HG10018384
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_008456760.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103496604 isoform X2 [Cucumis melo]

2.4e-87

79.91

Show/hide

Query:  MESQKRNLRARKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEKKSKPILVSESTSVNLRASNPSSDFLPTETTSDFPPAEPNPSSDSLP
        MES KRNLRARKPLADCTNTILSSQS ASNFSASIKPRKRV KSAVKDV NN+KK +P+L SESTSVNLRASNPSS+FLP E TSD PPAEPNPS DS P
Subjt:  MESQKRNLRARKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEKKSKPILVSESTSVNLRASNPSSDFLPTETTSDFPPAEPNPSSDSLP

Query:  SEPSSSRLPTDVSTPLRRADLPSTSGTDSVSEPQSFYSRR-PMNKRKSVEIAVAPFIFSTASKIQTGVRKRDGYDSPSRARTVPCKK--RATLYEEDESN
        SEPSSSR PT+ STP R ADLPS+SGTD VSEPQ+ YSRR P NKRKSVE A+ PFI  TASKIQ G R RD  +SPS+ARTVPC K  RA+L+EED+SN
Subjt:  SEPSSSRLPTDVSTPLRRADLPSTSGTDSVSEPQSFYSRR-PMNKRKSVEIAVAPFIFSTASKIQTGVRKRDGYDSPSRARTVPCKK--RATLYEEDESN

Query:  IELPREFVEEQKAYFSEVDAFELPVEEAKSSDSE
        +ELPREFVE+QK YFSEVDAFELPVEEAKSSDSE
Subjt:  IELPREFVEEQKAYFSEVDAFELPVEEAKSSDSE

XP_016901973.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103496604 isoform X3 [Cucumis melo]

7.3e-89

80.6

Show/hide

Query:  MESQKRNLRARKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEKKSKPILVSESTSVNLRASNPSSDFLPTETTSDFPPAEPNPSSDSLP
        MES KRNLRARKPLADCTNTILSSQS ASNFSASIKPRKRV KSAVKDV NN+KK +P+L SESTSVNLRASNPSS+FLP E TSD PPAEPNPS DS P
Subjt:  MESQKRNLRARKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEKKSKPILVSESTSVNLRASNPSSDFLPTETTSDFPPAEPNPSSDSLP

Query:  SEPSSSRLPTDVSTPLRRADLPSTSGTDSVSEPQSFYSRR-PMNKRKSVEIAVAPFIFSTASKIQTGVRKRDGYDSPSRARTVPCKKRATLYEEDESNIE
        SEPSSSR PT+ STP R ADLPS+SGTD VSEPQ+ YSRR P NKRKSVE A+ PFI  TASKIQ G R RD  +SPS+ARTVPC KRA+L+EED+SN+E
Subjt:  SEPSSSRLPTDVSTPLRRADLPSTSGTDSVSEPQSFYSRR-PMNKRKSVEIAVAPFIFSTASKIQTGVRKRDGYDSPSRARTVPCKKRATLYEEDESNIE

Query:  LPREFVEEQKAYFSEVDAFELPVEEAKSSDSE
        LPREFVE+QK YFSEVDAFELPVEEAKSSDSE
Subjt:  LPREFVEEQKAYFSEVDAFELPVEEAKSSDSE

XP_038884347.1 uncharacterized protein LOC120075210 isoform X1 [Benincasa hispida]

7.8e-99

86.61

Show/hide

Query:  MESQKRNLRARKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEKKSKPILVSESTSVNLRASNPSSDFLPTETTSDFPPAEPNPSSDSLP
        MESQKR LRARKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEKKS+P+L SESTSVNLRASNPSSDFLPTE  SDF P EPNPS+DSLP
Subjt:  MESQKRNLRARKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEKKSKPILVSESTSVNLRASNPSSDFLPTETTSDFPPAEPNPSSDSLP

Query:  SEPSSSRLPTDVSTPLRRADLPSTSGTDSVSEPQSFYSRR-PMNKRKSVEIAVAPFIFSTASKIQTGVRKRDGYDSPSRARTVPCKK-------RATLYE
        SEPSSSRLPT+VSTP RRADLPS+SGTD VSEPQSFYSRR P NKRKSVEIAVAPFIFST+SKI T  RKR+GYDSPS+A+TVPCKK       RAT+YE
Subjt:  SEPSSSRLPTDVSTPLRRADLPSTSGTDSVSEPQSFYSRR-PMNKRKSVEIAVAPFIFSTASKIQTGVRKRDGYDSPSRARTVPCKK-------RATLYE

Query:  EDESNIELPREFVEEQKAYFSEVDAFELPVEEAKSSDSE
        +DESNIELPREFVE+QKAYFSEVDAFELPVEEAKSSDSE
Subjt:  EDESNIELPREFVEEQKAYFSEVDAFELPVEEAKSSDSE

XP_038884348.1 uncharacterized protein LOC120075210 isoform X2 [Benincasa hispida]

4.7e-96

85.77

Show/hide

Query:  MESQKRNLRARKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEKKSKPILVSESTSVNLRASNPSSDFLPTETTSDFPPAEPNPSSDSLP
        MESQKR LRARKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEKKS+P+L SESTSVNLRASNPSSDFLPTE  SDF P EPNPS+DSLP
Subjt:  MESQKRNLRARKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEKKSKPILVSESTSVNLRASNPSSDFLPTETTSDFPPAEPNPSSDSLP

Query:  SEPSSSRLPTDVSTPLRRADLPSTSGTDSVSEPQSFYSRR-PMNKRKSVEIAVAPFIFSTASKIQTGVRKRDGYDSPSRARTVPCKK-------RATLYE
        SEPSSSRLPT+VSTP RRADLPS+S  D VSEPQSFYSRR P NKRKSVEIAVAPFIFST+SKI T  RKR+GYDSPS+A+TVPCKK       RAT+YE
Subjt:  SEPSSSRLPTDVSTPLRRADLPSTSGTDSVSEPQSFYSRR-PMNKRKSVEIAVAPFIFSTASKIQTGVRKRDGYDSPSRARTVPCKK-------RATLYE

Query:  EDESNIELPREFVEEQKAYFSEVDAFELPVEEAKSSDSE
        +DESNIELPREFVE+QKAYFSEVDAFELPVEEAKSSDSE
Subjt:  EDESNIELPREFVEEQKAYFSEVDAFELPVEEAKSSDSE

XP_038884349.1 uncharacterized protein LOC120075210 isoform X3 [Benincasa hispida]

2.1e-99

88.46

Show/hide

Query:  MESQKRNLRARKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEKKSKPILVSESTSVNLRASNPSSDFLPTETTSDFPPAEPNPSSDSLP
        MESQKR LRARKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEKKS+P+L SESTSVNLRASNPSSDFLPTE  SDF P EPNPS+DSLP
Subjt:  MESQKRNLRARKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEKKSKPILVSESTSVNLRASNPSSDFLPTETTSDFPPAEPNPSSDSLP

Query:  SEPSSSRLPTDVSTPLRRADLPSTSGTDSVSEPQSFYSRR-PMNKRKSVEIAVAPFIFSTASKIQTGVRKRDGYDSPSRARTVPCKK--RATLYEEDESN
        SEPSSSRLPT+VSTP RRADLPS+SGTD VSEPQSFYSRR P NKRKSVEIAVAPFIFST+SKI T  RKR+GYDSPS+A+TVPCKK  RAT+YE+DESN
Subjt:  SEPSSSRLPTDVSTPLRRADLPSTSGTDSVSEPQSFYSRR-PMNKRKSVEIAVAPFIFSTASKIQTGVRKRDGYDSPSRARTVPCKK--RATLYEEDESN

