CuGenDBv2

Gene ID	HG10019970
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	J domain-containing protein
Genome location	Chr04:27441943..27444555
RNA-Seq Expression	HG10019970
Synteny	HG10019970
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

XP_022158327.1 dnaJ homolog subfamily C member 7 homolog [Momordica charantia]

6.5e-82

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XP_022930351.1 dnaJ homolog subfamily C member 7 homolog [Cucurbita moschata]

7.6e-83

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XP_022971359.1 uncharacterized protein LOC111470107 [Cucurbita maxima]

1.5e-83

88.37

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XP_023547226.1 uncharacterized protein LOC111806102 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

1.7e-82

87.21

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XP_038905942.1 uncharacterized protein LOC120091865 [Benincasa hispida]

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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LF16 J domain-containing protein

1.8e-74

77.72

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A0A5D3DP21 Uncharacterized protein

1.3e-72

77.72

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        RCNHYTKSFRRIN KQ+LLRNVSAYAEFL QSW+DE EANDPSSS  TSWFKR +SFRGSK DR NQR  C SRSFEFTEDDP++ETVFRSAFGG RSYY
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        WSFINEENPQWRSSTN SS             NYGRSW+W+HRVD+DYDS N YEDS+ANL  HRLALGL+ SGPLKLEDVKNA
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A0A6J1DWY6 dnaJ homolog subfamily C member 7 homolog

3.1e-82

87.21

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A0A6J1EQP4 dnaJ homolog subfamily C member 7 homolog

3.7e-83

87.79

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A0A6J1I8B8 uncharacterized protein LOC111470107

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G42080.1 Chaperone DnaJ-domain superfamily protein

4.5e-33

44.2

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Query:  RCNHYTKSFRRINAKQTLLRNVSAYAEFLLQSWQDEGEANDPSSSRATSWFKRQYSFRGSKTDRTNQRPRCW-SRSFEFTE--DDPNLETVFRSAFGGNR
        + N + K FRR+  KQ LLRNV+A+A  +  SW DE + + PSS + TSWFK+QYS            P  W  R+F+F E  +D +++ VFR+AFGG+R
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Query:  SYYWSFINEEN-PQWR-SSTNYSSNYGRSWNWRHRVD-----DDYDSSNEYEDSEANLAPHRLALGLRVSGPLKLEDVKNA
         + +SF +EE+ P+WR  S+ +S+N  RSW  ++R+D     +DY S +   +SE N   HR ALGL  SGPL L+DVK+A
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AT3G58020.1 Chaperone DnaJ-domain superfamily protein

2.6e-20

39.66

Show/hide

Query:  TKSFRRINAKQTLLRNVSAYAEFLLQSWQDEGEANDPSSSRATSWFKRQYSFRGSKTDR---TNQRPRCWSRSFEFTEDDP--NLETVFRSAFGGNRSYY
        +K F R  AKQ L RNV+A+A+ L   W D  +     S + TSWF++QYS R SK +R   T+       R F+F+E D    +E   ++A GG+R + 
Subjt:  TKSFRRINAKQTLLRNVSAYAEFLLQSWQDEGEANDPSSSRATSWFKRQYSFRGSKTDR---TNQRPRCWSRSFEFTEDDP--NLETVFRSAFGGNRSYY

Query:  WSFINEENPQWRSSTNYSSNYGRSWNWRHRVD-DDYDSSNEYE-------DSEANLAPHRLALGLRVSGPLKLEDVKNA
        WS   E   +   S  YS+N+ +SW  R+R+D ++ +   EYE       D+E N   HR  LGL  SGPL LEDVK A
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGAGATGCAACCATTATACGAAGAGTTTTAGAAGGATTAATGCAAAACAAACATTGCTGCGCAATGTCAGTGCCTATGCAGAATTCCTCTTGCAGAGTTGGCAGGATGA
GGGTGAGGCGAATGATCCTTCCTCGAGTAGAGCCACTTCATGGTTTAAAAGGCAGTACTCATTTAGGGGCTCTAAAACAGACAGGACCAACCAGAGGCCACGGTGTTGGA
GTAGAAGTTTTGAGTTTACTGAAGATGACCCTAATCTTGAGACTGTCTTCCGATCTGCATTTGGTGGAAATCGGTCTTATTACTGGTCTTTCATTAATGAAGAGAATCCT
CAATGGAGGAGCTCAACAAATTACTCAAGTAACTATGGGAGATCTTGGAACTGGCGACATAGGGTTGATGACGATTATGACTCTTCTAATGAATATGAGGATTCAGAGGC
AAATTTGGCACCGCATAGACTTGCTCTTGGACTACGAGTATCTGGTCCACTTAAACTTGAAGATGTTAAAAATGCGTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MRCNHYTKSFRRINAKQTLLRNVSAYAEFLLQSWQDEGEANDPSSSRATSWFKRQYSFRGSKTDRTNQRPRCWSRSFEFTEDDPNLETVFRSAFGGNRSYYWSFINEENP
QWRSSTNYSSNYGRSWNWRHRVDDDYDSSNEYEDSEANLAPHRLALGLRVSGPLKLEDVKNA

HG10019970 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome