; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10018789 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10018789
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationChr04:8443081..8445706
RNA-Seq ExpressionHG10018789
SyntenyHG10018789
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004136915.2 uncharacterized protein LOC101209598 [Cucumis sativus]3.4e-8276.36Show/hide
Query:  MEEVKFDHESKEKIFEIFKEFMASVAKLEELGTLGNQLLSGIQQGLELLRRPPINRTSKLIENVIETNNTENLRSYIEAGCIDTHDAVQST---------
        MEEV+FDHESKEKIF+IFKEFMASVAKL+ELGTLG+QLLSG++QGLELLRRP IN TSKLIENVIE +NTENLRSYIEAGCI+THD  QST         
Subjt:  MEEVKFDHESKEKIFEIFKEFMASVAKLEELGTLGNQLLSGIQQGLELLRRPPINRTSKLIENVIETNNTENLRSYIEAGCIDTHDAVQST---------

Query:  -----KKSRSLINELEDLLNDVNIALETENPPCTSTVSDEGLELNEKEAI----KPDANEYALLMGIIKVMVKKNHRMQEKIISGLGLKSSSGELETYCL
             KK+RSLI+ELE L NDVNI LETENP C ST+SDE LEL+E+EA     KPDAN+YA+LMGI+KVM+KKNH MQEKIISGL LKSSSGELETYCL
Subjt:  -----KKSRSLINELEDLLNDVNIALETENPPCTSTVSDEGLELNEKEAI----KPDANEYALLMGIIKVMVKKNHRMQEKIISGLGLKSSSGELETYCL

Query:  MWSLRPYIDDEIMHRAWKLV
        MWSL+PYIDDEIM  AWKLV
Subjt:  MWSLRPYIDDEIMHRAWKLV

XP_008455091.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495347 isoform X3 [Cucumis melo]7.6e-8276.82Show/hide
Query:  MEEVKFDHESKEKIFEIFKEFMASVAKLEELGTLGNQLLSGIQQGLELLRRPPINRTSKLIENVIETNNTENLRSYIEAGCIDTHDAVQST---------
        MEEVKFDHESKEKIFEIFKEFMASVAKL+ELGT G+QLLSG++QGLELLRRP IN TSKLIENVIET+NTENLR+YIEAGCI+THD  QST         
Subjt:  MEEVKFDHESKEKIFEIFKEFMASVAKLEELGTLGNQLLSGIQQGLELLRRPPINRTSKLIENVIETNNTENLRSYIEAGCIDTHDAVQST---------

Query:  -----KKSRSLINELEDLLNDVNIALETENPPCTSTVSDEGLELNEKEAIKP----DANEYALLMGIIKVMVKKNHRMQEKIISGLGLKSSSGELETYCL
             KK+RSLI+ELE L NDVNI LETENP CTST+SDE LEL+E+EA  P    DAN+YALLMGI+KVM+KKNH MQEKIISGL LKSSSGELETYCL
Subjt:  -----KKSRSLINELEDLLNDVNIALETENPPCTSTVSDEGLELNEKEAIKP----DANEYALLMGIIKVMVKKNHRMQEKIISGLGLKSSSGELETYCL

Query:  MWSLRPYIDDEIMHRAWKLV
        MWSL+PYIDD IM  AWKLV
Subjt:  MWSLRPYIDDEIMHRAWKLV

XP_016901720.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495347 isoform X2 [Cucumis melo]7.1e-8074.78Show/hide
Query:  MEEVKFDHESKEKIFEIFKEFMASVAKLEELGTLGNQLLSGIQQGL------ELLRRPPINRTSKLIENVIETNNTENLRSYIEAGCIDTHDAVQST---
        MEEVKFDHESKEKIFEIFKEFMASVAKL+ELGT G+QLLSG++QGL      ELLRRP IN TSKLIENVIET+NTENLR+YIEAGCI+THD  QST   
Subjt:  MEEVKFDHESKEKIFEIFKEFMASVAKLEELGTLGNQLLSGIQQGL------ELLRRPPINRTSKLIENVIETNNTENLRSYIEAGCIDTHDAVQST---

Query:  -----------KKSRSLINELEDLLNDVNIALETENPPCTSTVSDEGLELNEKEAIKP----DANEYALLMGIIKVMVKKNHRMQEKIISGLGLKSSSGE
                   KK+RSLI+ELE L NDVNI LETENP CTST+SDE LEL+E+EA  P    DAN+YALLMGI+KVM+KKNH MQEKIISGL LKSSSGE
Subjt:  -----------KKSRSLINELEDLLNDVNIALETENPPCTSTVSDEGLELNEKEAIKP----DANEYALLMGIIKVMVKKNHRMQEKIISGLGLKSSSGE

Query:  LETYCLMWSLRPYIDDEIMHRAWKLV
        LETYCLMWSL+PYIDD IM  AWKLV
Subjt:  LETYCLMWSLRPYIDDEIMHRAWKLV

XP_038887975.1 uncharacterized protein LOC120077932 isoform X1 [Benincasa hispida]2.6e-9083.18Show/hide
Query:  MEEVKFDHESKEKIFEIFKEFMASVAKLEELGTLGNQLLSGIQQGLELLRRPPINRTSKLIENVIETNNTENLRSYIEAGCIDTHDAVQST---------
        MEEVKFD +SKEKIFEIFKEFMASVAKLEELGTLG+QLLSGIQQGLELLRRP INRTSKLIENVIETNNTE+LRSYIEAGCI+THDAVQST         
Subjt:  MEEVKFDHESKEKIFEIFKEFMASVAKLEELGTLGNQLLSGIQQGLELLRRPPINRTSKLIENVIETNNTENLRSYIEAGCIDTHDAVQST---------

Query:  -----KKSRSLINELEDLLNDVNIALETENPPCTSTVSDEGLELNEKEAI----KPDANEYALLMGIIKVMVKKNHRMQEKIISGLGLKSSSGELETYCL
             KK+RS+I++LE LLNDVNIALETENPPC+STVSDE LE NE EA     KPDANEYALLMGIIKVMVKKNHRMQEKIISGL LKSSSGELETYCL
Subjt:  -----KKSRSLINELEDLLNDVNIALETENPPCTSTVSDEGLELNEKEAI----KPDANEYALLMGIIKVMVKKNHRMQEKIISGLGLKSSSGELETYCL

Query:  MWSLRPYIDDEIMHRAWKLV
        MWSL+PYIDDEIMH+AWKLV
Subjt:  MWSLRPYIDDEIMHRAWKLV

XP_038887977.1 uncharacterized protein LOC120077932 isoform X2 [Benincasa hispida]4.2e-8082.41Show/hide
Query:  MASVAKLEELGTLGNQLLSGIQQGLELLRRPPINRTSKLIENVIETNNTENLRSYIEAGCIDTHDAVQST--------------KKSRSLINELEDLLND
        MASVAKLEELGTLG+QLLSGIQQGLELLRRP INRTSKLIENVIETNNTE+LRSYIEAGCI+THDAVQST              KK+RS+I++LE LLND
Subjt:  MASVAKLEELGTLGNQLLSGIQQGLELLRRPPINRTSKLIENVIETNNTENLRSYIEAGCIDTHDAVQST--------------KKSRSLINELEDLLND

Query:  VNIALETENPPCTSTVSDEGLELNEKEAI----KPDANEYALLMGIIKVMVKKNHRMQEKIISGLGLKSSSGELETYCLMWSLRPYIDDEIMHRAWKLV
        VNIALETENPPC+STVSDE LE NE EA     KPDANEYALLMGIIKVMVKKNHRMQEKIISGL LKSSSGELETYCLMWSL+PYIDDEIMH+AWKLV
Subjt:  VNIALETENPPCTSTVSDEGLELNEKEAI----KPDANEYALLMGIIKVMVKKNHRMQEKIISGLGLKSSSGELETYCLMWSLRPYIDDEIMHRAWKLV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K2B6 Uncharacterized protein1.7e-8276.36Show/hide
Query:  MEEVKFDHESKEKIFEIFKEFMASVAKLEELGTLGNQLLSGIQQGLELLRRPPINRTSKLIENVIETNNTENLRSYIEAGCIDTHDAVQST---------
        MEEV+FDHESKEKIF+IFKEFMASVAKL+ELGTLG+QLLSG++QGLELLRRP IN TSKLIENVIE +NTENLRSYIEAGCI+THD  QST         
Subjt:  MEEVKFDHESKEKIFEIFKEFMASVAKLEELGTLGNQLLSGIQQGLELLRRPPINRTSKLIENVIETNNTENLRSYIEAGCIDTHDAVQST---------

