; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10019571 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10019571
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Descriptionsurfeit locus protein 2-like
Genome locationChr04:23292289..23295949
RNA-Seq ExpressionHG10019571
SyntenyHG10019571
Gene Ontology termsGO:0010073 - meristem maintenance (biological process)
InterPro domainsIPR008833 - Surfeit locus protein 2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022152174.1 uncharacterized protein LOC111019957 isoform X2 [Momordica charantia]1.3e-4376.58Show/hide
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XP_038903228.1 surfeit locus protein 2-like isoform X1 [Benincasa hispida]4.6e-4475.22Show/hide
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XP_038903229.1 surfeit locus protein 2-like isoform X2 [Benincasa hispida]4.6e-4475.22Show/hide
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XP_038906359.1 serine/threonine-protein phosphatase 7 long form homolog [Benincasa hispida]2.5e-5391.15Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1DE57 serine/threonine-protein phosphatase 7 long form homolog isoform X16.5e-4476.58Show/hide
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A0A6J1DF94 uncharacterized protein LOC111019957 isoform X26.5e-4476.58Show/hide
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A0A6J1F4F2 uncharacterized protein LOC1114420701.6e-4273.45Show/hide
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A0A6J1J3F4 surfeit locus protein 2 isoform X14.7e-4272.57Show/hide
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A0A6J1J5G4 uncharacterized protein LOC111481480 isoform X34.7e-4272.57Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G14440.1 Surfeit locus protein 2 (SURF2)3.7e-3963.89Show/hide
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AT5G14440.2 Surfeit locus protein 2 (SURF2)3.7e-3963.89Show/hide
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AT5G40570.1 Surfeit locus protein 2 (SURF2)6.1e-3463.64Show/hide
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        EG  L G P F +L NGRLRCVETGHE+L  D  SY+R K C LGLI+ ALS  K PLNMF   PL  SKL+C+LTGDT+NK EEHIWKH++G+RFL++
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AT5G40570.2 Surfeit locus protein 2 (SURF2)7.4e-3259.43Show/hide
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        EG  L G P F +L NGRLRCVETGHE+L  D  SY+R K C LGLI+ ALS  K PLNMF   PL         SKL+C+LTGDT+NK EEHIWKH++G
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTGTCGACTACCAGCGACAAGAGGCCGACGGCCAATGTCGAAGGGGCCGACCTTCTGGGGCAACCGAACTTCACAGAGCTCGACAATGGCCGCTTGCGGTGTGTGGA
GACTGGCCACGAAATCCTCACCAAGGACAGGAATTCCTACTCTCGGACCAAGCACTGTCATCTCGGCCTCATCGACTTCGCTTTGTCCCATCAAAAAGTTCCTCTTAATA
TGTTCGTGCATGATCCTCTCTTTAGTTCGAAGTTAATATGCAGACTTACTGGTGATACCATCAACAAAACAGAGGAACATATATGGAAGCATATTAGTGGCAGACGATTC
CTCAACAGAAGGTCTGTTCTATATGGAGTATGTGGAATGTTATGTTTAGCCTTTATCTTATCAATGACATGGACGACAATATTCATGGCAAGTATTCTGATACTTGTTAA
GCTCAAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTGTCGACTACCAGCGACAAGAGGCCGACGGCCAATGTCGAAGGGGCCGACCTTCTGGGGCAACCGAACTTCACAGAGCTCGACAATGGCCGCTTGCGGTGTGTGGA
GACTGGCCACGAAATCCTCACCAAGGACAGGAATTCCTACTCTCGGACCAAGCACTGTCATCTCGGCCTCATCGACTTCGCTTTGTCCCATCAAAAAGTTCCTCTTAATA
TGTTCGTGCATGATCCTCTCTTTAGTTCGAAGTTAATATGCAGACTTACTGGTGATACCATCAACAAAACAGAGGAACATATATGGAAGCATATTAGTGGCAGACGATTC
CTCAACAGAAGGTCTGTTCTATATGGAGTATGTGGAATGTTATGTTTAGCCTTTATCTTATCAATGACATGGACGACAATATTCATGGCAAGTATTCTGATACTTGTTAA
GCTCAAGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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LNRRSVLYGVCGMLCLAFILSMTWTTIFMASILILVKLK