; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10020062 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10020062
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionNDR1/HIN1-Like protein 3-like
Genome locationChr04:28446492..28449902
RNA-Seq ExpressionHG10020062
SyntenyHG10020062
Gene Ontology termsGO:0098542 - defense response to other organism (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR044839 - Protein NDR1-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8651106.1 hypothetical protein Csa_001623 [Cucumis sativus]7.8e-6788.75Show/hide
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        QEG+S LN RFDGQQLMNLDA+QLAVFTLE+LVDIFSIKVEL LHMRV+IG IRIKLNPK
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TYK25308.1 NDR1/HIN1-Like protein 3-like [Cucumis melo var. makuwa]4.0e-6385Show/hide
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        +EG+SLLN RFDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVEL LHMRV+IG IRIKLNPK
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XP_004136710.2 uncharacterized protein LOC101218041 [Cucumis sativus]7.8e-6788.75Show/hide
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        QEG+S LN RFDGQQLMNLDA+QLAVFTLE+LVDIFSIKVEL LHMRV+IG IRIKLNPK
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XP_023005830.1 NDR1/HIN1-like protein 3 [Cucurbita maxima]4.9e-5372.67Show/hide
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        MSRTKKC IIF III+VL+L+SL I+WLITM NK+KF V  A+LTQFNFTDD+QLLF L++NM VKNPNR F VFFD I+V +LYQDIKFSN S+SPFYQ
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Query:  GQEGRSLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRIKLNPK
        GQ+G  LL L+FDGQQLMNL+AEQLAVF LEKLV+IF++K+EL L +RV I LI+IKL PK
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XP_038904446.1 NDR1/HIN1-like protein 10 [Benincasa hispida]2.7e-6790Show/hide
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        MSRTKK IIFTIIIIVL+LISLFILWLIT T+K+KFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGF VFFDSI+VVVLYQDIKFSNVSLSPFYQG
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Query:  QEGRSLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRIKLNPK
        QEG+SLLNL FDGQQLMNLDA+QLAVFTLEKL+DIFSIK+EL L MRV+IG IRIKLNPK
Subjt:  QEGRSLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRIKLNPK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LBJ3 LEA_2 domain-containing protein4.3e-5587.22Show/hide
Query:  ITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQGQEGRSLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVF
        +TMT K+KFQV NANLTQFN TDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGF VFFDSI+V VLYQ IKFSNVSLSPFYQGQEG+S LN RFDGQQLMNLDA+QLAVF
Subjt:  ITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQGQEGRSLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVF

Query:  TLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRIKLNPK
        TLE+LVDIFSIKVEL LHMRV+IG IRIKLNPK
Subjt:  TLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRIKLNPK

A0A5A7TKH6 NDR1/HIN1-Like protein 3-like4.0e-5384.21Show/hide
Query:  ITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQGQEGRSLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVF
        +TMT K+KFQV NA LT+FN T+ SQLLFQLSLNM V+NPNRGF VFFDSI+V VLYQDIKFSN+SLSPFYQG+EG+SLLN RFDGQQLMNLDAEQLAVF
Subjt:  ITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQGQEGRSLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVF

Query:  TLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRIKLNPK
        TLEKLVDIFSIKVEL LHMRV+IG IRIKLNPK
Subjt:  TLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRIKLNPK

A0A5D3DNY5 NDR1/HIN1-Like protein 3-like1.9e-6385Show/hide
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        MSRTKK IIF+II+IVLILISLFILWL+TMT K+KFQV NA LT+FN T+ SQLLFQLSLNM V+NPNRGF VFFDSI+V VLYQDIKFSN+SLSPFYQG
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Query:  QEGRSLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRIKLNPK
        +EG+SLLN RFDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVEL LHMRV+IG IRIKLNPK
Subjt:  QEGRSLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRIKLNPK

A0A6J1H1R7 NDR1/HIN1-like protein 31.2e-5272.67Show/hide
Query:  MSRTKKC-IIFTIIIIVLILISLFILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQ
        MSRTKKC IIF III+VL+L+SL I+WLITM NK+KF V +A+LTQFNFTDD QLLF L++NM VKNPNR F VFFD I+V VLYQDIKFSN SLSPFYQ
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Query:  GQEGRSLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRIKLNPK
         Q+G  LL L+FDGQQLMNL+AEQLAVF LEKLV+ F++K+EL L +RV I LI+IKL PK
Subjt:  GQEGRSLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRIKLNPK

A0A6J1KYH7 NDR1/HIN1-like protein 32.4e-5372.67Show/hide
Query:  MSRTKKC-IIFTIIIIVLILISLFILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQ
        MSRTKKC IIF III+VL+L+SL I+WLITM NK+KF V  A+LTQFNFTDD+QLLF L++NM VKNPNR F VFFD I+V +LYQDIKFSN S+SPFYQ
Subjt:  MSRTKKC-IIFTIIIIVLILISLFILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQ

Query:  GQEGRSLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRIKLNPK
        GQ+G  LL L+FDGQQLMNL+AEQLAVF LEKLV+IF++K+EL L +RV I LI+IKL PK
Subjt:  GQEGRSLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRIKLNPK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8LD98 NDR1/HIN1-like protein 61.4e-0524.49Show/hide
Query:  FTIIIIVLILISLFILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFF-DSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQGQEGRSLLN
        F ++++V +  S+ IL+L+       + +    LT+F    DS L    ++ +T KNPN    +++ D  K+ V Y + + SN SL  FYQG E  +++ 
Subjt:  FTIIIIVLILISLFILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFF-DSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQGQEGRSLLN

Query:  LRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRI
        +   G Q  N    +  +   ++      +++ +   +RV+ G +++
Subjt:  LRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRI

Q9C615 Putative syntaxin-241.1e-1030Show/hide
Query:  TNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQGQEGRSLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLE
        +N VKFQV +A LT F+   ++ L + LSLN++++N      + +D  +  V Y + +   V +  FY G +   LL   F+GQ L+ L   +   F  +
Subjt:  TNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQGQEGRSLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLE

Query:  KLVDIFSIKVELLLHMRVQI
        +   ++ I V+L ++ RV +
Subjt:  KLVDIFSIKVELLLHMRVQI

Q9FNH6 NDR1/HIN1-like protein 35.5e-1536Show/hide
Query:  IIFTIIIIVLIL--ISLFILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFS-NVSLSPFYQGQEGR
        +IF I+I + +L  I+  I+WLI   N +KF VT+A LT+F     + L + L LN T++NPNR   V++D I+V   Y D +F  + ++S FYQG +  
Subjt:  IIFTIIIIVLIL--ISLFILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFS-NVSLSPFYQGQEGR

Query:  SLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIR
        +++  +  GQQL+ LD  +      +    I+ I  +L L +R + GLI+
Subjt:  SLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIR

Q9SJ52 NDR1/HIN1-like protein 101.0e-1632.45Show/hide
Query:  IIIIVLILISLFILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTD-DSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQGQEGRSLLNLR
        I +IV++ ++  I WLI     +KF VT+A+LT+F+ T  D+ L + L+L + V+NPN+   +++D I+    Y+  +FS ++L+PFYQG +  ++L   
Subjt:  IIIIVLILISLFILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTD-DSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQGQEGRSLLNLR

Query:  FDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRI-KLNPK
        F GQ L+  +A Q      E++  +++I+++  L +R ++G ++  ++ PK
Subjt:  FDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRI-KLNPK

Q9SRN1 NDR1/HIN1-like protein 23.0e-1332.92Show/hide
Query:  CIIFTIIIIVLILISL------FILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQG
        C I ++I  +LI +++       ILWLI   N VKF V +ANL +F+F  ++ L + L LN T++NPN+   V++D   V   Y D +F + ++S FYQG
Subjt:  CIIFTIIIIVLILISL------FILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQG

Query:  QEGRSLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRI-KLNPK
         +  +++  + +GQ L+ L          ++   I+ I  +L L +R +   I+  KL PK
Subjt:  QEGRSLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRI-KLNPK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32270.1 syntaxin, putative7.6e-1230Show/hide
Query:  TNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQGQEGRSLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLE
        +N VKFQV +A LT F+   ++ L + LSLN++++N      + +D  +  V Y + +   V +  FY G +   LL   F+GQ L+ L   +   F  +
Subjt:  TNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQGQEGRSLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLE

Query:  KLVDIFSIKVELLLHMRVQI
        +   ++ I V+L ++ RV +
Subjt:  KLVDIFSIKVELLLHMRVQI

AT2G35460.1 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family8.1e-1434.23Show/hide
Query:  IIFTIIIIVLILISL--FILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDS-QLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQGQEGR
        II  I+I VL+ + +   ILW I   N VKFQVT A+LT+F F   S  L + +SLN +++NPN+   + +D ++V   Y D +FS  +++ FYQG +  
Subjt:  IIFTIIIIVLILISL--FILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDS-QLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQGQEGR

Query:  SLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLI
        +++    +GQ+L+ L A     F  ++   ++ I V+L   +R + G +
Subjt:  SLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLI

AT2G35980.1 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family7.1e-1832.45Show/hide
Query:  IIIIVLILISLFILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTD-DSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQGQEGRSLLNLR
        I +IV++ ++  I WLI     +KF VT+A+LT+F+ T  D+ L + L+L + V+NPN+   +++D I+    Y+  +FS ++L+PFYQG +  ++L   
Subjt:  IIIIVLILISLFILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTD-DSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQGQEGRSLLNLR

Query:  FDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRI-KLNPK
        F GQ L+  +A Q      E++  +++I+++  L +R ++G ++  ++ PK
Subjt:  FDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRI-KLNPK

AT3G11650.1 NDR1/HIN1-like 22.1e-1432.92Show/hide
Query:  CIIFTIIIIVLILISL------FILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQG
        C I ++I  +LI +++       ILWLI   N VKF V +ANL +F+F  ++ L + L LN T++NPN+   V++D   V   Y D +F + ++S FYQG
Subjt:  CIIFTIIIIVLILISL------FILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQG

Query:  QEGRSLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRI-KLNPK
         +  +++  + +GQ L+ L          ++   I+ I  +L L +R +   I+  KL PK
Subjt:  QEGRSLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRI-KLNPK

AT5G06320.1 NDR1/HIN1-like 33.9e-1636Show/hide
Query:  IIFTIIIIVLIL--ISLFILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFS-NVSLSPFYQGQEGR
        +IF I+I + +L  I+  I+WLI   N +KF VT+A LT+F     + L + L LN T++NPNR   V++D I+V   Y D +F  + ++S FYQG +  
Subjt:  IIFTIIIIVLIL--ISLFILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFS-NVSLSPFYQGQEGR

Query:  SLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIR
        +++  +  GQQL+ LD  +      +    I+ I  +L L +R + GLI+
Subjt:  SLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCAAGAACAAAGAAGTGCATCATATTCACCATTATCATTATAGTTTTAATTCTCATTTCCTTGTTCATCTTATGGCTCATCACCATGACCAATAAAGTCAAATTCCA
AGTGACCAACGCCAACCTGACCCAATTCAACTTCACCGACGACAGCCAACTCCTCTTCCAACTCAGCCTTAACATGACTGTCAAAAACCCTAATCGCGGCTTTGAAGTTT
TCTTTGACAGCATCAAAGTGGTTGTGTTGTATCAAGACATTAAGTTTAGCAACGTATCGCTGTCGCCATTTTACCAAGGCCAAGAGGGAAGAAGCTTGCTGAATTTAAGG
TTTGATGGTCAGCAATTGATGAATCTTGACGCTGAGCAGCTGGCTGTGTTCACTCTTGAGAAACTTGTTGATATCTTCTCTATTAAAGTGGAGCTTCTTCTTCATATGAG
GGTTCAGATTGGTCTCATTAGGATCAAACTCAATCCCAAGCCATTTGATCACAACGATGGACTTATCAAATCCAACGGTGATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCAAGAACAAAGAAGTGCATCATATTCACCATTATCATTATAGTTTTAATTCTCATTTCCTTGTTCATCTTATGGCTCATCACCATGACCAATAAAGTCAAATTCCA
AGTGACCAACGCCAACCTGACCCAATTCAACTTCACCGACGACAGCCAACTCCTCTTCCAACTCAGCCTTAACATGACTGTCAAAAACCCTAATCGCGGCTTTGAAGTTT
TCTTTGACAGCATCAAAGTGGTTGTGTTGTATCAAGACATTAAGTTTAGCAACGTATCGCTGTCGCCATTTTACCAAGGCCAAGAGGGAAGAAGCTTGCTGAATTTAAGG
TTTGATGGTCAGCAATTGATGAATCTTGACGCTGAGCAGCTGGCTGTGTTCACTCTTGAGAAACTTGTTGATATCTTCTCTATTAAAGTGGAGCTTCTTCTTCATATGAG
GGTTCAGATTGGTCTCATTAGGATCAAACTCAATCCCAAGCCATTTGATCACAACGATGGACTTATCAAATCCAACGGTGATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSRTKKCIIFTIIIIVLILISLFILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQGQEGRSLLNLR
FDGQQLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRIKLNPKPFDHNDGLIKSNGD