; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10018993 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10018993
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Descriptionglycine-rich cell wall structural protein 1-like
Genome locationChr04:13379573..13380208
RNA-Seq ExpressionHG10018993
SyntenyHG10018993
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6571715.1 hypothetical protein SDJN03_28443, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.7e-5558.87Show/hide
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        +GRGGE  GE++GR  EAIGG+ G G EA+  +LGRGG+A G  +GRGG+A+GG++ RGG + GE+ GRGGEAIG ++G GG+AIGG IGRGGEAIG +L
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Query:  GRGGGTIGEMMGRGGEVIGEIVGRGGEAIVGFIGRGGEA----------IGEILGRRREAIGEIFGRGGEAIGEILGRG----------GGTIGEMMGRG
        GR GG +GEMMGRGGE IG ++GRGG+AI G IGRGGEA          +GE++GR  EAIG + GRGG+A+G  +GRG          GG +GEMMGRG
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        GE IG ++G GG+A+GG IGRG +AIG +LG
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KAG7011439.1 hypothetical protein SDJN02_26344, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-5356.2Show/hide
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        +GRGG+  GE++GR  EAIGGL G G +AI E+ GRGG+A G + GRGG+A GG++ RGG V GE+ GRGGEAIG ++G GGEA+GG +GRGG+A+G  +
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Query:  GRG----------GGTIGEMMGRGGEVIGEIVGRGGEAIVGFIGRGGEAIGEILGRRREAIGEIFGRGGEAIGEILGRG---------------------
        GRG          GG +GEMMGRGGE IG ++GRGG+AI G IGRGGEAIG +LGR  + +GE+ GRGGEAIG +LGRG                     
Subjt:  GRG----------GGTIGEMMGRGGEVIGEIVGRGGEAIVGFIGRGGEAIGEILGRRREAIGEIFGRGGEAIGEILGRG---------------------

Query:  GGTIGEMMGRGGEVIGAIVGCGGEAIGGFIGRGSDAIGEILG
        GG +GEMMGRGGE IG ++G GG+A+GG IGRG +AIG +LG
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TYK13397.1 glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like [Cucumis melo var. makuwa]3.7e-6368.87Show/hide
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        GRG EA GEILGR  EAIG +FG G EA+ EILGR GEA GEILGRGG+A+G +I RGG   GEI GRGG A+GEI+G GGEA+G  +GRGGEA+GEILG
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Query:  RGGGTIGEMMGRGGEVIGEIVGRGGEAIVGFIGRGGEAIGEILGRRREAIGEIFGRGGEAIGEILGRGGGTIGEMMGRGGEVIGAIVGCGGEAIGGFIGR
        RGG  +GE++GRGGE +GEI+GRGGEAI   IGRGGEA+GEILGR  +A+GEI GRGGEAIGEI+GRGG  IGE+ GRGGE +G I G GGEA+G  +GR
Subjt:  RGGGTIGEMMGRGGEVIGEIVGRGGEAIVGFIGRGGEAIGEILGRRREAIGEIFGRGGEAIGEILGRGGGTIGEMMGRGGEVIGAIVGCGGEAIGGFIGR

