; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10019584 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10019584
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionLOB domain-containing protein
Genome locationChr04:23480585..23481118
RNA-Seq ExpressionHG10019584
SyntenyHG10019584
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR004883 - Lateral organ boundaries, LOB


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_011652293.1 LOB domain-containing protein 25 isoform X2 [Cucumis sativus]5.8e-9498.87Show/hide
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XP_022935530.1 LOB domain-containing protein 25-like [Cucurbita moschata]4.3e-8994.35Show/hide
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XP_038905774.1 LOB domain-containing protein 25-like [Benincasa hispida]2.9e-9398.31Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LI15 LOB domain-containing protein2.8e-9498.87Show/hide
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A0A1S3B938 LOB domain-containing protein 25-like6.3e-9498.31Show/hide
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A0A5D3BPW0 LOB domain-containing protein 25-like6.3e-9498.31Show/hide
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A0A6J1DD95 LOB domain-containing protein 25-like2.7e-8996.11Show/hide
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A0A6J1FAW3 LOB domain-containing protein 25-like2.1e-8994.35Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2WXT0 LOB domain-containing protein 61.1e-3963.64Show/hide
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           L +Y  +   A + S+S+
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O04479 Protein ASYMMETRIC LEAVES 21.9e-3952Show/hide
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        L    + L +Y    I A +  S        ++      ++T+   HY+   +F P      G   P G+ +D G
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Q8L8Q3 LOB domain-containing protein 256.3e-5183.78Show/hide
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        S Y+NSPCAACKFLRRKC  DCVFAPYFPPEEP KFANVH+IFGASNVSK+L+EV PHQREDAVNSLAYEAEAR+KDPVYGCVGAIS+LQRQV++LQ+EL
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Q8LQH4 LOB domain-containing protein 61.1e-3963.64Show/hide
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Q9FML4 Protein LATERAL ORGAN BOUNDARIES7.0e-5077.42Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G27650.1 LOB domain-containing protein 254.5e-5283.78Show/hide
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        + TNA+L+RYA
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AT5G63090.1 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein5.0e-5177.42Show/hide
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        ELDA NA+L  Y  S   A +P +
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AT5G63090.2 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein5.0e-5177.42Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
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AT5G63090.3 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein5.0e-5177.42Show/hide
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        ELDA NA+L  Y  S   A +P +
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AT5G63090.4 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein5.0e-5177.42Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTTCTTCCACCTACTCCAATTCTCCATGTGCAGCCTGCAAGTTCCTACGTCGAAAATGCCTACCCGATTGCGTTTTCGCCCCGTATTTCCCGCCCGAAGAGCCCCA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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IRYACSEIPAPSPSSSSQYARRSSSTSHEGSSSTSSYGHYYSGLYFSPWSNNNNGPCGDGHDKGEYK