Query:  IELPREFVEEQKAYFSEVDAFELPVEEAKSSDSE
        IELPREFVE+QKAYFSEVDAFELPVEEAKSSDSE
Subjt:  IELPREFVEEQKAYFSEVDAFELPVEEAKSSDSE

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KDF7 Uncharacterized protein

4.3e-87

79.91

Show/hide

Query:  MESQKRNLRARKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEKKSKPILVSESTSVNLRASNPSSDFLPTETTSDFPPAEPNPSSDSLP
        MES KRNLRARKPLADCTNTILSSQS ASNFSASIKPRKRV KSAVKDV NNEKK +PIL SESTSVNLRASNPSSDFLPTE TSD P AEPNPS DSLP
Subjt:  MESQKRNLRARKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEKKSKPILVSESTSVNLRASNPSSDFLPTETTSDFPPAEPNPSSDSLP

Query:  SEPSSSRLPTDVSTPLRRADLPSTSGTDSVSEPQSFYSRR-PMNKRKSVEIAVAPFIFSTASKIQTGVRKRDGYDSPSRARTVPCKK--RATLYEEDESN
        SEPSS+R PT+++TP R +DLPS+SGTD VSEP + YSRR P NKRKSVE A+ PFIF TASKIQ G R RD  +SPS+ARTVPC K  RA ++EED+S 
Subjt:  SEPSSSRLPTDVSTPLRRADLPSTSGTDSVSEPQSFYSRR-PMNKRKSVEIAVAPFIFSTASKIQTGVRKRDGYDSPSRARTVPCKK--RATLYEEDESN

Query:  IELPREFVEEQKAYFSEVDAFELPVEEAKSSDSE
        IELPREFVE+QK YFSEVDAFELPVEEAKSSDSE
Subjt:  IELPREFVEEQKAYFSEVDAFELPVEEAKSSDSE

A0A1S3C3Z6 uncharacterized protein LOC103496604 isoform X1

4.3e-87

78.24

Show/hide

Query:  MESQKRNLRARKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEKKSKPILVSESTSVNLRASNPSSDFLPTETTSDFPPAEPNPSSDSLP
        MES KRNLRARKPLADCTNTILSSQS ASNFSASIKPRKRV KSAVKDV NN+KK +P+L SESTSVNLRASNPSS+FLP E TSD PPAEPNPS DS P
Subjt:  MESQKRNLRARKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEKKSKPILVSESTSVNLRASNPSSDFLPTETTSDFPPAEPNPSSDSLP

Query:  SEPSSSRLPTDVSTPLRRADLPSTSGTDSVSEPQSFYSRR-PMNKRKSVEIAVAPFIFSTASKIQTGVRKRDGYDSPSRARTVPCKK-------RATLYE
        SEPSSSR PT+ STP R ADLPS+SGTD VSEPQ+ YSRR P NKRKSVE A+ PFI  TASKIQ G R RD  +SPS+ARTVPC K       RA+L+E
Subjt:  SEPSSSRLPTDVSTPLRRADLPSTSGTDSVSEPQSFYSRR-PMNKRKSVEIAVAPFIFSTASKIQTGVRKRDGYDSPSRARTVPCKK-------RATLYE

Query:  EDESNIELPREFVEEQKAYFSEVDAFELPVEEAKSSDSE
        ED+SN+ELPREFVE+QK YFSEVDAFELPVEEAKSSDSE
Subjt:  EDESNIELPREFVEEQKAYFSEVDAFELPVEEAKSSDSE

A0A1S3C4N9 uncharacterized protein LOC103496604 isoform X2

1.1e-87

79.91

Show/hide

Query:  MESQKRNLRARKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEKKSKPILVSESTSVNLRASNPSSDFLPTETTSDFPPAEPNPSSDSLP
        MES KRNLRARKPLADCTNTILSSQS ASNFSASIKPRKRV KSAVKDV NN+KK +P+L SESTSVNLRASNPSS+FLP E TSD PPAEPNPS DS P
Subjt:  MESQKRNLRARKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEKKSKPILVSESTSVNLRASNPSSDFLPTETTSDFPPAEPNPSSDSLP

Query:  SEPSSSRLPTDVSTPLRRADLPSTSGTDSVSEPQSFYSRR-PMNKRKSVEIAVAPFIFSTASKIQTGVRKRDGYDSPSRARTVPCKK--RATLYEEDESN
        SEPSSSR PT+ STP R ADLPS+SGTD VSEPQ+ YSRR P NKRKSVE A+ PFI  TASKIQ G R RD  +SPS+ARTVPC K  RA+L+EED+SN
Subjt:  SEPSSSRLPTDVSTPLRRADLPSTSGTDSVSEPQSFYSRR-PMNKRKSVEIAVAPFIFSTASKIQTGVRKRDGYDSPSRARTVPCKK--RATLYEEDESN

Query:  IELPREFVEEQKAYFSEVDAFELPVEEAKSSDSE
        +ELPREFVE+QK YFSEVDAFELPVEEAKSSDSE
Subjt:  IELPREFVEEQKAYFSEVDAFELPVEEAKSSDSE

A0A1S4E175 uncharacterized protein LOC103496604 isoform X3

3.6e-89

80.6

Show/hide

Query:  MESQKRNLRARKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEKKSKPILVSESTSVNLRASNPSSDFLPTETTSDFPPAEPNPSSDSLP
        MES KRNLRARKPLADCTNTILSSQS ASNFSASIKPRKRV KSAVKDV NN+KK +P+L SESTSVNLRASNPSS+FLP E TSD PPAEPNPS DS P
Subjt:  MESQKRNLRARKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEKKSKPILVSESTSVNLRASNPSSDFLPTETTSDFPPAEPNPSSDSLP

Query:  SEPSSSRLPTDVSTPLRRADLPSTSGTDSVSEPQSFYSRR-PMNKRKSVEIAVAPFIFSTASKIQTGVRKRDGYDSPSRARTVPCKKRATLYEEDESNIE
        SEPSSSR PT+ STP R ADLPS+SGTD VSEPQ+ YSRR P NKRKSVE A+ PFI  TASKIQ G R RD  +SPS+ARTVPC KRA+L+EED+SN+E
Subjt:  SEPSSSRLPTDVSTPLRRADLPSTSGTDSVSEPQSFYSRR-PMNKRKSVEIAVAPFIFSTASKIQTGVRKRDGYDSPSRARTVPCKKRATLYEEDESNIE

Query:  LPREFVEEQKAYFSEVDAFELPVEEAKSSDSE
        LPREFVE+QK YFSEVDAFELPVEEAKSSDSE
Subjt:  LPREFVEEQKAYFSEVDAFELPVEEAKSSDSE

A0A5A7U9W2 Vitellogenin-2 isoform X1

1.1e-87

79.91

Show/hide

Query:  MESQKRNLRARKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEKKSKPILVSESTSVNLRASNPSSDFLPTETTSDFPPAEPNPSSDSLP
        MES KRNLRARKPLADCTNTILSSQS ASNFSASIKPRKRV KSAVKDV NN+KK +P+L SESTSVNLRASNPSS+FLP E TSD PPAEPNPS DS P
Subjt:  MESQKRNLRARKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEKKSKPILVSESTSVNLRASNPSSDFLPTETTSDFPPAEPNPSSDSLP

Query:  SEPSSSRLPTDVSTPLRRADLPSTSGTDSVSEPQSFYSRR-PMNKRKSVEIAVAPFIFSTASKIQTGVRKRDGYDSPSRARTVPCKK--RATLYEEDESN
        SEPSSSR PT+ STP R ADLPS+SGTD VSEPQ+ YSRR P NKRKSVE A+ PFI  TASKIQ G R RD  +SPS+ARTVPC K  RA+L+EED+SN
Subjt:  SEPSSSRLPTDVSTPLRRADLPSTSGTDSVSEPQSFYSRR-PMNKRKSVEIAVAPFIFSTASKIQTGVRKRDGYDSPSRARTVPCKK--RATLYEEDESN

