; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10018465 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10018465
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Descriptionthylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic
Genome locationChr04:4416727..4418505
RNA-Seq ExpressionHG10018465
SyntenyHG10018465
Gene Ontology termsGO:0009534 - chloroplast thylakoid (cellular component)
InterPro domainsIPR001646 - Pentapeptide repeat
IPR044213 - Thylakoid lumenal 15kDa protein 1-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022133545.1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X1 [Momordica charantia]4.0e-10592.66Show/hide
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XP_023552471.1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-10391.74Show/hide
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XP_038883977.1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic [Benincasa hispida]2.2e-10386.92Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KA71 Uncharacterized protein1.6e-10291.28Show/hide
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A0A6J1BVJ8 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X12.0e-10592.66Show/hide
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A0A6J1GU31 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X11.4e-10390.83Show/hide
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A0A6J1GWM1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X24.8e-10491.28Show/hide
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A0A6J1JKT4 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X23.5e-10290.37Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B1WVN5 Pentapeptide repeat protein Rfr323.4e-1443.65Show/hide
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        L G+DFSGK+L    F  + L  +NF  A L GA F  + L GADL  ADL      L +   A+L+NA L  A+    T F  + I GADF+   L   
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        + + LC  ADGVNP TG +TRE+L C
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O22160 Thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic2.8e-7770.54Show/hide
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        L N SL  CC+ S+   +P +  P S S+H   +    Q          R++V S+GE  SK +  A +SASLF  DPALAFKGGGPYG GVTRGQDLSG
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        KDFSG+TLI+QDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLS+ADLRGADFSLANVTK NL+NANLEGA  TGNTSF+GS I GADFTDVPLR+DQR 
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P73709 Uncharacterized protein slr18192.0e-0637.07Show/hide
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        G DL G D SG TL         ++Q+ K        +IL +A+ +GA + G     ADL+ A+L +A+LR  D     + KA+LS ANL+GAL T + +
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Query:  FRGSTINGADFTDVPL
          G+ +NGAD  +  L
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Q8H1Q1 Thylakoid lumenal protein TL20.3, chloroplastic2.5e-0930.15Show/hide
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        N +++ + N       SA   T+   LSA+  +A   +A   G P  A +      TRG+            DLS    S +   + +F ++ +R+++F 
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        G+   GA    A    A+ S ADL         + +ANL+NA L  ++ T  +   G+ I GADF+D  +   Q++ LCK A G NP TG  TR++L C
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Q9SE95 FH protein interacting protein FIP23.1e-0737.84Show/hide
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        R  D  G  F    L + +F ++ LR A   G  L  A+  DA L G     ADLR A    A++T ANL  ANLEGA   G    N +F+G+ +  A  
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Query:  TDVPLREDQRE
          V LRE   E
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12250.1 Pentapeptide repeat-containing protein1.8e-1030.15Show/hide
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        N +++ + N       SA   T+   LSA+  +A   +A   G P  A +      TRG+            DLS    S +   + +F ++ +R+++F 
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Query:  GAKLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTINGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRETLLC
        G+   GA    A    A+ S ADL         + +ANL+NA L  ++ T  +   G+ I GADF+D  +   Q++ LCK A G NP TG  TR++L C
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AT1G12250.2 Pentapeptide repeat-containing protein1.8e-1033.33Show/hide
Query:  GPYGAGVTR---GQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGS
        G +G G        DLS    S +   + +F ++ +R+++F G+   GA    A    A+ S ADL         + +ANL+NA L  ++ T  +   G+
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Query:  TINGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRETLLC
         I GADF+D  +   Q++ LCK A G NP TG  TR++L C
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AT2G44920.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein5.2e-5867.38Show/hide
Query:  LLNASL--CCSTSRFPSRPHIPLPPSISAHSTPQVFNQQ------LEATRNLVLSVGESASKTTFLAFLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSG
        L N SL  CC+ S+   +P +  P S S+H   +    Q          R++V S+GE  SK +  A +SASLF  DPALAFKGGGPYG GVTRGQDLSG
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Query:  KDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTINGA
        KDFSG+TLI+QDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLS+ADLRGADFSLANVTK NL+NANLEGA  TGNTSF+GS I GA
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AT2G44920.2 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein2.0e-7870.54Show/hide
Query:  LLNASL--CCSTSRFPSRPHIPLPPSISAHSTPQVFNQQ------LEATRNLVLSVGESASKTTFLAFLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSG
        L N SL  CC+ S+   +P +  P S S+H   +    Q          R++V S+GE  SK +  A +SASLF  DPALAFKGGGPYG GVTRGQDLSG
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Query:  KDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTINGADFTDVPLREDQRE
        KDFSG+TLI+QDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLS+ADLRGADFSLANVTK NL+NANLEGA  TGNTSF+GS I GADFTDVPLR+DQR 
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Query:  YLCKVADGVNPTTGNATRETLLCD
        YLCKVADGVN TTGNATR+TLLC+
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AT5G55000.2 potassium channel tetramerisation domain-containing protein / pentapeptide repeat-containing protein2.2e-0837.84Show/hide
Query:  RGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATG----NTSFRGSTINGADF
        R  D  G  F    L + +F ++ LR A   G  L  A+  DA L G     ADLR A    A++T ANL  ANLEGA   G    N +F+G+ +  A  
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Query:  TDVPLREDQRE
          V LRE   E
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCTGCTCAACGCTTCGTTATGTTGTTCCACTTCCAGATTTCCTTCCAGACCTCACATTCCTCTTCCTCCCTCCATTTCCGCCCATTCTACGCCTCAGGTATTCAA
CCAACAACTGGAAGCTACGCGGAATTTGGTCCTTTCCGTCGGAGAATCCGCCTCAAAAACCACCTTCCTCGCTTTCCTTTCCGCCTCTTTGTTCCTCGCCGATCCTGCCC
TAGCTTTTAAGGGTGGAGGCCCTTATGGCGCTGGGGTCACTAGAGGTCAGGATCTCTCTGGGAAAGATTTCAGTGGGAAGACGTTAATCAAGCAAGATTTCAAAACGTCT
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TTCTTTGGCCAATGTTACCAAGGCAAATTTAAGCAATGCCAACTTAGAAGGTGCACTCGCCACAGGAAATACTTCTTTCCGTGGATCAACAATAAACGGAGCTGACTTCA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TAGCTTTTAAGGGTGGAGGCCCTTATGGCGCTGGGGTCACTAGAGGTCAGGATCTCTCTGGGAAAGATTTCAGTGGGAAGACGTTAATCAAGCAAGATTTCAAAACGTCT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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