Query:  -----KKSRSLINELEDLLNDVNIALETENPPCTSTVSDEGLELNEKEAI----KPDANEYALLMGIIKVMVKKNHRMQEKIISGLGLKSSSGELETYCL
             KK+RSLI+ELE L NDVNI LETENP C ST+SDE LEL+E+EA     KPDAN+YA+LMGI+KVM+KKNH MQEKIISGL LKSSSGELETYCL
Subjt:  -----KKSRSLINELEDLLNDVNIALETENPPCTSTVSDEGLELNEKEAI----KPDANEYALLMGIIKVMVKKNHRMQEKIISGLGLKSSSGELETYCL

Query:  MWSLRPYIDDEIMHRAWKLV
        MWSL+PYIDDEIM  AWKLV
Subjt:  MWSLRPYIDDEIMHRAWKLV

A0A1S3C033 uncharacterized protein LOC103495347 isoform X11.2e-7768.15Show/hide
Query:  MEEVKFDHESKEKIFEIFKEFMASVAKLEELGTLGNQLLSGIQQGL----------------------------ELLRRPPINRTSKLIENVIETNNTEN
        MEEVKFDHESKEKIFEIFKEFMASVAKL+ELGT G+QLLSG++QGL                            ELLRRP IN TSKLIENVIET+NTEN
Subjt:  MEEVKFDHESKEKIFEIFKEFMASVAKLEELGTLGNQLLSGIQQGL----------------------------ELLRRPPINRTSKLIENVIETNNTEN

Query:  LRSYIEAGCIDTHDAVQST--------------KKSRSLINELEDLLNDVNIALETENPPCTSTVSDEGLELNEKEAIKP----DANEYALLMGIIKVMV
        LR+YIEAGCI+THD  QST              KK+RSLI+ELE L NDVNI LETENP CTST+SDE LEL+E+EA  P    DAN+YALLMGI+KVM+
Subjt:  LRSYIEAGCIDTHDAVQST--------------KKSRSLINELEDLLNDVNIALETENPPCTSTVSDEGLELNEKEAIKP----DANEYALLMGIIKVMV

Query:  KKNHRMQEKIISGLGLKSSSGELETYCLMWSLRPYIDDEIMHRAWKLV
        KKNH MQEKIISGL LKSSSGELETYCLMWSL+PYIDD IM  AWKLV
Subjt:  KKNHRMQEKIISGLGLKSSSGELETYCLMWSLRPYIDDEIMHRAWKLV

A0A1S3C0U3 uncharacterized protein LOC103495347 isoform X33.7e-8276.82Show/hide
Query:  MEEVKFDHESKEKIFEIFKEFMASVAKLEELGTLGNQLLSGIQQGLELLRRPPINRTSKLIENVIETNNTENLRSYIEAGCIDTHDAVQST---------
        MEEVKFDHESKEKIFEIFKEFMASVAKL+ELGT G+QLLSG++QGLELLRRP IN TSKLIENVIET+NTENLR+YIEAGCI+THD  QST         
Subjt:  MEEVKFDHESKEKIFEIFKEFMASVAKLEELGTLGNQLLSGIQQGLELLRRPPINRTSKLIENVIETNNTENLRSYIEAGCIDTHDAVQST---------

Query:  -----KKSRSLINELEDLLNDVNIALETENPPCTSTVSDEGLELNEKEAIKP----DANEYALLMGIIKVMVKKNHRMQEKIISGLGLKSSSGELETYCL
             KK+RSLI+ELE L NDVNI LETENP CTST+SDE LEL+E+EA  P    DAN+YALLMGI+KVM+KKNH MQEKIISGL LKSSSGELETYCL
Subjt:  -----KKSRSLINELEDLLNDVNIALETENPPCTSTVSDEGLELNEKEAIKP----DANEYALLMGIIKVMVKKNHRMQEKIISGLGLKSSSGELETYCL

Query:  MWSLRPYIDDEIMHRAWKLV
        MWSL+PYIDD IM  AWKLV
Subjt:  MWSLRPYIDDEIMHRAWKLV

A0A1S4E157 uncharacterized protein LOC103495347 isoform X23.4e-8074.78Show/hide
Query:  MEEVKFDHESKEKIFEIFKEFMASVAKLEELGTLGNQLLSGIQQGL------ELLRRPPINRTSKLIENVIETNNTENLRSYIEAGCIDTHDAVQST---
        MEEVKFDHESKEKIFEIFKEFMASVAKL+ELGT G+QLLSG++QGL      ELLRRP IN TSKLIENVIET+NTENLR+YIEAGCI+THD  QST   
Subjt:  MEEVKFDHESKEKIFEIFKEFMASVAKLEELGTLGNQLLSGIQQGL------ELLRRPPINRTSKLIENVIETNNTENLRSYIEAGCIDTHDAVQST---

Query:  -----------KKSRSLINELEDLLNDVNIALETENPPCTSTVSDEGLELNEKEAIKP----DANEYALLMGIIKVMVKKNHRMQEKIISGLGLKSSSGE
                   KK+RSLI+ELE L NDVNI LETENP CTST+SDE LEL+E+EA  P    DAN+YALLMGI+KVM+KKNH MQEKIISGL LKSSSGE
Subjt:  -----------KKSRSLINELEDLLNDVNIALETENPPCTSTVSDEGLELNEKEAIKP----DANEYALLMGIIKVMVKKNHRMQEKIISGLGLKSSSGE

Query:  LETYCLMWSLRPYIDDEIMHRAWKLV
        LETYCLMWSL+PYIDD IM  AWKLV
Subjt:  LETYCLMWSLRPYIDDEIMHRAWKLV

A0A6J1D9B8 uncharacterized protein LOC1110187942.9e-7974.55Show/hide
Query:  MEEVKFDHESKEKIFEIFKEFMASVAKLEELGTLGNQLLSGIQQGLELLRRPPINRTSKLIENVIETNNTENLRSYIEAGCIDTHDAVQST---------
        MEEV FDH SKEKIF+IF+EFMASVAKLEELGTLG++ LSG QQGLELLRRP INR+SKLIE+VIETNNTENL+SY EAGCI+THD VQST         
Subjt:  MEEVKFDHESKEKIFEIFKEFMASVAKLEELGTLGNQLLSGIQQGLELLRRPPINRTSKLIENVIETNNTENLRSYIEAGCIDTHDAVQST---------

Query:  -----KKSRSLINELEDLLNDVNIALETENPPCTSTVSDEGLELNEKEAIKP----DANEYALLMGIIKVMVKKNHRMQEKIISGLGLKSSSGELETYCL
             KK+RSLI+ELE LLN+ NIALETEN P  STVSDE +EL+E+EA  P    DANEYAL MGIIK MVKK++ MQEKIISGL LKSSSGELETYC+
Subjt:  -----KKSRSLINELEDLLNDVNIALETENPPCTSTVSDEGLELNEKEAIKP----DANEYALLMGIIKVMVKKNHRMQEKIISGLGLKSSSGELETYCL

Query:  MWSLRPYIDDEIMHRAWKLV
        MWSLRPYIDDEI+ RAWKLV
Subjt:  MWSLRPYIDDEIMHRAWKLV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G49645.1 unknown protein4.2e-4647.22Show/hide
Query:  ESKEKIFEIFKEFMASVAKLEELGTLGNQLLSGIQQGLELLRRPPINRTSKLIENVIETNNTENLRSYIEAGCIDTHDAVQSTK--------------KS
        E K+KI EIFK+FM  + +LEELG   N  L   QQGL  L+RPPI  +SKLIEN+I+ N T  L+SYIEAGCI+ HDA QST+              K+
Subjt:  ESKEKIFEIFKEFMASVAKLEELGTLGNQLLSGIQQGLELLRRPPINRTSKLIENVIETNNTENLRSYIEAGCIDTHDAVQSTK--------------KS

Query:  RSLINELEDLLNDVNIALETENPPCTSTVSDEGLEL----NEKEAIK----PDANEYALLMGIIKVMVKKNHRMQEKIISGLGLKSSSGELETYCLMWSL
        ++L+ ELE L ++  +A+E+         S +GL+      E E ++    P+  EYA L+ +I  M+K+N+ MQ+KI+  L LKSSSGELETY LMWSL
Subjt:  RSLINELEDLLNDVNIALETENPPCTSTVSDEGLEL----NEKEAIK----PDANEYALLMGIIKVMVKKNHRMQEKIISGLGLKSSSGELETYCLMWSL

Query:  RPYIDDEIMHRAWKLV
        RP+++DEI++RAWK +
Subjt:  RPYIDDEIMHRAWKLV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGAAGTTAAATTTGATCACGAGTCAAAAGAGAAGATTTTTGAGATTTTTAAAGAGTTCATGGCTAGTGTTGCAAAGCTCGAGGAATTGGGGACTTTAGGAAACCA
GTTACTTTCTGGCATTCAGCAAGGACTTGAGCTTCTTCGACGACCTCCGATAAATAGAACATCAAAGTTGATTGAGAATGTCATTGAAACGAACAATACGGAGAATCTTA
GATCATACATTGAAGCTGGATGCATTGATACTCATGATGCTGTGCAAAGTACAAAGAAGTCAAGGAGCCTAATCAACGAACTTGAGGACCTACTCAATGATGTCAATATT
GCACTGGAAACTGAAAATCCCCCGTGCACTTCAACAGTTTCAGATGAAGGTTTAGAATTGAATGAAAAAGAAGCAATTAAACCTGATGCTAATGAATATGCTTTATTAAT
GGGGATCATCAAAGTTATGGTCAAGAAAAACCATAGAATGCAGGAGAAGATTATTTCTGGTTTAGGTCTCAAATCATCCTCAGGGGAACTTGAAACATACTGCCTAATGT
GGTCTTTACGACCATATATCGACGATGAAATAATGCATCGGGCTTGGAAGCTTGTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAGAAGTTAAATTTGATCACGAGTCAAAAGAGAAGATTTTTGAGATTTTTAAAGAGTTCATGGCTAGTGTTGCAAAGCTCGAGGAATTGGGGACTTTAGGAAACCA
GTTACTTTCTGGCATTCAGCAAGGACTTGAGCTTCTTCGACGACCTCCGATAAATAGAACATCAAAGTTGATTGAGAATGTCATTGAAACGAACAATACGGAGAATCTTA
GATCATACATTGAAGCTGGATGCATTGATACTCATGATGCTGTGCAAAGTACAAAGAAGTCAAGGAGCCTAATCAACGAACTTGAGGACCTACTCAATGATGTCAATATT
GCACTGGAAACTGAAAATCCCCCGTGCACTTCAACAGTTTCAGATGAAGGTTTAGAATTGAATGAAAAAGAAGCAATTAAACCTGATGCTAATGAATATGCTTTATTAAT
GGGGATCATCAAAGTTATGGTCAAGAAAAACCATAGAATGCAGGAGAAGATTATTTCTGGTTTAGGTCTCAAATCATCCTCAGGGGAACTTGAAACATACTGCCTAATGT
GGTCTTTACGACCATATATCGACGATGAAATAATGCATCGGGCTTGGAAGCTTGTTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEEVKFDHESKEKIFEIFKEFMASVAKLEELGTLGNQLLSGIQQGLELLRRPPINRTSKLIENVIETNNTENLRSYIEAGCIDTHDAVQSTKKSRSLINELEDLLNDVNI
ALETENPPCTSTVSDEGLELNEKEAIKPDANEYALLMGIIKVMVKKNHRMQEKIISGLGLKSSSGELETYCLMWSLRPYIDDEIMHRAWKLV