Query:  IELPREFVEEQKAYFSEVDAFELPVEEAKSSDSE
        +ELPREFVE+QK YFSEVDAFELPVEEAKSSDSE
Subjt:  IELPREFVEEQKAYFSEVDAFELPVEEAKSSDSE

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G56250.1 unknown protein

5.0e-11

30.8

Show/hide

Query:  RKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEK-KSKPILVSESTSVNLRASNPSSDFLPTETTSDFPPAEPNPSSD-----SLPSEPS
        RKPLADCTNT+     S+   S+S+K     + S++K +V     K KP  V+ S +    AS P         T+D  P     S+D     S PS P 
Subjt:  RKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEK-KSKPILVSESTSVNLRASNPSSDFLPTETTSDFPPAEPNPSSD-----SLPSEPS

Query:  SSRLPTDVSTPLRRADLPSTSGTDSVSEPQSFYS--RRPMNKRKSVEIAVAPFIFSTASKIQ------TGVRKRDGYDSPSRA-RTVPCKKRATLYEEDE
        +SR    VS                 +EP S Y+  R+   +++S + + +    S A++I+      +G + R   ++  +  +  P K++ T+ +E E
Subjt:  SSRLPTDVSTPLRRADLPSTSGTDSVSEPQSFYS--RRPMNKRKSVEIAVAPFIFSTASKIQ------TGVRKRDGYDSPSRA-RTVPCKKRATLYEEDE

Query:  SNIELP-REFVEEQKAYFSEVDAFELPVEEAKSSDSE
          +    ++++E+QKAYF+E+DAFELPVEE  +SDS+
Subjt:  SNIELP-REFVEEQKAYFSEVDAFELPVEEAKSSDSE

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAATCTCAGAAACGAAATCTCAGAGCTCGAAAACCCCTCGCGGATTGTACAAATACCATCCTCTCCTCCCAATCTTCCGCTTCCAATTTCTCCGCTTCTATCAAACC
CCGCAAGCGTGTAATTAAGTCTGCGGTTAAAGATGTTGTCAACAATGAGAAGAAAAGCAAACCAATTCTTGTGTCTGAATCTACATCCGTTAATTTGCGAGCTTCAAACC
CTAGTTCTGATTTTCTTCCTACAGAAACTACCTCTGATTTTCCTCCTGCAGAGCCAAACCCTAGTTCTGACTCTCTTCCTTCAGAACCTAGTTCTAGTCGACTCCCTACG
GATGTCTCCACTCCTTTGCGGCGTGCTGATTTGCCCTCTACTTCAGGAACAGATAGTGTTTCGGAGCCCCAGTCATTCTACAGTCGAAGGCCTATGAATAAAAGGAAGAG
CGTTGAGATAGCAGTTGCACCATTTATTTTCTCTACCGCATCGAAAATCCAAACCGGGGTTAGAAAAAGAGATGGATACGATAGCCCATCCAGAGCGAGGACTGTTCCTT
GTAAAAAGCGCGCCACATTGTATGAGGAAGATGAGTCCAACATAGAGCTTCCACGGGAATTTGTTGAAGAGCAGAAAGCATATTTTTCAGAAGTAGATGCATTTGAACTA
CCAGTGGAGGAGGCTAAATCATCCGACTCGGAGTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MESQKRNLRARKPLADCTNTILSSQSSASNFSASIKPRKRVIKSAVKDVVNNEKKSKPILVSESTSVNLRASNPSSDFLPTETTSDFPPAEPNPSSDSLPSEPSSSRLPT
DVSTPLRRADLPSTSGTDSVSEPQSFYSRRPMNKRKSVEIAVAPFIFSTASKIQTGVRKRDGYDSPSRARTVPCKKRATLYEEDESNIELPREFVEEQKAYFSEVDAFEL
PVEEAKSSDSE

HG10018384 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome