CuGenDBv2

Gene ID	HG10018991
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	proline-rich extensin-like protein EPR1 isoform X1
Genome location	Chr04:13377210..13377548
RNA-Seq Expression	HG10018991
Synteny	HG10018991
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_022963537.1 proline-rich extensin-like protein EPR1 isoform X2 [Cucurbita moschata]

1.4e-24

66.07

Show/hide

Query:  MASPPRPIISLIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNISPIASPPRPNISPTTLPPRPNISPIASPPPPVISPLALPPRPNISPIAPPPRPIISPM
        MASPPRPI+   ASPPRP+I P+A P R I PP+  PPRP+I P+ASPPRP ISP TLPPRPNI+P+A PP P++ P+  PPRP+I P+A PPRPIISP 
Subjt:  MASPPRPIISLIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNISPIASPPRPNISPTTLPPRPNISPIASPPPPVISPLALPPRPNISPIAPPPRPIISPM

Query:  ASPPRPNISPIA
          PPRPNI+P+A
Subjt:  ASPPRPNISPIA

XP_022967601.1 proline-rich extensin-like protein EPR1 isoform X1 [Cucurbita maxima]

1.1e-24

67.86

Show/hide

Query:  MASPPRPIISLIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNISPIASPPRPNISPTTLPPRPNISPIASPPPPVISPLALPPRPNISPIAPPPRPIISPM
        +ASPP+P I  IA PPRP I P+ASP R INPP   PPRP+  PIASPPRP ISP TLPPRPNI P+ASPP P++ P+A PPRP+I P+A PPRPIISP 
Subjt:  MASPPRPIISLIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNISPIASPPRPNISPTTLPPRPNISPIASPPPPVISPLALPPRPNISPIAPPPRPIISPM

Query:  ASPPRPNISPIA
          PPRPNI P+A
Subjt:  ASPPRPNISPIA

XP_023554788.1 proline-rich extensin-like protein EPR1 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

1.1e-24

70.91

Show/hide

Query:  MASPPRPIISLIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNISPIASPPRPNISPTTLPPRPNISPIASPPPPVISPLALPPRPNISPIAPPPRPIISPM
        MASPPRPIIS    PPRP I P+ASP R I PP+A PPRP+I P+ASPPRP ISP TLPPRPNI P+ASPP P++ P A PPRP+  PIA PPR II PM
Subjt:  MASPPRPIISLIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNISPIASPPRPNISPTTLPPRPNISPIASPPPPVISPLALPPRPNISPIAPPPRPIISPM

Query:  ASPPRPNISP
        ASPPRP ISP
Subjt:  ASPPRPNISP

XP_023554789.1 proline-rich extensin-like protein EPR1 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

1.1e-24

70.91

Show/hide

Query:  MASPPRPIISLIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNISPIASPPRPNISPTTLPPRPNISPIASPPPPVISPLALPPRPNISPIAPPPRPIISPM
        MASPPRPIIS    PPRP I P+ASP R I PP+A PPRP+I P+ASPPRP ISP TLPPRPNI P+ASPP P++ P A PPRP+  PIA PPR II PM
Subjt:  MASPPRPIISLIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNISPIASPPRPNISPTTLPPRPNISPIASPPPPVISPLALPPRPNISPIAPPPRPIISPM

Query:  ASPPRPNISP
        ASPPRP ISP
Subjt:  ASPPRPNISP

XP_023554790.1 extensin-like isoform X3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

1.1e-24

70.91

Show/hide

Query:  MASPPRPIISLIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNISPIASPPRPNISPTTLPPRPNISPIASPPPPVISPLALPPRPNISPIAPPPRPIISPM
        MASPPRPIIS    PPRP I P+ASP R I PP+A PPRP+I P+ASPPRP ISP TLPPRPNI P+ASPP P++ P A PPRP+  PIA PPR II PM
Subjt:  MASPPRPIISLIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNISPIASPPRPNISPTTLPPRPNISPIASPPPPVISPLALPPRPNISPIAPPPRPIISPM

Query:  ASPPRPNISP
        ASPPRP ISP
Subjt:  ASPPRPNISP

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A6J1HFI1 proline-rich extensin-like protein EPR1 isoform X2

6.7e-25

66.07

Show/hide

Query:  MASPPRPIISLIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNISPIASPPRPNISPTTLPPRPNISPIASPPPPVISPLALPPRPNISPIAPPPRPIISPM
        MASPPRPI+   ASPPRP+I P+A P R I PP+  PPRP+I P+ASPPRP ISP TLPPRPNI+P+A PP P++ P+  PPRP+I P+A PPRPIISP 
Subjt:  MASPPRPIISLIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNISPIASPPRPNISPTTLPPRPNISPIASPPPPVISPLALPPRPNISPIAPPPRPIISPM

Query:  ASPPRPNISPIA
          PPRPNI+P+A
Subjt:  ASPPRPNISPIA

A0A6J1HGC8 proline-rich extensin-like protein EPR1 isoform X1

6.7e-25

66.07

Show/hide

Query:  MASPPRPIISLIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNISPIASPPRPNISPTTLPPRPNISPIASPPPPVISPLALPPRPNISPIAPPPRPIISPM
        MASPPRPI+   ASPPRP+I P+A P R I PP+  PPRP+I P+ASPPRP ISP TLPPRPNI+P+A PP P++ P+  PPRP+I P+A PPRPIISP 
Subjt:  MASPPRPIISLIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNISPIASPPRPNISPTTLPPRPNISPIASPPPPVISPLALPPRPNISPIAPPPRPIISPM

