| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG7022543.1 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 4.6e-93 | 86.83 | Show/hide |
Query: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSD
TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RDDY+DRDYRR RSRSRSRSLD+SD
Subjt: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSD
Query: RDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP------------SPRRSPSPRRSLSPRRSP
RDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RSRS SRSRGRSRSV+S SPGRRSP SPRRS SP+RSLSPRRSP
Subjt: RDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP------------SPRRSPSPRRSLSPRRSP
Query: SPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
SPRGESPERNG+GG RSPT RSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
Subjt: SPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| XP_004136874.2 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucumis sativus] | 8.3e-103 | 95.63 | Show/hide |
Query: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSD
TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDY+D+DYRRRSRSRSRSRSLDK+D
Subjt: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSD
Query: RDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGN
RDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRS SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPR ESPERNGN
Subjt: RDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGN
Query: GGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
G RSPTSRSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: GGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
|
|
| XP_008455209.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucumis melo] | 1.7e-103 | 96.07 | Show/hide |
Query: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSD
TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRR+RDDY+DRDYRRRSRSRSRSRSLD+SD
Subjt: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSD
Query: RDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGN
RDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRS SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPR ESPERNGN
Subjt: RDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGN
Query: GGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
GG RSPTSRSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: GGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
|
|
| XP_022927926.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucurbita moschata] | 1.6e-93 | 87.24 | Show/hide |
Query: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSD
TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RDDY+DRDYRR RSRSRSRSLD+SD
Subjt: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSD
Query: RDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR------------RSLSPRRSP
RDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RSRS SRSRGRSRSV+S SPGRRSPSPRRS SPR RSLSPRRSP
Subjt: RDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR------------RSLSPRRSP
Query: SPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
SPRGESPERNG+GG RSPT RSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
Subjt: SPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| XP_038888048.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Benincasa hispida] | 4.1e-102 | 93.56 | Show/hide |
Query: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSD
TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRY+SRSRSPRRR+RDDY+DRDYRRRSRSRSRSRS D+SD
Subjt: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSD
Query: RDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDER--RSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPERN
RDRRGRE+ERER+YRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDER RSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGR+SPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRG SPERN
Subjt: RDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDER--RSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPERN
Query: GNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
GNGG RSPTSRSVSPRG+P DSRSPSPQNSDVD
Subjt: GNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0K7C0 RRM domain-containing protein | 4.0e-103 | 95.63 | Show/hide |
Query: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSD
TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDY+D+DYRRRSRSRSRSRSLDK+D
Subjt: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSD
Query: RDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGN
RDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRS SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPR ESPERNGN
Subjt: RDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGN
Query: GGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
G RSPTSRSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: GGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
|
|
| A0A1S3C0I4 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 8.1e-104 | 96.07 | Show/hide |
Query: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSD
TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRR+RDDY+DRDYRRRSRSRSRSRSLD+SD
Subjt: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSD
Query: RDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGN
RDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRS SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPR ESPERNGN
Subjt: RDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGN
Query: GGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
GG RSPTSRSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: GGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
|
|
| A0A6J1CKN2 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 6.4e-93 | 89.7 | Show/hide |
Query: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSD
TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAF K RYRSRSRSPRRR+RDD +DRDYRRRSRSRSRSRSLD+SD
Subjt: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSD
Query: RDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR--SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPERN
RDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR SRS+SRG+SRSVDS SPG RRS SPRRSLSP+RSPSPRGESP RN
Subjt: RDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR--SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPRRSLSPRRSPSPRGESPERN
Query: GNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
G+GG R+PT RSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
Subjt: GNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| A0A6J1EIV3 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 7.6e-94 | 87.24 | Show/hide |
Query: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSD
TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RDDY+DRDYRR RSRSRSRSLD+SD
Subjt: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSD
Query: RDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR------------RSLSPRRSP
RDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RSRS SRSRGRSRSV+S SPGRRSPSPRRS SPR RSLSPRRSP
Subjt: RDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR------------RSLSPRRSP
Query: SPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
SPRGESPERNG+GG RSPT RSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
Subjt: SPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| A0A6J1JE82 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 4.6e-91 | 83.94 | Show/hide |
Query: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSD
TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RD+Y+DRDYRR RSRSRSRSLD+SD
Subjt: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSD
Query: RDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR------------------RSL
RDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RSRS SRSRGRSRSV+S SPGRRSPSPRRS SPR RSL
Subjt: RDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRRSPSPR------------------RSL
Query: SPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
SPRRSPSPRGESPERNG+GG RSPT RSVSPRGQ ADSRSPSPQNSDV+
Subjt: SPRRSPSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 2.2e-13 | 44.44 | Show/hide |
Query: WTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLD
+T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++ +G + S Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS
Subjt: WTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLD
Query: KSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSPSPRG
+S R R R + R R R RSRS SK R R + S SRSRSRSR RSRS RSP P R S S RS SP +SP G
Subjt: KSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSPSPRG
|
|
| Q01130 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 8.3e-13 | 43.94 | Show/hide |
Query: WTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLD
+T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++ +G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS
Subjt: WTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLD
Query: KSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSPSPRG
+S R R R + R R R RSRS SK R R + S SRSRSRSR RSRS RSP P R S S RS SP +SP G
Subjt: KSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSPSPRG
|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 8.3e-13 | 43.94 | Show/hide |
Query: WTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLD
+T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++ +G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS
Subjt: WTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLD
Query: KSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSPSPRG
+S R R R + R R R RSRS SK R R + S SRSRSRSR RSRS RSP P R S S RS SP +SP G
Subjt: KSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSPSPRG
|
|
| Q62093 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 8.3e-13 | 43.94 | Show/hide |
Query: WTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLD
+T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++ +G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS
Subjt: WTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLD
Query: KSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSPSPRG
+S R R R + R R R RSRS SK R R + S SRSRSRSR RSRS RSP P R S S RS SP +SP G
Subjt: KSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP---RRSPSPRRSLSPRRSPSPRG
|
|
| Q9FMG4 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 1.1e-38 | 55.13 | Show/hide |
Query: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDD
TGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDD
Subjt: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDD
Query: YKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP-------
Y+++DYR+RSRSRS DRR R E++RD+RRR+RS R SPD K R RGRYD+E RS SRS S S R RS S SP + SP
Subjt: YKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP-------
Query: --SPRRSPSPRRSLSPR----RSPSPRGE-SPERNGNGGRRSPTSRSVSP-RGQPADSRSPSP
S RSPSPRRSLSPR + SP E SPER N RSP+ S +P R A SRS SP
Subjt: --SPRRSPSPRRSLSPR----RSPSPRGE-SPERNGNGGRRSPTSRSVSP-RGQPADSRSPSP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 7.0e-07 | 38.93 | Show/hide |
Query: FWTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDK
++TGD RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+ R + R R R + RD RRR+ R SRS +
Subjt: FWTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDK
Query: SDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGR---RSPSPRRSPSPR--RSLSPRRS
S RRGR R R DY R RSISPR D + R D SR RS + RG+SRS+ S SP R RSP RSPSP+ RS+SPRRS
Subjt: SDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGR---RSPSPRRSPSPR--RSLSPRRS
Query: PSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
S SP R+ RSP S +PA SRS SP D
Subjt: PSPRGESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 6.3e-08 | 38.75 | Show/hide |
Query: DSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRD
D RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+ N ++ + + E SR+R R R+P R + SRSR S
Subjt: DSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRD
Query: RRGRERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGR---RSPSPRRSPSPR--RSLSPRRSPSPR
RRGR R R DY R RSISPR D + R D SR RS + RG+SRS+ S SP R RSP RSPSP+ RS+SPRRS S
Subjt: RRGRERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGR---RSPSPRRSPSPR--RSLSPRRSPSPR
Query: GESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
SP R+ RSP S +PA SRS SP D
Subjt: GESPERNGNGGRRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| AT5G64200.1 ortholog of human splicing factor SC35 | 8.1e-40 | 55.13 | Show/hide |
Query: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDD
TGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDD
Subjt: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDD
Query: YKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP-------
Y+++DYR+RSRSRS DRR R E++RD+RRR+RS R SPD K R RGRYD+E RS SRS S S R RS S SP + SP
Subjt: YKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP-------
Query: --SPRRSPSPRRSLSPR----RSPSPRGE-SPERNGNGGRRSPTSRSVSP-RGQPADSRSPSP
S RSPSPRRSLSPR + SP E SPER N RSP+ S +P R A SRS SP
Subjt: --SPRRSPSPRRSLSPR----RSPSPRGE-SPERNGNGGRRSPTSRSVSP-RGQPADSRSPSP
|
|
| AT5G64200.2 ortholog of human splicing factor SC35 | 8.1e-40 | 55.13 | Show/hide |
Query: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDD
TGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDD
Subjt: TGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDD
Query: YKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP-------
Y+++DYR+RSRSRS DRR R E++RD+RRR+RS R SPD K R RGRYD+E RS SRS S S R RS S SP + SP
Subjt: YKDRDYRRRSRSRSRSRSLDKSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP-------
Query: --SPRRSPSPRRSLSPR----RSPSPRGE-SPERNGNGGRRSPTSRSVSP-RGQPADSRSPSP
S RSPSPRRSLSPR + SP E SPER N RSP+ S +P R A SRS SP
Subjt: --SPRRSPSPRRSLSPR----RSPSPRGE-SPERNGNGGRRSPTSRSVSP-RGQPADSRSPSP
|
|