Query:  GSD--AIGEILG
        G    AIGEI+G
Subjt:  GSD--AIGEILG

XP_016900727.1 PREDICTED: glycine-rich cell wall structural protein 1-like [Cucumis melo]5.6e-4363.13Show/hide
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        EILGRGGEA+GEI+GRGG+A+G ++ RGG   GEI GRGGEAIGEI+G GG+ IG   GRGGEA+GEI GRGG  +GE++GRGG+ IGEI+GRGGEAI  
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Query:  FIGRGGEAIGEILGRRREAIGEIFGRGGEAIGEILGRGGGTIGEMMGRGGEVIGAIV---GCGGEAIGGFIGRGSDAIG
             GE  G  +GR  +AIGEIFGRGG+AIGEI GR G +IG M+GRGG+V+G I    G GG  IGG  GRG   IG
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XP_031742894.1 glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like [Cucumis sativus]1.0e-5261.43Show/hide
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        +GRGGE  GE +GR  +AIG +FG G  A+ EILGRGGE  GE +GRGGKAIG +  RGG   GEI GRGGE +GE +G GG+AIG   GRGG A+GEIL
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Query:  GRGGGTIGEMMGRGGEVIGEIVGRGGEAIVGFIGRGGEAIGEILGRRREAIGEIFGRGGEAIGEILGRGGGTIGEMMGRGGEVIGAIVGCG---GEAIGG
        GRGG T+GE MGRGG+ IGEI GRGG A+   +GRGGE +GE +GR  +AIGEIFGRGG AIGEI+GRG G +G M+GRGG+V+G I+G G   G+  GG
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Query:  FIGRGSDAIG
          GRG    G
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KHS4 Pollen coat oleosin-glycine rich protein2.4e-6063.81Show/hide
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        GRGG+A GEILGR  EA+G +FG G  A+ EILGRGGE  GE +GRGGKAIG +  RGG   GEI GRGGE +GE +G GG+AIG   GRGG A+GEILG
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Query:  RGGGTIGEMMGRGGEVIGEIVGRGGEAIVGFIGRGGEAIGEILGRRREAIGEIFGRGGEAIGEILGRGGGTIGEMMGRGGEVIGAIVGCGGEAIGGFIGR
        RGG T+GE MGRGG+ IGEI GRGG A+   +GRGGE +GE +GR  +AIGEIFGRGG A+GE+LGRGG T+GE MGRGG+ IG I G GG A+G  +GR
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Query:  GSDAIGEILG
        G + +GE +G
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A0A1S4DXM4 glycine-rich cell wall structural protein 1-like2.7e-4363.13Show/hide
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        EILGRGGEA+GEI+GRGG+A+G ++ RGG   GEI GRGGEAIGEI+G GG+ IG   GRGGEA+GEI GRGG  +GE++GRGG+ IGEI+GRGGEAI  
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Query:  FIGRGGEAIGEILGRRREAIGEIFGRGGEAIGEILGRGGGTIGEMMGRGGEVIGAIV---GCGGEAIGGFIGRGSDAIG
             GE  G  +GR  +AIGEIFGRGG+AIGEI GR G +IG M+GRGG+V+G I    G GG  IGG  GRG   IG
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A0A5A7UQF2 Glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like3.0e-2653.14Show/hide
Query:  RGGEASGEILGRGGKAIGGLIRRGGGVSGEIFGRGGEAIGEIIGLGGEAIGGFIGRGGEAIGEILGRGGGTIGEMMGRGGEVIGEIVGRGGEAIVGFIGR
        RGG+ +GE  GRG K IG   RRGG   GE   RGG+ IGE             GRG + IGE  GRG   IGE++GR GE IGEI GRGGEA+   +GR
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Query:  GGEAIGEILGRRREAIGEIFGRGGEAIGEILGRGGGTIGEMMGRGGEVIGAIVGCGGEAIGGFIGRGSDAIGEIL
         GEA+GEILGR  EA+GE+ GRGGEAIGEI+GRGG  +GE++GRGG + G ++  GG  +GG +  G   IG I+
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A0A5D3BMR9 Glycine-rich cell wall structural protein 1-like2.8e-2471.74Show/hide
Query:  IGEIIGLGGEAIGGFIGRGGEAIGEILGRGGGTIGEMMGRGGEVIGEIVGRGGEAIVGFIGRGGEAIGEILGRRREAIGEIFGRGGEAIGEI
        +GEI+G GG+A+G  +GRGGEAIGEI+GRGG  IGE+ GRGGE +GEI GRGGEA+   +GRGG+AIGEILGR  EAIGEIFGRGG+A GEI
Subjt:  IGEIIGLGGEAIGGFIGRGGEAIGEILGRGGGTIGEMMGRGGEVIGEIVGRGGEAIVGFIGRGGEAIGEILGRRREAIGEIFGRGGEAIGEI

A0A5D3CNE0 Glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like1.8e-6368.87Show/hide
Query:  GRGGEANGEILGRVSEAIGGLFGCGVEAIREILGRGGEASGEILGRGGKAIGGLIRRGGGVSGEIFGRGGEAIGEIIGLGGEAIGGFIGRGGEAIGEILG
        GRG EA GEILGR  EAIG +FG G EA+ EILGR GEA GEILGRGG+A+G +I RGG   GEI GRGG A+GEI+G GGEA+G  +GRGGEA+GEILG
Subjt:  GRGGEANGEILGRVSEAIGGLFGCGVEAIREILGRGGEASGEILGRGGKAIGGLIRRGGGVSGEIFGRGGEAIGEIIGLGGEAIGGFIGRGGEAIGEILG

Query:  RGGGTIGEMMGRGGEVIGEIVGRGGEAIVGFIGRGGEAIGEILGRRREAIGEIFGRGGEAIGEILGRGGGTIGEMMGRGGEVIGAIVGCGGEAIGGFIGR
        RGG  +GE++GRGGE +GEI+GRGGEAI   IGRGGEA+GEILGR  +A+GEI GRGGEAIGEI+GRGG  IGE+ GRGGE +G I G GGEA+G  +GR
Subjt:  RGGGTIGEMMGRGGEVIGEIVGRGGEAIVGFIGRGGEAIGEILGRRREAIGEIFGRGGEAIGEILGRGGGTIGEMMGRGGEVIGAIVGCGGEAIGGFIGR

Query:  GSD--AIGEILG
        G    AIGEI+G
Subjt:  GSD--AIGEILG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G23450.1 unknown protein8.6e-1042.72Show/hide
Query:  GRGGEANGEILGRVSEAIGGLFGCGVEAIREILGRGGEASGEILGRGGKAIGGLIRRGGGVSGEIFGRGGEAIGEIIGLGGEAIGGFIGRGGEAIGEILG
        G+GG   G I G+    +GG FG G   +   +G+GG   G I G+GG  IGG I +GGG+ G I G+GG  IG  IG GG  IGG IG+GG  IG  +G
Subjt:  GRGGEANGEILGRVSEAIGGLFGCGVEAIREILGRGGEASGEILGRGGKAIGGLIRRGGGVSGEIFGRGGEAIGEIIGLGGEAIGGFIGRGGEAIGEILG

Query:  RGGGTIGEMMGRGGEV-IGEIVGRGGEAIVGFIGRG-----------GEAIGEILGRRREAIGEIFGRGGEAIGEILGRGGGTIGEMMGRGGEVIGAIVG
        +GGG IG  +G+GG +  G   G+GG  I G IG+G           G  IG  +G +   IG  FG+GG   G I G GG   G   G+GG + G I  
Subjt:  RGGGTIGEMMGRGGEV-IGEIVGRGGEAIVGFIGRG-----------GEAIGEILGRRREAIGEIFGRGGEAIGEILGRGGGTIGEMMGRGGEVIGAIVG

Query:  CGGEAIGGFIGRG
         GG   GG  G+G
Subjt:  CGGEAIGGFIGRG

AT4G01985.1 unknown protein3.6e-0837.14Show/hide
Query:  MGRGGEANGEI--LGRVSEAIGGLFGCGVEAIREILGRGGEASGEILGRGGKAIG-GLIRRGGGVSGEIFGRGGEAIGEIIGLGGEAIGGFIGRGGEAIG
        +G GG A G +   G +    GG  G G        G GG       G GG + G G+    GG  G   G GG   G +   GG   GG +G GG   G
Subjt:  MGRGGEANGEI--LGRVSEAIGGLFGCGVEAIREILGRGGEASGEILGRGGKAIG-GLIRRGGGVSGEIFGRGGEAIGEIIGLGGEAIGGFIGRGGEAIG

Query:  EILGR-GGGTIGEMMGRGGEVIGEIVGRGGEAIVGFIGRG-GEAIGEILGRRREAIGEIFGRGGEAIGEILGRGGGTIGEMMGR--GGEVIGAIVGCGGE
         + G  GGG  G + G  G  +G  VG GG   VG  GRG G A G   G      G   G GG   G + G  GG +G  +G   GG V GA+ G GG 
Subjt:  EILGR-GGGTIGEMMGRGGEVIGEIVGRGGEAIVGFIGRG-GEAIGEILGRRREAIGEIFGRGGEAIGEILGRGGGTIGEMMGR--GGEVIGAIVGCGGE

Query:  AIGGFIGRGS
        ++GG  GRGS
Subjt:  AIGGFIGRGS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGACGGGGGGGCGAAGCCAATGGTGAAATATTAGGACGAGTGAGCGAAGCCATTGGTGGACTATTTGGATGTGGGGTTGAAGCTATTAGAGAAATATTAGGACGAGG
GGGTGAAGCTAGTGGAGAAATATTGGGACGAGGGGGAAAAGCCATTGGTGGATTAATAAGACGAGGGGGTGGAGTTAGTGGTGAAATATTCGGACGAGGGGGTGAAGCTA
TTGGTGAAATAATTGGACTTGGGGGTGAAGCCATTGGTGGATTTATAGGACGAGGGGGAGAAGCTATTGGTGAAATATTGGGACGAGGAGGCGGAACCATTGGTGAAATG
ATGGGACGAGGGGGTGAAGTTATTGGTGAAATAGTTGGACGTGGGGGTGAAGCCATTGTTGGATTTATAGGACGAGGGGGTGAAGCTATAGGTGAAATATTAGGACGAAG
GCGTGAAGCTATAGGTGAAATATTCGGACGAGGGGGAGAAGCCATTGGTGAAATATTGGGACGAGGAGGTGGAACCATTGGTGAAATGATGGGACGAGGGGGTGAAGTTA
TTGGTGCAATAGTTGGATGTGGGGGTGAAGCCATTGGTGGATTTATAGGACGAGGGAGTGATGCTATTGGTGAAATATTGGGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGACGGGGGGGCGAAGCCAATGGTGAAATATTAGGACGAGTGAGCGAAGCCATTGGTGGACTATTTGGATGTGGGGTTGAAGCTATTAGAGAAATATTAGGACGAGG
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GCGTGAAGCTATAGGTGAAATATTCGGACGAGGGGGAGAAGCCATTGGTGAAATATTGGGACGAGGAGGTGGAACCATTGGTGAAATGATGGGACGAGGGGGTGAAGTTA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGRGGEANGEILGRVSEAIGGLFGCGVEAIREILGRGGEASGEILGRGGKAIGGLIRRGGGVSGEIFGRGGEAIGEIIGLGGEAIGGFIGRGGEAIGEILGRGGGTIGEM
MGRGGEVIGEIVGRGGEAIVGFIGRGGEAIGEILGRRREAIGEIFGRGGEAIGEILGRGGGTIGEMMGRGGEVIGAIVGCGGEAIGGFIGRGSDAIGEILG