CuGenDBv2

Gene ID	HG10020197
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	PWWP domain protein
Genome location	Chr04:29734973..29737579
RNA-Seq Expression	HG10020197
Synteny	HG10020197
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_004137983.1 uncharacterized protein LOC101217493 isoform X2 [Cucumis sativus]

1.2e-113

91.3

Show/hide

Query:  MAKKRKTPQKKKGEKQSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLFCYSSSIARRGTSALPRLSLNEVGLSKLIVNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSLGEDE
        MAKKRKT QKKKGEKQSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLF YSSSI  + T+AL RLSLNEVG SKL+V+HSDNT EELSSSSLVKCSNSL  DE
Subjt:  MAKKRKTPQKKKGEKQSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLFCYSSSIARRGTSALPRLSLNEVGLSKLIVNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSLGEDE

Query:  ELSLCSSPDEMQSVECRLSDSSCKAVSKRKGTSKISYPVGKKLPDSESNSLSETPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDNDVH
         LSLCSSPDEMQSVEC LS+SSCKAVSKRKGTSKIS+PVGKKLPDSESNSLS TPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSC DKGSSSNSSRIEDND+H
Subjt:  ELSLCSSPDEMQSVECRLSDSSCKAVSKRKGTSKISYPVGKKLPDSESNSLSETPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDNDVH

Query:  LDRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA
         DRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA
Subjt:  LDRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA

XP_008442737.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486526 isoform X1 [Cucumis melo]

1.8e-112

90.51

Show/hide

Query:  MAKKRKTPQKKKGEKQSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLFCYSSSIARRGTSALPRLSLNEVGLSKLIVNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSLGEDE
        MAKKRKT  KKKGE QSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLF YSSSI  +  +AL RLSLNEVG SKL+VNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSL EDE
Subjt:  MAKKRKTPQKKKGEKQSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLFCYSSSIARRGTSALPRLSLNEVGLSKLIVNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSLGEDE

Query:  ELSLCSSPDEMQSVECRLSDSSCKAVSKRKGTSKISYPVGKKLPDSESNSLSETPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDNDVH
         LSLCSSPDEMQSVECRLS+SSC    KRKGTSKIS+PVGKKLPDSESNSLS TPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDND+H
Subjt:  ELSLCSSPDEMQSVECRLSDSSCKAVSKRKGTSKISYPVGKKLPDSESNSLSETPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDNDVH

Query:  LDRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA
         DRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA
Subjt:  LDRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA

XP_031739028.1 uncharacterized protein LOC101217493 isoform X1 [Cucumis sativus]

1.7e-115

91.7

Show/hide

Query:  MAKKRKTPQKKKGEKQSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLFCYSSSIARRGTSALPRLSLNEVGLSKLIVNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSLGEDE
        MAKKRKT QKKKGEKQSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLF YSSSI  + T+AL RLSLNEVG SKL+V+HSDNT EELSSSSLVKCSNSL  DE
Subjt:  MAKKRKTPQKKKGEKQSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLFCYSSSIARRGTSALPRLSLNEVGLSKLIVNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSLGEDE

Query:  ELSLCSSPDEMQSVECRLSDSSCKAVSKRKGTSKISYPVGKKLPDSESNSLSETPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDNDVH
         LSLCSSPDEMQSVEC LS+SSCKAVSKRKGTSKIS+PVGKKLPDSESNSLS TPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDND+H
Subjt:  ELSLCSSPDEMQSVECRLSDSSCKAVSKRKGTSKISYPVGKKLPDSESNSLSETPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDNDVH

Query:  LDRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA
         DRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA
Subjt:  LDRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA

XP_038905234.1 uncharacterized protein LOC120091323 isoform X1 [Benincasa hispida]

1.1e-122

94.07

Show/hide

Query:  MAKKRKTPQKKKGEKQSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLFCYSSSIARRGTSALPRLSLNEVGLSKLIVNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSLGEDE
        MAKKRKTPQ+KKGE Q PL+DNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLFCYSSSI   GTSALP+LSLNEVG SKLIVNHSD+TNEELSSSSLVKCSNSLGEDE
Subjt:  MAKKRKTPQKKKGEKQSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLFCYSSSIARRGTSALPRLSLNEVGLSKLIVNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSLGEDE

Query:  ELSLCSSPDEMQSVECRLSDSSCKAVSKRKGTSKISYPVGKKLPDSESNSLSETPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDNDVH
        ELSLCSSPDEMQS+ECRLSDSSCKAVSKRKGTSKIS+PVGKK+PDSESNSLS TPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDND+H
Subjt:  ELSLCSSPDEMQSVECRLSDSSCKAVSKRKGTSKISYPVGKKLPDSESNSLSETPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDNDVH

Query:  LDRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA
        LDRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA
Subjt:  LDRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA

XP_038905235.1 uncharacterized protein LOC120091323 isoform X2 [Benincasa hispida]

8.0e-121

93.68

Show/hide

Query:  MAKKRKTPQKKKGEKQSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLFCYSSSIARRGTSALPRLSLNEVGLSKLIVNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSLGEDE
        MAKKRKTPQ+KKGE Q PL+DNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLFCYSSSI   GTSALP+LSLNEVG SKLIVNHSD+TNEELSSSSLVKCSNSLGEDE
Subjt:  MAKKRKTPQKKKGEKQSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLFCYSSSIARRGTSALPRLSLNEVGLSKLIVNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSLGEDE

Query:  ELSLCSSPDEMQSVECRLSDSSCKAVSKRKGTSKISYPVGKKLPDSESNSLSETPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDNDVH
        ELSLCSSPDEMQS+ECRLSDSSCKAVSKRKGTSKIS+PVGKK+PDSESNSLS TPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSC DKGSSSNSSRIEDND+H
Subjt:  ELSLCSSPDEMQSVECRLSDSSCKAVSKRKGTSKISYPVGKKLPDSESNSLSETPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDNDVH

Query:  LDRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA
        LDRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA
Subjt:  LDRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LAN1 Uncharacterized protein

6.0e-114

91.3

Show/hide

Query:  MAKKRKTPQKKKGEKQSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLFCYSSSIARRGTSALPRLSLNEVGLSKLIVNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSLGEDE
        MAKKRKT QKKKGEKQSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLF YSSSI  + T+AL RLSLNEVG SKL+V+HSDNT EELSSSSLVKCSNSL  DE
Subjt:  MAKKRKTPQKKKGEKQSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLFCYSSSIARRGTSALPRLSLNEVGLSKLIVNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSLGEDE

Query:  ELSLCSSPDEMQSVECRLSDSSCKAVSKRKGTSKISYPVGKKLPDSESNSLSETPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDNDVH
         LSLCSSPDEMQSVEC LS+SSCKAVSKRKGTSKIS+PVGKKLPDSESNSLS TPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSC DKGSSSNSSRIEDND+H
Subjt:  ELSLCSSPDEMQSVECRLSDSSCKAVSKRKGTSKISYPVGKKLPDSESNSLSETPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDNDVH

Query:  LDRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA
         DRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA
Subjt:  LDRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA

A0A1S3B6F2 uncharacterized protein LOC103486526 isoform X1

8.6e-113

90.51

Show/hide

Query:  MAKKRKTPQKKKGEKQSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLFCYSSSIARRGTSALPRLSLNEVGLSKLIVNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSLGEDE
        MAKKRKT  KKKGE QSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLF YSSSI  +  +AL RLSLNEVG SKL+VNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSL EDE
Subjt:  MAKKRKTPQKKKGEKQSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLFCYSSSIARRGTSALPRLSLNEVGLSKLIVNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSLGEDE

Query:  ELSLCSSPDEMQSVECRLSDSSCKAVSKRKGTSKISYPVGKKLPDSESNSLSETPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDNDVH
         LSLCSSPDEMQSVECRLS+SSC    KRKGTSKIS+PVGKKLPDSESNSLS TPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDND+H
Subjt:  ELSLCSSPDEMQSVECRLSDSSCKAVSKRKGTSKISYPVGKKLPDSESNSLSETPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDNDVH

Query:  LDRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA
         DRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA
Subjt:  LDRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA

A0A1S3B734 uncharacterized protein LOC103486526 isoform X2

6.2e-111

90.12

Show/hide

Query:  MAKKRKTPQKKKGEKQSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLFCYSSSIARRGTSALPRLSLNEVGLSKLIVNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSLGEDE
        MAKKRKT  KKKGE QSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLF YSSSI  +  +AL RLSLNEVG SKL+VNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSL EDE
Subjt:  MAKKRKTPQKKKGEKQSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLFCYSSSIARRGTSALPRLSLNEVGLSKLIVNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSLGEDE

Query:  ELSLCSSPDEMQSVECRLSDSSCKAVSKRKGTSKISYPVGKKLPDSESNSLSETPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDNDVH
         LSLCSSPDEMQSVECRLS+SSC    KRKGTSKIS+PVGKKLPDSESNSLS TPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSC DKGSSSNSSRIEDND+H
Subjt:  ELSLCSSPDEMQSVECRLSDSSCKAVSKRKGTSKISYPVGKKLPDSESNSLSETPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDNDVH

Query:  LDRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA
         DRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA
Subjt:  LDRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA

A0A5A7TQ68 PWWP domain protein

8.6e-113

90.51

Show/hide

Query:  MAKKRKTPQKKKGEKQSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLFCYSSSIARRGTSALPRLSLNEVGLSKLIVNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSLGEDE
        MAKKRKT  KKKGE QSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLF YSSSI  +  +AL RLSLNEVG SKL+VNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSL EDE
Subjt:  MAKKRKTPQKKKGEKQSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLFCYSSSIARRGTSALPRLSLNEVGLSKLIVNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSLGEDE

Query:  ELSLCSSPDEMQSVECRLSDSSCKAVSKRKGTSKISYPVGKKLPDSESNSLSETPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDNDVH
         LSLCSSPDEMQSVECRLS+SSC    KRKGTSKIS+PVGKKLPDSESNSLS TPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDND+H
Subjt:  ELSLCSSPDEMQSVECRLSDSSCKAVSKRKGTSKISYPVGKKLPDSESNSLSETPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDNDVH

Query:  LDRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA
         DRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA
Subjt:  LDRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA

A0A5D3DNG7 PWWP domain protein

6.2e-111

90.12

Show/hide

Query:  MAKKRKTPQKKKGEKQSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLFCYSSSIARRGTSALPRLSLNEVGLSKLIVNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSLGEDE
        MAKKRKT  KKKGE QSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLF YSSSI  +  +AL RLSLNEVG SKL+VNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSL EDE
Subjt:  MAKKRKTPQKKKGEKQSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLFCYSSSIARRGTSALPRLSLNEVGLSKLIVNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSLGEDE

Query:  ELSLCSSPDEMQSVECRLSDSSCKAVSKRKGTSKISYPVGKKLPDSESNSLSETPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDNDVH
         LSLCSSPDEMQSVECRLS+SSC    KRKGTSKIS+PVGKKLPDSESNSLS TPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSC DKGSSSNSSRIEDND+H
Subjt:  ELSLCSSPDEMQSVECRLSDSSCKAVSKRKGTSKISYPVGKKLPDSESNSLSETPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDNDVH

Query:  LDRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA
         DRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA
Subjt:  LDRGRGKRERKPKVPFDEEMTISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCGAAGAAGAGAAAGACGCCCCAGAAGAAAAAGGGCGAAAAACAATCACCCCTTATCGATAATATACCCAAGTATTCTCAACAGCGCCGAAGCTCACCGCCTAAACG
CCGCACTGATTTCTCCTCTCTCTTTTGCTATTCTTCTTCAATTGCCCGTCGAGGCACATCTGCCTTGCCACGATTGTCGTTGAATGAAGTTGGATTGTCAAAATTGATAG
TGAATCACTCAGATAATACAAATGAAGAACTCTCTTCTAGCTCTTTGGTGAAATGCAGCAACTCCCTGGGGGAAGATGAAGAACTAAGCCTATGCTCAAGTCCTGATGAA
ATGCAATCAGTTGAATGCCGCCTCAGCGATAGTTCATGCAAGGCTGTAAGCAAGAGAAAAGGTACTTCTAAGATATCATACCCTGTTGGTAAAAAATTACCAGATTCAGA
AAGCAACAGTCTTTCTGAAACTCCAGAGAATGTACAGCTGTGGTCTACTGAAAGTTTCGAGGAGAGGAGTTCAAACACAACGGTAGAGTTTCAAGATCAATCATGTGCAG
ATAAGGGGTCTTCATCAAACTCAAGCAGGATTGAAGATAATGACGTACACCTAGACAGAGGAAGAGGAAAAAGGGAAAGAAAGCCAAAAGTTCCCTTCGATGAAGAGATG
ACCATATCTCTTAAATCAACAAGAAAGTTTCGCCGAATGAGGATTATGCGGTACCTTGGGCTTGCAGCTCCAGTTGGTTCTCCTTTTTCACCAATTGCCTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAKKRKTPQKKKGEKQSPLIDNIPKYSQQRRSSPPKRRTDFSSLFCYSSSIARRGTSALPRLSLNEVGLSKLIVNHSDNTNEELSSSSLVKCSNSLGEDEELSLCSSPDE
MQSVECRLSDSSCKAVSKRKGTSKISYPVGKKLPDSESNSLSETPENVQLWSTESFEERSSNTTVEFQDQSCADKGSSSNSSRIEDNDVHLDRGRGKRERKPKVPFDEEM
TISLKSTRKFRRMRIMRYLGLAAPVGSPFSPIA

HG10020197 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome