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HG10019564 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10019564
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Descriptionrhomboid-like protein 20
Genome locationChr04:23210442..23214859
RNA-Seq ExpressionHG10019564
SyntenyHG10019564
Gene Ontology termsGO:0006508 - proteolysis (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0004252 - serine-type endopeptidase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR035952 - Rhomboid-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6596983.1 Rhomboid-like protein 20, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.4e-3583Show/hide
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XP_004141121.1 rhomboid-like protein 20 [Cucumis sativus]6.8e-3685Show/hide
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XP_008464944.1 PREDICTED: rhomboid-like protein 20 [Cucumis melo]3.1e-3686Show/hide
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XP_022154191.1 rhomboid-like protein 20 [Momordica charantia]8.9e-3685Show/hide
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XP_022936013.1 rhomboid-like protein 20 [Cucurbita moschata]4.4e-3583Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LG81 UBA domain-containing protein3.3e-3685Show/hide
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A0A1S3CMQ9 rhomboid-like protein 201.5e-3686Show/hide
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A0A5D3D5B1 Rhomboid-like protein 201.5e-3686Show/hide
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A0A6J1DN01 rhomboid-like protein 204.3e-3685Show/hide
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A0A6J1FC34 rhomboid-like protein 202.1e-3583Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8RXQ2 Rhomboid-like protein 181.4e-2859.48Show/hide
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        L+ + + +L  SG +A
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Q9LET3 Rhomboid-like protein 205.6e-3373Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G41160.1 Ubiquitin-associated (UBA) protein1.0e-2959.48Show/hide
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AT3G56740.1 Ubiquitin-associated (UBA) protein4.0e-3473Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GCTTGGCTTGTCCTATCAGGATGTGATTGTGAAGCTCCGATTTTGGAAGTTAGTAATGTCAGTTTTTGCCTTTTCATCTACTCCTGAATTGATGTTCGGACTGTTTCTGC
TATATTACTTCAGAGTATTTGAAAGACAGATAGGATCCAACAAATACTCGGACCGGAAGTCCTTCTTAGCAAGTCACTCACTTGCTGGGGAGTTAATTGGGCTTAGTGAC
AATGGTTCATGGTCTCTTGATATTTCTGGGAGTTTTGCTTGGCAAGTGTTTTTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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