; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10018994 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10018994
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Descriptionproline-rich extensin-like protein EPR1 isoform X2
Genome locationChr04:13380531..13381274
RNA-Seq ExpressionHG10018994
SyntenyHG10018994
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022963536.1 proline-rich extensin-like protein EPR1 isoform X1 [Cucurbita moschata]4.7e-1751.18Show/hide
Query:  MASYKTLVV-FGVFVSLCCLGIEGNEASLDFKQT---SSKHVKNSQSFSLPIKTSSIFTPLSPLPNFPPIRF-PLTPIQLPPPIRLPPL---PPIQLP--
        MASYKTLVV FGVFVSLCCL IE +EA+   +QT   S +HV NSQ  +LP+    I  P  PL   PPIR  PL PI   PPIRLPPL   PPI+LP  
Subjt:  MASYKTLVV-FGVFVSLCCLGIEGNEASLDFKQT---SSKHVKNSQSFSLPIKTSSIFTPLSPLPNFPPIRF-PLTPIQLPPPIRLPPL---PPIQLP--

Query:  ---PPIRFPP---LPPIRLPPLPPIQLPPPIRLPPIQLPPLPPIHLPPLPPIQLPPP---IRLPPLTPIPLPPLPPIQLPP---FPPLILPPINHLPP--
           PPIR PP   LPP+ LPP+ P++ PPP   PP  +PP PP   PP PP  +PPP     +PP +P PLP +PP+ LPP    PP+ LPP   +PP  
Subjt:  ---PPIRFPP---LPPIRLPPLPPIQLPPPIRLPPIQLPPLPPIHLPPLPPIQLPPP---IRLPPLTPIPLPPLPPIQLPP---FPPLILPPINHLPP--

Query:  -------PP---PPPPL--PTTPQTPN------PPPP-------PPPPPPPPITSPPPPSIAPTLTPRPNISPME-PPRPNIPP-TSSPHPSIVPMA
               PP   PP P+  PT P  PN      PP P       PP P  PP+ SPP P I+PTL PRPNI+PM  PPRP +PP  S P PSI PMA
Subjt:  -------PP---PPPPL--PTTPQTPN------PPPP-------PPPPPPPPITSPPPPSIAPTLTPRPNISPME-PPRPNIPP-TSSPHPSIVPMA

XP_022963537.1 proline-rich extensin-like protein EPR1 isoform X2 [Cucurbita moschata]9.5e-1853.26Show/hide
Query:  MASYKTLVV-FGVFVSLCCLGIEGNEASLDFKQT---SSKHVKNSQSFSLPIKTSSIFTPLSPLPNFPPIRF-PLTPIQLPPPIRLPPL---PPIQLP--
        MASYKTLVV FGVFVSLCCL IE +EA+   +QT   S +HV NSQ  +LP+    I  P  PL   PPIR  PL PI   PPIRLPPL   PPI+LP  
Subjt:  MASYKTLVV-FGVFVSLCCLGIEGNEASLDFKQT---SSKHVKNSQSFSLPIKTSSIFTPLSPLPNFPPIRF-PLTPIQLPPPIRLPPL---PPIQLP--

Query:  ---PPIRFPP---LPPIRLPPLPPIQLPPPIRLPPIQLPPLPPIHLPPLPPIQLPPP---IRLPPLTPIPLPPLPPIQLPP---FPPLILPPINHLPP--
           PPIR PP   LPP+ LPP+ P++ PPP   PP  +PP PP   PP PP  +PPP     +PP +P PLP +PP+ LPP    PP+ LPP   +PP  
Subjt:  ---PPIRFPP---LPPIRLPPLPPIQLPPPIRLPPIQLPPLPPIHLPPLPPIQLPPP---IRLPPLTPIPLPPLPPIQLPP---FPPLILPPINHLPP--

Query:  -PPPP--PPLPTTPQTPNPP-PPPPPPPPPPITSPPPPSIAPTLTPRPNISPME-PPRPNIPP-TSSPHPSIVPMA
         PP P  PP+ + P+   PP   PP P  PP+ SPP P I+PTL PRPNI+PM  PPRP +PP  S P PSI PMA
Subjt:  -PPPP--PPLPTTPQTPNPP-PPPPPPPPPPITSPPPPSIAPTLTPRPNISPME-PPRPNIPP-TSSPHPSIVPMA

XP_022963538.1 proline-rich extensin-like protein EPR1 isoform X3 [Cucurbita moschata]4.7e-1751.18Show/hide
Query:  MASYKTLVV-FGVFVSLCCLGIEGNEASLDFKQT---SSKHVKNSQSFSLPIKTSSIFTPLSPLPNFPPIRF-PLTPIQLPPPIRLPPL---PPIQLP--
        MASYKTLVV FGVFVSLCCL IE +EA+   +QT   S +HV NSQ  +LP+    I  P  PL   PPIR  PL PI   PPIRLPPL   PPI+LP  
Subjt:  MASYKTLVV-FGVFVSLCCLGIEGNEASLDFKQT---SSKHVKNSQSFSLPIKTSSIFTPLSPLPNFPPIRF-PLTPIQLPPPIRLPPL---PPIQLP--

Query:  ---PPIRFPP---LPPIRLPPLPPIQLPPPIRLPPIQLPPLPPIHLPPLPPIQLPPP---IRLPPLTPIPLPPLPPIQLPP---FPPLILPPINHLPP--
           PPIR PP   LPP+ LPP+ P++ PPP   PP  +PP PP   PP PP  +PPP     +PP +P PLP +PP+ LPP    PP+ LPP   +PP  
Subjt:  ---PPIRFPP---LPPIRLPPLPPIQLPPPIRLPPIQLPPLPPIHLPPLPPIQLPPP---IRLPPLTPIPLPPLPPIQLPP---FPPLILPPINHLPP--

Query:  -------PP---PPPPL--PTTPQTPN------PPPP-------PPPPPPPPITSPPPPSIAPTLTPRPNISPME-PPRPNIPP-TSSPHPSIVPMA
               PP   PP P+  PT P  PN      PP P       PP P  PP+ SPP P I+PTL PRPNI+PM  PPRP +PP  S P PSI PMA
Subjt:  -------PP---PPPPL--PTTPQTPN------PPPP-------PPPPPPPPITSPPPPSIAPTLTPRPNISPME-PPRPNIPP-TSSPHPSIVPMA

XP_022963540.1 proline-rich extensin-like protein EPR1 isoform X5 [Cucurbita moschata]9.5e-1853.26Show/hide
Query:  MASYKTLVV-FGVFVSLCCLGIEGNEASLDFKQT---SSKHVKNSQSFSLPIKTSSIFTPLSPLPNFPPIRF-PLTPIQLPPPIRLPPL---PPIQLP--
        MASYKTLVV FGVFVSLCCL IE +EA+   +QT   S +HV NSQ  +LP+    I  P  PL   PPIR  PL PI   PPIRLPPL   PPI+LP  
Subjt:  MASYKTLVV-FGVFVSLCCLGIEGNEASLDFKQT---SSKHVKNSQSFSLPIKTSSIFTPLSPLPNFPPIRF-PLTPIQLPPPIRLPPL---PPIQLP--

Query:  ---PPIRFPP---LPPIRLPPLPPIQLPPPIRLPPIQLPPLPPIHLPPLPPIQLPPP---IRLPPLTPIPLPPLPPIQLPP---FPPLILPPINHLPP--
           PPIR PP   LPP+ LPP+ P++ PPP   PP  +PP PP   PP PP  +PPP     +PP +P PLP +PP+ LPP    PP+ LPP   +PP  
Subjt:  ---PPIRFPP---LPPIRLPPLPPIQLPPPIRLPPIQLPPLPPIHLPPLPPIQLPPP---IRLPPLTPIPLPPLPPIQLPP---FPPLILPPINHLPP--

Query:  -PPPP--PPLPTTPQTPNPP-PPPPPPPPPPITSPPPPSIAPTLTPRPNISPME-PPRPNIPP-TSSPHPSIVPMA
         PP P  PP+ + P+   PP   PP P  PP+ SPP P I+PTL PRPNI+PM  PPRP +PP  S P PSI PMA
Subjt:  -PPPP--PPLPTTPQTPNPP-PPPPPPPPPPITSPPPPSIAPTLTPRPNISPME-PPRPNIPP-TSSPHPSIVPMA

XP_038888460.1 vegetative cell wall protein gp1-like [Benincasa hispida]7.4e-3963.12Show/hide
Query:  MASYKTLVVFGVFVSLCCLGIEGNEASLDFKQT--SSKHVKNSQSFSLPIKTSSI----FTPLSPLPNFPPIRFP----LTPI---------QLPP--PI
        MASYKTL++FG+ VSLCCLGI+GNE SL  +QT  SSKH KNSQSFSLP+K S++      PL  LP  PPIR P    LTP+          LPP  PI
Subjt:  MASYKTLVVFGVFVSLCCLGIEGNEASLDFKQT--SSKHVKNSQSFSLPIKTSSI----FTPLSPLPNFPPIRFP----LTPI---------QLPP--PI

Query:  RLPPLPPIQLPPPIRFPPLPPIRLPPLPPIQLP--PPIRLPPIQLPPLPPIHLPPLPPIQLPPPIRLPPLTPIPLPPLPPIQLPPFPPLILPPINHLPPP
        RLPPLPPI+LPP     PLPPIRL PLPPI+LP  PPIRLPPI+L PLPPI LPPLPPI+LPP   L PL PI LPPLPPI+LPP PP+ILPPI  +P  
Subjt:  RLPPLPPIQLPPPIRFPPLPPIRLPPLPPIQLP--PPIRLPPIQLPPLPPIHLPPLPPIQLPPPIRLPPLTPIPLPPLPPIQLPPFPPLILPPINHLPPP

Query:  PPPPPLPTTPQTPNP--PPPPPPPPPPPITSPPPPSIAPTLTPRPNISP-MEPPRPNIPPTSS
        PPPP +P TP+ P P  P P PPP  PP TSPPPPS  P+ T RP ISP   PPRPNI P +S
Subjt:  PPPPPLPTTPQTPNP--PPPPPPPPPPPITSPPPPSIAPTLTPRPNISP-MEPPRPNIPPTSS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1HFI1 proline-rich extensin-like protein EPR1 isoform X24.6e-1853.26Show/hide
Query:  MASYKTLVV-FGVFVSLCCLGIEGNEASLDFKQT---SSKHVKNSQSFSLPIKTSSIFTPLSPLPNFPPIRF-PLTPIQLPPPIRLPPL---PPIQLP--
        MASYKTLVV FGVFVSLCCL IE +EA+   +QT   S +HV NSQ  +LP+    I  P  PL   PPIR  PL PI   PPIRLPPL   PPI+LP  
Subjt:  MASYKTLVV-FGVFVSLCCLGIEGNEASLDFKQT---SSKHVKNSQSFSLPIKTSSIFTPLSPLPNFPPIRF-PLTPIQLPPPIRLPPL---PPIQLP--

Query:  ---PPIRFPP---LPPIRLPPLPPIQLPPPIRLPPIQLPPLPPIHLPPLPPIQLPPP---IRLPPLTPIPLPPLPPIQLPP---FPPLILPPINHLPP--
           PPIR PP   LPP+ LPP+ P++ PPP   PP  +PP PP   PP PP  +PPP     +PP +P PLP +PP+ LPP    PP+ LPP   +PP  
Subjt:  ---PPIRFPP---LPPIRLPPLPPIQLPPPIRLPPIQLPPLPPIHLPPLPPIQLPPP---IRLPPLTPIPLPPLPPIQLPP---FPPLILPPINHLPP--

Query:  -PPPP--PPLPTTPQTPNPP-PPPPPPPPPPITSPPPPSIAPTLTPRPNISPME-PPRPNIPP-TSSPHPSIVPMA
         PP P  PP+ + P+   PP   PP P  PP+ SPP P I+PTL PRPNI+PM  PPRP +PP  S P PSI PMA
Subjt:  -PPPP--PPLPTTPQTPNPP-PPPPPPPPPPITSPPPPSIAPTLTPRPNISPME-PPRPNIPP-TSSPHPSIVPMA

A0A6J1HGD3 proline-rich extensin-like protein EPR1 isoform X62.3e-1751.18Show/hide
Query:  MASYKTLVV-FGVFVSLCCLGIEGNEASLDFKQT---SSKHVKNSQSFSLPIKTSSIFTPLSPLPNFPPIRF-PLTPIQLPPPIRLPPL---PPIQLP--
        MASYKTLVV FGVFVSLCCL IE +EA+   +QT   S +HV NSQ  +LP+    I  P  PL   PPIR  PL PI   PPIRLPPL   PPI+LP  
Subjt:  MASYKTLVV-FGVFVSLCCLGIEGNEASLDFKQT---SSKHVKNSQSFSLPIKTSSIFTPLSPLPNFPPIRF-PLTPIQLPPPIRLPPL---PPIQLP--

Query:  ---PPIRFPP---LPPIRLPPLPPIQLPPPIRLPPIQLPPLPPIHLPPLPPIQLPPP---IRLPPLTPIPLPPLPPIQLPP---FPPLILPPINHLPP--
           PPIR PP   LPP+ LPP+ P++ PPP   PP  +PP PP   PP PP  +PPP     +PP +P PLP +PP+ LPP    PP+ LPP   +PP  
Subjt:  ---PPIRFPP---LPPIRLPPLPPIQLPPPIRLPPIQLPPLPPIHLPPLPPIQLPPP---IRLPPLTPIPLPPLPPIQLPP---FPPLILPPINHLPP--

Query:  -------PP---PPPPL--PTTPQTPN------PPPP-------PPPPPPPPITSPPPPSIAPTLTPRPNISPME-PPRPNIPP-TSSPHPSIVPMA
               PP   PP P+  PT P  PN      PP P       PP P  PP+ SPP P I+PTL PRPNI+PM  PPRP +PP  S P PSI PMA
Subjt:  -------PP---PPPPL--PTTPQTPN------PPPP-------PPPPPPPPITSPPPPSIAPTLTPRPNISPME-PPRPNIPP-TSSPHPSIVPMA

A0A6J1HI27 proline-rich extensin-like protein EPR1 isoform X32.3e-1751.18Show/hide
Query:  MASYKTLVV-FGVFVSLCCLGIEGNEASLDFKQT---SSKHVKNSQSFSLPIKTSSIFTPLSPLPNFPPIRF-PLTPIQLPPPIRLPPL---PPIQLP--
        MASYKTLVV FGVFVSLCCL IE +EA+   +QT   S +HV NSQ  +LP+    I  P  PL   PPIR  PL PI   PPIRLPPL   PPI+LP  
Subjt:  MASYKTLVV-FGVFVSLCCLGIEGNEASLDFKQT---SSKHVKNSQSFSLPIKTSSIFTPLSPLPNFPPIRF-PLTPIQLPPPIRLPPL---PPIQLP--

Query:  ---PPIRFPP---LPPIRLPPLPPIQLPPPIRLPPIQLPPLPPIHLPPLPPIQLPPP---IRLPPLTPIPLPPLPPIQLPP---FPPLILPPINHLPP--
           PPIR PP   LPP+ LPP+ P++ PPP   PP  +PP PP   PP PP  +PPP     +PP +P PLP +PP+ LPP    PP+ LPP   +PP  
Subjt:  ---PPIRFPP---LPPIRLPPLPPIQLPPPIRLPPIQLPPLPPIHLPPLPPIQLPPP---IRLPPLTPIPLPPLPPIQLPP---FPPLILPPINHLPP--

Query:  -------PP---PPPPL--PTTPQTPN------PPPP-------PPPPPPPPITSPPPPSIAPTLTPRPNISPME-PPRPNIPP-TSSPHPSIVPMA
               PP   PP P+  PT P  PN      PP P       PP P  PP+ SPP P I+PTL PRPNI+PM  PPRP +PP  S P PSI PMA
Subjt:  -------PP---PPPPL--PTTPQTPN------PPPP-------PPPPPPPPITSPPPPSIAPTLTPRPNISPME-PPRPNIPP-TSSPHPSIVPMA

A0A6J1HIA7 proline-rich extensin-like protein EPR1 isoform X54.6e-1853.26Show/hide
Query:  MASYKTLVV-FGVFVSLCCLGIEGNEASLDFKQT---SSKHVKNSQSFSLPIKTSSIFTPLSPLPNFPPIRF-PLTPIQLPPPIRLPPL---PPIQLP--
        MASYKTLVV FGVFVSLCCL IE +EA+   +QT   S +HV NSQ  +LP+    I  P  PL   PPIR  PL PI   PPIRLPPL   PPI+LP  
Subjt:  MASYKTLVV-FGVFVSLCCLGIEGNEASLDFKQT---SSKHVKNSQSFSLPIKTSSIFTPLSPLPNFPPIRF-PLTPIQLPPPIRLPPL---PPIQLP--

Query:  ---PPIRFPP---LPPIRLPPLPPIQLPPPIRLPPIQLPPLPPIHLPPLPPIQLPPP---IRLPPLTPIPLPPLPPIQLPP---FPPLILPPINHLPP--
           PPIR PP   LPP+ LPP+ P++ PPP   PP  +PP PP   PP PP  +PPP     +PP +P PLP +PP+ LPP    PP+ LPP   +PP  
Subjt:  ---PPIRFPP---LPPIRLPPLPPIQLPPPIRLPPIQLPPLPPIHLPPLPPIQLPPP---IRLPPLTPIPLPPLPPIQLPP---FPPLILPPINHLPP--

Query:  -PPPP--PPLPTTPQTPNPP-PPPPPPPPPPITSPPPPSIAPTLTPRPNISPME-PPRPNIPP-TSSPHPSIVPMA
         PP P  PP+ + P+   PP   PP P  PP+ SPP P I+PTL PRPNI+PM  PPRP +PP  S P PSI PMA
Subjt:  -PPPP--PPLPTTPQTPNPP-PPPPPPPPPPITSPPPPSIAPTLTPRPNISPME-PPRPNIPP-TSSPHPSIVPMA

A0A6J1HKG7 proline-rich extensin-like protein EPR1 isoform X42.3e-1751.18Show/hide
Query:  MASYKTLVV-FGVFVSLCCLGIEGNEASLDFKQT---SSKHVKNSQSFSLPIKTSSIFTPLSPLPNFPPIRF-PLTPIQLPPPIRLPPL---PPIQLP--
        MASYKTLVV FGVFVSLCCL IE +EA+   +QT   S +HV NSQ  +LP+    I  P  PL   PPIR  PL PI   PPIRLPPL   PPI+LP  
Subjt:  MASYKTLVV-FGVFVSLCCLGIEGNEASLDFKQT---SSKHVKNSQSFSLPIKTSSIFTPLSPLPNFPPIRF-PLTPIQLPPPIRLPPL---PPIQLP--

Query:  ---PPIRFPP---LPPIRLPPLPPIQLPPPIRLPPIQLPPLPPIHLPPLPPIQLPPP---IRLPPLTPIPLPPLPPIQLPP---FPPLILPPINHLPP--
           PPIR PP   LPP+ LPP+ P++ PPP   PP  +PP PP   PP PP  +PPP     +PP +P PLP +PP+ LPP    PP+ LPP   +PP  
Subjt:  ---PPIRFPP---LPPIRLPPLPPIQLPPPIRLPPIQLPPLPPIHLPPLPPIQLPPP---IRLPPLTPIPLPPLPPIQLPP---FPPLILPPINHLPP--

Query:  -------PP---PPPPL--PTTPQTPN------PPPP-------PPPPPPPPITSPPPPSIAPTLTPRPNISPME-PPRPNIPP-TSSPHPSIVPMA
               PP   PP P+  PT P  PN      PP P       PP P  PP+ SPP P I+PTL PRPNI+PM  PPRP +PP  S P PSI PMA
Subjt:  -------PP---PPPPL--PTTPQTPN------PPPP-------PPPPPPPPITSPPPPSIAPTLTPRPNISPME-PPRPNIPP-TSSPHPSIVPMA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCCTACAAGACCTTAGTTGTGTTTGGTGTATTTGTGAGTTTATGTTGTTTGGGCATTGAGGGGAATGAAGCTTCCCTTGATTTCAAACAAACATCATCAAAACA
TGTGAAGAATTCACAATCCTTTTCTTTGCCCATAAAAACTTCATCAATATTCACTCCACTCTCTCCACTTCCTAATTTCCCTCCTATTCGTTTCCCTCTTACTCCTATTC
AACTTCCTCCTCCTATTCGTCTCCCTCCTCTCCCTCCTATTCAACTTCCTCCTCCTATTCGTTTCCCTCCTCTCCCTCCTATTCGTCTCCCTCCTCTCCCTCCTATTCAA
CTTCCTCCTCCTATTCGTCTCCCTCCTATTCAACTTCCTCCTCTCCCTCCTATTCATCTCCCTCCTCTCCCTCCTATTCAACTTCCTCCTCCTATTCGTCTCCCTCCTCT
CACTCCTATTCCTCTCCCTCCTCTCCCTCCTATTCAACTACCTCCCTTTCCTCCTTTAATATTACCGCCAATAAATCATCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCGTTAC
CAACTACACCACAAACGCCTAACCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCACCAATAACTTCGCCTCCACCGCCCAGCATTGCACCAACTTTGACGCCTCGCCCT
AACATTTCACCGATGGAACCTCCCCGTCCAAACATTCCACCAACTTCGTCGCCGCACCCTAGTATTGTACCAATGGCCCAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTCCTACAAGACCTTAGTTGTGTTTGGTGTATTTGTGAGTTTATGTTGTTTGGGCATTGAGGGGAATGAAGCTTCCCTTGATTTCAAACAAACATCATCAAAACA
TGTGAAGAATTCACAATCCTTTTCTTTGCCCATAAAAACTTCATCAATATTCACTCCACTCTCTCCACTTCCTAATTTCCCTCCTATTCGTTTCCCTCTTACTCCTATTC
AACTTCCTCCTCCTATTCGTCTCCCTCCTCTCCCTCCTATTCAACTTCCTCCTCCTATTCGTTTCCCTCCTCTCCCTCCTATTCGTCTCCCTCCTCTCCCTCCTATTCAA
CTTCCTCCTCCTATTCGTCTCCCTCCTATTCAACTTCCTCCTCTCCCTCCTATTCATCTCCCTCCTCTCCCTCCTATTCAACTTCCTCCTCCTATTCGTCTCCCTCCTCT
CACTCCTATTCCTCTCCCTCCTCTCCCTCCTATTCAACTACCTCCCTTTCCTCCTTTAATATTACCGCCAATAAATCATCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCGTTAC
CAACTACACCACAAACGCCTAACCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCACCAATAACTTCGCCTCCACCGCCCAGCATTGCACCAACTTTGACGCCTCGCCCT
AACATTTCACCGATGGAACCTCCCCGTCCAAACATTCCACCAACTTCGTCGCCGCACCCTAGTATTGTACCAATGGCCCAATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASYKTLVVFGVFVSLCCLGIEGNEASLDFKQTSSKHVKNSQSFSLPIKTSSIFTPLSPLPNFPPIRFPLTPIQLPPPIRLPPLPPIQLPPPIRFPPLPPIRLPPLPPIQ
LPPPIRLPPIQLPPLPPIHLPPLPPIQLPPPIRLPPLTPIPLPPLPPIQLPPFPPLILPPINHLPPPPPPPPLPTTPQTPNPPPPPPPPPPPPITSPPPPSIAPTLTPRP
NISPMEPPRPNIPPTSSPHPSIVPMAQ