; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10019284 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10019284
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionProtein RALF-like 33
Genome locationChr04:19767653..19768030
RNA-Seq ExpressionHG10019284
SyntenyHG10019284
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044366.1 protein RALF-like 33 [Cucumis melo var. makuwa]2.1e-5088.33Show/hide
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XP_022934551.1 protein RALF-like 1 [Cucurbita moschata]4.0e-4986.78Show/hide
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XP_022983404.1 protein RALF-like 1 [Cucurbita maxima]6.9e-4986.78Show/hide
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XP_023529110.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.9e-4986.78Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWI2 Uncharacterized protein3.0e-5088.52Show/hide
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A0A5A7TQI0 Protein RALF-like 331.0e-5088.33Show/hide
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A0A6J1F244 protein RALF-like 11.9e-4986.78Show/hide
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A0A6J1J798 protein RALF-like 13.3e-4986.78Show/hide
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A0A6N2MA16 Uncharacterized protein4.7e-2762.5Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 335.9e-2754.55Show/hide
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Q945T0 Rapid alkalinization factor5.1e-2351.69Show/hide
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        P  L + +   AFF+S +     A     +  W+    +   C G SI EC+    EFE+DSE NRRILAT  YISY +L+ N++PCSRRG+SYYNC+PG
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Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 232.2e-2145.93Show/hide
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Q9MA62 Protein RALF-like 223.1e-2064Show/hide
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Q9SRY3 Protein RALF-like 14.6e-2454.05Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 13.3e-2554.05Show/hide
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AT2G33775.1 ralf-like 199.6e-1745.74Show/hide
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AT3G05490.1 ralf-like 222.2e-2164Show/hide
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AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 231.5e-2245.93Show/hide
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AT4G15800.1 ralf-like 334.2e-2854.55Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TAGCGACAGTAGTCTTAGTTGGCTCTCAACCGAAGCTCGATGCAATGGGCGTTCGATAAGCGAATGCATGATGAACATTGAGTTTGAAATGGATTCTGAGATCAATCGTC
GCATCTTAGCCACTTCGAGTTACATAAGTTACAAGTCGTTGAGAGCGAACAACATTCCATGCTCTCGGAGAGGTTCGTCCTACTACAATTGCCAACCCGGGGCCGAGGCT
AACCCGTATCAGCGGGGTTGTACCGCCATTACTCGTTGTAGAAGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAGAAGGCAACCATTGGCAACTCTTCTTCTCCACCTGCCTTATGTATGCTCATTTTCACCATAGCATTCTTCGTCTCTTCGTCCTCTATAACGGCCACGGCGATGAG
TAGCGACAGTAGTCTTAGTTGGCTCTCAACCGAAGCTCGATGCAATGGGCGTTCGATAAGCGAATGCATGATGAACATTGAGTTTGAAATGGATTCTGAGATCAATCGTC
GCATCTTAGCCACTTCGAGTTACATAAGTTACAAGTCGTTGAGAGCGAACAACATTCCATGCTCTCGGAGAGGTTCGTCCTACTACAATTGCCAACCCGGGGCCGAGGCT
AACCCGTATCAGCGGGGTTGTACCGCCATTACTCGTTGTAGAAGCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKKATIGNSSSPPALCMLIFTIAFFVSSSSITATAMSSDSSLSWLSTEARCNGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGSSYYNCQPGAEA
NPYQRGCTAITRCRS