; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10018499 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10018499
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionZinc finger protein 511
Genome locationChr04:4716246..4717912
RNA-Seq ExpressionHG10018499
SyntenyHG10018499
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR039258 - Zinc finger protein 511


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0056568.1 zinc finger protein 511 [Cucumis melo var. makuwa]2.4e-12480.68Show/hide
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KAG6602683.1 Zinc finger protein 511, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.9e-11876.95Show/hide
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XP_038885473.1 zinc finger protein 511 [Benincasa hispida]2.4e-12178.98Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LMY3 Uncharacterized protein9.1e-12279.66Show/hide
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A0A1S3B3Y4 zinc finger protein 5112.8e-12380Show/hide
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A0A5D3DLV5 Zinc finger protein 5111.1e-12480.68Show/hide
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A0A6J1E4J7 zinc finger protein 5111.4e-11776.61Show/hide
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Q6P0X2 Zinc finger protein 5113.5e-1425.62Show/hide
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Q7ZZ00 Zinc finger protein 5118.1e-1926.95Show/hide
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Q8NB15 Zinc finger protein 5111.2e-1427.13Show/hide
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Q9V574 Protein lethal(2)k102016.0e-0623.08Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G14140.1 zinc ion binding;nucleic acid binding;zinc ion binding1.3e-8355.81Show/hide
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        M V++  E  FPYW P +RRF PDSPFFASGNVERE+LAKQV LD TEDE   LH      +  I CPIVGC   LKSLD FEDHYN+RHTASCSVC RV
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        YPTSRLLS+H+SEAHD+FFQAKV+RGYD                                              MYECLVEGCGLKFK+YK+R +HL+DK
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Query:  HKFSASFEFFKKAHPSKKQRQKLHRKQAVQGREE-------TSEMEVE-KETIDGLISGVSKLSTSDSTPSTISFGRRHTRGLTFVPRSVQREKVSDSST
        HKF  +FEFFKK   SKK+R+KL R+   + + E       +  MEVE K ++DGL+S +S L+TSD+TPS +SFGRRH RGLTFVPRSV REK ++SS+
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Query:  A
        A
Subjt:  A


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AGAGATGA
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AGAGATGA
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