Query:  ASPPRPNISPIA
          PPRPNI+P+A
Subjt:  ASPPRPNISPIA

A0A6J1HIA7 proline-rich extensin-like protein EPR1 isoform X5

6.7e-25

66.07

Show/hide

Query:  MASPPRPIISLIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNISPIASPPRPNISPTTLPPRPNISPIASPPPPVISPLALPPRPNISPIAPPPRPIISPM
        MASPPRPI+   ASPPRP+I P+A P R I PP+  PPRP+I P+ASPPRP ISP TLPPRPNI+P+A PP P++ P+  PPRP+I P+A PPRPIISP 
Subjt:  MASPPRPIISLIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNISPIASPPRPNISPTTLPPRPNISPIASPPPPVISPLALPPRPNISPIAPPPRPIISPM

Query:  ASPPRPNISPIA
          PPRPNI+P+A
Subjt:  ASPPRPNISPIA

A0A6J1HKG7 proline-rich extensin-like protein EPR1 isoform X4

6.7e-25

66.07

Show/hide

Query:  MASPPRPIISLIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNISPIASPPRPNISPTTLPPRPNISPIASPPPPVISPLALPPRPNISPIAPPPRPIISPM
        MASPPRPI+   ASPPRP+I P+A P R I PP+  PPRP+I P+ASPPRP ISP TLPPRPNI+P+A PP P++ P+  PPRP+I P+A PPRPIISP 
Subjt:  MASPPRPIISLIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNISPIASPPRPNISPTTLPPRPNISPIASPPPPVISPLALPPRPNISPIAPPPRPIISPM

Query:  ASPPRPNISPIA
          PPRPNI+P+A
Subjt:  ASPPRPNISPIA

A0A6J1HSM4 proline-rich extensin-like protein EPR1 isoform X1

5.1e-25

67.86

Show/hide

Query:  MASPPRPIISLIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNISPIASPPRPNISPTTLPPRPNISPIASPPPPVISPLALPPRPNISPIAPPPRPIISPM
        +ASPP+P I  IA PPRP I P+ASP R INPP   PPRP+  PIASPPRP ISP TLPPRPNI P+ASPP P++ P+A PPRP+I P+A PPRPIISP 
Subjt:  MASPPRPIISLIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNISPIASPPRPNISPTTLPPRPNISPIASPPPPVISPLALPPRPNISPIAPPPRPIISPM

Query:  ASPPRPNISPIA
          PPRPNI P+A
Subjt:  ASPPRPNISPIA

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q9FM99 Alpha carbonic anhydrase 8

3.7e-04

35.58

Show/hide

Query:  PPRPIISLIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNISPIASPPRPNISPTTLPPRPNISPIASPPPPVISPLALPPRPNISPIAPPPRPIISPMASP
        PP+P  +   +PP+P  +P  +P +    P   PP+P  +P  +PP+P  +P   PP+P   P  +PP P  +P   PP+P  +P AP P P   P  +P
Subjt:  PPRPIISLIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNISPIASPPRPNISPTTLPPRPNISPIASPPPPVISPLALPPRPNISPIAPPPRPIISPMASP

Query:  -PRP
         P P
Subjt:  -PRP

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G15880.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein

2.9e-04

41.67

Show/hide

Query:  SPPRPIIS---LIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNIS---PIASPPRPNISPTTLPPRPNIS---PIASPPPPVIS---PLALPPRPNISPIA
        SPP P+ S    + SPP P  SP   P  S  PP+  PP P  S   P+ SPP P   P   PP P  S   P+ SPPPPV S   P+  PP P +   +
Subjt:  SPPRPIIS---LIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNIS---PIASPPRPNISPTTLPPRPNIS---PIASPPPPVIS---PLALPPRPNISPIA

Query:  PPPRPIISPMASPPRPNISP
        PPP P+ SP   PP+ +  P
Subjt:  PPPRPIISPMASPPRPNISP

AT5G56330.1 alpha carbonic anhydrase 8

2.6e-05

35.58

Show/hide

Query:  PPRPIISLIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNISPIASPPRPNISPTTLPPRPNISPIASPPPPVISPLALPPRPNISPIAPPPRPIISPMASP
        PP+P  +   +PP+P  +P  +P +    P   PP+P  +P  +PP+P  +P   PP+P   P  +PP P  +P   PP+P  +P AP P P   P  +P
Subjt:  PPRPIISLIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNISPIASPPRPNISPTTLPPRPNISPIASPPPPVISPLALPPRPNISPIAPPPRPIISPMASP

Query:  -PRP
         P P
Subjt:  -PRP

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTTCGCCCCCTCGTCCAATTATTTCACTGATAGCTTCACCCCCTCGTCCAACCATTTCTCCAGTAGCTTCACCCCATCGTTCTATTAATCCACCATTGGCACAGCC
TCCTCGTCCCAATATTTCACCTATTGCTTCACCCCCTCGGCCCAATATTTCACCAACGACCTTGCCCCCTCGTCCTAATATTTCACCTATAGCTTCACCCCCTCCTCCGG
TCATTTCACCATTGGCTTTGCCCCCGCGTCCAAATATTTCACCGATAGCTCCACCCCCTCGACCCATCATTTCACCAATGGCCTCGCCCCCTCGTCCTAATATTTCACCA
ATAGCATAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MASPPRPIISLIASPPRPTISPVASPHRSINPPLAQPPRPNISPIASPPRPNISPTTLPPRPNISPIASPPPPVISPLALPPRPNISPIAPPPRPIISPMASPPRPNISP
IA

HG10018991 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome