; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10019036 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10019036
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionReverse transcriptase
Genome locationChr04:14627630..14628097
RNA-Seq ExpressionHG10019036
SyntenyHG10019036
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR036691 - Endonuclease/exonuclease/phosphatase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA3467625.1 reverse transcriptase [Gossypium australe]2.6e-2142.22Show/hide
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        W+V GD NEILF  EK+GG  R++G M  F+  L++C+L D+GYSG  FTW         +   LDR +AN E+++LF    V H  +S SDH P    L
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         I  D L Q  GR+ F F  +W+  E+ EK+++E+
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XP_012831565.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC105952547 [Erythranthe guttata]6.8e-2242.96Show/hide
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        W+VGGD NEIL + EK GGP RE   M  F+ ALDDC L ++G+ G  FTW N R+    V   LDR   N  +  LF   +V H   + SDH PI L  
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        + + +P  +   +RPFRF   W+S  + E+IVQ +
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XP_012857002.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC105976270 [Erythranthe guttata]8.9e-2242.55Show/hide
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        N  WVVGGD NEIL + EK+GG  R    +  F+ ALDDC L DL + G  FTW N RD    V   LDR  A+ +++  F   +V+H  +S SDH P++
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        L L    DP     +R  +RPFRF   W   ++ E+IVQ++
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XP_018859783.1 uncharacterized protein LOC109021580 [Juglans regia]1.5e-2142.18Show/hide
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        W++ GD NEIL   EK+GG RR EGLM +F+ AL DC L+DLG+S G  FTWCN R+    +   LDR LA+P+++  F +  V+H   S SDH PI L 
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Query:  LRIVGDPLFQRLGRRPFRFNVFWSSYENYEKIVQESVGQEEARNHLI
            G   + R  ++ FRF   W  +E  E I+++    EE R +++
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XP_041011336.1 uncharacterized protein LOC121255118 [Juglans microcarpa x Juglans regia]6.8e-2241.18Show/hide
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        +  W++ GD NE+L ++EK GG  R +  M +F+  +D+CEL DLG+ G  FTWCN R+ +  +S  LDR LAN ++ ALF  + V H   + SDH PI+
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        L L+      F R GR+PF F   W   +N ++I++
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A2I4HUH1 uncharacterized protein LOC1090215807.3e-2242.18Show/hide
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        W++ GD NEIL   EK+GG RR EGLM +F+ AL DC L+DLG+S G  FTWCN R+    +   LDR LA+P+++  F +  V+H   S SDH PI L 
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            G   + R  ++ FRF   W  +E  E I+++    EE R +++
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A0A2N9IEV4 Uncharacterized protein2.8e-2138.31Show/hide
Query:  MDNSAWVVGGDLNEILFSKEKQGGPRREEGLMSNFQTALDDCELKDLGYSGNMFTWCNRRDQNLQVSLCLDRFLANPEFMALFLDLIVNHQGWSKSDHRP
        M +  WV+ GD N+IL+S EK GG       M+ F+  ++DC + DLG+SG  FTW N  D    +   LDR +ANP +  LF +  V+H   + SDH P
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Query:  IELTLRIVGDPLFQRLGRRPFRFNVFWSSYENYEKIVQESVGQEEARNHLIWDT
        I LTL     P   R   RPFRF   W S+ ++ KIV+++         + +DT
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A0A5B6VBB6 Reverse transcriptase1.4e-2041.48Show/hide
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        W+V GD NEILF  EK+GG  R++G M  F+  L++C+L D+GYSG  FTW         +   LDR +AN E+++LF    V H  +S SDH P    L
Subjt:  WVVGGDLNEILFSKEKQGGPRREEGLMSNFQTALDDCELKDLGYSGNMFTWCNRRDQNLQVSLCLDRFLANPEFMALFLDLIVNHQGWSKSDHRPIELTL

Query:  RIVGDPLFQRLGRRPFRFNVFWSSYENYEKIVQES
         I  D L Q+  R+ F F  +W   E+ EK+++E+
Subjt:  RIVGDPLFQRLGRRPFRFNVFWSSYENYEKIVQES

A0A5B6VEN5 Reverse transcriptase1.2e-2142.22Show/hide
Query:  WVVGGDLNEILFSKEKQGGPRREEGLMSNFQTALDDCELKDLGYSGNMFTWCNRRDQNLQVSLCLDRFLANPEFMALFLDLIVNHQGWSKSDHRPIELTL
        W+V GD NEILF  EK+GG  R++G M  F+  L++C+L D+GYSG  FTW         +   LDR +AN E+++LF    V H  +S SDH P    L
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Query:  RIVGDPLFQRLGRRPFRFNVFWSSYENYEKIVQES
         I  D L Q  GR+ F F  +W+  E+ EK+++E+
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A0A5C7HJN1 Uncharacterized protein2.8e-2139.29Show/hide
Query:  MDNSAWVVGGDLNEILFSKEKQGGPRREEGLMSNFQTALDDCELKDLGYSGNMFTWCNRRDQNLQVSLCLDRFLANPEFMALFLDLIVNHQGWSKSDHRP
        +D+ +W+ GGD NEIL  KEK GG  +    +  F+  +DDC L DLG+ G   TW NRRD +  V   +DR LA+  ++ LF    V H G++ SDHRP
Subjt:  MDNSAWVVGGDLNEILFSKEKQGGPRREEGLMSNFQTALDDCELKDLGYSGNMFTWCNRRDQNLQVSLCLDRFLANPEFMALFLDLIVNHQGWSKSDHRP

Query:  IELTLRIVGDPLFQRLGRRPFRFNVFWSSYENYEKIVQES
        + L+    G    ++  R+PF+F  FW   E   K+++E+
Subjt:  IELTLRIVGDPLFQRLGRRPFRFNVFWSSYENYEKIVQES

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATAATTCGGCATGGGTGGTGGGAGGTGATTTGAATGAAATTTTATTTAGTAAAGAGAAGCAGGGCGGACCAAGGCGAGAGGAAGGTTTAATGTCGAATTTCCAAAC
AGCCTTGGATGATTGCGAGTTGAAAGATCTTGGTTATTCAGGCAATATGTTTACGTGGTGCAATAGAAGGGACCAAAATTTACAGGTTAGTCTCTGCCTTGATCGTTTTC
TTGCTAATCCTGAATTTATGGCTCTGTTCCTAGATCTTATAGTTAATCACCAAGGTTGGTCAAAATCTGATCATCGTCCCATAGAGCTGACTTTAAGAATTGTTGGAGAT
CCTTTGTTCCAAAGGTTAGGCAGGAGGCCTTTTCGTTTCAATGTTTTCTGGTCTTCTTATGAGAATTATGAAAAAATTGTGCAGGAATCGGTTGGGCAGGAGGAGGCGCG
AAACCATTTAATTTGGGACACAATTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATAATTCGGCATGGGTGGTGGGAGGTGATTTGAATGAAATTTTATTTAGTAAAGAGAAGCAGGGCGGACCAAGGCGAGAGGAAGGTTTAATGTCGAATTTCCAAAC
AGCCTTGGATGATTGCGAGTTGAAAGATCTTGGTTATTCAGGCAATATGTTTACGTGGTGCAATAGAAGGGACCAAAATTTACAGGTTAGTCTCTGCCTTGATCGTTTTC
TTGCTAATCCTGAATTTATGGCTCTGTTCCTAGATCTTATAGTTAATCACCAAGGTTGGTCAAAATCTGATCATCGTCCCATAGAGCTGACTTTAAGAATTGTTGGAGAT
CCTTTGTTCCAAAGGTTAGGCAGGAGGCCTTTTCGTTTCAATGTTTTCTGGTCTTCTTATGAGAATTATGAAAAAATTGTGCAGGAATCGGTTGGGCAGGAGGAGGCGCG
AAACCATTTAATTTGGGACACAATTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDNSAWVVGGDLNEILFSKEKQGGPRREEGLMSNFQTALDDCELKDLGYSGNMFTWCNRRDQNLQVSLCLDRFLANPEFMALFLDLIVNHQGWSKSDHRPIELTLRIVGD
PLFQRLGRRPFRFNVFWSSYENYEKIVQESVGQEEARNHLIWDTI